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Schistosoma mansoni
cluster # 7776 cluster # 7776       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7776#0 length = 739 sequences # 5  

consensusID : consensus_7776#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 739
fasta sequence
                              [CGCGCCACATTAAAATCTTCGCTACTCAATCACATTGTTATCAGTTACCAATATTTAATAACTATGTTGCCTACACAAGAGGTGAATACACTGACAGAGATGTTAATATCTGGATATCGTCTAGATGGCCGGTCAATAAATGAATATCGTGAAATCAGCTTTCGTTTCCCTCAGGGGAAAGATCCTAATGTTTCCGGTTGTTGTGTTGTTAAAATAGGCGCTACGACTGTAATGGCACAAGTTTCAGTTGAAGTAATTGAGCCTAAACATTTTCGCCCTTCTCAAGGAATGTTGTTTGTACACTTCGATGCTAGTATTTTAAAGTTATCTAAAACTCTATATCGTAAACA-AAAACGTGATGATGAAGGTCGTCGTCTATCAGCTGTTCTCCAAACATTACTTCGAGATAGTATTGACTTGGATGCTCTGTGTATAGTTGCTTGGGAACGTGTATTTGCTGTACGAGTTGAATTACGTGCTTTATCTTATGATGGAAATTTAGGAGATTGTGGTACATTAGCAGCTGTTGCCGCTCTGGCAGCTTTTCGTCGACCAGATGTTTACGTTGATGATATGG-GTAAAGTACTAGTCGATTTTGAGGCTAAATTTCGACCTA-GAGTACCTTTAGGTATTCGTCGTACTC-C-AGTACTTGTTACACTTGGTTTAACTGCAGATGCANAAGTAGTTCTAGTTGATCCTACTGCTCGTGAAGAACTTATCCTGACTGGTGGACGTGTAT]

