cluster # 7797

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Schistosoma mansoni
cluster # 7797 cluster # 7797 Sequences # 5 consensus # 2

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consensus_7797#0 length = 1256 sequences # 4

consensus_7797#1 length = 533 sequences # 1

consensusID : consensus_7797#0
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NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1256
fasta sequence

                              [ACTTTACGCGGACATAGTAAGAGCTACAAATCGAGATGAACGTACCACATACATTATTGTACTACTACTTACTCGTCAAATTGGTCTCATTTTTGGTCCTTCGTTTACACTAATGATGGCTAAAATGGATTATCGTGTAGCAAACTTTGCACTCAACGTCTACAATGGGCCTGGGCTTCTAATGGCAATATTATGGCTTTTACACTCATTTATTATATTTTTCTCATATCCAAATGTTGATAAAAATGGTAGAGTTATTTATAATAATGGTCAACGGTCCTGTTGCGACCGCGATAATTGGATACAGTCTAATGAACAAGCGAAGGAGGATTCTCGACCAATGCTTAGTGATTCTACTGATTCGCTAAACTCTGGTCGGTTTAGTACTGCTGTTATAAACAATTCTTTACGACATTACCTATCGTTTAATATAATTGCTCTTTACTGTGTAAATTTCGCAGCATACTTCAGCTTTATGAGCTTAGAAGCAGCATTACCACCGGTAGCTAATCGTGTATTTCAATGGACTGAAGTGGAAACGAGCTATGTATATCTTGCTGCAAGCATTCTGATTATCTTCGTGGTAATATTGCTACGTATTCTTAATCAATTTTATACGGATCGTGTCTTACTATTAGCAGGTCTTGTTACTATGGTGATTTCTTACTTGTGGTTGACAGTAACAGTTTATTTACTTTCTGAAATCCCTTTACGAATGAGTATTCCTTTAACGCTCACAGGTATAGCAATACATGTACTTGGAATACCTTTCACATATGCTTATTCAG-AATCGTTGTACACAAAACTTGCTCCAGTTTCTGATATGGATCGAGCACAAACTATTTTCCGTACTGTTATAAATGTAGCCTTCTTGGTTGGACCCTATGTTGGGAGGTTCTTTAATTGGATATCCAACTTTTAG-GTTCCTATCCATGTTTCTATTGTCGAGTTTCCCTACGTTACTCGTTGCTTGTCGATTCAAAGATTTCATTGTCAATGATAGACCTAATTCACCAAGTGAATTGGAGATAGCAAAAGAAAGCTAGTAGCTTATATATGAGCGATCTAATCATATGTCTTTCGTATTCATTGCACAGATTACTGTAAAAAATGATTCTCCTAATCACTTTACTGGACTTAATGTTCATGGTTATGAATCAAGGGGACATTGGTCGTTTTAATAATTCATTCTTAAGGTTTGTTTTACAGACTACTATCTTTGTAAATTAATCATTCTTTATTAATATGAATCATAT]

