These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7790#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 594 fasta sequence [CTATCAGAAACAAGAATTTGAATTTCCATTATTTAGGAAAGTGAGCCCGTTCACAATGAATACACCTAAAATCCAAAACCTTCAAACACTTGACAAAGTAAGTTGGGTGAGTACTTAAGAATTCCGATATATGGAATTACCTACAATTATTTTAATGACATATATAATAGCAAAG-ATTGTCTGAATGACCGATAAGGGATGATAAAGTTGCTTAAGCCTTGTAAAGCTTAGTAAGGAATAATTTACAAAGTTGAGTAGGGGGAAATCTTAATTATACTATGAAAACGTGACAAGTAAATCAGTATATTTAGCTGGAGACCGCAATGCAATAAGCAGACAACAGTTGGCATAAATAATTGTCGTAAACAAAGAGTAAAGTGGTAACAATGTCGATTAATTAACATGCAGATATGTACAGGTAATTCAACTAATAATTGATATACAATTGCAAATACAGAAAACCTTACAAAACAAGTGAACATTGAAATCTTTTTTAGGTGACTAATATTCGGAAAACACTACGGAAAACTGGCCGCCAAATCACAGAAGAATGT-TACAAGATGGATACCGAANAATCTTGGTTTGACTGTGAAC] [+] EMBL CD088554 [CTATCAGAAACAAGAATTTGAATTTCCATTATTTAGGAAAGTGAGCCCGTTCAC ATGAATACACCTAAAATCCAAAACCCTCAAACACTTGACAAAGTAAGTTGGGTGAGTACTTAAGAATTCCGATATATGGAATTACCTACAATTATTTTAATGACATATATAATAGCAAAG ATTGTCTGAATGACCGATAAGGGATGATAAAGTTGCTTAAGCCTTGTAAAGCTTAGTAAGGAATAATTTACAAAGTTGAGTAGGGGGAAATCTTAATTATACTATGAAAACGTGACAAGTAAATCAGTATATTTAGCTGGAGACCGCAATGCAATAAGCAGACAACAGTTGGCATAAATAATTGTCGTAAACAAAGAGTAAAGTGGTAACAATGTCGATTAATTAACATGCAGATATGTACAGGTAATTCAACTAATAATTGATATACAATTGCAAATACAGAAAACCTTACAAAACAAGTGAACATTGAAATCTTTTTTAGGTGACTAATATTCGGAAAACACTACGGAAAACTGGCCGCCAAATCACAGAAGAATGT TACAAGATGGATACCGAANAATCTTGGTTTGACTGTGAAC] [+] EMBL CD088520 [CTATCAGAAACAAGAATTTGAATTTCCATTATTTAGGAAAGTGAGCCCGTTCACAATGAATACACCTAAAATCCAAAACCTTCAAACACTTGACAAAGTAAGTTGGGTGAGTACTTAAGAATTCCGATATATGGAATTACCTACAATTATTTTAATGACATATATAATAGCAAAG ATTGTCTGAATGACCGATAAGGGATGATAAAGTTGCTTAAGCCTTGTAAAGCTTAGTAAGGAATAATTTACAAAGTTGAGTAGGGGGAAATCTTAATTATACTATGAAAACGTGACAAGTAAATCAGTATATTTAGCTGGAGACCGCAATGCAATAAGCAGACAACAGTTGGCATAAATAATTGTCGTAAACAAAGAGTAAAGTGGTAACAATGTCGATTAATTAACATGCAGATATGTACAGGTAATTCAACTAATAATTGATATACAATTGCAAATACAGAAGACCTTACAAAACAAGTGAACATTGAAATCTTTTTTAGGTGACTAATATTCGGAAAACACTACGGAAAACTGGCCGCCAAATCACAGAAGAATGT TACAAGATGGATACCGAA AATCTTGGTTT ] [+] EMBL CD088549 [CTATCAGAAACAAGAATTTGAATTTCCATTATTTAGGAAAGTGAGCCCGTTCACAATGAATACACCTAAAATCCAAAACCTTCAAACACTTGACAAAGTAAGTTGGGTGAGTACTTAAGAATTCCGATATATGGAATTACCTACAATTATTTTAATGACATATATAATAGCAAAG ATTGTCTGAATGACCGATAAGGGATGATAAAGTTGCTTAAGCCTTGTAAAGCTTAGTAAGGAATAATTTACAAAGTTGAGTAGGGGGAAATCTTAATTATACTATGAAAACGTGACAAGTAAATCAGTATATTTAGCTGGAGACCGCAATGCAATAAGCAGACAACAGTTGGCATAAATAATTGTCGTAAACAAAGAGTAAAGTGGTAACAATGTCGATTAATTAACATGCAGATATGTACAGGTAATTCAACTAATAATTGATATACAATTGCAAATACAGAAAACCTTACAAAACAAGTGAACATTGAAATCTTTTTTAGGTGACTAATATTCGGAAAACACTACGGAAAACTGGCCGCC AATCACAGAAG ATGT TAC AGATGGATA ] [+] EMBL CD088586 [CTATCAGAAACAAGAATTTGAATTTCCATTATTTAGGAAAGTGAGCCCGTTCACAATGAATACACCTAAAATCCAAAACCTTCAAACACTTGACAAAGTAAGTTGGGTGAGTACTTAAGAATTCCGATATATGGAATTACCTACAATTATTTTAATGACATATATAATAGCAAAG ATTGTCTGAATGACCGATAAGGGATGATAAAGTTGCTTAAGCCTTGTAAAGCTTAGTAAGGAATAATTTACAAAGTTGAGTAGGGGGAAATCTTAATTATACTATGAAAACGTGACAAGTAAATCAGTATATTTAGCTGGAGACCGCAATGCAATAAGCAGACAACAGTTGGCATAAATAATTGTCGTAAACAAAGAGTAAAGTGGTAACAATGTCGATTAATTAACATGCAGATATGTACAGGTAATTCAACTAATAATTGATATACAATTGCAAATACAGAAAACCTTACAAAACAAGTAAACATTGAAATCTTTTTTAGGTGACTAATATTCGGANAACACTACGGANAACTGGCCGCC AATCACAGAAG ATGTNTACAg ] [+] EMBL CD088570 [ ACATATATANTAGCAAAGAATTGTCTGAATGACCGATAAGGGATGATAAAGTTGCTTAAGCCTTGTAAAGCTTAGTAAGGAATAATTTACAAAGTTGAGTAGGGGGAAATCTTAATTATACTATGAAAACGTGACAAGTAAATCAGTATATTTAGCTGGAGACCGCAATGCAATAAGCAGACAACAGTTGGCATAAATAATTGTCGTAAACAAAGAGTAAAGTGGTAACAATGTCGATTAATTAACATGCAGATATGTACAGGTAATTCAACTAATAATTGATATACAATTGCAAATACAGAAAACCTTACANAACAAGTGAACATT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||