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Schistosoma mansoni
cluster # 7790 cluster # 7790       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7790#0 length = 594 sequences # 5  

consensusID : consensus_7790#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 594
fasta sequence
                              [CTATCAGAAACAAGAATTTGAATTTCCATTATTTAGGAAAGTGAGCCCGTTCACAATGAATACACCTAAAATCCAAAACCTTCAAACACTTGACAAAGTAAGTTGGGTGAGTACTTAAGAATTCCGATATATGGAATTACCTACAATTATTTTAATGACATATATAATAGCAAAG-ATTGTCTGAATGACCGATAAGGGATGATAAAGTTGCTTAAGCCTTGTAAAGCTTAGTAAGGAATAATTTACAAAGTTGAGTAGGGGGAAATCTTAATTATACTATGAAAACGTGACAAGTAAATCAGTATATTTAGCTGGAGACCGCAATGCAATAAGCAGACAACAGTTGGCATAAATAATTGTCGTAAACAAAGAGTAAAGTGGTAACAATGTCGATTAATTAACATGCAGATATGTACAGGTAATTCAACTAATAATTGATATACAATTGCAAATACAGAAAACCTTACAAAACAAGTGAACATTGAAATCTTTTTTAGGTGACTAATATTCGGAAAACACTACGGAAAACTGGCCGCCAAATCACAGAAGAATGT-TACAAGATGGATACCGAANAATCTTGGTTTGACTGTGAAC]

