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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7804#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 827 fasta sequence
[ATGAACTTGTCGATGATAATATTCGTTACAATTTGGCTGATCCGTTGTTGGACACAGTGGCAGCGCACTGGGAGTTGAATTTTTGTCGCATTTATTCAGTAATATCTTTACGTGTACGATGATAATGATGTTTCCGTTGTCGTGAATTAGCTGGGGCATTAATATTATTACTAGTTAATAAATCAGAAACAGGAATATTAGACAATTCAGTAGTATCTGGTTGACTAGTAGTATTAGTAGTAGTAGTAGTACTGATATACTCGGCAGATTTAGGGATTGATGACGTATTACTTAAATTCAACGTCTTTATCTCGTCCGTTACAGTATTATTCATCGGTTGGTTTGTCTTACTAGTAGCATATCTTTTATATAGTTTAGCACGTGGATTTTGTTGAATTGAAGCAGAATACGGAACTAGTTCCTTAACAGTACCAACAGCTTTTGTTTTACCTTCACGAAATATTAAACGTAGACCAGTGTACAAATATTCAGGAGATTTAATAAAACGAAATACAACCATATCTTTATCACCAGTTCGTAAACGTTCATGTGAATTTAATTTTAATATTGTTGCAGTTTGACGTACAGGACCAGCATGAACCATAGCTTGATAACCAACTGATATAGTTGTAGGATGATGTAAAATTAATACTTCAGCAATAAATTCAATACATGCTTTTGGTTTAGATTCTGGTGCTAACAATACCATACCTTTACGAACTTGATTACGTCGAAGTTTTTTCAATGCAAATGATGCAGTTTGTCCACCACGTACATAATTCACTGATAAACGTTTACGTTGTATACTTTTAATTGATATCGGATTA]
[+] EMBL CD095364 [ATGAACTTGTCGATGATAATATTCGTTACAATTTGGCTGATCCGTTGTTGGACACAGTGGCAGCGCACTGGGAGTTGAATTTTTGTCGCATTTATTCAGTAATATCTTTACGTGTACGATGATAATGATGTTTCCGTTGTCGTGAATTAGCTGGGGCATTAATATTATTACTAGTTAATAAATCAGAAACAGGAATATTAGACAATTCAGTAGTATCTGGTTGACTAGTAGTATTAGTAGTAGTAGTAGTACTGATATACTCGGCAGATTTAGGGATTGATGACGTATTACTTAAATTCAACGTCTTTATCTCGTCCGTTACAGTATTATTCATCGGTTGGTTTGTCTTACTAGTAGCATATCTTTTATATAGTTTAGCACGTGGATTTTGTTGAATTGAAGCAGAATACGGAACTAGTTCCTTAACAGTACCAACAGCTTTTGTTTTACCTTCACGAAATATTAAACGTAGACCAGTGTACAAATATTCAGGAGATTTAATAAAACGAAATACAACCATATCTTTATCACCAGTTCGTAAACGTTCATGTG ]
[+] EMBL CD145447 [ GTGGCAGCGCACTGGGAGTTGAATTTTTGTCGCATTTATTCAGTAATATCTTTACGTGTACGATGATAATGATGTTTCCGTTGTTGTGAATTAGCTGGGGCATTAATATTATTACTAGTTAATAAATCAGAAACAGGAATATTAGACAATTCAGTAGTATCTGGTTGACTAGTAGTATTAGTAGTAGTAGTAGTACTGATATACTCGGTAGATTTAGGGATTGATGACGTATTACTTAAATTCAACGTCTTTATCTCGTCCGTTACAGTATTATTCATCGGTTGGTTTGTCTTACTAGTAGCATATCTTTTATATAGTTTAGCACGTGGATTTTGTTGAATTGAAGCAGAATACGGAACTAGTTCC ]
[-] EMBL CD188549 [ TTTGTCGCATTTATTCAGTAATATCTTTACGTGTACGATGATAATGATGTTTCCGTTGTCGTGAATTAGCTGGGGCATTAATATTATTACTAGTTAATAAATCAGAAACAGGAATATTAGACAATTCAGTAGTATCTGGTTGACTAGTA ]
[-] EMBL CD202212 [ GAATTAGCTGGGGCATTAATATTATTACTAGTTAATAAATCAGAAACAGGAATATTAGACAATTCAGTAGTATCTGGTTGACTAGTAGTATTAGTAGTAGTAGTAGTACTGATATACTCGGCAGATTTAGGGATTGATGACGTATTACTTAAATTCAACGTCTTTATCTCGTCCGTTACAGTATTATTCATCGGTTGGTTTGTCTTACTAGTAGCATATCTTTTATATAGTTTAGCACGTGGATTTTGTTGAATTGAAGCAGAATACGGAACTAGTTCCT ]
[+] EMBL CD066584 [ ATAAAACGAAATACAACCATATCTCTATCACCAGTTCGTAAACGTTCATGTGAATTTAATTTTAATATTGTTGCAGTTTGACGTACAGGACCAGCATGAACCATAGCTTGATAACCAACTGATATAGTTGTAGGATGATGTAAAATTAATACTTCAGCAATAAATTCAATACATGCTTTTGGTTTAGATTCTGGTGCTAACAATACCATACCTTTACGAACTTGATTACGTCGAAGTTTTTTCAATGCAAATGATGCAGTTTGTCCACCACGTACATAATTCACTGATAAACGTTTACGTTGTATACTTTTAATTGATATCGGATTA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||