These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7766#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1176 fasta sequence [TTAACTGATGTCTGAATCTGGTGTCCAGGTTATTAGCCCGATTAAAAGCTTTTTAGCTGGTGGGTTCGGTGGAGCATGTTGCATTGCAATCGGTCACCCTTTCGATACTATAAAGGTTCGACTTCAAACAATGCCTCACGTAACATCAGGAGCAACGCCTATGTATTATGGGACTTTTGATTGTGTCAGGAAAACTGTGGCGGCTGATGGCATCTTTGGACTTTATAAGGGGAATGGGGGCACCCATAGCTGGGGTGGCCCCTGTATTCGCCATTTGCTTTTTCGGCTACAATTTAGGTAAGCAGCTTCTCGCCAAGGATCCAATGAATTTAAGGAAACATGAAATTTTGTTTGCGGGGATGTTTTCTGGCATTTTTTCAACCGCAATCTTGGCTCCAGGAGAGCGTATAAAATGCCTATTGCAAGTTCAGTCAAATGCAAGTGGACCTTTGAAGTATAGCGGACCGGTCGATGTTCTTCGTCAGTTGTATCGCGAAGGTGGGATTCGAAGCATTTTCAAGGGAACAGCTGCGACACTTCTGCGAGATGTCCCTGCATCTGGAGTGTATTTTCTGAGTTACGAGGTAATGAAAGATGCATTAAGGAATCCACACTCAAAGAATAATGAATT-GAGTG-TTGGTAAAACTCTCTTTGCCGGTGGTATGGCAGGTATCTTCAACTGGTTAATAGCTATTCCTCCT-GATGTTTTAAAATCGCGTCTACAGAGTGCTTCTGAAGGTGTTTAT-CCCAATGGAATTCGATCGGTATTCTCTGAGCTTATTGCAAAA-GAAGGATTTTTGGGATTGTATCGGGGCATGACTCCGGTTATGCTTCGAGCATTTCCTGCGAACGCTGCATGCTTTCTCGGTTACGAAGTTGCATTGAAGTTTCTGGATTATGCATTCCCTGGTCTGTGATAATGTTTCGGTGTGATCATTTTATTACATCTATCAGTTGATTTTGAAATCGGGTTGCTTTGGTCTCTATTTTCAGAGTAGAATATTGTTTTCGCTTCATGTACATCTTTGCTTAAAAATTTAACAAGATCAGTATTATAGTTGAGAAACATTACCACTCTGTAAATTACGATTTTGAAATTTCATTTTATTAGCTACTGTGAAATGCTTTTCAATTAATTGATCTATGATAACTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL BF936543 [TTAACTGATGTCTGAATCTGGTGTCCAGGTTATTAGCCCGATTAAAAGCTTTTTAGCTGGTGGGTTCGGTGGAGCATGTTGCATTGCAATCGGTCACCCTTTCGATACTATAAAGGTTCGACTTCAAACAATGCCTCACGTAACATCAGGAGCAACGCCTATGTATTATGGGACTTTTGATTGTGTCAGGAAAACTGTGGCGGCTGATGGCATCTTTGGACTTTATAAGGGGAATGGGGGCACCCATAGCTGGGGTGGCCCCTGTATTCGCCATTTGCTTTTTCGGCTACAATTTAGGTAAGCAGCTTCTCGCCAAGGATCCAATGAATTTAAGGAAACATGAAATTTTGTTTGCGGGGATGTTTTCTGGCATTTTTTCAACCGCAATCTTGGCTCCAGGAGAGCGTATAAAATGCCTATTGCAAGTTCAGTCAAATGCAAGTGGACCTTTGAAGTATAGCGGACCGGTCGATGTTCTTCGTCAGTTGTATCGCGAAGGTGGGATTCGAAGCATTTTCAAGGGAACAGCTGCGACACTTCTGCGAGATGTCCCTGCATCTGGAGTGTATTTTCTGAGTTACGAGGTAATGAAAGATGCATTAAGGAATCCACACTCAAAGAATAATGAATTGGAGTGTTTGGTAAAACTCTCTTTGCCGGTGGTATGGCAAGTATCTTCAACTGGTTAATAGCTATTCCTCCTGGATGTTTAAA ] [+] EMBL SM58067 [ AGCTGGTGGGTTCGGTGGAGCATGTTGCATTGCAATCGGTCACCCTTTCGATACTATAAAGGTTCGACTTCAAACAAT SCTCACGTAACATCAGGAGCAACGCTTATGTATTATGGGACTTTTGATTGTGTCAGGAAAACTGTGGCGGCTGATGGCATCTTTGGACTTTATAAGGGG ATGGGGGCACC ] [+] EMBL CD064929 [ acaTTTCAAGAGAACAGCTGCGACACTTCTGCGAGATGTCCCTGCATCTGGAGTGTATTTTCTGAGTTACGAGGTAATGAAAGATGCATTAAGGAATCCACACTCAAAGAATAATGAATT GAGTG TTGGTAAAACTCTCTTTGCCGGTGGTATGGCAGGTATCTTCAACTGGTTAATAGCTATTCCTCCT GATGTTTTAAAATCGCGTCTACAGAGTGCTTCTGAAGGTGTTTAT CCCAATGGAATTCGATCGGTATTCTCTGAGCTTATTGCAAAA GAAGGATTTTTGGGATTGTATCGGGGCATGACTCCGGTTATGCTTCGAGCATTTCCTGCGAACGCTGCATGCTTTCTCGGTTACGAAGTTGCATTGAAGTTTCTGGATTATGCATTCCCTGGTCTGTGATAATGTTTCGGTGTGATCATTTTATTACATCTA ] [-] EMBL CD123239 [ AACAGCTGCGACACTTCTGCGAGATGTCCCTGCATCTGGAGTGTATTTTCTGAGTTACGAGGTAATGAAAGATGCATTAAGGAATCCACACTCAAAGAATAATGAATT GAGTG TTGGTAAAACTCTCTTTGCCGGTGGTATGGCAGGTATCTTCAACTGGTTAATAGCTATTCCTCCT GATGTTTTAAAATCGCGTCTACA ] [-] EMBL AI395316 [ AGAGTGCTTCTGAAGGTG CTATCCCCAATGGAATTCGATCGGTATTCTCTGAGCTTATTGCAAAATGAAGGATTTTTGGGATTGTATCGGGGCATGACTCCGGTTATGCTTCGAGCATTTCCTGCGAACGATGCATGCTTTCTCGGTTATGAAGTTGCATTGAAGTTTCTGGACTATGCATTCCCTGGTCTGTGATAATGTTTCGGTGTGATCATTTTATTACATCTATCAGTTGATTTTGAAATCGGGTTGCTTTGGTCTCTATTTTCAGAGTAGAATATTGTTTTCGCTTCATGTACATCTTTGCTTAAAAATTTAACAAGATCAGTATTATAGTTGAGAAACATTACCACTCTGTAAATTACGATTTTGAAATTTCATTTTATTAGCTACTGTGAAATGCTTTTCAATTAATTGATCTATGATAACTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||