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Schistosoma mansoni
cluster # 7823 cluster # 7823       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7823#0 length = 1073 sequences # 5  
consensusID : consensus_7823#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1073
fasta sequence 
                              [ATAATAACACAACATTAGTCTTTTCCTATTGTTATAACTATGGTATTGGTTCGATTCTTAACCATTAGTGGTACGTGTAGGTGTAACAGACAGACAGACAGAAAGAAAAAGAATGTTTGTTCTATGGGTTATTAGTAAGCTGATAAGCAATTGTTTTAATGAAAAAGAGTTGTATCGTATCGTTAGGAAACAAAAAGGATAAACAAATAAAGGATGGATTAGGGTTGAAATGTATGTTTTTTTTTTAAAAATGTTATACATGTATTCATTATCAATAAATAGACACACAGAGAGAGATGGATACTTAAAGAGCATAGAGGATCAAACAATTTAAATCATTCATTGAATCAATATCATTAATTAGTTATCATGTACAACAGAACATTATAAAGGATTGAATACACTTTTTTTATTAACCATAGTTACTATTGTTATTCAATGATTAAAACACAATCATTTGGCACTGTTATATATATTTCATTTGGACATTGAGATGAATGATTTTGAAAGGAAATAATTAAGGACAAATGAATGAATGGATGAGGTACAAAAACTAGACAAATTAAGATATACATCAGATGATGTAAGTGAGAAGACACAAAAAATTTTTTTAGTACGTTTTTTTCTTGGATTCAAAGTGTTTACAACAAACGGAAAAAAAAAGACCT--TGTGTGTGTGTGTGTGAGGGGGTGTGTTGATGAATTCATGACTAACAAAATATTGCCGATTTAACATAGTGACATTGAATAAATCATGAACGTGTCGATGGGAAATTGCCAATATATCCACCACCGATGTCG-CACCACCAGTGAGAGAACATGAGGAAGAATTATTTCGTCCAAATCCACCTGTTGTCATAGTTGTTGTTGGTGTTGTGGATATTGTTGACAAATTATTCTTAGTGGAATAATTTTCAGTTGATAAGATTTGCATATAAATATTTTTCAAATTAGTATCTGCATTGATAATACGTAATAACTCCACATAATGACGATTTTTATCAATATCATCAATATTTCTTAAACTGACTATCAATCCAAGAGCACACGATTTAATTCTTGCATTTTCTCCTC]

[+] EMBL AI068220             [ATAATAACACAACATTAGTCTTTTCCTATTGTTATAACTATGGTATTGGTTCGATTCTTAACCATTAGTGGTACGTGTAGGTGTAACAGACAGACAGACAGAAAGAAAAAGAATGTTTGTTCTATGGGTTATTAGTAAGCTGATAAGCAATTGTTTTAATGAAAAAGAGTTGTATCGTATCGTTAGGAAACAAAAAGGATAAACAAATAAAGGATGGATTAGGGTTGAAATGTATGTTTTTTTTTTAAAAATGTTATACATGTATTCATTATCAATAAATAGACACACAGAGAGAGATGGATACTTAAAGAGCATAGAGGATCAAACAATTTAAATCATTCATTGAATCAATATCATTAATTAGTTATCATGTACAACAGAACATTATAAAGGATTGAATACACTTTTTTTATTAACCATAGTTACTATTGTTATTCAATGATTAAAACACAATCATTTGGCACTGTTATATATATTTCATTTGGACATTGAGATGAATGATTTTGAAAGGAAATAATTAAGGACAAATGAATGAATGGATGAGGTACAAAAACTAGACAAATTAAGATATACATCAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AI068344             [ATAATAACACAACATTAGTCTTTTCCTATTGTTATAACTATGGTATTGGTTCGATTCTTAACCATTAGTGGTACGTGTAGGTGTAACAGACAGACAGACAGAAAGAAAAAGAATGTTTGTTCTATGGGTTATTAGTAAGCTGATAAGCAATTGTTTTAATGAAAAAGAGTTGTATCGTATCGTTAGGAAACAAAAAGGATAAACAAATAAAGGATGGATTAGGGTTGAAATGTATGTTTTTTTTTTAAAAATGTTATACATGTATTCATTATCAATAAATAGACACACAGAGAGAGATGGATACTTAAAGAGCATAGAGGATCAAACAATTTAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD114878             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATATATATTTCATTTGGACATTGAGATGAATGATTTTGAAAGGAAATAATTAAGGACAAATGAATGAATGGATGAGGTACAAAAACTAGACAAATTAAGATATACATCAGATGATGTAAGTGAGAAGACACAAAAAATTTTTTTAGTACGTTTTTTTCTTGGATTCAAAGTGTTTACAACAAACGGAAAAAAAAAGACCT  TGTGTGTGTGTGTGTGAGGGGGTGTGTTGATGAATTCATGACTAACAAAATATTGCCGATTTAACATAGTGACATTGAATAAATCATGAACGTGTCGATGGGAAATTGCCTATATATCCACCACCGATGTCG CACCACCAGTGAGAGAACATGAGGAAGAATTATTTCGTCCAAATCCACCTGTTGTCATAGTTGTTGTTGGTGTTGTGTATATTGTTGACAAATTATTCTTAGTGGAATAATTTTCAGTTGATAAAATTTGCATATAAATATTTTTCAAATTAGTATCTGCATTGATAATACGTAATAACTCCA                                                                                          ]
