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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7836#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 796 fasta sequence
[GATATGATCAGTCTACATATATTGGCAGAGCCAAACACTTTTTTATTACNACTAATCCTTTGAATGCTTTCAAAACACCTGCTGAATTAGAAGAAGCAAGGACCATTGTNCATAATTATAGGATAGGGATTATTCAGCCTGGTTTAACTGTANAAAAGCTTTGGCAGGCAAAAAATGTGTACGACTCAGCGTTTCATCCAGATACAGGAGAAAAAATGATACTCATTGGACGCATGTCATTTCAGGTGCCTGGGAATATGTTTATAACGGGTTGTTTGCTACAGTTTTACAAGTCTACACCGGCTGTCATATTTTGGCAATGGTTTAACCAAACATTCAATGCCGTTGTAAATTATACTAATCGGAGTGGTGACGCACCTATTTCACTAACACGTCTTGGTATATCATATGTTTTGGCTACTGGTGGAGCATTAGGTACTGCATTAACTATCAATAAACAAGTTCAAAAATTCCCTCCTATAATTGGTCGATTTGTACCATTTATTGCAGTCAGTGCAGCTAATTGTATTAATATTCCATGTATGAGAAGTGCAGAATTAACAGAAGGTACACCTATATTAGATGAAAATGGTGAAAAATTGGGTAAATCAACTGTTGTAGGACGTA-GAGCTGTTAGTCAAGTGGTTTTATCACGAATATTAATGGCTTCTCCTGGAATGACAATTTTACCTTTTGTGATGCAATCATTAGAAAGACAAAAATTACTTATTCGTTATCCTTGGTTAGGAGCTCCAATACAAATTAGTTTAGTCGGTTTGATGTTATCACTTGTAAC]
[+] EMBL AA559369 [GATATGATCAGTCTACATATATTGGCAGAGCCAAACACTTTTTTATTACNACTAATCCTTTGAATGCTTTCAAAACACCTGCTGAATTAGAAGAAGCAAGGACCATTGTNCATAATTATAGGATAGGGATTATTCAGCCTGGTTTAACTGTANAAAAGCTTTGGCAGGCAANAAATGTGTACNACTCACCGTTTCATCCAGATACAGGAGAAAAAATGATNCTCATNGGACGCATGTCTTTTCAGGTGCCTGGGAATATGTTTATNACNGGTTGTTTGCTACA ]
[+] EMBL CD201901 [ TCAGTCTACATACATTGGCAGAGCCAAACACTTTTTTATTACAACTAATCCTTTGAATGCTTTCAAAACACCTGCTGAATTAGAAGAAGCAAGGGCCATTGTTCATAATTATAGGATAGGGATTATTCAGCCTGGTTTAACTGTAGAAAGGCTTTGGCAGGCAAAAAATGTGTACGACTCAGCGTTTCATCCAGATACAGGAGAAAAAATGATACTCATTGGACGCATGTCATTTCAGGTGCCTGGGAATATGTTTATAACGGGTTGTTTGCTACAGTTTTACAAGTCTACACCGGCTGTCATATTTTGGCAATGGTTTAACCAAACATTCAATGCCGTTGTAAATTATACTAATCGGAGTGGTGACGCACCTATTTCACTAACACGTCTTGGTATATCATATGTTTTGGCTACTGGTGGAGCATTAGGTACTGCATTAACTATCAATAAACAAGTTCAAAAATTCCCTCCTATAATTGGTCGATTTGTACCATTTATTGCAGTCAGTGCAGCTAATTGTATTAATATTCCATGTATGAGAAGTGCAGAATTAACAGAAGGTACACCTATATTAGATGAAAATGGTGAAAAATTGGGTAAATCAACTGTTGTAGGACGTANAAGCTG TANTCAAGTGGTTTTATCAC ]
[-] EMBL CD151702 [ TTTGGCAGGCAAAAAATGTGTACGACTCAGCGTTTCATCCAGATACAGGAGAAAAAATGATACTCATTGGACGCATGTCATTTCAGGTGCATGGGAATATGTTTATAACGGGTTGTTTGCTACAGTTTTACAAGTCTACACCGGCTGTCATATTTTGGCAATGGTTTAACCAAACATTCAATGCCGTTGTAAATTATACTAATCGGAGTGGTGACGCACCTATTTCACTAACACGTCTTGGTATATCATATGTTTTGGCTACTGGTGGAGCATTAGGCACTGCACTAACTATCAATAAACAAGTTCAAAAATTTCCTCCTATAATTGGTCGATTTGTACCATTTATTGCAGTCAGTGCAGCTAATTGTATTAATATTCCATGTATGAGAAGTGCTGAATTAACAGAAGGTACACCTATATTAGATGAAAATGGTGTAAAATTGGGTAAATCAACTGTTGTAGGACGTA GAGCTGTTAGTCAAGTGGTTTTATCACGAATATTAATGGCTTCTCCTGGAATGACAATTTTACCTTTTGTGATGCAATCATTAGAAAGACAAAAATTGCTTATTCGTTATCCTTGGTTAGGAGCTCCAATACAAATTAGTTTAGTCGGTTTAATGTTATCACTTGTAAC]
[-] EMBL CD186506 [ ACTGCATTAACTATCAATAAACAAGTTCAAAAATTCCCTCCTATAATTGGTCGATTTGTACCATTTATTGCAGTCAGTGCAGCTAATTGTATTAATATTCCATGTATGAGAAGTGCAGAATTAACAGAAGGTACACCTATATTAGATGAAAATGGTGAAAAATTGGGTAAATCAACTGTTGTAGGACGTA GAGCTGTTAGTCAAGTGGTTTTATCACGAATATTAACGGCTTCTCCTGGAATGACAATTTTACCTTTTGTGATGCAATCATTAGAAAGACAAAAATTACTTATTCGTTATCCTTGGTTAGGAGCTCCAATACAAATTAGTTTAGTCGGTTTGATGTTAT ]
[+] EMBL SMAA69224 [ TAGGACGTA GAGCTGTTAGTCAAGTGGTTTTATCACGAATATTAATGGCTTCTCCTGGAATGACAA TTACCTTTTATGATCGAATCATTAGAAAGACAAAAATTACTTATNCGTTATCCTTGGTTAGGAGCTCCAATACAAATTAGTTTAGTCGGTTTGATGTTATCACTTGTA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||