These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7817#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 581 fasta sequence [GAGAGAATATTACTAGTAAATCTGAACAATCTAATGGTATATTACTTGAAGGAAGCGATATGGACTTAGGTACTACTAATTCACACTTCCTACCGTATTCAGGCATAATTCTTTTTACTAGCGCTCCATCTGCTGCACAAAAAAAGCTGTGGAATGAATTATCACAGGAAACCGGTGAAATCTTCCCGCCTACACACTTATCAACGAAACTCCAAGGTAGAGTTACAAATTCTATGGATTTGTGTGGGATAAATATGCATGAATGCAGTTCGTCACCTCAACTACTTTTAAATGATCACTCACCTGACGAAAATGAGTGTGATTTTAAGGCACATGCAGAATGTGATCACTCTTCTGAATTTCCTTGCTCTTTTGATCAGTTATCATGCACTTGTTGCAACCTATTTTACAATAAAAAAGAAATCAATACTTTAGGTTGTGTCTGTGGTCAGTGTTGTAATTGTGTTCATTCGTCCAAAAATTCCAACAACAGTTCTCTTTTGCATATTAAACCGGATACATGGAAAGATAAAAGATTATATTCCAGTTTAATGTGTCCACATCGTAGACGTTCTTGGGAA] [+] EMBL CD166614 [GAGAGAATATTACTAGTAAATCTGAACAATCTAATGGTATATTACTTGAAGGAAGCGATATGGACTTAGGTACTACTAATTCACACTTCCTACCGTATTCAGGCATAATTCTTTTTACTAGCGCTCCATCTGCTGCACAAAAAAAGCTGTGGAATGAATTATCACAGGAAACCGGTGAAATCTTCCCGCCTACACACTTATCAACGAAACTCCAAGGTAGAGTTACAAATTCTATGGATTTGTGTGGGA ] [+] EMBL CD125563 [ GCTGTGGAATGAATTATCACAGGAAGCCGGTGAAATCTTCCCGCCTACACGCTTATCAACGAAACTCCAAGGTAGAGTTACAAATTCTATGGATTTGTGTGGGATAAATATGCATGAATGCAGTTCGTCACCTCAACTACTTTTAAATGATCACTCACCTGACGAAAATGAGTGTGATTTTAAGGCACATGCAGAGTGTGATCACTCTTCTGAATTTCCTTGCTCTTTTGATCAGTTATCATGCACTTGTTGCAACCTATTTTACAATAAAAAAGAAACCAATACTTTAGGTTGTGTCTGTGGTCAGTGTTGTAATTGTGTTCATTCGTCCAAAAATTCCAACAACAGTTCTCTTTTGCATATTAAACCGGATACATGGAAAGATAAAAGATTATATTCCAGTTTAATGTGTCCACATCGTAGACGTTCTTGGGA ] [+] EMBL CD164771 [ GCTGTGGAATGAATTATCACAGGAAACCGGTGAAATCTTCCCGCCTACACACTTATCAACGAAACTCCAAGGTAGAGTTACAAATTCTATGGATTTGTGTGGGATAAATATGCATGAATGCAGTTCGTCACCTCAACTACTTTTAAATGATCACTCACCTGACGAAAATGAGTGTGATTTTAAGGCACATGCAGAATGTGATCACTCTTCTGAATTTCCTTGCTCTTTTGATCAGTTATCATGCACTTGTTGCAACCTATTTTACAATAAAAAAGAAATCAATACTTTAGGTTGTGTCTGTGGTCAGTGTTGTAATTGTGTTCATTCGTCCAAAAATTCCAACAACAGTTCTCTTTTGCATATTAAACCGGATACATGGAAAGATAAAAGATTATATTCCAGTTTAACGTGTCCACATCGTAGACGTTCTTGGGA ] [+] EMBL CD125524 [ GCTGTGGAATGAATTATCACAGGAAACCGGTGAAATCTTCCCGCCTACACACTTATCAACGAAACTCCAAGGTAGAGTTACAAATTCTATGGATTTGTGTGGGATAAATATGCATGAATGCAGTTCGTCACCTCAACTACTTTTAAATGATCACTCACCTGACGAAAATGAGTGTGATTTTAAGGCACATGCAGAATGTGATCACTCTTCTGAATTTCCTTGCTCTTTTGATCAGTTATCATGCACTTGTTGCAACCTATTTTACAATAAAAAAGAAATCAATACTTTAGGTTGTGTCAGTGGTCAGTGTTGTAATTGTGTTCATTCGTCCAAAAGTTCCAACAACAGTTCTCTTTTGCATATTAAACCGGATACATGGAAAGATAAAAGATTATATTCCAGTTTAATGTGTCCACATCGTAGACGTTCTTGGGA ] [-] EMBL CD164812 [ CTGTGGAATGAATTATCACAGGAAACCGGTGAAATCTTCCCGCCTACACACTTATCAACGAAACTCCAAGGTAGAGTTACAAATTCTATGGATTTGTGTGGGATAAATATGCATGAATGCAGTTCGTCACCTCAACTACTTTTAAATGATCACTCACCTGACGAAAATGAGTGTGATTTTAAGGCACATGCAGAATGTGATCACTCTTCTGAATTTCCTTGCTCTTTTGATCAGTTATCGTGCACTTGTTGCAACCTATTTTACAATAAAAAAGAAATCAATACTTTAGGTTGTGTCTGTGGTCAGTGTTGTAATTGTGTTCATTCGTCCAAAAATTCCAACAACAGTTCTCTTTTGCATATTAAACCGGATACATGGAAAGATAAAAGATTATATTCCAGTTTAATGTGTCCACATCGTAGACGTTCTTGGGAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||