[-] EMBL CD114971             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AATGAATGGATGAGGTACAAAAACTAGACAAATTAAGATATACATCAGATGATGTAAGTGAGAAGACACAAAAAATTTTTTTAGTACGTTTTTTTCTTGGATTCAAAGTGTTTACAACAAACGGAAAAAAAAAGACCT  TGTGTGTGTGTGTGTGAGGGGGTGTGTTGATGAATTCATGACTAACAAAATATTGCCGATTTAACATAGTGACATTGAATAAATCATGAACGTGTCGATGGGAAATTGCCAATATATCCACCACCGATGTCGCCACCACCAGTGAGAGAACATGAGGAAGAATTATTTCGTCCAAATCCACCTGTTGTCATAGTTGTTGTTGGTGTTGTGGATATTGTTGACAAATTATTCTTAGTGGAATAATTTTCAGTTGATAAGATTTGCATATAAATATTTTTCAAATTAGTATCTGCATTGATAATACGTAATAACTCCA                                                                                          ]
[-] EMBL CD084137             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CAAACGG AAAAAAAAGACCTTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGGGGGTGTGTTGATGAATTCATGACTAACAAAATATTGCCAATTTAACATAGTGACATTGAATAAATCATGAACGTGTCGATGGGAAATTGCCAATATATCCACCACCGATGTCGCCACCACCAGTGAGAGAACATGAGGAAGAATTATTTCGTCCAAATCCACCTGTTGTCATAGTTGTTGTTGGTGTTGTGGATGTTGTTGACAAATTATTCTTAGTGGAATAATTTTCAGTTGATAAGATTTGCATATAAATATTTTTCAAATTAGTATCTGCATTGATAATACGTAATAACTCCACATAATGACGATTTTTATCAATATCATCAATATTTCTTAAACTGACTATCAATCCAAGAGCACACGATTTAATTCTTGCATTTTCTCCTC]




>consensus_7823#0
ATAATAACACAACATTAGTCTTTTCCTATTGTTATAACTATGGTATTGGTTCGATTCTTA
ACCATTAGTGGTACGTGTAGGTGTAACAGACAGACAGACAGAAAGAAAAAGAATGTTTGT
TCTATGGGTTATTAGTAAGCTGATAAGCAATTGTTTTAATGAAAAAGAGTTGTATCGTAT
CGTTAGGAAACAAAAAGGATAAACAAATAAAGGATGGATTAGGGTTGAAATGTATGTTTT
TTTTTTAAAAATGTTATACATGTATTCATTATCAATAAATAGACACACAGAGAGAGATGG
ATACTTAAAGAGCATAGAGGATCAAACAATTTAAATCATTCATTGAATCAATATCATTAA
TTAGTTATCATGTACAACAGAACATTATAAAGGATTGAATACACTTTTTTTATTAACCAT
AGTTACTATTGTTATTCAATGATTAAAACACAATCATTTGGCACTGTTATATATATTTCA
TTTGGACATTGAGATGAATGATTTTGAAAGGAAATAATTAAGGACAAATGAATGAATGGA
TGAGGTACAAAAACTAGACAAATTAAGATATACATCAGATGATGTAAGTGAGAAGACACA
AAAAATTTTTTTAGTACGTTTTTTTCTTGGATTCAAAGTGTTTACAACAAACGGAAAAAA
AAAGACCTTGTGTGTGTGTGTGTGAGGGGGTGTGTTGATGAATTCATGACTAACAAAATA
TTGCCGATTTAACATAGTGACATTGAATAAATCATGAACGTGTCGATGGGAAATTGCCAA
TATATCCACCACCGATGTCGCACCACCAGTGAGAGAACATGAGGAAGAATTATTTCGTCC
AAATCCACCTGTTGTCATAGTTGTTGTTGGTGTTGTGGATATTGTTGACAAATTATTCTT
AGTGGAATAATTTTCAGTTGATAAGATTTGCATATAAATATTTTTCAAATTAGTATCTGC
ATTGATAATACGTAATAACTCCACATAATGACGATTTTTATCAATATCATCAATATTTCT
TAAACTGACTATCAATCCAAGAGCACACGATTTAATTCTTGCATTTTCTCCTC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)