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Schistosoma mansoni
cluster # 7793 cluster # 7793       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7793#0 length = 1320 sequences # 5  

consensusID : consensus_7793#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1320
fasta sequence
                              [CATGCTACTGCAAAAAATAAGATCAATTCGGTTGATGATCTACTGAATTCTCCTATTGTTCTAGCAACTGTAGCAATTGCTGTCACCAATTATTTCAATGTTATGGAATCAGATGAAAAAACAGTTGAACATTGTGGTGTTCTGATTAAATTCCTACAGAAAAAGTTGTCTGATCGAATATCATCATCATCATCATTGTCTGTTGATTCGTCTATTGTTCATCATTTTACTTCAATTCACACTGTATATAACTATTTACGATCGTTGACATATTTAATTGATGAATTGTTACCATCTGATCGAAAATCCAATTGTTTAAGCTTTCTTCCGTCATGGATATTCTTTCCATCTGGACATTTATTTCATAGTCTTGCGATTGATATAGAATCACTTAAACCAGATGATAGATATCGTTTAACTTTACGCTATTGGCTCCCTCGCCTTTATCGTATTCCAAAGTTAAACGCTGAATTCGCAATGAAATTGCAAAAATTAGCTGAAATTTATGAACACGTAATAGGTATTGCAAGTGAGATGATACGTTTACCAGTATCTGCTCCAAATATTGTATATCAAAAGGTACCAACAACTATTCCTGTCATTGATTTGCTTAAAAATGAAATGCCTTCAAATCCCCCAAGTTCAGTTAGAACAACAAACACTGAAAAGAGCTTACAAGATAAATCAGAAGTCATCAAGAGATCACACTCTTCTATCAATATAAAGTCAGATGCCCCACTGTCTAAACCTAAACAATCATTAAATGCATTACCTATTCGTCATTACTCAGAGAAAGCACTTGTAACGTCTAAAAAACAATCTCGAAAATTACCTTATCACTTACGCTCTACTGGTTATGCCGCTCG-TTTACGTGCCAGGCTTGAAGAAACAGAATGAGATATCACCTATCTTTTTGTTGTTGTTGATT-ACTCTATCTTAGATTTGTCCATTTCCATCAACTACCGATTTTATTATGCCTTTCAAGTTAGAAATTATTCCGGTTATTTTCCATTTTCTGATTATATATTCCAAAATATCAGCATTTTTTA-TTGGAGAATATTAAGTTTTTGTTGCTGTGCTCATACTCCTATACCTTTCAACCAGCTTTTTTATTTAAAGTAAGTGTATCTCAGTTGAGCTGGAAACCCCTTGCTGTGAAAACATATCACTTAGTCTTTAAGGTTCCTAGTATTCTCTTGAAAACACAGATGAACTCGATGATGTGGGTAAAAATACCATTGAACACTTTACCGTTTATTTGAGTTCTGATCAACGTTATCTCAAGTATAATACTCCTATTTTCACACCTAAGTTTAATAA]

