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Schistosoma mansoni
cluster # 7770 cluster # 7770       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7770#0 length = 626 sequences # 5  

consensusID : consensus_7770#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 626
fasta sequence
                              [TACGCAGTACGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTCATTAAATGTGTTTATTAAGAAAAAGACAAACATATAAATCTTACAATTTCAATATTCATTAATTAACAATATATATATATATATTCATCATCATTTGATTTATCCATTAGATTTATACACAACATTCAATGTTCCCTAGATATGATCAACAAGAATAGTAGCCGCCAGTATGTCAGTAACTATATATTGATTTGTATTAATATGGAAAATATGTAAC-ATAATGTTTATTTTTTCTTTTATCACTATCAATAATAGTATGATATTTTTTACTTCCACTACTAAGTTTTGATTTATCAGAACGTCTCACACTACCATAAATATCATAATTAGAATAATTTTTAATTTTACCTTTTGCATCTTGTTTACCACTATGATGATATGATATGGATTCTTCATAATCTGTTGTTTTTAATGTATTATCAAAAAGAAATAGATCATTTGGTAGTTTATCATCACCAATATAATCATTATAATTTTGGTTTGTTGAATATTTATATGGGTTATTATATAGTGATTTGACATTATTATTTTTATTATGGGTTCTATAGTTCCCTTTCCTATGATA]

[+] EMBL AI975851             [TACGCAGTACGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTCATTAAATGTGTTTATTAAGAAAAAGACAAACATATAAATCTTACAATTTCAATATTCATTAATTAACAATATATATATATATATTCATCATCATTTGATTTATCCATTAGATTTATACACAACATTCAATGTTCCCTAGATATGATCAACAAGAATAGTAGCCGCCAGTATGTCAGTAACTATATATTGATTTGTATTAATATGGAAAATATGTAAC ATAATGTTTATTTTTTCTTTTATCACTATCAATAATAGTATGATATTTTTTACTTCCACTACTAAGTTTTGATTTATCAGAACGTCTCACACTACCATAAATATCATAATTAGAATAATTTTTAATTTTACCTTTTGCATCTTGTTTACCACTATGATGATATGATATGGATTCT                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL AI975742             [                                                              TTAAATGTGTTTATTAAGAAAAAGACAAACATATAAATCTTACAATTTCAATATTCATTAATTAACAATATATATATATATATTCATCATCATTTGATTTATCCATTAGATTTATACACAACATTCAATGTTCCCTAGATATGATCAACAAGAATAGTAGCCGCCAGTATGTCAGTAACTATATATTGATTTGTATTAATATGGAAAATATGTAAC ATAATGTTTATTTTTTCTTTTATCACTATCAATAATAGTATGATATTTTTTACTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BF936125             [                                                                  ATGTGTTTATTAAGAAAAAGACAAACATATGAATCTTACAATTTCAATATTCATTAATTAACAATATATATATATATATTCATCATCATTTGATTTATCCATTAGATTTATACACAACATTCAATGTTCCCTAGATATGATCAACAAGAATAGTAGCCGCCAGTATGTCAGTAACTATATATTGATTTGTATTAATATGGAAAATATGTAAC ATAATGTTTATTTTTTCTTTTATCACTATCAATAATAGTATGATATTTTTTACTTCCACTACTAAGTTTTGATTTATCAGAACGTCTCACACTACCATAAATATCATAATTAGAATAATTTTTAATTTTACCTTTTGCATCTTGTTTACCACTATGATGATATGATATGGATTCTTCATAATCTGTTGTTTTTAATGTATTATCAAAAAGAAATAGATCATTTGGTAGTTTATCATCACCAATATAATCATTATAATTTTGGTTTGTTGAATATTTATATGGGTTATTATATAGTGATTTGACATTATTATTTTTATTATGGGTTCTATAGTTCCCTTTCCTATGATA]
[+] EMBL AI739698             [                                                                  ATGTGTTTATTAAGAAAAAGACAAACATATAAATCTTACAATTTCAATATTCATTAATTAACAATATATATATATACACTCATCATCATTTGATTTATCCATTAGATTTATACACAACATTCAATGTTCCCTAGATATGATCCACAAGAATAGTAGGCGCGAGTATGTCAGTAACTATATATTGATTTGTATTAATATGG AAATATGTAACAATAATGTTTA TTTTTCCTTTATCACTATCAATAATAGTATGATATTTTTTACTTCCACTACTAAGTTTTGATTTATCAG ATGTTTTAGATTA CATAA                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD059972             [                                                                                                                                                                                                                  CAA AATAGTAGCCGCCAGTATGTCAGTAACTATATATTGATTTGTATTAATATGGAAAATATGTAAC ATAATGTTTATTTTTTCTTTTATCACTATCAATAATAGTATGATATTTTTTACTTCCACTACTAAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]


>consensus_7770#0 TACGCAGTACGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTT CATTAAATGTGTTTATTAAGAAAAAGACAAACATATAAATCTTACAATTTCAATATTCAT TAATTAACAATATATATATATATATTCATCATCATTTGATTTATCCATTAGATTTATACA CAACATTCAATGTTCCCTAGATATGATCAACAAGAATAGTAGCCGCCAGTATGTCAGTAA CTATATATTGATTTGTATTAATATGGAAAATATGTAACATAATGTTTATTTTTTCTTTTA TCACTATCAATAATAGTATGATATTTTTTACTTCCACTACTAAGTTTTGATTTATCAGAA CGTCTCACACTACCATAAATATCATAATTAGAATAATTTTTAATTTTACCTTTTGCATCT TGTTTACCACTATGATGATATGATATGGATTCTTCATAATCTGTTGTTTTTAATGTATTA TCAAAAAGAAATAGATCATTTGGTAGTTTATCATCACCAATATAATCATTATAATTTTGG TTTGTTGAATATTTATATGGGTTATTATATAGTGATTTGACATTATTATTTTTATTATGG GTTCTATAGTTCCCTTTCCTATGATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)