These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7815#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1331 fasta sequence [TACGCTTTATTGTGTGCGTTGCGGTCAGGTCGTCGTGATTGGCTGGTTCGTTCGTATGACCTTGAGCGCTAGCTATGACAGTTATTGTTTTTCTGCTTGACAACAGCGCAGCAATGAACCAGCGCACTTTTCAAGGTACTACGTTACTAGACGTTGCAAAGTCTGCGGTAGAGATTTTCTTCAAAATAAGGATGAGCAAATCAAGAGTAGATCGTTATTTTGTGCTTACGCTCAATTCTGATATAAGTTATGTCAAACTTACCGGTTGGAAACAGAACGTTGATCTTCAGTTACTTCATTCTGCCTTAAATAATATAAAACCAGATGGTCTAATAGACTTGTCAACTGGCATTCAAAGAACATTCCGAATGTTAAACGTAAATAGATTGCAACTCGGACTGGAAAATTATGGGATGGTATTTAGCATTTATCAGTTGATATTTCTTAAGGGAATTTATCCATCATGTATTGAACCCTCTGTGATAATATGTATTACTTGTAGCATAGGGTCATGCAGTTTCGATGGTCAAGTNTTCAACGATGCATCTANCACTTCCATAGAATCTGCTGTTCTTGGAAATGTTTTGACAAAAGAGACTTTTCGTTGGGATTACCGCATGTATTCTCTGGTACTTCGTTTTCCAGCATTTGTCAGTAATATTCATGGTGGTAACTCCATAAGATCAGAAACAAACTCACCGCTTAAAATACTTGCGGAAGAAACTGGCGGTGAAAGTTTTGATGTTTACGACGGTCGGGAACTCCACCAATGTCTCGACTCTCTTGTTACAAAATGTCAACCTGGCGTGGTTTTAAAATTACGAAGGTCTACTGATTGCGTTGATACGGTTTGTCAAGAGAAATTTGTAAAGCAGTTGATGTCAGTTAAGTTAATGGGAAGATCATCGTCTTGGCCTATTCCAGAACAATTTTGGCCTGATGATGAGATGCTAGCATCACAGTTGCCACCTAGAAGTGCACATCCTGAAGTCCTTGTATCTAAAGTTCCTGTGGCGGAACCTGAATTGCCCGAGTATTTCCCCGTCGACCGTTACGAGTTGACTCCGTCACATCTTACGAAAGAGTTTCTAAATTCATCGGAGCACAACATGGTGTGGCGTTGTTTCAGCTATGGTATCAAAAAGAGTCAGAATGCACCGTTTGGTTATTTAAAAGCATCAAATGATCTACAGTCAGTACATCTACACATACTTCCTTACAATTATCCTGTATTTCTTCAGTTACTTGGTGATATATGTGATCATAAGCGTATGACGGAAGCTTGGGGTCATCAGTTTGTGAACTATCTAGGAACTATACCAAAATATTAC] [+] EMBL CD185865 [TACGCTTTATTGTGTGCGTTGCGGTCAGGTCGTCGTGATTGGCTGGTTCGTTCGTATGACCTTGAGCGCTAGCTATGACAGTTATTGTTTTTCTGCTTGACAACAGCGCAGCAATGAACCAGCGCACTTTTCAAGGTACTACGTTACTAGACGTTGCAAAGTCTGCGGTAGAGATTTTCTTCAAAATAAGGATGAGCAAATCAAGAGTAGATCGTTATTTTGTGCTTACGCTCAATTCTGATATAAGTTATGTCAAACTTACCGGTTGGAAACAGAACGTTGATCTTCAGTTACTTCATTCTGCCTTAAATAATATAAAACCAGATGGTCTAATAGACTTGTCAACTGGCATTCAAAGAACATTCCGAATGTTAAACGTAAATAGATTGCAACTCGGACTGGAAAATTATGGGATGGTATTTAGCATTTATCAGTTGATATTTCTTAAGGGAATTTATCCATCATGTATTGAACCCTCTGTGATAATATGTATTACTTGTAGCATAGGGTCATGCAGTTTCGATGGTCAAGTNTTCAACGATGCATCTANCACTTCCATAGAATCTGCTGT ] [-] EMBL CD065615 [ CATCATGTAGTGAACCCTCTGTGATAATGTGTATTACTTGTAGCATAGGGTCATGCAGTTTCGATGTTCAAGTTTTCAACGATGCATCTACAACTTCCATAGAATCTGCTGTTCTTGGAAATGTTTTGACAAAAGAGACTTTTCGTTGGGATTACCGCATGTATTCTCTGGTACTTCGTTTTCCAGCATTTGTCAGTAATATTCATGGTGGTAACTCCATAAGATCAGAAACAAACTCACCGCTTAAAATACTTGCGGAAGAAACTGGCGGTGAAAGTTTTGATGTTTACGACGGTCGGGAACTCCACCAATGTCTCGACTCTCTTGTTACAAAATGTCAACCTGGCGTGGTTTTAAAATTACGAAGGTCTACTGATTGCGTTGATACGGTTTGTCAAGAGAAATTTGTAAAGCAGTTGATGTCAGTTAAGTTAATGGGAAGATCATCGTCTTGGCCTATTCCAGAACTATTTTGGCCTGATGATGAGATGCTGGCATCACAG TGCCACCTAGAAGTGCAC TCCTGAAGT ] [-] EMBL CD065508 [ CTCGACTCTCTTGTTACAAAATGTCAACCTGGCGTGGTTTTAAAATTACGAAGGTCTACTGATTGCGTTGATACGGTTTGTCAAGAGAAATTTGTAAAGCAGTTGATGTCAGTTAAGTTAATGGGAAGATCATCGTCTTGGCCTATTCCAGAAC ATTTTGGCCTGATGATGAGATGCTAGCATCACAGTTGCCACCTAGA GCACATCCTGAAGTCC TGTATCTAAg ] [-] EMBL CD111408 [ CGACTCTCTTGTTACAAAATGTCAACCTGGCGTGGTTTTAAAATTACGAAGGTCTACTGATTGCGTTGATACGGTTTGTCAAGAGAAATTTGTAAAGCAGTTGATGTCAGTTAAGTTAATGGGAAGATCATCGTCTTGGCCTATTCCAGAACAATTTTGGCCTGATGATGAGATGCTAGCATCACAGTTGCCACCTAGAAGTGCACATCCTGAAGTCCTTGTATCTAAAGTTCCTGTGGCGGAAC ] [-] EMBL CD153033 [ TTTGTAAAGCAGTTGATGTCAGTTAAGTTAATGGGAAGATCATCGTCTTGGCCTATTCCAGAACAATTTTGGCCTGATGATGAGATGCTAGCATCACAGTTGCCACCTAGAAGTGCACATCCTGAAGTCCTTGTATCTAAAGTTCCTGTGGCGGAACCTGAATTGCCCGAGTATTTCCCCGTCGACCGTTACGAGTTGACTCCGTCACATCTTACGAAAGAGTTTCTAAATTCATCGGAGCACAACATGGTGTGGCGTTGTTTCAGCTATGGTATCAAAAAGAGTCAGAATGCACCGTTTGGTTATTTAAAAGCATCAAATGATCTACAGTCAGTACATCTACACATACTTCCTTACAATTATCCTGTATTTCTTCAGTTACTTGGTGATATATGTGATCATAAGCGTATGACGGAAGCTTGGGGTCATCAGTTTGTGAACTATCTAGGAACTATACCAAAATATTAC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||