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Schistosoma mansoni
cluster # 7815 cluster # 7815       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7815#0 length = 1331 sequences # 5  

consensusID : consensus_7815#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1331
fasta sequence
                              [TACGCTTTATTGTGTGCGTTGCGGTCAGGTCGTCGTGATTGGCTGGTTCGTTCGTATGACCTTGAGCGCTAGCTATGACAGTTATTGTTTTTCTGCTTGACAACAGCGCAGCAATGAACCAGCGCACTTTTCAAGGTACTACGTTACTAGACGTTGCAAAGTCTGCGGTAGAGATTTTCTTCAAAATAAGGATGAGCAAATCAAGAGTAGATCGTTATTTTGTGCTTACGCTCAATTCTGATATAAGTTATGTCAAACTTACCGGTTGGAAACAGAACGTTGATCTTCAGTTACTTCATTCTGCCTTAAATAATATAAAACCAGATGGTCTAATAGACTTGTCAACTGGCATTCAAAGAACATTCCGAATGTTAAACGTAAATAGATTGCAACTCGGACTGGAAAATTATGGGATGGTATTTAGCATTTATCAGTTGATATTTCTTAAGGGAATTTATCCATCATGTATTGAACCCTCTGTGATAATATGTATTACTTGTAGCATAGGGTCATGCAGTTTCGATGGTCAAGTNTTCAACGATGCATCTANCACTTCCATAGAATCTGCTGTTCTTGGAAATGTTTTGACAAAAGAGACTTTTCGTTGGGATTACCGCATGTATTCTCTGGTACTTCGTTTTCCAGCATTTGTCAGTAATATTCATGGTGGTAACTCCATAAGATCAGAAACAAACTCACCGCTTAAAATACTTGCGGAAGAAACTGGCGGTGAAAGTTTTGATGTTTACGACGGTCGGGAACTCCACCAATGTCTCGACTCTCTTGTTACAAAATGTCAACCTGGCGTGGTTTTAAAATTACGAAGGTCTACTGATTGCGTTGATACGGTTTGTCAAGAGAAATTTGTAAAGCAGTTGATGTCAGTTAAGTTAATGGGAAGATCATCGTCTTGGCCTATTCCAGAACAATTTTGGCCTGATGATGAGATGCTAGCATCACAGTTGCCACCTAGAAGTGCACATCCTGAAGTCCTTGTATCTAAAGTTCCTGTGGCGGAACCTGAATTGCCCGAGTATTTCCCCGTCGACCGTTACGAGTTGACTCCGTCACATCTTACGAAAGAGTTTCTAAATTCATCGGAGCACAACATGGTGTGGCGTTGTTTCAGCTATGGTATCAAAAAGAGTCAGAATGCACCGTTTGGTTATTTAAAAGCATCAAATGATCTACAGTCAGTACATCTACACATACTTCCTTACAATTATCCTGTATTTCTTCAGTTACTTGGTGATATATGTGATCATAAGCGTATGACGGAAGCTTGGGGTCATCAGTTTGTGAACTATCTAGGAACTATACCAAAATATTAC]

