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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7793#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1320 fasta sequence
[CATGCTACTGCAAAAAATAAGATCAATTCGGTTGATGATCTACTGAATTCTCCTATTGTTCTAGCAACTGTAGCAATTGCTGTCACCAATTATTTCAATGTTATGGAATCAGATGAAAAAACAGTTGAACATTGTGGTGTTCTGATTAAATTCCTACAGAAAAAGTTGTCTGATCGAATATCATCATCATCATCATTGTCTGTTGATTCGTCTATTGTTCATCATTTTACTTCAATTCACACTGTATATAACTATTTACGATCGTTGACATATTTAATTGATGAATTGTTACCATCTGATCGAAAATCCAATTGTTTAAGCTTTCTTCCGTCATGGATATTCTTTCCATCTGGACATTTATTTCATAGTCTTGCGATTGATATAGAATCACTTAAACCAGATGATAGATATCGTTTAACTTTACGCTATTGGCTCCCTCGCCTTTATCGTATTCCAAAGTTAAACGCTGAATTCGCAATGAAATTGCAAAAATTAGCTGAAATTTATGAACACGTAATAGGTATTGCAAGTGAGATGATACGTTTACCAGTATCTGCTCCAAATATTGTATATCAAAAGGTACCAACAACTATTCCTGTCATTGATTTGCTTAAAAATGAAATGCCTTCAAATCCCCCAAGTTCAGTTAGAACAACAAACACTGAAAAGAGCTTACAAGATAAATCAGAAGTCATCAAGAGATCACACTCTTCTATCAATATAAAGTCAGATGCCCCACTGTCTAAACCTAAACAATCATTAAATGCATTACCTATTCGTCATTACTCAGAGAAAGCACTTGTAACGTCTAAAAAACAATCTCGAAAATTACCTTATCACTTACGCTCTACTGGTTATGCCGCTCG-TTTACGTGCCAGGCTTGAAGAAACAGAATGAGATATCACCTATCTTTTTGTTGTTGTTGATT-ACTCTATCTTAGATTTGTCCATTTCCATCAACTACCGATTTTATTATGCCTTTCAAGTTAGAAATTATTCCGGTTATTTTCCATTTTCTGATTATATATTCCAAAATATCAGCATTTTTTA-TTGGAGAATATTAAGTTTTTGTTGCTGTGCTCATACTCCTATACCTTTCAACCAGCTTTTTTATTTAAAGTAAGTGTATCTCAGTTGAGCTGGAAACCCCTTGCTGTGAAAACATATCACTTAGTCTTTAAGGTTCCTAGTATTCTCTTGAAAACACAGATGAACTCGATGATGTGGGTAAAAATACCATTGAACACTTTACCGTTTATTTGAGTTCTGATCAACGTTATCTCAAGTATAATACTCCTATTTTCACACCTAAGTTTAATAA]
[+] EMBL CD113121 [CATGCTACTGCAAAAAATAAGATCAATTCGGTTGATGATCTACTGAATTCTCCTATTGTTCTAGCAACTGTAGCAATTGCTGTCACCAATTATTTCAATGTTATGGAATCAGATGAAAAAACAGTTGAACATTGTGGTGTTCTGATTAAATTCCTACAGAAAAAGTTGTCTGATCGAATATCATCATCATCATCATTGTCTGTTGATTCGTCTATTGTTCATCATTTTACTTCAATTCACACTGTATATAACTATTTACGATCGTTGACATATTTAATTGATGAATTGTTACCATCTGATCGAAAATCCAATTGTTTAAGCTTTCTTCCGTCATGGATATTCTTTCCATCTGGACATTAATTTCATAGTCTTGCGATTGATATAGAATCACTTAAACCAGATGATAGATATCGTTTAACTTTACGCTATTGGCTCCCTCGCCTTTATCGTATTCCAAAGTTAAACGCTGAATTCGCGATGAAATTGCAAAAATTAGCTGAAATTTATGAACACGTAATAGGTATTGCAAGTGAGATGATACATTTACCAGTATCTGCTCCAAATATTGTATATCAAAAGGTACCAACAACT ]
