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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7850#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 956 fasta sequence
[GTGTGGCAGAAACAAGTATCTTTTGTAAAGTAATATCAACACTCCTATCGTAATGATAACCAACAGTTGGTATAGGTCTTGAACGTTTGCGTACAGAGACATTGGACCAACTATTTTGATTAGTTGAAGATGTGTAATAGTACAATACATCCTCTAAAGTATGGTACCAGTTTTGTTTTTCTTCAACTATCACTCGATCGGCTTCATCGATTACCAGGATTCTTAAACGTTCCATACTAAAACCAGGAGTATTGTACAAATGGTCTACTAAACGTCCAGGTGTAGCTATTACAATGTCAACTTTGACAGAGTAACTTTCATTTGTAAGGTTTATAATATCTTCTTGTTCTTTACTAAAACTTTTGATGCCAGCAAGAACTCCA-ACCTGAATATCTGTTCCATTAACCAGCTGACTGAAGGTTTTGTACACTTGAACAGCCAAATCTCTGACCGGGACAATGATTAAAGCTCGAATAAATCTATGGACCCTATTAAGAAATAGTTGGATGATTGGCACAGCATAAGCTAGTGTTTTCCCGCTTCCTGTCGGTGCGCAAATACATATGTCTCTTGGTCGACATAATGGCCTATGTTTAGATGTGAAGTAACAATCTAACATGTAAGGGATTACAGCAGACTGAACAGGAAAGAAATGAGTGATGCCGATTTCACTTAGTCGCAGCCGTAAAAATTCGCCAATCTTAGCTACTTCATTGACAGATAGAGATTGTTTAAGGTCAGATGAAAAAAGTTCAGGCTTTGTAATCCAAAAGGGGAGAACTTCTTGGACATTATGTGCTTTGGATTTTGTTTTCTCATTTATAACTGTGAACCCTCCATAACACGATCTTTCGTTGCAGTATCACAATTCATAATCAGGAAACTGTGANACTATTGNATGCATCCCGTGTTGACATAGACAATTCAGCAGAGTCCTGCGTGTTACCGCATAACCT]
[+] EMBL CD124892 [GTGTGGCAGAAACAAGTATCTTTTGTAAAGTAATATCAACACTCCTATCGTAATGATAACCAACAGTTGGTATAGGTCTTGAACGTTTGCGTACAGAGACATTGGACCAACTATTTTGATTAGTTGAAGATGTGTAATAGTACAATACATCCTCTAAAGTATGGTACCAGTTTTGTTTTTCTTCAACTATCACTCGATCGGCTTCATCGATTACCAGGATTCTTAAACGTTCCATACTAAAACCAGGAGTATTGTACAAATGG ]
[-] EMBL CD197627 [ CAAGTATCTTTTGTAAAGTAATATCAACACTCCTATCGTAATGATAACCAACAGTTGGTATAGGTCTTGAACGTTTGCGTACAGAGACATTGGACCAACTATTTTGATTAGTTGAAGATGTGTAATAGTACAATACATCCTCTAAAGTATGGTACCAGTTTTGTTTTTCTTCAACTATCACTCGATCGGCTTCATCGATTACCAGGATTCTTAAACGTTCCATACTAAAACCAGGAGTATTGTACAAATGGTCTACTAAACGTCCAGGTGTAGCTATTACAATGTCAACTTTGACAGAGTAACTTTCATTTGTAAGGTTTATAATATCTTCTTGTTCTTTACTAAAACTTTTGATGCCAGCAAGAACTCCA ACCTGAATATCTGTTCCATTAACCAGCTGACTGAAGGTTTTGTACACTTGAACAGCCAAATCTCTG ]
[-] EMBL CD115383 [ AGTAATATCAACACTCCTATCGTAATGATAACCAACAGTTGGTATAGGTCTTGAACGTTTGCGTACAGAGACATTGGACCAACTATTTTGATTAGTTGAAGATGTGTAATAGTACAATACATCCTCTAAAGTATGGTACCAGTTTTGTTTTTCTTCAACTATCACTCGATCGGCTTCATCGATTACCAGGATTCTTAAACGTTCCATACTAAAACCAGGAGTATTGTACAAATGGTCTACTAAACGTCCAGGTGTAGCTATTACAATGTCAACTTTGACAGAGTAACTTTCATTTGTAAGGTTTATAATATCTTCTTGTTCTTTACTAAAACTTTTGATGCCAGCAAGAACTCCA ACCTGAATATCTGTTCCATTAACCAGCTGACTGAAGGTTTTGTACACTTGAACAGCCAAATCTCTGACCGGGACAATGATTAAAGCTCGAATAAATCTATGGACCCTATTAAGAAATAGTTGGATGATTGGCACAGCATAAGCTAGTGTTTTCCCGCTTCCTGTCGGTGCGCAAATACATATGTCTCTTGGTCGACATAATGGCCTATGTTTAGATGTGAAGTAACAATCTAACATGTAAGGGATTACAGCAGACTGAACAGGAAAG ]
[+] EMBL CD133420 [ TACAATGTCAACTTTGACAGAGTAACTTTCATTTGTAAGGTTTATAATATCTTCTTGTTCTTTACTAAAACTTTTGATGCCAGCAAGAACTCCA ACCTGAATATCTGTTCCATTAACCAGCTGACTGAAGGTTTTGTACACTTGAACAGCCAAATCTCTGACCGGGACAATGATTAAAGCTCGAATAAATCTATGGACCCTATTAAGAAATAGTTGGATGATTGGCACAGCATAAGCTAGTGTTTTCCCGCTTCCTGTCGGTGCGCAAATACATATGTCTCTTGGTCGACATAATGGCCTATGTTTAGATGTGAAGTAACAATCTAACATGTAAGGGATTACAGCAGACTGAACAGGAAAGAAATGAGTGATGCCGATTTCACTTAGTCGCAGCCGTAAAAATTCGCCAATCTTAGCTACTTCATTGACAGATAGAGATTGTTTAAGGTCAGATGAAAAAAGTTCAGGCTTTGTAATCCAAAAGGGGAGAACTTCTTGGACATTATGTGCTTTGGATTTTGTTTTCTCATTTATAACTGTGAACCCTCCATAACACGATCTTTCGTTGCAGTATCACAATTCATAATCAGGAAACTGTGANACTATTGNATGCATCCCGTGTTGACATAGACAATTCAGCAGAGTCCTGCGTGTTACCGCATAACCT]
[-] EMBL CD165184 [ AAG ACTCCANNCCTGAATATCTGTCCCATTAACCAGCTGACTGAAGGTTTTGTACACTTGAACAGCCAAATCTCTGACCGGGACAATGATTAAAGCTCGAATAAATCTATGGACCCTATTAAGAAATAGTTGGATGATTGGCACAGCATAAGCTAGTGTTTTCCCGCTTCCTGTCGGTGCGCAAATACATATGTCTCTTGGTCGACATAATGGCCTATGTTTAGATGTGAAGTAACAATCTAACATGTAAGGGATTACAGCAGACTGAACAGGAAAGAAATGAGTGATGC ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||