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Schistosoma mansoni
cluster # 7761 cluster # 7761       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7761#0 length = 618 sequences # 5  

consensusID : consensus_7761#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 618
fasta sequence
                              [TTGCAATTGTGTTGGATATAATTGACTGAATAGCAAATTAGCATTTGTCGACATACCCGTATAATTATAGGTGACAGGATTTGATTTCGTTGTACTTATTGTTGTCATTGAAGTAGGAATAGTGGCAGGAAGCAATGACAATGAACTTGGATTTAAAACATTTTGAAATGTTAAAGTATTTGTACCTTGTTGGTTTGACTGTATTTGTTGGGACTGTTGTTGTTGCTGTAATAATGGAAGTAATGCTAATATGGACGTATCAAACAATGGAATTTGATTAATCGAATTAGCTGCAGATGTTGTAGTCACAATTTTATCCAATGCTTTCGTCGTATTCATATTGGACTGTACAGGGCTAGATGATAACAAACTCAATGGTATACAACCTGTATTGATTGAGGATTTTGTTTCGCTAATTACACCGTCAATAATTCCTTGTGACTTATAATCTTGTTTTGTTGATTTTGTATTCAAAGAACCTGTATGATAGTCCATGGAATCAGATGTTTCATTATGTAAAGACAAGTCTAATGCATCAGCTTCATTTGAAGTACTTTGTTGTGTAGTCGAAGATTCCAGAGATATTGCACTCAATATAGGCTTTTTTTTCATTGAGCA]

