Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7822 cluster # 7822       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7822#0 length = 730 sequences # 5  
consensusID : consensus_7822#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 730
fasta sequence 
                              [CACATAAAAATAAATTTCATAAACTAATCAATTTCTCTTAGTAAATCGTTTTTATTAACAACAGATAGACATTAACATATGTTCAGCCAGTCATATTGACAGATAATAAAATACATATTCTGTAATGTCGAAAGTGAACAAATGTAATGATGACTGACCGAAACAAAAACACATATGACAATTCATTGAAGCCAAGTAAAATGAATTGCGAAAAAAAACACGAATAGTGCAGAACCATTCATGAACAATCACCGCGATGGCGACAACAATAACAAAAAAAAATGATAACAAAAATATGGTCAATTAAGTGCTGATACCATAAAGTGTATTATTATTATTCGTAGTATCAGTATGAATATGAAAATAAAAAAAAGTTCAATTTTGACCTTTCGCCTTCTGATCCCATCCCAATCATGTGTACTCACTCACGTGTCGATTATGAATTATGTAGGTATCAAAATACAAATATACACTGGTATATCAATACAATTTTATTAT-TATTATTATAATTATTGCTAGATTAAGCATGATGAAATGAAAGTTATAAACATGGAAAAAATATGTGTGGAATAGGAGTGTTGAGATTCAGTTTGTTTGTTTTAAAGAAAAAAAGAACAGCACAGCCATAAATTTGATCTATGAGGAAGTGTCAGCTACTTGTTTTTTAATTATTGTATATAATTGATGAAATATAGAGGAGATTGTCAACTCTCGTGCCGAATTCCTGGCT]

[+] EMBL CD072869             [CACATAAAAATAAATTTCATAAACTAATCAATTTCTCTTAGTAAATCGTTTTTATTAACAACAGATAGACATTAACATATGTTCAGCCAGTCATATTGACAGATAATAAAATACATATTCTGTAATGTCGAAAGTGAACAAATGTAATGATGACTGACCGAAACAAAAACACATATGACAATTCATTGAAGCCAAGTAAAATGAATTGCGAAAAAAAACACGAATAGTGCAGAACCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD076961             [                                           AATCGTTTTTATTAACAACAGATAGACATTAACATATGTTCAGCCAGTCATATTGACAGATAATAAAATACATATTCTGTAATGTCGAAAGTGAACAAATGTAATGATGACTGACCGAAACAAAAACACATATGACAATTCATTGAAGCCAAGTAAAATGAATTGCGAAAAAAAACACGAATAGTGCAGAACCATTCATGAACAATCACCGCGATGGCGACAACAATAACAAAAAAAAATGATAACAAAAATATGGTCAATTAAGTGCTGATACCATAAAGTGTATTATTATTATTCGTAGTATCAGTATGAATATGAAAATAAAAAAAAGTTCAATTTTGACCTTTCGCCTTCTGATCCCATCCCAATCATGTGTACTCACTCACGTGTCGATTATGAATTATGTAGGTATCAAAATACAAATATACACTGGTATATCAATACAATTTTATTAT TATTATTATAATTATTGCTAGATTAAGCATGATGAAATGAAAGTTATAAACATGGAAAAAATATGTGTGGAATAGGAGTGTTGAGATTCAGTTTGTTTGTTTTAAAGAAAAAAAGAACAGCACAGCCATAAATTTGATCTATGAGGAAGTGTCAGCTACTTGTTTTTTAATTATTGTATATAATTGA                                             ]
[+] EMBL AI977729             [                                           AATCGTTTTTATTAACAACAGATAGACATTAACATATGTTCAGCCAGTCATATTGACAGATAATAAAATACATATTCTGTAATGTCGAAAGTGAACAAATGTAATGATGACTGACCGAAACAAAAACACATATGACAATTCATTGAAGCCAAGTAAAATGAATTGCGAAAAAAAACACGAATAGTGCAGAACCATTCATGAACAATCACCGCGATGGCGACAACAATAACAAAAAAAAATGATAACAAAAATATGGCCAATTAAGTGCTGATACCATAAAGTGTATTATTATTATTCGTAGTATCAGTATGAATATGAAAATAAAAAAAAGTTCAATTTTGACCTTTCGCCTTCTGATCCCATCCCAATCATGTGTACTCACTCACGTGTCGATTATGAATTATGTAGGTATCAAAATACAAATATACACTGGTATATCAA                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD077625             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATGTAGGTATCAAAATACAAATATACACTGGTATATCAATACAATTTTATTAT TATTATTATAATTATTGCTAGATTAAGCATGATGAAATGAAAGTTATAAACATGGAAAAAATATGTGTGGAATAGGAGTGTTGAGATTCAGTTTGTTTGTTTTAAAGAAAAAAAGAACAGCACAGCCATAAATTTGATCTATGAGGAAGTGTCAGCTACTTGTTTTTTAATTATTGTAGATAATTGATGAAATATAGAGGAGATTGTCAACTCTCGTGCCGAATTCCTGGCT]
[-] EMBL AW017385             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TATATCAATTCAATTGCATTATCTATTATTATAATTATTGCTAGATTAAGCATGATGAAATGAAAGTTATAATCATGGATTGAATATGTGTGGAATAGGAGTGTTGAGATTCAGTTTGTTTGTGTTAAAGAAATAAAGATCAGCACAGCCATAAATCTGATCTATGAGTAAGTGTCAGCTACTTGTTTTTTAATTATTGTATAGAATTGATGACATATAGA GAGATTGT                         ]




>consensus_7822#0
CACATAAAAATAAATTTCATAAACTAATCAATTTCTCTTAGTAAATCGTTTTTATTAACA
ACAGATAGACATTAACATATGTTCAGCCAGTCATATTGACAGATAATAAAATACATATTC
TGTAATGTCGAAAGTGAACAAATGTAATGATGACTGACCGAAACAAAAACACATATGACA
ATTCATTGAAGCCAAGTAAAATGAATTGCGAAAAAAAACACGAATAGTGCAGAACCATTC
ATGAACAATCACCGCGATGGCGACAACAATAACAAAAAAAAATGATAACAAAAATATGGT
CAATTAAGTGCTGATACCATAAAGTGTATTATTATTATTCGTAGTATCAGTATGAATATG
AAAATAAAAAAAAGTTCAATTTTGACCTTTCGCCTTCTGATCCCATCCCAATCATGTGTA
CTCACTCACGTGTCGATTATGAATTATGTAGGTATCAAAATACAAATATACACTGGTATA
TCAATACAATTTTATTATTATTATTATAATTATTGCTAGATTAAGCATGATGAAATGAAA
GTTATAAACATGGAAAAAATATGTGTGGAATAGGAGTGTTGAGATTCAGTTTGTTTGTTT
TAAAGAAAAAAAGAACAGCACAGCCATAAATTTGATCTATGAGGAAGTGTCAGCTACTTG
TTTTTTAATTATTGTATATAATTGATGAAATATAGAGGAGATTGTCAACTCTCGTGCCGA
ATTCCTGGCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)