[+] EMBL CD155034             [CGCGCCACATTAAAATCTTCGCTACTCAATCACATTGTTATCAGTTACCAATATTTAATAACTATGTTGCCTACACAAGAGGTGAATACACTGACAGAGATGTTAATATCTGGATATCGTCTAGATGGCCGGTCAATAAATGAATATCGTGAAATCAGCTTTCGTTTCCCTCAGGGGAAAGATCCTAATGTTTCCGGTTGTTGTGTTGTTAAAATAGGCGCTACGACTGTAATGGCACAAGTTTCAGTTGAAGTAATTGAGCCTAAACATTTTCGCCCTTCTCAAGGAATGTTGTTTGTACACTTCGATGCTAGTATTTTAAAGTTATCTAAAACTCTATATCGTAAACA AAAACGTGATGATGAAGGTCGTCGTCTATCAGCTGTTCTCCAAACATTACTTCGAGATAGTATTGACTTGGATGCTCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD181255             [                                                                                              CAGAGATGTTAATATCTGGATATCGTCTAGATGGCCGGTCAATAAATGAATATCGTGAAATCAGCTTTCGTTTCCCTCAGGGGAAAGATCCTAATGTTTCCGGTTGTTGTGTTGTTAAAATAGGCGCTACGACTGTAATGGCACAAGTTTCAGTTGAAGTAATTGAGCCTAAACATTTTCGCCCTTCTCAAGGAATGTTGTTTGTACACTTCGATGCTAGTATTTTAAAGTTATCTAAAACTCTATATCGTANACA AAAACGTGATGATGAAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD078276             [                                                                                                                                                     TGAAATCAGCTTTCGTTTCCCTCAGGGGAAAGATCCTAATGTTTCCGGTTGTTGTGTTGTTAAAATAGGCGCTACGACTGTAATGGCACAAGTTTCAGTTGAAGTAATTGAGCCTAAACATTTTCGCCCTTCTCAAGGAATGTTGTTTGTACACTTCGATGCTAGTATTTTAAAGTTATCTAAAACTCTATATCGTAAACA AAAACGTGATGATGAAGGTCGTCGTCTATCAGCTGTTCTCCAAACATTACTTCGAGATAGTATTGACTTGGATGCTCTGTGTATAGTTGCTTGGGAACGTGTATTTGCTGTACGAGTTGAATTACGTGCTTTATCTTATGATGGAAATTTAGGAGATTGTGGTACATTAGCAGCTGTTGCCGCTCTGGCAGCTTTTCGTCGACCAGATGTTTACGTTGATGATATGG GTAAAGTACTAGTCGATTTTGAGGCTAAATTTCGACCTA GAGTACCTTTAGGTATTCGTCGTACTC C AGTACTTGTTACACTTGGTTTAACTGCAGATGCANAAGTAGTTCTAGTTGATCCTACTGCTCGTGAAGAACTTATCCTGACTGGTGGACGTGTAT]
[+] EMBL CD078360             [                                                                                                                                                     TGAAATCAGCTTTCGTTTCCCTCAGGGGAAAGATCCTAATGTTTCCGGTTGTTGTGTTGTTAAAATAGGCGCTACGACTGTAATGGCACAAGTTTCAGTTGAAGTAATTGAGCCTAAACATTTTCGCCCTTCTCAAGGAATGTTGTTTGTACACTTCGATGCTAGTATTTTAAAGTTATCTAAAACTCTATATCGTAAACA AAAACGTGATGATGAAGGTCGTCGTCTATCAGCTGTTCTCCAAACATTACTTCGAGATAGTATTGACTCGGATGCTCTGTGTATAGTTGCTTGGGAACGTGTATTTGCTGTACGAGTTGAATTACGTGCTTTATCTTATGATGGAAATTTAGGAGATTGTGGTACACCACCACCTGTTGCCGCTCTGGCAGCTTTTCCTCCACCAGATGTTTACGTTGATGATATGG GTAAAGTACTAGTCGATTTTGAGGCTAAATTTCGACCTA GAGTACCTTTAGGTATCCGACTCACTC C AGTACTTGNTACACTTGGTTTAACTGCAGATGCAAAAGTAGTTCTAGNTGATCCTACTGCTCGTGAAGAACTTATNCTGACTGGTGGACG     ]
[-] EMBL CD155080             [                                                                                                                                                                                  AAGATCGTAATGTTTCCGGTTGTTGTGTTGTTAAAATAGGCGCTACGACTGTAATGGCACAAGTTTCAGTTGAAGTAATTGAGCCTAAACATTTTCGCCCTTCTCAAGGAATGTTGTTTGTACACTTCCATGCTAGTATTTTAAAGTTATCTAAAACTCTATATCGTAAACAGAGAGCGTGATGATGAAGGTCGTCGTCTATCAGCTGTTCTCCAAACATTACTTCGAGATAGTATTGACTTGGATGTTCTGTGTATAGTTGCTTGGGAACGTGTATATGCTGTACGAGATGAATTACGTGCTTTATCTTATGATGGAAATTTAGGAGATTGTGGTACATTAGCAGCTGTTGCCGCTCTGGCAGCTTTTCGTCGACCAGATGTTTCCGTTGATGATATGGCGTAAAGTACTAGTCGATTTAGAGGGTAAATTTGGACGTATGAGTACCTTTAGGTATTAGTAGTACTCACGAGTA                                                                                           ]


>consensus_7776#0 CGCGCCACATTAAAATCTTCGCTACTCAATCACATTGTTATCAGTTACCAATATTTAATA ACTATGTTGCCTACACAAGAGGTGAATACACTGACAGAGATGTTAATATCTGGATATCGT CTAGATGGCCGGTCAATAAATGAATATCGTGAAATCAGCTTTCGTTTCCCTCAGGGGAAA GATCCTAATGTTTCCGGTTGTTGTGTTGTTAAAATAGGCGCTACGACTGTAATGGCACAA GTTTCAGTTGAAGTAATTGAGCCTAAACATTTTCGCCCTTCTCAAGGAATGTTGTTTGTA CACTTCGATGCTAGTATTTTAAAGTTATCTAAAACTCTATATCGTAAACAAAAACGTGAT GATGAAGGTCGTCGTCTATCAGCTGTTCTCCAAACATTACTTCGAGATAGTATTGACTTG GATGCTCTGTGTATAGTTGCTTGGGAACGTGTATTTGCTGTACGAGTTGAATTACGTGCT TTATCTTATGATGGAAATTTAGGAGATTGTGGTACATTAGCAGCTGTTGCCGCTCTGGCA GCTTTTCGTCGACCAGATGTTTACGTTGATGATATGGGTAAAGTACTAGTCGATTTTGAG GCTAAATTTCGACCTAGAGTACCTTTAGGTATTCGTCGTACTCCAGTACTTGTTACACTT GGTTTAACTGCAGATGCANAAGTAGTTCTAGTTGATCCTACTGCTCGTGAAGAACTTATC CTGACTGGTGGACGTGTAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)