[+] EMBL CD152993             [TTGCAATTGTGTTGGATATAATTGACTGAATAGCAAATTAGCATTTGTCGACATACCCGTATAATTATAGGTGACAGGATTTGATTTCGTTGTACTTATTGTTGTCATTGAAGTAGGAATAGTGGCAGGAAGCAATGACAATGAACTTGGATTTAAAACATTTTGAAATGTTAAAGTATTTGTACCTTGTTGGTTTGACTGTATTTGTTGGGACTGTTGTTGTTGCTGTAATAATGGAAGTAATGCTAATATGGACGTATCAAACAATGGAATTTGATTAATCGAATTAGCTGCAGATGTTGTAGTCACAATTTTATCCAATGCTTTCGTCGTATTCATATTGGACTGTACAGGGCTAGATGATAACAAACTCAATGGTATACAACCTGCATTGATTGAGGATTTTGTTTCGCTAATTACACCGTCAATAATTCCTTGTGACTTATAATCTTGTTTTGTTGATTNTGTATTCAAAGAACCTGTATGATAGTCCATGGAATCAGATGTTTCATTATGTAAAGACAAGTCTAATGCATCAGCTTCATTTGAAGTACTTTGTT                                                          ]
[-] EMBL CD166353             [                                                                                   ATTTCGTTGTACTTATTGTTGTCATTGAAGTAGGAATAGTGGCAGGAAGCAATGACAATGAACTTGGATTTAAAACATTTTGAAATGTTAAAGTATTTGTACCTTGTTGGTTTGACTGTATTTGTTGGGACTGTTGTTGTTGCTGTAATAATGGAAGTAATGCTAATATGGACGTATCAAACAATGGAATTTGATTAATCGAATTAGCTGCAGATGTTGTAGTCACAATTTTATCCAATGCTTTCGTCGTATTCATATTGGACTGTACAGGGCTAGATGATAACAAACTCAATGGTATACAACCTGTATTGATTGAGGATTTTGTTTCGCTAATTACACCGTCAATAATTCCTTGTGACTTATAATCTTGTTTTGTTGATTTTGTATTCAAAGAACCTGTATGATAGTCCATGGAATCAGATGTTTCATTATGTAAAGACAAGTTTAATGCATCAGCTCCATTTGAAGTACTTTGTTGTGTAGTCGAAGATT                                           ]
[+] EMBL CD146895             [                                                                                             ACTTATTGTTGTCATTGAAGTAGGAATAGTGGCAGGAAGCAATGACAATGAACTTGGATTTAAAACATTTTGAAATGTTAAAGTATTTGTACCTTGTTGGTTTGACTGTATTTGTTGGGACTGTTGTTGGTGCTGTAATAATGGAAGTAATGCTAATATGGACGTATCAAACAATGGAATTTGATTAATCGAATTAGCTGCAGATGTTGTAGTCACAATTTTATCCAATGCTTTCGTCGTATTCATATTGGACTGTACAGGGCTAGATGATAACAAACTCAATGGTATACAACCTGTATTGATTGAGGATTTTGTTTCGCTAATTACACCGTCAATAATTCCTTGTGACTTATAATCTTGTTTTGTTGATTTTGTATTCAAAGAACCTGTATGATAGTCCATGGAATCAGATGTTTTATTATGTAAAGACAAGTCT                                                                                         ]
[+] EMBL CD187261             [                                                                                                                                                                                                                  GGACTGTTGTTGTTGCTGTACTAATGGAAGTAATGCTAATATGGACGTATCAAACAATGGAATTTGATTAATCGAATTATCTGCAGATGTTGTACTCACAATTTTATCCCATGCTTTCGTCCTATACATATTGGACTGTACAGGGCTAGATTATAACAAACTCAATGGTATACAACCTGTATTGATCGAGGATTTTGTTTCGCTAATTACACCGTCAATAATTCCTTGTGACTTATAATCTTGTTTTGTCGATATTGTATTCAAAGAACCTGTATG                                                                                                                                    ]
[-] EMBL BG931809             [                                                                                                                                                                                                                        gattcGTTGCTGTAATAATGGAAGTAATGCTAATATGGACGTATCAAACAATGGAATTTGATTAATCGAAATAGCTGCAGATGTTGTAGTCACAATTTTATCCAATGCTTTCGTCGTATTCATATTGGACTGTACAGGGCTAGATGATAACAAACTCAATGGTATACAACCTGTATTGATTGAGGATTTTGTTTCGCTAATTACACCGTCAATAATTCCTTGTGACTTATAATCTTGTTTTGTTGATTTTGTATTCAAAGAACCTGTATGATAGTCCATGGAATCAGATGTTTCATTATGTAAAGACAAGTCTAATGCATCAGCTTCATTTGAAGTACTTTGTTGTGTAGTCGAAGATTCCAGAGATATTGCACTCAATATAGGCTTTTTTTTCATTGAGCA]


>consensus_7761#0 TTGCAATTGTGTTGGATATAATTGACTGAATAGCAAATTAGCATTTGTCGACATACCCGT ATAATTATAGGTGACAGGATTTGATTTCGTTGTACTTATTGTTGTCATTGAAGTAGGAAT AGTGGCAGGAAGCAATGACAATGAACTTGGATTTAAAACATTTTGAAATGTTAAAGTATT TGTACCTTGTTGGTTTGACTGTATTTGTTGGGACTGTTGTTGTTGCTGTAATAATGGAAG TAATGCTAATATGGACGTATCAAACAATGGAATTTGATTAATCGAATTAGCTGCAGATGT TGTAGTCACAATTTTATCCAATGCTTTCGTCGTATTCATATTGGACTGTACAGGGCTAGA TGATAACAAACTCAATGGTATACAACCTGTATTGATTGAGGATTTTGTTTCGCTAATTAC ACCGTCAATAATTCCTTGTGACTTATAATCTTGTTTTGTTGATTTTGTATTCAAAGAACC TGTATGATAGTCCATGGAATCAGATGTTTCATTATGTAAAGACAAGTCTAATGCATCAGC TTCATTTGAAGTACTTTGTTGTGTAGTCGAAGATTCCAGAGATATTGCACTCAATATAGG CTTTTTTTTCATTGAGCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)