[+] EMBL CD185865             [TACGCTTTATTGTGTGCGTTGCGGTCAGGTCGTCGTGATTGGCTGGTTCGTTCGTATGACCTTGAGCGCTAGCTATGACAGTTATTGTTTTTCTGCTTGACAACAGCGCAGCAATGAACCAGCGCACTTTTCAAGGTACTACGTTACTAGACGTTGCAAAGTCTGCGGTAGAGATTTTCTTCAAAATAAGGATGAGCAAATCAAGAGTAGATCGTTATTTTGTGCTTACGCTCAATTCTGATATAAGTTATGTCAAACTTACCGGTTGGAAACAGAACGTTGATCTTCAGTTACTTCATTCTGCCTTAAATAATATAAAACCAGATGGTCTAATAGACTTGTCAACTGGCATTCAAAGAACATTCCGAATGTTAAACGTAAATAGATTGCAACTCGGACTGGAAAATTATGGGATGGTATTTAGCATTTATCAGTTGATATTTCTTAAGGGAATTTATCCATCATGTATTGAACCCTCTGTGATAATATGTATTACTTGTAGCATAGGGTCATGCAGTTTCGATGGTCAAGTNTTCAACGATGCATCTANCACTTCCATAGAATCTGCTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD065615             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CATCATGTAGTGAACCCTCTGTGATAATGTGTATTACTTGTAGCATAGGGTCATGCAGTTTCGATGTTCAAGTTTTCAACGATGCATCTACAACTTCCATAGAATCTGCTGTTCTTGGAAATGTTTTGACAAAAGAGACTTTTCGTTGGGATTACCGCATGTATTCTCTGGTACTTCGTTTTCCAGCATTTGTCAGTAATATTCATGGTGGTAACTCCATAAGATCAGAAACAAACTCACCGCTTAAAATACTTGCGGAAGAAACTGGCGGTGAAAGTTTTGATGTTTACGACGGTCGGGAACTCCACCAATGTCTCGACTCTCTTGTTACAAAATGTCAACCTGGCGTGGTTTTAAAATTACGAAGGTCTACTGATTGCGTTGATACGGTTTGTCAAGAGAAATTTGTAAAGCAGTTGATGTCAGTTAAGTTAATGGGAAGATCATCGTCTTGGCCTATTCCAGAACTATTTTGGCCTGATGATGAGATGCTGGCATCACAG TGCCACCTAGAAGTGCAC TCCTGAAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD065508             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTCGACTCTCTTGTTACAAAATGTCAACCTGGCGTGGTTTTAAAATTACGAAGGTCTACTGATTGCGTTGATACGGTTTGTCAAGAGAAATTTGTAAAGCAGTTGATGTCAGTTAAGTTAATGGGAAGATCATCGTCTTGGCCTATTCCAGAAC ATTTTGGCCTGATGATGAGATGCTAGCATCACAGTTGCCACCTAGA   GCACATCCTGAAGTCC TGTATCTAAg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD111408             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGACTCTCTTGTTACAAAATGTCAACCTGGCGTGGTTTTAAAATTACGAAGGTCTACTGATTGCGTTGATACGGTTTGTCAAGAGAAATTTGTAAAGCAGTTGATGTCAGTTAAGTTAATGGGAAGATCATCGTCTTGGCCTATTCCAGAACAATTTTGGCCTGATGATGAGATGCTAGCATCACAGTTGCCACCTAGAAGTGCACATCCTGAAGTCCTTGTATCTAAAGTTCCTGTGGCGGAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD153033             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTTGTAAAGCAGTTGATGTCAGTTAAGTTAATGGGAAGATCATCGTCTTGGCCTATTCCAGAACAATTTTGGCCTGATGATGAGATGCTAGCATCACAGTTGCCACCTAGAAGTGCACATCCTGAAGTCCTTGTATCTAAAGTTCCTGTGGCGGAACCTGAATTGCCCGAGTATTTCCCCGTCGACCGTTACGAGTTGACTCCGTCACATCTTACGAAAGAGTTTCTAAATTCATCGGAGCACAACATGGTGTGGCGTTGTTTCAGCTATGGTATCAAAAAGAGTCAGAATGCACCGTTTGGTTATTTAAAAGCATCAAATGATCTACAGTCAGTACATCTACACATACTTCCTTACAATTATCCTGTATTTCTTCAGTTACTTGGTGATATATGTGATCATAAGCGTATGACGGAAGCTTGGGGTCATCAGTTTGTGAACTATCTAGGAACTATACCAAAATATTAC]


>consensus_7815#0 TACGCTTTATTGTGTGCGTTGCGGTCAGGTCGTCGTGATTGGCTGGTTCGTTCGTATGAC CTTGAGCGCTAGCTATGACAGTTATTGTTTTTCTGCTTGACAACAGCGCAGCAATGAACC AGCGCACTTTTCAAGGTACTACGTTACTAGACGTTGCAAAGTCTGCGGTAGAGATTTTCT TCAAAATAAGGATGAGCAAATCAAGAGTAGATCGTTATTTTGTGCTTACGCTCAATTCTG ATATAAGTTATGTCAAACTTACCGGTTGGAAACAGAACGTTGATCTTCAGTTACTTCATT CTGCCTTAAATAATATAAAACCAGATGGTCTAATAGACTTGTCAACTGGCATTCAAAGAA CATTCCGAATGTTAAACGTAAATAGATTGCAACTCGGACTGGAAAATTATGGGATGGTAT TTAGCATTTATCAGTTGATATTTCTTAAGGGAATTTATCCATCATGTATTGAACCCTCTG TGATAATATGTATTACTTGTAGCATAGGGTCATGCAGTTTCGATGGTCAAGTNTTCAACG ATGCATCTANCACTTCCATAGAATCTGCTGTTCTTGGAAATGTTTTGACAAAAGAGACTT TTCGTTGGGATTACCGCATGTATTCTCTGGTACTTCGTTTTCCAGCATTTGTCAGTAATA TTCATGGTGGTAACTCCATAAGATCAGAAACAAACTCACCGCTTAAAATACTTGCGGAAG AAACTGGCGGTGAAAGTTTTGATGTTTACGACGGTCGGGAACTCCACCAATGTCTCGACT CTCTTGTTACAAAATGTCAACCTGGCGTGGTTTTAAAATTACGAAGGTCTACTGATTGCG TTGATACGGTTTGTCAAGAGAAATTTGTAAAGCAGTTGATGTCAGTTAAGTTAATGGGAA GATCATCGTCTTGGCCTATTCCAGAACAATTTTGGCCTGATGATGAGATGCTAGCATCAC AGTTGCCACCTAGAAGTGCACATCCTGAAGTCCTTGTATCTAAAGTTCCTGTGGCGGAAC CTGAATTGCCCGAGTATTTCCCCGTCGACCGTTACGAGTTGACTCCGTCACATCTTACGA AAGAGTTTCTAAATTCATCGGAGCACAACATGGTGTGGCGTTGTTTCAGCTATGGTATCA AAAAGAGTCAGAATGCACCGTTTGGTTATTTAAAAGCATCAAATGATCTACAGTCAGTAC ATCTACACATACTTCCTTACAATTATCCTGTATTTCTTCAGTTACTTGGTGATATATGTG ATCATAAGCGTATGACGGAAGCTTGGGGTCATCAGTTTGTGAACTATCTAGGAACTATAC CAAAATATTAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)