These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7776#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 739 fasta sequence [CGCGCCACATTAAAATCTTCGCTACTCAATCACATTGTTATCAGTTACCAATATTTAATAACTATGTTGCCTACACAAGAGGTGAATACACTGACAGAGATGTTAATATCTGGATATCGTCTAGATGGCCGGTCAATAAATGAATATCGTGAAATCAGCTTTCGTTTCCCTCAGGGGAAAGATCCTAATGTTTCCGGTTGTTGTGTTGTTAAAATAGGCGCTACGACTGTAATGGCACAAGTTTCAGTTGAAGTAATTGAGCCTAAACATTTTCGCCCTTCTCAAGGAATGTTGTTTGTACACTTCGATGCTAGTATTTTAAAGTTATCTAAAACTCTATATCGTAAACA-AAAACGTGATGATGAAGGTCGTCGTCTATCAGCTGTTCTCCAAACATTACTTCGAGATAGTATTGACTTGGATGCTCTGTGTATAGTTGCTTGGGAACGTGTATTTGCTGTACGAGTTGAATTACGTGCTTTATCTTATGATGGAAATTTAGGAGATTGTGGTACATTAGCAGCTGTTGCCGCTCTGGCAGCTTTTCGTCGACCAGATGTTTACGTTGATGATATGG-GTAAAGTACTAGTCGATTTTGAGGCTAAATTTCGACCTA-GAGTACCTTTAGGTATTCGTCGTACTC-C-AGTACTTGTTACACTTGGTTTAACTGCAGATGCANAAGTAGTTCTAGTTGATCCTACTGCTCGTGAAGAACTTATCCTGACTGGTGGACGTGTAT] [+] EMBL CD155034 [CGCGCCACATTAAAATCTTCGCTACTCAATCACATTGTTATCAGTTACCAATATTTAATAACTATGTTGCCTACACAAGAGGTGAATACACTGACAGAGATGTTAATATCTGGATATCGTCTAGATGGCCGGTCAATAAATGAATATCGTGAAATCAGCTTTCGTTTCCCTCAGGGGAAAGATCCTAATGTTTCCGGTTGTTGTGTTGTTAAAATAGGCGCTACGACTGTAATGGCACAAGTTTCAGTTGAAGTAATTGAGCCTAAACATTTTCGCCCTTCTCAAGGAATGTTGTTTGTACACTTCGATGCTAGTATTTTAAAGTTATCTAAAACTCTATATCGTAAACA AAAACGTGATGATGAAGGTCGTCGTCTATCAGCTGTTCTCCAAACATTACTTCGAGATAGTATTGACTTGGATGCTCTG ] [+] EMBL CD181255 [ CAGAGATGTTAATATCTGGATATCGTCTAGATGGCCGGTCAATAAATGAATATCGTGAAATCAGCTTTCGTTTCCCTCAGGGGAAAGATCCTAATGTTTCCGGTTGTTGTGTTGTTAAAATAGGCGCTACGACTGTAATGGCACAAGTTTCAGTTGAAGTAATTGAGCCTAAACATTTTCGCCCTTCTCAAGGAATGTTGTTTGTACACTTCGATGCTAGTATTTTAAAGTTATCTAAAACTCTATATCGTANACA AAAACGTGATGATGAAGG ] [+] EMBL CD078276 [ TGAAATCAGCTTTCGTTTCCCTCAGGGGAAAGATCCTAATGTTTCCGGTTGTTGTGTTGTTAAAATAGGCGCTACGACTGTAATGGCACAAGTTTCAGTTGAAGTAATTGAGCCTAAACATTTTCGCCCTTCTCAAGGAATGTTGTTTGTACACTTCGATGCTAGTATTTTAAAGTTATCTAAAACTCTATATCGTAAACA AAAACGTGATGATGAAGGTCGTCGTCTATCAGCTGTTCTCCAAACATTACTTCGAGATAGTATTGACTTGGATGCTCTGTGTATAGTTGCTTGGGAACGTGTATTTGCTGTACGAGTTGAATTACGTGCTTTATCTTATGATGGAAATTTAGGAGATTGTGGTACATTAGCAGCTGTTGCCGCTCTGGCAGCTTTTCGTCGACCAGATGTTTACGTTGATGATATGG GTAAAGTACTAGTCGATTTTGAGGCTAAATTTCGACCTA GAGTACCTTTAGGTATTCGTCGTACTC C AGTACTTGTTACACTTGGTTTAACTGCAGATGCANAAGTAGTTCTAGTTGATCCTACTGCTCGTGAAGAACTTATCCTGACTGGTGGACGTGTAT] [+] EMBL CD078360 [ TGAAATCAGCTTTCGTTTCCCTCAGGGGAAAGATCCTAATGTTTCCGGTTGTTGTGTTGTTAAAATAGGCGCTACGACTGTAATGGCACAAGTTTCAGTTGAAGTAATTGAGCCTAAACATTTTCGCCCTTCTCAAGGAATGTTGTTTGTACACTTCGATGCTAGTATTTTAAAGTTATCTAAAACTCTATATCGTAAACA AAAACGTGATGATGAAGGTCGTCGTCTATCAGCTGTTCTCCAAACATTACTTCGAGATAGTATTGACTCGGATGCTCTGTGTATAGTTGCTTGGGAACGTGTATTTGCTGTACGAGTTGAATTACGTGCTTTATCTTATGATGGAAATTTAGGAGATTGTGGTACACCACCACCTGTTGCCGCTCTGGCAGCTTTTCCTCCACCAGATGTTTACGTTGATGATATGG GTAAAGTACTAGTCGATTTTGAGGCTAAATTTCGACCTA GAGTACCTTTAGGTATCCGACTCACTC C AGTACTTGNTACACTTGGTTTAACTGCAGATGCAAAAGTAGTTCTAGNTGATCCTACTGCTCGTGAAGAACTTATNCTGACTGGTGGACG ] [-] EMBL CD155080 [ AAGATCGTAATGTTTCCGGTTGTTGTGTTGTTAAAATAGGCGCTACGACTGTAATGGCACAAGTTTCAGTTGAAGTAATTGAGCCTAAACATTTTCGCCCTTCTCAAGGAATGTTGTTTGTACACTTCCATGCTAGTATTTTAAAGTTATCTAAAACTCTATATCGTAAACAGAGAGCGTGATGATGAAGGTCGTCGTCTATCAGCTGTTCTCCAAACATTACTTCGAGATAGTATTGACTTGGATGTTCTGTGTATAGTTGCTTGGGAACGTGTATATGCTGTACGAGATGAATTACGTGCTTTATCTTATGATGGAAATTTAGGAGATTGTGGTACATTAGCAGCTGTTGCCGCTCTGGCAGCTTTTCGTCGACCAGATGTTTCCGTTGATGATATGGCGTAAAGTACTAGTCGATTTAGAGGGTAAATTTGGACGTATGAGTACCTTTAGGTATTAGTAGTACTCACGAGTA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||