[-] EMBL CD190687             [ACTTTACGCGGACATAGTAAGAGCTACAAATCGAGATGAACGTACCACATACATTATTGTACTACTACTTACTCGTCAAATTGGTCTCATTTTTGGTCCTTCGTTTACACTAATGATGGCTAAAATGGATTATCGTGTAGCAAACTTTGCACTCAACGTCTACAATGGGCCTGGGCTTCTAATGGCAATATTATGGCTTTTACACTCATTTATTATATTTTTCTCATATCCAAATGTTGATAAAAATGGTAGAGTTATTTATAATAATGGTCAACGGTCCTGTTGCGACCGCGATAATTGGATACAGTCTAATGAACAAGCGAAGGAGGATTCTCGACCAATGCTTAGTGATTCTACTGATTCGCTAAACTCTGGTCGGTTTAGTACTGCTGTTATAAACAATTCTTTACGACATTACCTATCGTTTAATATAATTGCTCTTTACTGTGTAAATTTCGCAGCATACTTCAGCTTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BF936570             [                                                                                                                                                                                                                                                                          ATGGTCAACGGTCCTGTTGCGACCGCGATAATTGGATACAGTCTAATGAACAAGCGAAGGAGGATTCTCGACCAATGCTTAGTGATTCTACTGATTCGCTAAACTCTGGTCGGTTTAGTACTGCTGTTATAAACAATTCTTTACGACATTACCTATCGTTTAATATAATTGCTCTTTACTGTGTAAATTTCGCAGCATACTTCAGCTTTATGAGCTTAGAAGCAGCATTACCACCGGTAGCTAATCGTGTATTTCAATGGACTGAAGTGGAAACGAGCTATGTATATCTTGCTGCAAGCATTCTGATTATCTTCGTGGTAATATTGCTACGTATTCTTAATCAATTTTATACGGATCGTGTCTTACTATTAGCAGGTCTTGTTACTATGGTGATTTCTTACTTGTGGTTGACAGTAACAGTTTATTTACTTTCTGAAATCCCTTTACGAATGAGTATTCCTTTAACGCTCACAGGTATAGCAATACATGTACTTGGAATACCTTTCACATATGCTTATTCAGAAATCGTTGTACACAAAACTTGCTCCAGTTTCTGATATGGATCGAGCACAAACTATTTTCCGTACTGTTATAAATGTAGCCTTCTTGGTTGGACCCTATGTTGGGAGGTTCTTTAATTGGATATCCAACTTTTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD160278             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTCTTTACGACATTACCTATCGTTTAATATAATTGCTCTTTACTGTGTAAATTTCGCAGCATACTTCAGCTTTATGAGCTTAGAAGCAGCATTACCACCGGTAGCTAATCGTGTATTTCAATGGACTGAAGTGGAAACGAGCTATGTATATCTTGCTGCAAGCATTCTGATTATCTTCGTGGTAATATTGCTACGTATTCTTAATCAATGATATACGGATCGTGTCTTACTATTAGCAGGTCTTGTTACTATGGTGATTTCTTACTTGTGGTTGACAGTAACAGTTTATTTACTTTCTGAAATCCCTTTACGAATGAGTATTCCTTTAACGCTCACAGGTATAGCAATACATGTACTTGGAATACCTTTCACATATGCTTATTCAG AATCGTTGTACACAAAACTTGCTCCAGTTTCTGATATGGATCGAGCACAAACTATTTTCCGTACTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD075292             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACAGGTATAGCAATACATGTACTTGGAATACCTTTCACATATGCTTATTCAG AATCGTTGTACACAAAACTTGCTCCAGTTTCTGATATGGATCGAGCACAAACTATTTTCCGTACTGTTATAAATGTAGCCTTCTTGGTTGGACCCTATGTT GGAGGTTCTTTAATTGGATATCCAAC TTTAGTGTTCCTATCCATGTTTCTATTGTCGAGTTTCCCTACGTTACTCGTTGCTTGTCGATTCAAAGATTTCATTGTCAATGATAGACCTAATTCACCAAGTGAATTGGAGATAGCAAAAGAAAGCTAGTAGCTTATATATGAGCGATCTAATCATATGTCTTTCGTATTCATTGCACAGATTACTGTAAAAAATGATTCTCCTAATCACTTTACTGGACTTAATGTTCATGGTTATGAATCAAGGGGACATTGGTCGTTTTAATAATTCATTCTTAAGGTTTGTTTTACAGACTACTATCTTTGTAAATTAATCATTCTTTATTAATATGAATCATAT]




>consensus_7797#0
ACTTTACGCGGACATAGTAAGAGCTACAAATCGAGATGAACGTACCACATACATTATTGT
ACTACTACTTACTCGTCAAATTGGTCTCATTTTTGGTCCTTCGTTTACACTAATGATGGC
TAAAATGGATTATCGTGTAGCAAACTTTGCACTCAACGTCTACAATGGGCCTGGGCTTCT
AATGGCAATATTATGGCTTTTACACTCATTTATTATATTTTTCTCATATCCAAATGTTGA
TAAAAATGGTAGAGTTATTTATAATAATGGTCAACGGTCCTGTTGCGACCGCGATAATTG
GATACAGTCTAATGAACAAGCGAAGGAGGATTCTCGACCAATGCTTAGTGATTCTACTGA
TTCGCTAAACTCTGGTCGGTTTAGTACTGCTGTTATAAACAATTCTTTACGACATTACCT
ATCGTTTAATATAATTGCTCTTTACTGTGTAAATTTCGCAGCATACTTCAGCTTTATGAG
CTTAGAAGCAGCATTACCACCGGTAGCTAATCGTGTATTTCAATGGACTGAAGTGGAAAC
GAGCTATGTATATCTTGCTGCAAGCATTCTGATTATCTTCGTGGTAATATTGCTACGTAT
TCTTAATCAATTTTATACGGATCGTGTCTTACTATTAGCAGGTCTTGTTACTATGGTGAT
TTCTTACTTGTGGTTGACAGTAACAGTTTATTTACTTTCTGAAATCCCTTTACGAATGAG
TATTCCTTTAACGCTCACAGGTATAGCAATACATGTACTTGGAATACCTTTCACATATGC
TTATTCAGAATCGTTGTACACAAAACTTGCTCCAGTTTCTGATATGGATCGAGCACAAAC
TATTTTCCGTACTGTTATAAATGTAGCCTTCTTGGTTGGACCCTATGTTGGGAGGTTCTT
TAATTGGATATCCAACTTTTAGGTTCCTATCCATGTTTCTATTGTCGAGTTTCCCTACGT
TACTCGTTGCTTGTCGATTCAAAGATTTCATTGTCAATGATAGACCTAATTCACCAAGTG
AATTGGAGATAGCAAAAGAAAGCTAGTAGCTTATATATGAGCGATCTAATCATATGTCTT
TCGTATTCATTGCACAGATTACTGTAAAAAATGATTCTCCTAATCACTTTACTGGACTTA
ATGTTCATGGTTATGAATCAAGGGGACATTGGTCGTTTTAATAATTCATTCTTAAGGTTT
GTTTTACAGACTACTATCTTTGTAAATTAATCATTCTTTATTAATATGAATCATAT