[+] EMBL CD113121             [CATGCTACTGCAAAAAATAAGATCAATTCGGTTGATGATCTACTGAATTCTCCTATTGTTCTAGCAACTGTAGCAATTGCTGTCACCAATTATTTCAATGTTATGGAATCAGATGAAAAAACAGTTGAACATTGTGGTGTTCTGATTAAATTCCTACAGAAAAAGTTGTCTGATCGAATATCATCATCATCATCATTGTCTGTTGATTCGTCTATTGTTCATCATTTTACTTCAATTCACACTGTATATAACTATTTACGATCGTTGACATATTTAATTGATGAATTGTTACCATCTGATCGAAAATCCAATTGTTTAAGCTTTCTTCCGTCATGGATATTCTTTCCATCTGGACATTAATTTCATAGTCTTGCGATTGATATAGAATCACTTAAACCAGATGATAGATATCGTTTAACTTTACGCTATTGGCTCCCTCGCCTTTATCGTATTCCAAAGTTAAACGCTGAATTCGCGATGAAATTGCAAAAATTAGCTGAAATTTATGAACACGTAATAGGTATTGCAAGTGAGATGATACATTTACCAGTATCTGCTCCAAATATTGTATATCAAAAGGTACCAACAACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD191739             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATCCAATTG TTAAGCTTTCTTCCGTCATGGATATTCTTTCCATCTGGACATTTATTTCATAGTCTTGCGATTGATATAGAATCACTTAAACCAGATGATAGATATCGTTTAACTTTACGCTATTGGCTCCCTCGCCTTTATCGTATTCCAAAGTTAAACGCTGAATTCGCAATGAAATTGCAAAAATTAGCTGAAATTTATGAACACGTAATAGGTATTGCAAGTGAGATGATACGTTTACCAGTATCTGCTCCAAATATTGTATATCAAAAGGTACCAACAACTATTCCTGTCATTGATTTGCTTAAAAATGAAATGCCTTCAAATCCCCCAAGTTCAGTTAGAACAACAAACACTGAAAAGAGCTTACAAGATAAATCAGAAGTCATCAAGAGATCACACTCTTCTATCAATATAAAGTCAGATGCCCCACTGTCTAAACCTAAACAATCATTAAATGCATTACCTATTCGTCATTACTCAGAGAAAGCACTTGTAACGTTTAAAAAACAATCTCGAAAATTACCTTATCACTTACGCTCTACTGGTTATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD191840             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CATGGATA TCTTCCCATCTGGACATTTATTTCATAGTCTTGCGATTGATATAGAATCACTTAAACCAGATGATAGATATCGTTTAACTTTACGCTATTGGCTCCCTCGCCTTTATCGTATTCCAAAGTTAAACGCTGAATTCGCAATGAAATTGCAAAAATTAGCTGAAATTTATGAACACGTAATAGGTATTGCAAGTGAGATGATACGTTTACCAGTATCTGCTCCAAATATTGTATATCAAAAGGTACCAACAACTATTCCTGTCATTGATTTGCTTAAAAATGAAATGCCTTCAAATCCCCCAAGTTCAGTTAGAACAACAAACACTGAAAAGAGCTTACAAGATAAATCAGAAGTCATCAAGAGATCACACTCTTCTATCAATATAAAGTCAGATGCCCCACTGTCTAAACCTAAACAATCATTAAATGCATTACCTATTCGTCATTACTCAGAGAAAGCACTTGTAACGTCTAAAAAACAATCTCGAAAATTACCTTATCACTTACGCTCTACTGGTTATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD178900             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTCAGATGCCCCACTGTCTAAACCTAAACAATCATTAAATGCATTACCTATTCGTCATTACTCAGAGAAAGCACTTGTAACGTCTAAAAAACAATCTCGAAAATTACCTTATCACTTACGCTCTACTGGTTATGCCGCTCG TTTACGTGCCAGGCTTGAAGAAACAGAATGAGATATCACCTATCTTTTTGTTGTTGTTGATT ACTCTATCTTAGATTTGTCCATTTCCATCAACTACCGATTTTATTATGCCTTTCAAGTTAGAAATTATTCCGGTTATTTTCCATTTTCTGATTATATATTCCAAAATATCAGCATTTTTTA TTGGAGAATATTAAGTTTTTGTTGCTGTGCTCA                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD111678             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ACCTTATCACTTACGCTCTACTGGTTATGCCGCTCGTTTTACGTGCCAGGCTTGAAGAAACAGAATGAGATATCACTTATCTTTTTGTTGTTGTTGATTAACTCTATCTTAGATTTGTCCATTTCCATTAACTACCGATTGTATTATGCCTTTCAAGTTAGAAATTATTCCGGTTATTTTCCATTGTCTGATGATATATGCCAAGATATCAGCATTTTTTATTTGGAGAATATTAAGTTTTTGTTGCTGTGCTCATACTCCTATACCTTTCAACCAGCTTTTTTATTTAAAGTAAGTGTATCTCAGTTGAGCTGGAAACCCCTTGCTGTGAAAACATATCACTTAGTCTTTAAGGTTCCTAGTATTCTCTTGAAAACACAGATGAACTCGATGATGTGGGTAAAAATACCATTGAACACTTTACCGTTTATTTGAGTTCTGATCAACGTTATCTCAAGTATAATACTCCTATTTTCACACCTAAGTTTAATAA]


>consensus_7793#0 CATGCTACTGCAAAAAATAAGATCAATTCGGTTGATGATCTACTGAATTCTCCTATTGTT CTAGCAACTGTAGCAATTGCTGTCACCAATTATTTCAATGTTATGGAATCAGATGAAAAA ACAGTTGAACATTGTGGTGTTCTGATTAAATTCCTACAGAAAAAGTTGTCTGATCGAATA TCATCATCATCATCATTGTCTGTTGATTCGTCTATTGTTCATCATTTTACTTCAATTCAC ACTGTATATAACTATTTACGATCGTTGACATATTTAATTGATGAATTGTTACCATCTGAT CGAAAATCCAATTGTTTAAGCTTTCTTCCGTCATGGATATTCTTTCCATCTGGACATTTA TTTCATAGTCTTGCGATTGATATAGAATCACTTAAACCAGATGATAGATATCGTTTAACT TTACGCTATTGGCTCCCTCGCCTTTATCGTATTCCAAAGTTAAACGCTGAATTCGCAATG AAATTGCAAAAATTAGCTGAAATTTATGAACACGTAATAGGTATTGCAAGTGAGATGATA CGTTTACCAGTATCTGCTCCAAATATTGTATATCAAAAGGTACCAACAACTATTCCTGTC ATTGATTTGCTTAAAAATGAAATGCCTTCAAATCCCCCAAGTTCAGTTAGAACAACAAAC ACTGAAAAGAGCTTACAAGATAAATCAGAAGTCATCAAGAGATCACACTCTTCTATCAAT ATAAAGTCAGATGCCCCACTGTCTAAACCTAAACAATCATTAAATGCATTACCTATTCGT CATTACTCAGAGAAAGCACTTGTAACGTCTAAAAAACAATCTCGAAAATTACCTTATCAC TTACGCTCTACTGGTTATGCCGCTCGTTTACGTGCCAGGCTTGAAGAAACAGAATGAGAT ATCACCTATCTTTTTGTTGTTGTTGATTACTCTATCTTAGATTTGTCCATTTCCATCAAC TACCGATTTTATTATGCCTTTCAAGTTAGAAATTATTCCGGTTATTTTCCATTTTCTGAT TATATATTCCAAAATATCAGCATTTTTTATTGGAGAATATTAAGTTTTTGTTGCTGTGCT CATACTCCTATACCTTTCAACCAGCTTTTTTATTTAAAGTAAGTGTATCTCAGTTGAGCT GGAAACCCCTTGCTGTGAAAACATATCACTTAGTCTTTAAGGTTCCTAGTATTCTCTTGA AAACACAGATGAACTCGATGATGTGGGTAAAAATACCATTGAACACTTTACCGTTTATTT GAGTTCTGATCAACGTTATCTCAAGTATAATACTCCTATTTTCACACCTAAGTTTAATAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)