These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7811#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 604 fasta sequence [CCTGTTATTTAACTGCCATCAGCTTGCGATAAGTCTTGTCAGCCAGCATTTGGTGTATACTGTGCAATGCCCGATAAACGGTCAACCTATCCAAATGCCTATAGAAAATGTTTCCCAATAGATCATTCAAGATCGTTTATTAGTGTTCATTTAAATCAGCAGTCAATAATATCCGATCCCAAAACTGGTGCACGAAGATCTCCAATTGTTAAGAAGTTCACCGACGAATCTCGTGTACAAACAGTCAAAGACATTTTTGAATATGGCTTAAGTAATTCGAGGTCTAATCGGTGTCTGGGGAAACGACCGTCTTTCAATGATCCATACTCGTGGCTAACTTATAATGAAGTGGATGAGCGAATTAGAGCTATCGGGTCGGCGCTCTCAAAAGTTGTGAAATTTAAACATGACAGTGAAAATGTTATCGGGATTTATGCACCAAATTCACCAGAGTGGGTTATTATGCAGCATGCATGTGCAGCATATTCTTATACCATCGTACCTTTGTATCCAACTCTCGGCGATGAAGCTATGCAACATATTCTATCTCAAACGGAAATGAACTGCGTGCTGTGTGCTTCAGGACGTGAAGCTCTTCATTTGA] [+] EMBL CD115858 [CCTGTTATTTAACTGCCATCAGCTTGCGATAAGTCTTGTCAGCCAGCATTTGGTGCATACTGTGCAATGCCCGATAAACGGTCAACCTATCCAAATGCCTATATAAAATGTTTCCCAATAGATCATTCAAGATCGTTTATTAGTGTTCATTTAAATCAGCAGTCAATAATATCCGATCCCAAAACTGGTGCACGAAGATCTCCAATTGTTAAGAAGTTCACCGACGAATCTCGTGTACAAACAGTCAAAGACATTTTTGAATATGGCTTAAGTAATTCGAGGTCTAATCGGTGTCTGGGGAAACGACCGTCTTTCAATGATCCATACTCGTGGCTAACTTATAATGAAGTGGATGAGCGAATTAGAGCTATCGGGTCGGCGCTCTCAAAAGTTGTGGAATTTAAACATGACAGTGAAAATGTTATCGGGATTTATGCACCAAATTCACCAGAGTGGGTTATTATGCAGCATGCATGTGCAGCATATTCTTATACCATCGTACCTTTGTATCCAACTCTCGGCGATGAAGCTATGCAACATA ] [+] EMBL CD159763 [ cccagGTCAGCCAGCAGTTGGTGTATACTGTGCAATGCCCGATAAACGGTCAACCTATCCAAATGCCTATAGAAAATGTTTCCCAATAGATCATTCAAGATCGTTTATTGGTGTTCATTTAAATCAGCAGTCAATAATATCCGATCCCAAAACTGGTGCACGAAGATCTCCAATTGTTAAGAAGTTCACCGACGAATCTCGTGTACAAACAGTCAAAGACATTTTTGAATATGGCTTAAGTAATTCGAGGTCTAATCGGTGTCTGGGGAAACGACCGTCTTTCAATGATCCATACTCGTGGCTAACTTATAATGAAGTGGATGAGCGAATTAGAGCTATCGGGTCGGCGCTCTCAAAAGTTGTGAAATTTAAACATGACAGTGAAAATGTTATCGGGATTTATGCACCAAATTCACCAGAGTGGGTTATTATGCAGCATGCATGTGCAGCATAT ] [+] EMBL CD125478 [ cactcTGGTGTATACTGTGCAATGCCCGATAAACGGTCAACCTATCCAAATGCCTATAGAAAATGTTTCCCAATAGATCATTCAAGATCGTTTATTAGTGTTCATTTAAATCAGCAGTCAATAATATCCGATCCCAAAACTGGTGCACGAAGATCTCCAATTGTTAAGAAGTTCACCGACGAATCTCGTGTACAAACAGTCAAAGACATTTTTGAATATGGCTTAAGTAATTCGAGGTCTAATCGGTGTCTGGGGAAACGACCGTCTTTCAATGATCCATACTCGTGGCTAACTTATAATGAAGTGGATGAGCGAATTAGAGCTATCGGGTCGGCGCTCTCAAAAGTTGTGGAATTTAAACATGACAGTGAAAATGTTATCGGGATTTATGCACCAAATTCACCAGAGTGGGTTATTATGCA ] [+] EMBL CD122887 [ CAGCAGTCAATAATATCCGATCCCAAAACTGGTGCACGAAGATCTCCAATTGTTAAGAAGTTCACCGACGAATCTCGTGTACAAACAGTCAAAGACATTTTTGAATATGGCTTAAGTAATTCGAGGTCTAATCGGTGTCTGGGGAAACGACCGTCTTTCAATGATCCATACTCGTGGCTAACTTATAATGAAGTGGATGAGCGAATTAGAGCTATCGGGTCGGCGCTCTCAAAAGTTGTGAAATTTAAACATGACAGTGAAAATGTTATCGGGATTTATGCACCAAATTCACCAGAGTGGGTTATTATGCAGCATGCATGTGCAGCATATTCTTATACCATCGTA ] [+] EMBL CD155370 [ CTATCGGGTCGGCGCTCTCAAAAGTTGTGAAATTTAAACATGACAGTGAAAATGTTATCGGGATTTATGCACCAAATTCACCAGAGTGGGTTATTATGCAGCATGCATGTGCAGCATATTCTTATACCATCGTACCTTTGTATCCAACTCTCGGCGATGAAGCTATGCAACATATTCTATCTCAAACGGAAATGAACTGCGTGCTGTGTGCTTCAGGACGTGAAGCTCTTCATTTGA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||