[-] EMBL CD191739 [ ATCCAATTG TTAAGCTTTCTTCCGTCATGGATATTCTTTCCATCTGGACATTTATTTCATAGTCTTGCGATTGATATAGAATCACTTAAACCAGATGATAGATATCGTTTAACTTTACGCTATTGGCTCCCTCGCCTTTATCGTATTCCAAAGTTAAACGCTGAATTCGCAATGAAATTGCAAAAATTAGCTGAAATTTATGAACACGTAATAGGTATTGCAAGTGAGATGATACGTTTACCAGTATCTGCTCCAAATATTGTATATCAAAAGGTACCAACAACTATTCCTGTCATTGATTTGCTTAAAAATGAAATGCCTTCAAATCCCCCAAGTTCAGTTAGAACAACAAACACTGAAAAGAGCTTACAAGATAAATCAGAAGTCATCAAGAGATCACACTCTTCTATCAATATAAAGTCAGATGCCCCACTGTCTAAACCTAAACAATCATTAAATGCATTACCTATTCGTCATTACTCAGAGAAAGCACTTGTAACGTTTAAAAAACAATCTCGAAAATTACCTTATCACTTACGCTCTACTGGTTATG ]
[-] EMBL CD191840 [ CATGGATA TCTTCCCATCTGGACATTTATTTCATAGTCTTGCGATTGATATAGAATCACTTAAACCAGATGATAGATATCGTTTAACTTTACGCTATTGGCTCCCTCGCCTTTATCGTATTCCAAAGTTAAACGCTGAATTCGCAATGAAATTGCAAAAATTAGCTGAAATTTATGAACACGTAATAGGTATTGCAAGTGAGATGATACGTTTACCAGTATCTGCTCCAAATATTGTATATCAAAAGGTACCAACAACTATTCCTGTCATTGATTTGCTTAAAAATGAAATGCCTTCAAATCCCCCAAGTTCAGTTAGAACAACAAACACTGAAAAGAGCTTACAAGATAAATCAGAAGTCATCAAGAGATCACACTCTTCTATCAATATAAAGTCAGATGCCCCACTGTCTAAACCTAAACAATCATTAAATGCATTACCTATTCGTCATTACTCAGAGAAAGCACTTGTAACGTCTAAAAAACAATCTCGAAAATTACCTTATCACTTACGCTCTACTGGTTATG ]
[+] EMBL CD178900 [ GTCAGATGCCCCACTGTCTAAACCTAAACAATCATTAAATGCATTACCTATTCGTCATTACTCAGAGAAAGCACTTGTAACGTCTAAAAAACAATCTCGAAAATTACCTTATCACTTACGCTCTACTGGTTATGCCGCTCG TTTACGTGCCAGGCTTGAAGAAACAGAATGAGATATCACCTATCTTTTTGTTGTTGTTGATT ACTCTATCTTAGATTTGTCCATTTCCATCAACTACCGATTTTATTATGCCTTTCAAGTTAGAAATTATTCCGGTTATTTTCCATTTTCTGATTATATATTCCAAAATATCAGCATTTTTTA TTGGAGAATATTAAGTTTTTGTTGCTGTGCTCA ]
[-] EMBL CD111678 [ ACCTTATCACTTACGCTCTACTGGTTATGCCGCTCGTTTTACGTGCCAGGCTTGAAGAAACAGAATGAGATATCACTTATCTTTTTGTTGTTGTTGATTAACTCTATCTTAGATTTGTCCATTTCCATTAACTACCGATTGTATTATGCCTTTCAAGTTAGAAATTATTCCGGTTATTTTCCATTGTCTGATGATATATGCCAAGATATCAGCATTTTTTATTTGGAGAATATTAAGTTTTTGTTGCTGTGCTCATACTCCTATACCTTTCAACCAGCTTTTTTATTTAAAGTAAGTGTATCTCAGTTGAGCTGGAAACCCCTTGCTGTGAAAACATATCACTTAGTCTTTAAGGTTCCTAGTATTCTCTTGAAAACACAGATGAACTCGATGATGTGGGTAAAAATACCATTGAACACTTTACCGTTTATTTGAGTTCTGATCAACGTTATCTCAAGTATAATACTCCTATTTTCACACCTAAGTTTAATAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||