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Schistosoma mansoni
cluster # 7766 cluster # 7766       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7766#0 length = 1176 sequences # 5  

consensusID : consensus_7766#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1176
fasta sequence
                              [TTAACTGATGTCTGAATCTGGTGTCCAGGTTATTAGCCCGATTAAAAGCTTTTTAGCTGGTGGGTTCGGTGGAGCATGTTGCATTGCAATCGGTCACCCTTTCGATACTATAAAGGTTCGACTTCAAACAATGCCTCACGTAACATCAGGAGCAACGCCTATGTATTATGGGACTTTTGATTGTGTCAGGAAAACTGTGGCGGCTGATGGCATCTTTGGACTTTATAAGGGGAATGGGGGCACCCATAGCTGGGGTGGCCCCTGTATTCGCCATTTGCTTTTTCGGCTACAATTTAGGTAAGCAGCTTCTCGCCAAGGATCCAATGAATTTAAGGAAACATGAAATTTTGTTTGCGGGGATGTTTTCTGGCATTTTTTCAACCGCAATCTTGGCTCCAGGAGAGCGTATAAAATGCCTATTGCAAGTTCAGTCAAATGCAAGTGGACCTTTGAAGTATAGCGGACCGGTCGATGTTCTTCGTCAGTTGTATCGCGAAGGTGGGATTCGAAGCATTTTCAAGGGAACAGCTGCGACACTTCTGCGAGATGTCCCTGCATCTGGAGTGTATTTTCTGAGTTACGAGGTAATGAAAGATGCATTAAGGAATCCACACTCAAAGAATAATGAATT-GAGTG-TTGGTAAAACTCTCTTTGCCGGTGGTATGGCAGGTATCTTCAACTGGTTAATAGCTATTCCTCCT-GATGTTTTAAAATCGCGTCTACAGAGTGCTTCTGAAGGTGTTTAT-CCCAATGGAATTCGATCGGTATTCTCTGAGCTTATTGCAAAA-GAAGGATTTTTGGGATTGTATCGGGGCATGACTCCGGTTATGCTTCGAGCATTTCCTGCGAACGCTGCATGCTTTCTCGGTTACGAAGTTGCATTGAAGTTTCTGGATTATGCATTCCCTGGTCTGTGATAATGTTTCGGTGTGATCATTTTATTACATCTATCAGTTGATTTTGAAATCGGGTTGCTTTGGTCTCTATTTTCAGAGTAGAATATTGTTTTCGCTTCATGTACATCTTTGCTTAAAAATTTAACAAGATCAGTATTATAGTTGAGAAACATTACCACTCTGTAAATTACGATTTTGAAATTTCATTTTATTAGCTACTGTGAAATGCTTTTCAATTAATTGATCTATGATAACTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL BF936543             [TTAACTGATGTCTGAATCTGGTGTCCAGGTTATTAGCCCGATTAAAAGCTTTTTAGCTGGTGGGTTCGGTGGAGCATGTTGCATTGCAATCGGTCACCCTTTCGATACTATAAAGGTTCGACTTCAAACAATGCCTCACGTAACATCAGGAGCAACGCCTATGTATTATGGGACTTTTGATTGTGTCAGGAAAACTGTGGCGGCTGATGGCATCTTTGGACTTTATAAGGGGAATGGGGGCACCCATAGCTGGGGTGGCCCCTGTATTCGCCATTTGCTTTTTCGGCTACAATTTAGGTAAGCAGCTTCTCGCCAAGGATCCAATGAATTTAAGGAAACATGAAATTTTGTTTGCGGGGATGTTTTCTGGCATTTTTTCAACCGCAATCTTGGCTCCAGGAGAGCGTATAAAATGCCTATTGCAAGTTCAGTCAAATGCAAGTGGACCTTTGAAGTATAGCGGACCGGTCGATGTTCTTCGTCAGTTGTATCGCGAAGGTGGGATTCGAAGCATTTTCAAGGGAACAGCTGCGACACTTCTGCGAGATGTCCCTGCATCTGGAGTGTATTTTCTGAGTTACGAGGTAATGAAAGATGCATTAAGGAATCCACACTCAAAGAATAATGAATTGGAGTGTTTGGTAAAACTCTCTTTGCCGGTGGTATGGCAAGTATCTTCAACTGGTTAATAGCTATTCCTCCTGGATGTTTAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL SM58067              [                                                      AGCTGGTGGGTTCGGTGGAGCATGTTGCATTGCAATCGGTCACCCTTTCGATACTATAAAGGTTCGACTTCAAACAAT SCTCACGTAACATCAGGAGCAACGCTTATGTATTATGGGACTTTTGATTGTGTCAGGAAAACTGTGGCGGCTGATGGCATCTTTGGACTTTATAAGGGG ATGGGGGCACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD064929             