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Schistosoma mansoni
cluster # 7812 cluster # 7812       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7812#0 length = 581 sequences # 5  

consensusID : consensus_7812#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 581
fasta sequence
                              [TTACTACGATAACGACTTGGTCGGTTATTACGACGACAGTGGTGTTTTTAAACCCTGGATGAATTCAGACTACCGCTATTCATATAGGGATTCACGACAAATAAGTGATGATTTGCGCTACGGTAAACGGATTTATATTTACAGAGACTACACAAGTACCCCTAGTTATTATCAAAGTACATATTCACCAAGTTATAACTA-TGTGTCTCCTCTACGTCGTTTTCGATCATATGGTAGTCTCTCAGATTATGGGATGAATTCGCTTTA-TGGCTATTCATATTCACGTCCAGCTTCTCAACTTCAACGAGTAGATATATATGACGATACTCGTTATAGCAGATATTATTATTAGAAAACGTTTATCTTTCGACAGAACTACATCTTTTCTTTTGAGTGTCTATTAATTTTGGTGGATAAAATCACGTGCTCTTCTTTCTAATTTTTCTACAAAGTAAGGTATTTCACTCTCATCGAGACATATAAATGGATAAACGTACGGAATAAAATGAACGTGACATGTTTTGTTGGCATGTGATTTATTTCATGTAACTTAGCTTTGTNTTTTGTGAAATATAGATTGT]

[+] EMBL CD093505             [TTACTACGATAACGACTTGGTCGGTTATTACGACGACAGTGGTGTTTTTAAACCCTGGATGAATTCAGACTACCGCTATTCGTATAGGGATTCACGACAAATAAGTGATGATTTGCGCTACGGTAAACGGATTTATATTTACAGAGACTACACAAGTACCCCTAGTTATTATCAAAGTACATATTCACCAAGTTATAACTA TGTGTCTCCTCTACGTCGTTTTCGATCATATGGTAGTCTCTCAGATTATGGGATGAATTCGCTTTA TGGCTATTCATATTCACGTCCAGCTTCTCAACTTCAACGAGTAGATATATATGACGATACTCGTTATAGCAGATATTATTATTAGAAAACGTTTATCTTTCGACAGAACTACATCTTTTCTTTTGAGTGTCTATTAATTTTGGTGG                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL AA999347             [                     CGGTTATTACGACGACAGTGGTGTTTTTAAACCCTGGATGAATTCAGACTACCGCTATTCATATAGGGATTCACGACAAATAAGTGATGATTTGCGCTACGGTAAACGGATTTATATTTACAGAGACTACACAAGTACCCCTAGTTATTATCAAAGTACATATTCACCAAGTTATAACTA TGTGTCTCCTCTACGTCGTTTTCGATCATTTTGTAGTCTCTCAGATTATTGGATGAATTCGCTTTATTGGCTATTCATATTCACGTCCAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL SMAA43852            [                                      GTGGTGTTTTTAAACCCTGGATGAATTCAGACTACCGCTATTCATATAGGGATTCACGACAAATAAGTGATGATTTGCGCTACGGTAAACGGATTTATATTTACAGAGACTACACAAGTACCCCTAGTTATTATCAAAGTACATATTCACCAAGTTATAACTA TGTGTCTCCTCTACGTCGTTTTCGATCATATGGTAGTCTCTCAGATTATGGGATGAATTCGCTTTA TGGCTATTCATATTCACGTCCAGCTTCTCAACTTCAACGAGTAGATATATATGACGATACTCGTTATAGCAGA                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AA952857             [                                       TGGTGTTTTTAAACCCTGGATGAATTCAGACTACCGCTATTCATATAGGGATTCACGACAAATAAGTGATGA TTGCGCTACGGTAAACGGATTTATATTTACAGAGACTACACAAGTACCCCTAGTTATTATC AAGTACATA TCACC AGTTAT ACTAGTGT TCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL AA999553             [                                                                                                                                                                                                                                                                                    TCATATTCACGTCCAGGTTCTCAACTTCAACGAGTAGATATATATGACGATACTCGTTATAGCCGATATTATTATTAGAAAACGTTTATCTTTCGACAGAACTACATCTTTTCTTTTGAGTGTTTATTAATTTTGGTGGATAAAATCACGTGCTCTTCTTTCTAATTTTTCTACAAAGTAAGGTATTTCACTCTCATCGAGACATATAAATGGATAAACGTACGGAATAAAATGAACGTGACATGTTTTGTTGGCATGTGATTTATTTCATGTAACTTAGCTTTGTNTTTTGTGAAATATAGATTGT]


>consensus_7812#0 TTACTACGATAACGACTTGGTCGGTTATTACGACGACAGTGGTGTTTTTAAACCCTGGAT GAATTCAGACTACCGCTATTCATATAGGGATTCACGACAAATAAGTGATGATTTGCGCTA CGGTAAACGGATTTATATTTACAGAGACTACACAAGTACCCCTAGTTATTATCAAAGTAC ATATTCACCAAGTTATAACTATGTGTCTCCTCTACGTCGTTTTCGATCATATGGTAGTCT CTCAGATTATGGGATGAATTCGCTTTATGGCTATTCATATTCACGTCCAGCTTCTCAACT TCAACGAGTAGATATATATGACGATACTCGTTATAGCAGATATTATTATTAGAAAACGTT TATCTTTCGACAGAACTACATCTTTTCTTTTGAGTGTCTATTAATTTTGGTGGATAAAAT CACGTGCTCTTCTTTCTAATTTTTCTACAAAGTAAGGTATTTCACTCTCATCGAGACATA TAAATGGATAAACGTACGGAATAAAATGAACGTGACATGTTTTGTTGGCATGTGATTTAT TTCATGTAACTTAGCTTTGTNTTTTGTGAAATATAGATTGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)