consensusID : consensus_7797#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 533
fasta sequence

                              [AGATTCGGCACGAGGACAATGGTAGAGTTATTTATAATAATGGTCAACTGTCCTGTTGCGACCGCGATAATTGGATACAGTCTAATGAACAAGCGAAGGAGGATTCTCGACCAATGCTTAGCGATTCTACTGATTCGCTAAACTCTGGTCGGTTTAGTACTGCTGTTATAAACAATTCTTTACGACATTACCTATCGTTTAATATAATTGCTCCTTACTGTGTAAATTTCGCAGCATACTTCAGCTTTATGAGCTTAGAAGCAGCATTACCACCGGTAGCTAATCGTGTATTTCAATGGACTGAAGTGGAAACGAGCTATGTATATCTTGCTGCAAGCATTCTGATTATCTTCGTGGTAATATTGCTACGTATTCTTAATCAATTTTATACGGATCGTGTCTTACTATTAGCAGGTCTTGTTACTATGGTGATTTCTTACTTGTGGTTGACAGTAACAGTTTATTTACTTTCTGAAATCCCTTTACGAATGAGTATTCCTTTAACGCTCACAGGTATAGCAATACATGTACTT]

[+] EMBL CD081467             [AGATTCGGCACGAGGACAATGGTAGAGTTATTTATAATAATGGTCAACTGTCCTGTTGCGACCGCGATAATTGGATACAGTCTAATGAACAAGCGAAGGAGGATTCTCGACCAATGCTTAGCGATTCTACTGATTCGCTAAACTCTGGTCGGTTTAGTACTGCTGTTATAAACAATTCTTTACGACATTACCTATCGTTTAATATAATTGCTCCTTACTGTGTAAATTTCGCAGCATACTTCAGCTTTATGAGCTTAGAAGCAGCATTACCACCGGTAGCTAATCGTGTATTTCAATGGACTGAAGTGGAAACGAGCTATGTATATCTTGCTGCAAGCATTCTGATTATCTTCGTGGTAATATTGCTACGTATTCTTAATCAATTTTATACGGATCGTGTCTTACTATTAGCAGGTCTTGTTACTATGGTGATTTCTTACTTGTGGTTGACAGTAACAGTTTATTTACTTTCTGAAATCCCTTTACGAATGAGTATTCCTTTAACGCTCACAGGTATAGCAATACATGTACTT]




>consensus_7797#1
AGATTCGGCACGAGGACAATGGTAGAGTTATTTATAATAATGGTCAACTGTCCTGTTGCG
ACCGCGATAATTGGATACAGTCTAATGAACAAGCGAAGGAGGATTCTCGACCAATGCTTA
GCGATTCTACTGATTCGCTAAACTCTGGTCGGTTTAGTACTGCTGTTATAAACAATTCTT
TACGACATTACCTATCGTTTAATATAATTGCTCCTTACTGTGTAAATTTCGCAGCATACT
TCAGCTTTATGAGCTTAGAAGCAGCATTACCACCGGTAGCTAATCGTGTATTTCAATGGA
CTGAAGTGGAAACGAGCTATGTATATCTTGCTGCAAGCATTCTGATTATCTTCGTGGTAA
TATTGCTACGTATTCTTAATCAATTTTATACGGATCGTGTCTTACTATTAGCAGGTCTTG
TTACTATGGTGATTTCTTACTTGTGGTTGACAGTAACAGTTTATTTACTTTCTGAAATCC
CTTTACGAATGAGTATTCCTTTAACGCTCACAGGTATAGCAATACATGTACTT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_7797#0      ACTTTACGCGGACATAGTAAGAGCTACAAATCGAGATGAACGTACCACATACATTATTGT 60
consensus_7797#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7797#0      ACTACTACTTACTCGTCAAATTGGTCTCATTTTTGGTCCTTCGTTTACACTAATGATGGC 120
consensus_7797#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7797#0      TAAAATGGATTATCGTGTAGCAAACTTTGCACTCAACGTCTACAATGGGCCTGGGCTTCT 180
consensus_7797#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7797#0      AATGGCAATATTATGGCTTTTACACTCATTTATTATATTTTTCTCATATCCAAATGTTGA 240
consensus_7797#1      ---------------------------------------------AGATTCGGCA--CGA 13
                                                                   * ** *       **