[+] EMBL CD088554             [CTATCAGAAACAAGAATTTGAATTTCCATTATTTAGGAAAGTGAGCCCGTTCAC ATGAATACACCTAAAATCCAAAACCCTCAAACACTTGACAAAGTAAGTTGGGTGAGTACTTAAGAATTCCGATATATGGAATTACCTACAATTATTTTAATGACATATATAATAGCAAAG ATTGTCTGAATGACCGATAAGGGATGATAAAGTTGCTTAAGCCTTGTAAAGCTTAGTAAGGAATAATTTACAAAGTTGAGTAGGGGGAAATCTTAATTATACTATGAAAACGTGACAAGTAAATCAGTATATTTAGCTGGAGACCGCAATGCAATAAGCAGACAACAGTTGGCATAAATAATTGTCGTAAACAAAGAGTAAAGTGGTAACAATGTCGATTAATTAACATGCAGATATGTACAGGTAATTCAACTAATAATTGATATACAATTGCAAATACAGAAAACCTTACAAAACAAGTGAACATTGAAATCTTTTTTAGGTGACTAATATTCGGAAAACACTACGGAAAACTGGCCGCCAAATCACAGAAGAATGT TACAAGATGGATACCGAANAATCTTGGTTTGACTGTGAAC]
[+] EMBL CD088520             [CTATCAGAAACAAGAATTTGAATTTCCATTATTTAGGAAAGTGAGCCCGTTCACAATGAATACACCTAAAATCCAAAACCTTCAAACACTTGACAAAGTAAGTTGGGTGAGTACTTAAGAATTCCGATATATGGAATTACCTACAATTATTTTAATGACATATATAATAGCAAAG ATTGTCTGAATGACCGATAAGGGATGATAAAGTTGCTTAAGCCTTGTAAAGCTTAGTAAGGAATAATTTACAAAGTTGAGTAGGGGGAAATCTTAATTATACTATGAAAACGTGACAAGTAAATCAGTATATTTAGCTGGAGACCGCAATGCAATAAGCAGACAACAGTTGGCATAAATAATTGTCGTAAACAAAGAGTAAAGTGGTAACAATGTCGATTAATTAACATGCAGATATGTACAGGTAATTCAACTAATAATTGATATACAATTGCAAATACAGAAGACCTTACAAAACAAGTGAACATTGAAATCTTTTTTAGGTGACTAATATTCGGAAAACACTACGGAAAACTGGCCGCCAAATCACAGAAGAATGT TACAAGATGGATACCGAA AATCTTGGTTT          ]
[+] EMBL CD088549             [CTATCAGAAACAAGAATTTGAATTTCCATTATTTAGGAAAGTGAGCCCGTTCACAATGAATACACCTAAAATCCAAAACCTTCAAACACTTGACAAAGTAAGTTGGGTGAGTACTTAAGAATTCCGATATATGGAATTACCTACAATTATTTTAATGACATATATAATAGCAAAG ATTGTCTGAATGACCGATAAGGGATGATAAAGTTGCTTAAGCCTTGTAAAGCTTAGTAAGGAATAATTTACAAAGTTGAGTAGGGGGAAATCTTAATTATACTATGAAAACGTGACAAGTAAATCAGTATATTTAGCTGGAGACCGCAATGCAATAAGCAGACAACAGTTGGCATAAATAATTGTCGTAAACAAAGAGTAAAGTGGTAACAATGTCGATTAATTAACATGCAGATATGTACAGGTAATTCAACTAATAATTGATATACAATTGCAAATACAGAAAACCTTACAAAACAAGTGAACATTGAAATCTTTTTTAGGTGACTAATATTCGGAAAACACTACGGAAAACTGGCCGCC AATCACAGAAG ATGT TAC AGATGGATA                           ]
[+] EMBL CD088586             [CTATCAGAAACAAGAATTTGAATTTCCATTATTTAGGAAAGTGAGCCCGTTCACAATGAATACACCTAAAATCCAAAACCTTCAAACACTTGACAAAGTAAGTTGGGTGAGTACTTAAGAATTCCGATATATGGAATTACCTACAATTATTTTAATGACATATATAATAGCAAAG ATTGTCTGAATGACCGATAAGGGATGATAAAGTTGCTTAAGCCTTGTAAAGCTTAGTAAGGAATAATTTACAAAGTTGAGTAGGGGGAAATCTTAATTATACTATGAAAACGTGACAAGTAAATCAGTATATTTAGCTGGAGACCGCAATGCAATAAGCAGACAACAGTTGGCATAAATAATTGTCGTAAACAAAGAGTAAAGTGGTAACAATGTCGATTAATTAACATGCAGATATGTACAGGTAATTCAACTAATAATTGATATACAATTGCAAATACAGAAAACCTTACAAAACAAGTAAACATTGAAATCTTTTTTAGGTGACTAATATTCGGANAACACTACGGANAACTGGCCGCC AATCACAGAAG ATGTNTACAg                                   ]
[+] EMBL CD088570             [                                                                                                                                                             ACATATATANTAGCAAAGAATTGTCTGAATGACCGATAAGGGATGATAAAGTTGCTTAAGCCTTGTAAAGCTTAGTAAGGAATAATTTACAAAGTTGAGTAGGGGGAAATCTTAATTATACTATGAAAACGTGACAAGTAAATCAGTATATTTAGCTGGAGACCGCAATGCAATAAGCAGACAACAGTTGGCATAAATAATTGTCGTAAACAAAGAGTAAAGTGGTAACAATGTCGATTAATTAACATGCAGATATGTACAGGTAATTCAACTAATAATTGATATACAATTGCAAATACAGAAAACCTTACANAACAAGTGAACATT                                                                                                                ]


>consensus_7790#0 CTATCAGAAACAAGAATTTGAATTTCCATTATTTAGGAAAGTGAGCCCGTTCACAATGAA TACACCTAAAATCCAAAACCTTCAAACACTTGACAAAGTAAGTTGGGTGAGTACTTAAGA ATTCCGATATATGGAATTACCTACAATTATTTTAATGACATATATAATAGCAAAGATTGT CTGAATGACCGATAAGGGATGATAAAGTTGCTTAAGCCTTGTAAAGCTTAGTAAGGAATA ATTTACAAAGTTGAGTAGGGGGAAATCTTAATTATACTATGAAAACGTGACAAGTAAATC AGTATATTTAGCTGGAGACCGCAATGCAATAAGCAGACAACAGTTGGCATAAATAATTGT CGTAAACAAAGAGTAAAGTGGTAACAATGTCGATTAATTAACATGCAGATATGTACAGGT AATTCAACTAATAATTGATATACAATTGCAAATACAGAAAACCTTACAAAACAAGTGAAC ATTGAAATCTTTTTTAGGTGACTAATATTCGGAAAACACTACGGAAAACTGGCCGCCAAA TCACAGAAGAATGTTACAAGATGGATACCGAANAATCTTGGTTTGACTGTGAAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)