These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7770#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 626 fasta sequence [TACGCAGTACGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTCATTAAATGTGTTTATTAAGAAAAAGACAAACATATAAATCTTACAATTTCAATATTCATTAATTAACAATATATATATATATATTCATCATCATTTGATTTATCCATTAGATTTATACACAACATTCAATGTTCCCTAGATATGATCAACAAGAATAGTAGCCGCCAGTATGTCAGTAACTATATATTGATTTGTATTAATATGGAAAATATGTAAC-ATAATGTTTATTTTTTCTTTTATCACTATCAATAATAGTATGATATTTTTTACTTCCACTACTAAGTTTTGATTTATCAGAACGTCTCACACTACCATAAATATCATAATTAGAATAATTTTTAATTTTACCTTTTGCATCTTGTTTACCACTATGATGATATGATATGGATTCTTCATAATCTGTTGTTTTTAATGTATTATCAAAAAGAAATAGATCATTTGGTAGTTTATCATCACCAATATAATCATTATAATTTTGGTTTGTTGAATATTTATATGGGTTATTATATAGTGATTTGACATTATTATTTTTATTATGGGTTCTATAGTTCCCTTTCCTATGATA] [+] EMBL AI975851 [TACGCAGTACGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTCATTAAATGTGTTTATTAAGAAAAAGACAAACATATAAATCTTACAATTTCAATATTCATTAATTAACAATATATATATATATATTCATCATCATTTGATTTATCCATTAGATTTATACACAACATTCAATGTTCCCTAGATATGATCAACAAGAATAGTAGCCGCCAGTATGTCAGTAACTATATATTGATTTGTATTAATATGGAAAATATGTAAC ATAATGTTTATTTTTTCTTTTATCACTATCAATAATAGTATGATATTTTTTACTTCCACTACTAAGTTTTGATTTATCAGAACGTCTCACACTACCATAAATATCATAATTAGAATAATTTTTAATTTTACCTTTTGCATCTTGTTTACCACTATGATGATATGATATGGATTCT ] [+] EMBL AI975742 [ TTAAATGTGTTTATTAAGAAAAAGACAAACATATAAATCTTACAATTTCAATATTCATTAATTAACAATATATATATATATATTCATCATCATTTGATTTATCCATTAGATTTATACACAACATTCAATGTTCCCTAGATATGATCAACAAGAATAGTAGCCGCCAGTATGTCAGTAACTATATATTGATTTGTATTAATATGGAAAATATGTAAC ATAATGTTTATTTTTTCTTTTATCACTATCAATAATAGTATGATATTTTTTACTTC ] [+] EMBL BF936125 [ ATGTGTTTATTAAGAAAAAGACAAACATATGAATCTTACAATTTCAATATTCATTAATTAACAATATATATATATATATTCATCATCATTTGATTTATCCATTAGATTTATACACAACATTCAATGTTCCCTAGATATGATCAACAAGAATAGTAGCCGCCAGTATGTCAGTAACTATATATTGATTTGTATTAATATGGAAAATATGTAAC ATAATGTTTATTTTTTCTTTTATCACTATCAATAATAGTATGATATTTTTTACTTCCACTACTAAGTTTTGATTTATCAGAACGTCTCACACTACCATAAATATCATAATTAGAATAATTTTTAATTTTACCTTTTGCATCTTGTTTACCACTATGATGATATGATATGGATTCTTCATAATCTGTTGTTTTTAATGTATTATCAAAAAGAAATAGATCATTTGGTAGTTTATCATCACCAATATAATCATTATAATTTTGGTTTGTTGAATATTTATATGGGTTATTATATAGTGATTTGACATTATTATTTTTATTATGGGTTCTATAGTTCCCTTTCCTATGATA] [+] EMBL AI739698 [ ATGTGTTTATTAAGAAAAAGACAAACATATAAATCTTACAATTTCAATATTCATTAATTAACAATATATATATATACACTCATCATCATTTGATTTATCCATTAGATTTATACACAACATTCAATGTTCCCTAGATATGATCCACAAGAATAGTAGGCGCGAGTATGTCAGTAACTATATATTGATTTGTATTAATATGG AAATATGTAACAATAATGTTTA TTTTTCCTTTATCACTATCAATAATAGTATGATATTTTTTACTTCCACTACTAAGTTTTGATTTATCAG ATGTTTTAGATTA CATAA ] [+] EMBL CD059972 [ CAA AATAGTAGCCGCCAGTATGTCAGTAACTATATATTGATTTGTATTAATATGGAAAATATGTAAC ATAATGTTTATTTTTTCTTTTATCACTATCAATAATAGTATGATATTTTTTACTTCCACTACTAAGT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||