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Schistosoma mansoni
cluster # 7807 cluster # 7807       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7807#0 length = 980 sequences # 5  
consensusID : consensus_7807#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 980
fasta sequence 
                              [TGATTTCGCAATGTACAAAATGGATCATGAGAAATGTGAATCTATCTTGAAAGGTTTCAAACTGTACGTATTTGTTAAATCAAAATAACTATTCTAGAAATTGGATGAACTTGCGTGATGCTGATTCTGGGAAAATTCTGTGGCAAAGCACCGATGATTTGTGAGTTTGGAATTATTAAAATTGTTATTTGTTTCTACGGAAAAATAGCTCTATTCCTGAAATAGAACACAAAGGTAAACGTGGCATTAACTCAGATATTTTATTAAGCTCATGTGCCGAGGAAAATTCTCAAGTGCAAATCAGTTTCTCGCGAAATCAATTTTTCCTCAAAAGAGCAGTTAGAAAATTTCTGGCTTGAACAAG-AAGTATTTCTTAGAGATCAATCGATTGAAAACTGGAGTTTTGAATTTGGTTTCGTAATACCAGGCTCAACAAATACATGGCAGTCGTTAATACAGTCCGATTCAGCTGATCGAATGATTCCGGCTAAAGTATTAAGTGGTAATGTTGTTATTGTGACACATTTCTATGATGGTGACCTTTTAGTAAGCAAATCTAAAGTGCGAATATTTTACGTTTTAATGAAGGTGCATTTTTTTCCACATTTGCAAACATCCTTTAAACAAATTAAAAGTTCAGATGTAAAACAATCGCTTGTCATTCACATATTACTCTAAAAACCATTTAGAGTTTTTTTTACAATATACTTTTCAGTCCATTCATATTTCAGAATATAAAAAGCTTATTTTGCCTTTAGCTCAATTCCACCATTAGCATTGTGTGTCTATACATTCTCTCTATTTCTAACTATCCGTGTTAACGTAACTAAAGTATGGTTTTATTCCGTTCTTATAACTCCATGAACAACTATACTCACC-TTTATACGCATTGTTCATTACCTCTTCTCTTCTATTTATCACAACTACTTCCCAGGATGAAGCTTTAAAGCTCTTTTTTCAACCCCAACAATTTGTGATAT]

[+] EMBL CD082495             [TGATTTCGCAATGTACAAAATGGATCATGAGAAATGTGAATCTATCTTGAAAGGTTTCAAACTGTACGTATTTGTTAAATCAAAATAACTATTCTAGAAATTGGATGAACTTGCGTGATGCTGATTCTGGGAAAATTCTGTGGCAAAGCACCGATGATTTGTGAGTTTGGAATTATTAAAATTGTTATTTGTTTCTACGGAAAAATAGCTCTATTCCTGAAATAGAACACAAAGGTAAACGTGGCATTAACTCAGATATTTTATTAAGCTCATGTGCCGAGGAAAATTCTCAAGTGCAAATCAGTTTCTCGCGAAATCAATTTTTCCTCAAAAGAGCAGTTAGAAAATTTCTGGCTTGAACAAG AAGTATTTCTTAGAGATCAATCGATTGAAAACTGGAGTTTTGAATTTGGTTTCGTAATACCAGGCTCAACAAATACATGGCAGTCGTTAATACAGTCCGATTCAGCTGATCGAATGATTCCGGCTAAAGTATTAAGTGGTAATGTTGTTATTGTGACACATTTCTATGATGGTGACCTTTTAGTAAGCAAATCTAAAGTGCGAATATTTTACGTTNTAATGAAGGTGCATTNTTTTCCACATTTGC AACATCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD076090             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TCAAGTGCAAATCAGTTTCTCGCGAAATCAATTTTTCCTCAAAAGAGCAGTTAGAAAATTTCTGGCTTGAACAAG AAGTATTTCTTAGAGATCAATCGATTGAAAACTGGAGTTTTGAATTTGGTTTCGTAATACCAGGCTCAACAAATACATGGCAGTCGTTAATACAGTCCGATTCAGCTGATCGAATGATTCCGGCTAAAGTATTAAGTGGTAATGTTGTTATTGTGACACATTTCTATGATGGTGACCTTTTAGTAAGCAAATCTAAAGTGCGAATATTTTACGTTTTAATGAAGGTGCATTTTTTTCCACA TTGCAAACATCCTTTAAACAAATTAAAAGTTCAGATGTAAAACAATCGCTTGTCATTCACATATTACTCTAAAAACCATTTAGAGTTTTTTTTACAATATACTTTTCAGTCCATTCATATTTCAGAATATAAAAAGCTTATTTTGCCTTTAGCTCAATTCCACCATTAGCATTGTGTGTCTATACATTCTCTCTATTTCTAACTATCCGTGTTAACGTAACTAAAGTATGGTTTTATTCCGTTCTTATAACTCCATGAACAACTATACTCACC TTTATA                                                                                               ]
