cluster # 7775

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Schistosoma mansoni
cluster # 7775 cluster # 7775 Sequences # 5 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7775#0 length = 325 sequences # 5

consensusID : consensus_7775#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 325
fasta sequence

                              [GTTAAAACAAAAGGTCGACAAAAACGCCTTGAACGGTCAATCAAACATGTAAATAAGGAAAAAGAACGTAAAATCAAAAAAACGTACAGAACTGACTAATTTCCATGCCTTAAATATGCTACATGATCCACAAACATTTGCTGAAAAACTCTTTCGAAAATTGGAACGATGCTCAGATCGCTTTGAAATTCGTCTTTTAATTCTTGATCTGATAAGCAGATTGATTGGATTAAATAAATTAGTTCTTCTTAATTTTTACCCATTTATTCAGCGTTTTCTACGTCCACAACAACGAGAGGTGACTCATTTATTATTGTTCTCAGCA]

[+] EMBL CD116274             [GTTAAAACAAAAGGTCGACAAAAACGCCTTGAACGGTCAATCAAACATGTAAATAAGGAAAAAGAACGTAAAATCAAAAAAACGTACAGAACTGACTAATTTCCATGCCTTAAATATGCTACATGATCCACAAACATTTGCTGAAAAACTCTTTCGAAAATTGGAACGATGCTCAGATCGCTTTGAAATTCGTCTTTTAATTCTTGATCTGATAAGCAGATTGATTGGATTAAATAAATTAGTTCTTCTTAATTTTTACCCATTTATTCAGCGTTTTCTACGTCCACAACAACGAGAGGTGACTCATTTATTATTGTTCTCAGCA]
[+] EMBL CD154590             [GTTAAAACAAAAGGTCGACAAAAACGCCTTGAACGGTCAATCAAACATGTAAATAAGGAAAAAGAACGTAAAATCAAAAAAACGTACAGAACTGACTAATTTCCATGCCTTAAATATGCTACATGATCCACAAACATTTGCTGAAAAACTCTTTCGAAAATTGGAACGATGCTCAGATCGCTTTGAAATTCGTCTTTTAATTCTTGATCTGATAAGCAGATTGATTGGATTAAATAAATTAGTTCTTCTTAATTTTTACCCATTTATTC                                                        ]
[+] EMBL CD154655             [GTTAAAACAAAAGGTCGACAAAAACGCCTTGAACGGTCAATCAAACATGTAAATAAGGAAAAAGAACGTAAAATCAAAAAAACGTACAGAACTGACTAATTTCCATGCCTTA                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD154777             [ TTAAAACAAAAGGTCGACAAAAACGCCTTGAACGGTCAATCAAACATGTAAATAAGGAAAAAGAACGTAAAATCAAAAAAACGTACAGAACTGACTAATTTCCATGCCTTAAATATGCTACATGATCCACAAACATTTGCTGAAAAACTCTTTCGAAAATTGGAACGATGCTCAGATCGCTTTGAAATTCGTCTTTTAATTCTTGATCTGATAAGCAGATTGATTGGATTAAATAAATTAGTTCTTCTTAATTTTCACCCATTTATTCA                                                       ]
[-] EMBL CD180548             [                                                       AGGAAAAAGAACGTAAAATC AAAAAACGTACAGAACTGACTAATTTCCATGCCTTAAATATGCTACATGAGCCACAAACATTTGCTGAAAAACTCTTTCGAAAATTGGAACGATGCTCAGATCGCTTTGAAATTCGTCTTTTAATTCTTGATCTGATAAGCAGATTGATTGGATTAAATAAATTAGTTCTTCTTAATTTTTACCCATTTATTCAGCGTTTTCTACGTCCACAACAACGAGAGGTGACTCATTTATTA            ]




>consensus_7775#0
GTTAAAACAAAAGGTCGACAAAAACGCCTTGAACGGTCAATCAAACATGTAAATAAGGAA
AAAGAACGTAAAATCAAAAAAACGTACAGAACTGACTAATTTCCATGCCTTAAATATGCT
ACATGATCCACAAACATTTGCTGAAAAACTCTTTCGAAAATTGGAACGATGCTCAGATCG
CTTTGAAATTCGTCTTTTAATTCTTGATCTGATAAGCAGATTGATTGGATTAAATAAATT
AGTTCTTCTTAATTTTTACCCATTTATTCAGCGTTTTCTACGTCCACAACAACGAGAGGT
GACTCATTTATTATTGTTCTCAGCA

clustalw multiple alignements is not computed in this case