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acaTTTCAAGAGAACAGCTGCGACACTTCTGCGAGATGTCCCTGCATCTGGAGTGTATTTTCTGAGTTACGAGGTAATGAAAGATGCATTAAGGAATCCACACTCAAAGAATAATGAATT GAGTG TTGGTAAAACTCTCTTTGCCGGTGGTATGGCAGGTATCTTCAACTGGTTAATAGCTATTCCTCCT GATGTTTTAAAATCGCGTCTACAGAGTGCTTCTGAAGGTGTTTAT CCCAATGGAATTCGATCGGTATTCTCTGAGCTTATTGCAAAA GAAGGATTTTTGGGATTGTATCGGGGCATGACTCCGGTTATGCTTCGAGCATTTCCTGCGAACGCTGCATGCTTTCTCGGTTACGAAGTTGCATTGAAGTTTCTGGATTATGCATTCCCTGGTCTGTGATAATGTTTCGGTGTGATCATTTTATTACATCTA                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD123239             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AACAGCTGCGACACTTCTGCGAGATGTCCCTGCATCTGGAGTGTATTTTCTGAGTTACGAGGTAATGAAAGATGCATTAAGGAATCCACACTCAAAGAATAATGAATT GAGTG TTGGTAAAACTCTCTTTGCCGGTGGTATGGCAGGTATCTTCAACTGGTTAATAGCTATTCCTCCT GATGTTTTAAAATCGCGTCTACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL AI395316             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGAGTGCTTCTGAAGGTG CTATCCCCAATGGAATTCGATCGGTATTCTCTGAGCTTATTGCAAAATGAAGGATTTTTGGGATTGTATCGGGGCATGACTCCGGTTATGCTTCGAGCATTTCCTGCGAACGATGCATGCTTTCTCGGTTATGAAGTTGCATTGAAGTTTCTGGACTATGCATTCCCTGGTCTGTGATAATGTTTCGGTGTGATCATTTTATTACATCTATCAGTTGATTTTGAAATCGGGTTGCTTTGGTCTCTATTTTCAGAGTAGAATATTGTTTTCGCTTCATGTACATCTTTGCTTAAAAATTTAACAAGATCAGTATTATAGTTGAGAAACATTACCACTCTGTAAATTACGATTTTGAAATTTCATTTTATTAGCTACTGTGAAATGCTTTTCAATTAATTGATCTATGATAACTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]


>consensus_7766#0 TTAACTGATGTCTGAATCTGGTGTCCAGGTTATTAGCCCGATTAAAAGCTTTTTAGCTGG TGGGTTCGGTGGAGCATGTTGCATTGCAATCGGTCACCCTTTCGATACTATAAAGGTTCG ACTTCAAACAATGCCTCACGTAACATCAGGAGCAACGCCTATGTATTATGGGACTTTTGA TTGTGTCAGGAAAACTGTGGCGGCTGATGGCATCTTTGGACTTTATAAGGGGAATGGGGG CACCCATAGCTGGGGTGGCCCCTGTATTCGCCATTTGCTTTTTCGGCTACAATTTAGGTA AGCAGCTTCTCGCCAAGGATCCAATGAATTTAAGGAAACATGAAATTTTGTTTGCGGGGA TGTTTTCTGGCATTTTTTCAACCGCAATCTTGGCTCCAGGAGAGCGTATAAAATGCCTAT TGCAAGTTCAGTCAAATGCAAGTGGACCTTTGAAGTATAGCGGACCGGTCGATGTTCTTC GTCAGTTGTATCGCGAAGGTGGGATTCGAAGCATTTTCAAGGGAACAGCTGCGACACTTC TGCGAGATGTCCCTGCATCTGGAGTGTATTTTCTGAGTTACGAGGTAATGAAAGATGCAT TAAGGAATCCACACTCAAAGAATAATGAATTGAGTGTTGGTAAAACTCTCTTTGCCGGTG GTATGGCAGGTATCTTCAACTGGTTAATAGCTATTCCTCCTGATGTTTTAAAATCGCGTC TACAGAGTGCTTCTGAAGGTGTTTATCCCAATGGAATTCGATCGGTATTCTCTGAGCTTA TTGCAAAAGAAGGATTTTTGGGATTGTATCGGGGCATGACTCCGGTTATGCTTCGAGCAT TTCCTGCGAACGCTGCATGCTTTCTCGGTTACGAAGTTGCATTGAAGTTTCTGGATTATG CATTCCCTGGTCTGTGATAATGTTTCGGTGTGATCATTTTATTACATCTATCAGTTGATT TTGAAATCGGGTTGCTTTGGTCTCTATTTTCAGAGTAGAATATTGTTTTCGCTTCATGTA CATCTTTGCTTAAAAATTTAACAAGATCAGTATTATAGTTGAGAAACATTACCACTCTGT AAATTACGATTTTGAAATTTCATTTTATTAGCTACTGTGAAATGCTTTTCAATTAATTGA TCTATGATAACTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)