[+] EMBL AA559625             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTGGCTTGAACAAGAAAGTATTTCTTAGAGATCAATCGATTGAAAACTGGAGTTTTGAATTTGGTTTCGTAATACCAGGCTCAACAAATACATGGCAGTCGTTAATACAGTCCGATTCAGCTGATCGAATGATTCCGGCTAAAGTATTAAGTGGTAATGTTGTTATTGTGACACATTTCTATGATGGTGACCTTTTAGTAAGCAAATCTAAAGTGCGAATATTTTACGTTTAAATGAAGGTGCATTTTTTNCCACATTGGCAAACATCCTTTAAACAAATTAAAAGTTCAGATGTAAAACAATCGCTTGTCATTCACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD133643             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gTCAGATGTAAAACAATCGCTTGTCATTCACATATTACTCTAAAAACCATTTAGAGTTTTTTTTACAATATACTTTTCAGTCCATTCATATTTCAGAATATAAAAAGCTTATTTTGCCTTTAGCTCAATTCCACCATTAGCATTGTGTGTCTATACATTCTCTCTATTTCTAACTATCCGTGTTAACGTAACTAAAGTATGGTTTTATTCCGTTCTTATAACTCCATGAACAACTATACTCACCTTTTATACGCATTGTTCATTACCTCTTCTCTTCTATTTATCAC                                                           ]
[-] EMBL CD182879             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTAACGTAACTAAAGTATGGTTTTATTCCGTTCTTATAACTCCATGAACAACTATACTCACCTTTTATACGCATTGTTCAATACCTCTTCTCTTCTATTTATCACAACTACTTCCCAGGATGAAGCTTTAAAGCTCTTTTTTCAACCCCAACAATTTGTGATAT]




>consensus_7807#0
TGATTTCGCAATGTACAAAATGGATCATGAGAAATGTGAATCTATCTTGAAAGGTTTCAA
ACTGTACGTATTTGTTAAATCAAAATAACTATTCTAGAAATTGGATGAACTTGCGTGATG
CTGATTCTGGGAAAATTCTGTGGCAAAGCACCGATGATTTGTGAGTTTGGAATTATTAAA
ATTGTTATTTGTTTCTACGGAAAAATAGCTCTATTCCTGAAATAGAACACAAAGGTAAAC
GTGGCATTAACTCAGATATTTTATTAAGCTCATGTGCCGAGGAAAATTCTCAAGTGCAAA
TCAGTTTCTCGCGAAATCAATTTTTCCTCAAAAGAGCAGTTAGAAAATTTCTGGCTTGAA
CAAGAAGTATTTCTTAGAGATCAATCGATTGAAAACTGGAGTTTTGAATTTGGTTTCGTA
ATACCAGGCTCAACAAATACATGGCAGTCGTTAATACAGTCCGATTCAGCTGATCGAATG
ATTCCGGCTAAAGTATTAAGTGGTAATGTTGTTATTGTGACACATTTCTATGATGGTGAC
CTTTTAGTAAGCAAATCTAAAGTGCGAATATTTTACGTTTTAATGAAGGTGCATTTTTTT
CCACATTTGCAAACATCCTTTAAACAAATTAAAAGTTCAGATGTAAAACAATCGCTTGTC
ATTCACATATTACTCTAAAAACCATTTAGAGTTTTTTTTACAATATACTTTTCAGTCCAT
TCATATTTCAGAATATAAAAAGCTTATTTTGCCTTTAGCTCAATTCCACCATTAGCATTG
TGTGTCTATACATTCTCTCTATTTCTAACTATCCGTGTTAACGTAACTAAAGTATGGTTT
TATTCCGTTCTTATAACTCCATGAACAACTATACTCACCTTTATACGCATTGTTCATTAC
CTCTTCTCTTCTATTTATCACAACTACTTCCCAGGATGAAGCTTTAAAGCTCTTTTTTCA
ACCCCAACAATTTGTGATAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)