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Schistosoma mansoni
cluster # 7811 cluster # 7811       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7811#0 length = 604 sequences # 5  

consensusID : consensus_7811#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 604
fasta sequence
                              [CCTGTTATTTAACTGCCATCAGCTTGCGATAAGTCTTGTCAGCCAGCATTTGGTGTATACTGTGCAATGCCCGATAAACGGTCAACCTATCCAAATGCCTATAGAAAATGTTTCCCAATAGATCATTCAAGATCGTTTATTAGTGTTCATTTAAATCAGCAGTCAATAATATCCGATCCCAAAACTGGTGCACGAAGATCTCCAATTGTTAAGAAGTTCACCGACGAATCTCGTGTACAAACAGTCAAAGACATTTTTGAATATGGCTTAAGTAATTCGAGGTCTAATCGGTGTCTGGGGAAACGACCGTCTTTCAATGATCCATACTCGTGGCTAACTTATAATGAAGTGGATGAGCGAATTAGAGCTATCGGGTCGGCGCTCTCAAAAGTTGTGAAATTTAAACATGACAGTGAAAATGTTATCGGGATTTATGCACCAAATTCACCAGAGTGGGTTATTATGCAGCATGCATGTGCAGCATATTCTTATACCATCGTACCTTTGTATCCAACTCTCGGCGATGAAGCTATGCAACATATTCTATCTCAAACGGAAATGAACTGCGTGCTGTGTGCTTCAGGACGTGAAGCTCTTCATTTGA]

[+] EMBL CD115858             [CCTGTTATTTAACTGCCATCAGCTTGCGATAAGTCTTGTCAGCCAGCATTTGGTGCATACTGTGCAATGCCCGATAAACGGTCAACCTATCCAAATGCCTATATAAAATGTTTCCCAATAGATCATTCAAGATCGTTTATTAGTGTTCATTTAAATCAGCAGTCAATAATATCCGATCCCAAAACTGGTGCACGAAGATCTCCAATTGTTAAGAAGTTCACCGACGAATCTCGTGTACAAACAGTCAAAGACATTTTTGAATATGGCTTAAGTAATTCGAGGTCTAATCGGTGTCTGGGGAAACGACCGTCTTTCAATGATCCATACTCGTGGCTAACTTATAATGAAGTGGATGAGCGAATTAGAGCTATCGGGTCGGCGCTCTCAAAAGTTGTGGAATTTAAACATGACAGTGAAAATGTTATCGGGATTTATGCACCAAATTCACCAGAGTGGGTTATTATGCAGCATGCATGTGCAGCATATTCTTATACCATCGTACCTTTGTATCCAACTCTCGGCGATGAAGCTATGCAACATA                                                               ]
[+] EMBL CD159763             [                                cccagGTCAGCCAGCAGTTGGTGTATACTGTGCAATGCCCGATAAACGGTCAACCTATCCAAATGCCTATAGAAAATGTTTCCCAATAGATCATTCAAGATCGTTTATTGGTGTTCATTTAAATCAGCAGTCAATAATATCCGATCCCAAAACTGGTGCACGAAGATCTCCAATTGTTAAGAAGTTCACCGACGAATCTCGTGTACAAACAGTCAAAGACATTTTTGAATATGGCTTAAGTAATTCGAGGTCTAATCGGTGTCTGGGGAAACGACCGTCTTTCAATGATCCATACTCGTGGCTAACTTATAATGAAGTGGATGAGCGAATTAGAGCTATCGGGTCGGCGCTCTCAAAAGTTGTGAAATTTAAACATGACAGTGAAAATGTTATCGGGATTTATGCACCAAATTCACCAGAGTGGGTTATTATGCAGCATGCATGTGCAGCATAT                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD125478             [                                             cactcTGGTGTATACTGTGCAATGCCCGATAAACGGTCAACCTATCCAAATGCCTATAGAAAATGTTTCCCAATAGATCATTCAAGATCGTTTATTAGTGTTCATTTAAATCAGCAGTCAATAATATCCGATCCCAAAACTGGTGCACGAAGATCTCCAATTGTTAAGAAGTTCACCGACGAATCTCGTGTACAAACAGTCAAAGACATTTTTGAATATGGCTTAAGTAATTCGAGGTCTAATCGGTGTCTGGGGAAACGACCGTCTTTCAATGATCCATACTCGTGGCTAACTTATAATGAAGTGGATGAGCGAATTAGAGCTATCGGGTCGGCGCTCTCAAAAGTTGTGGAATTTAAACATGACAGTGAAAATGTTATCGGGATTTATGCACCAAATTCACCAGAGTGGGTTATTATGCA                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD122887             [                                                                                                                                                            CAGCAGTCAATAATATCCGATCCCAAAACTGGTGCACGAAGATCTCCAATTGTTAAGAAGTTCACCGACGAATCTCGTGTACAAACAGTCAAAGACATTTTTGAATATGGCTTAAGTAATTCGAGGTCTAATCGGTGTCTGGGGAAACGACCGTCTTTCAATGATCCATACTCGTGGCTAACTTATAATGAAGTGGATGAGCGAATTAGAGCTATCGGGTCGGCGCTCTCAAAAGTTGTGAAATTTAAACATGACAGTGAAAATGTTATCGGGATTTATGCACCAAATTCACCAGAGTGGGTTATTATGCAGCATGCATGTGCAGCATATTCTTATACCATCGTA                                                                                                       ]
[+] EMBL CD155370             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CTATCGGGTCGGCGCTCTCAAAAGTTGTGAAATTTAAACATGACAGTGAAAATGTTATCGGGATTTATGCACCAAATTCACCAGAGTGGGTTATTATGCAGCATGCATGTGCAGCATATTCTTATACCATCGTACCTTTGTATCCAACTCTCGGCGATGAAGCTATGCAACATATTCTATCTCAAACGGAAATGAACTGCGTGCTGTGTGCTTCAGGACGTGAAGCTCTTCATTTGA]


>consensus_7811#0 CCTGTTATTTAACTGCCATCAGCTTGCGATAAGTCTTGTCAGCCAGCATTTGGTGTATAC TGTGCAATGCCCGATAAACGGTCAACCTATCCAAATGCCTATAGAAAATGTTTCCCAATA GATCATTCAAGATCGTTTATTAGTGTTCATTTAAATCAGCAGTCAATAATATCCGATCCC AAAACTGGTGCACGAAGATCTCCAATTGTTAAGAAGTTCACCGACGAATCTCGTGTACAA ACAGTCAAAGACATTTTTGAATATGGCTTAAGTAATTCGAGGTCTAATCGGTGTCTGGGG AAACGACCGTCTTTCAATGATCCATACTCGTGGCTAACTTATAATGAAGTGGATGAGCGA ATTAGAGCTATCGGGTCGGCGCTCTCAAAAGTTGTGAAATTTAAACATGACAGTGAAAAT GTTATCGGGATTTATGCACCAAATTCACCAGAGTGGGTTATTATGCAGCATGCATGTGCA GCATATTCTTATACCATCGTACCTTTGTATCCAACTCTCGGCGATGAAGCTATGCAACAT ATTCTATCTCAAACGGAAATGAACTGCGTGCTGTGTGCTTCAGGACGTGAAGCTCTTCAT TTGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)