consensus_7797#0      TAAAAATGGTAGAGTTATTTATAATAATGGTCAACGGTCCTGTTGCGACCGCGATAATTG 300
consensus_7797#1      GGACAATGGTAGAGTTATTTATAATAATGGTCAACTGTCCTGTTGCGACCGCGATAATTG 73
                        * ******************************* ************************

consensus_7797#0      GATACAGTCTAATGAACAAGCGAAGGAGGATTCTCGACCAATGCTTAGTGATTCTACTGA 360
consensus_7797#1      GATACAGTCTAATGAACAAGCGAAGGAGGATTCTCGACCAATGCTTAGCGATTCTACTGA 133
                      ************************************************ ***********

consensus_7797#0      TTCGCTAAACTCTGGTCGGTTTAGTACTGCTGTTATAAACAATTCTTTACGACATTACCT 420
consensus_7797#1      TTCGCTAAACTCTGGTCGGTTTAGTACTGCTGTTATAAACAATTCTTTACGACATTACCT 193
                      ************************************************************

consensus_7797#0      ATCGTTTAATATAATTGCTCTTTACTGTGTAAATTTCGCAGCATACTTCAGCTTTATGAG 480
consensus_7797#1      ATCGTTTAATATAATTGCTCCTTACTGTGTAAATTTCGCAGCATACTTCAGCTTTATGAG 253
                      ******************** ***************************************

consensus_7797#0      CTTAGAAGCAGCATTACCACCGGTAGCTAATCGTGTATTTCAATGGACTGAAGTGGAAAC 540
consensus_7797#1      CTTAGAAGCAGCATTACCACCGGTAGCTAATCGTGTATTTCAATGGACTGAAGTGGAAAC 313
                      ************************************************************

consensus_7797#0      GAGCTATGTATATCTTGCTGCAAGCATTCTGATTATCTTCGTGGTAATATTGCTACGTAT 600
consensus_7797#1      GAGCTATGTATATCTTGCTGCAAGCATTCTGATTATCTTCGTGGTAATATTGCTACGTAT 373
                      ************************************************************

consensus_7797#0      TCTTAATCAATTTTATACGGATCGTGTCTTACTATTAGCAGGTCTTGTTACTATGGTGAT 660
consensus_7797#1      TCTTAATCAATTTTATACGGATCGTGTCTTACTATTAGCAGGTCTTGTTACTATGGTGAT 433
                      ************************************************************

consensus_7797#0      TTCTTACTTGTGGTTGACAGTAACAGTTTATTTACTTTCTGAAATCCCTTTACGAATGAG 720
consensus_7797#1      TTCTTACTTGTGGTTGACAGTAACAGTTTATTTACTTTCTGAAATCCCTTTACGAATGAG 493
                      ************************************************************

consensus_7797#0      TATTCCTTTAACGCTCACAGGTATAGCAATACATGTACTTGGAATACCTTTCACATATGC 780
consensus_7797#1      TATTCCTTTAACGCTCACAGGTATAGCAATACATGTACTT-------------------- 533
                      ****************************************                    

consensus_7797#0      TTATTCAGAATCGTTGTACACAAAACTTGCTCCAGTTTCTGATATGGATCGAGCACAAAC 840
consensus_7797#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7797#0      TATTTTCCGTACTGTTATAAATGTAGCCTTCTTGGTTGGACCCTATGTTGGGAGGTTCTT 900
consensus_7797#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7797#0      TAATTGGATATCCAACTTTTAGGTTCCTATCCATGTTTCTATTGTCGAGTTTCCCTACGT 960
consensus_7797#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7797#0      TACTCGTTGCTTGTCGATTCAAAGATTTCATTGTCAATGATAGACCTAATTCACCAAGTG 1020
consensus_7797#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7797#0      AATTGGAGATAGCAAAAGAAAGCTAGTAGCTTATATATGAGCGATCTAATCATATGTCTT 1080
consensus_7797#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7797#0      TCGTATTCATTGCACAGATTACTGTAAAAAATGATTCTCCTAATCACTTTACTGGACTTA 1140
consensus_7797#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7797#0      ATGTTCATGGTTATGAATCAAGGGGACATTGGTCGTTTTAATAATTCATTCTTAAGGTTT 1200
consensus_7797#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7797#0      GTTTTACAGACTACTATCTTTGTAAATTAATCATTCTTTATTAATATGAATCATAT 1256
consensus_7797#1      --------------------------------------------------------