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Schistosoma mansoni
cluster # 7852 cluster # 7852       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7852#0 length = 976 sequences # 5  
consensusID : consensus_7852#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 976
fasta sequence 
                              [ATTTGTTATTCCTTTTTTAGGATATAATAAATTAACTGGATAAACAACAAGCAATAAACTTTAAAAAAGATAAAACAAAAGCCGATTAATCTTCTACCTTTATTGTTCTGATCATTCCTTATTCTGAGATTGGTTTCCATTTTTTAAATAATATTGATTAGTCGAATTACCTCTCAAGACGATAAAAATTTAATATCCTCAAGTAATAAATATATAACAACAGAGGAATAGTGGTGGTGGGAGGATGAAAAGAGAAAGACAATGTAAGAAAACATCACAGAAATAAGTGAATACTTGAAAGATCAATAAACAACTAACAATGAGCATTTTGAAATATTAACTGGATAGATTAATATTTTCACATTTGAATTTATTTTGGTAAGTAAATTATAAGCAGTAAATAATTAGACAAATAGCAGAGATAAATAATTCTGTTTTCATGAATAATTGACTTGAGTTTCACTTTGTTGTTATATGGTTTCAGAGGATTTGTATATGAACATAAAACGCTTGAACAATAAAGTATCAGTAGTAATTAAATAGGTAAGAATGATAGAAGGTTATTGGTTTTTTGTTTAATTTGAATTGAATAAAACTAAGGTAGAGTTACTATGTTAAAGAAGTATGCAATAACATAAATATGTGGTTATTTTTGTATGAACATTTCATTAAACAAATATCCGGAGTAAAAAAGAGAAAATAAGAATAAAAGAAAGAGAAATCGATGAAGCAGAAATTACATTTTTTTGTTGTAGTTTGGAAACAATTGATTTAAAGATACAACATTTATAATTAGTAAATAATACGTTAGTTATAAATAAGACAATTCTATTGGGCAATTTCTTTTATAAATCACCAAAAATTCCAGCAAATGTTTTGCGTAGGTTTTTCATAGTATCATCTGTATCTTCACTACTTGGTCCCGTACGTAATGAAGTTTGTCTTGGTGGGACATCTGGACGATCAAGTCCACTGG]

[+] EMBL CD137324             [ATTTGTTATTCCTTTTTTAGGATATAATAAATTAACTGGATAAACAACAAGCAATAAACTTTAAAAAAGATAAAACAAAAGCCGATTAATCTTCTACCTTTATTGTTCTGATCATTCCTTATTCTGAGATTGGTTTCCATTTTTTAAATAATATTGATTAGTCGAATTACCTCTCAAGACGATAAAAATTTAATATCCTCAAGTAATAAATATATAACAACAGAGGAATAGTGGTGGTGGGAGGATGAAAAGAGAAAGACAATGTAAGAAAACATCACAGAAATAAGTGAATACTTGAAAGATCAATAAACAACTAACAATGAGCATTTTGAAATATTAACTGGATAGATTAATATTTTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD201857             [                                                                                                                                                                                                                                           GGTGGGAGGATGAAAAGAGAAAGACAATGTAAGAAAACATTACAGAAATAAGTGAATACTTGAAAGATCAATAAACAACTAACAATGAGCATTTTGAAATATTAACTGGATAGATTAATATTTTCACATTTGAATTTATTTTGGTAAGTAAATTATAAGCAGTAAATAATTAGACAAATAGCAGAGATAAATAATTCTGTTTTCATGAATAATTGACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD141497             [                                                                                                                                                                                                                                                                         AAGAAAACATCACAGAAATAAGTGAATACTTGAAAGATCAATAAACAACTAACAATGAGCATTTTGAAATATTAACTGGATAGATTAATATTTTCGCATTTGAATTTATTTTGGTAAGTAAATTATAAGCAGTAAATAATTAGACAAATAGCAGAGATAAATAATTCTGTTTTCATGAATAATTGACTTGAGTTTCACTTTGTTGTTATATGGTTTCAGAGGATTTGTATATGAACATAAAACGCTTGAACAATAAAGTATCAGTAGTAATTAAATAGGTAAGAATGATAGAAGGTTATTGGTTTTTTGTTTAATTTGAATTGAATAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD137722             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATATGGTTTCAGAGGATTTGTATATGAACATAAAACGCTTGAACAATAAAGTATCAGTAGTAATTAAATAGGTAAGAATGATAGAAGGTTATTGGTTTTTTGTTTAATTTGAATTGAATAAAACTAAGGTAGAGTTACTATGTTAAAGAAGTATGCAATAACATAAATATGTGGTTATTTTTGTATGAACATTTCATTAAACAAATATCCGGAGTAAAAAAGAGAAAATAAGAATAAAAGAAAGAGAAATCGATGAAGCAGAAATTACATTTTTTTGTTGTAGTTTGGAAACAATTGATTTAAAGATACAACATTTATAATTAGTAAATAATACGTTAGTTATAAATAAGACAATTCTATTGGGCAATTTCTTTTATAAATCACCAAAAATTCCAGCAAATGTTTTGCGTAGGTTTTTCATAGTATCATCTGTATCTTCACTACTTGGTCCCGTACGTAATGAAGTTTGTCTTGGTGGGACATCTGGACGATCAAGTCCACTGG]
[-] EMBL AI559034             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TGGAAACAATTGATTTAAAGATACAACATTTATAATTAGTAAATAATACGTTAGTTATAAATAAGACAATTCTATTGGGCAATTTCTTTTATAAATCACCAAAAATTCCAGCAAATGTTTTGCGTAGGTTTTTCATAGTATCATCTGTATCTTCACTACTTGGTCCGGTACGTAATGAAGTTTGTCTTGGTGGGA                        ]




>consensus_7852#0
ATTTGTTATTCCTTTTTTAGGATATAATAAATTAACTGGATAAACAACAAGCAATAAACT
TTAAAAAAGATAAAACAAAAGCCGATTAATCTTCTACCTTTATTGTTCTGATCATTCCTT
ATTCTGAGATTGGTTTCCATTTTTTAAATAATATTGATTAGTCGAATTACCTCTCAAGAC
GATAAAAATTTAATATCCTCAAGTAATAAATATATAACAACAGAGGAATAGTGGTGGTGG
GAGGATGAAAAGAGAAAGACAATGTAAGAAAACATCACAGAAATAAGTGAATACTTGAAA
GATCAATAAACAACTAACAATGAGCATTTTGAAATATTAACTGGATAGATTAATATTTTC
ACATTTGAATTTATTTTGGTAAGTAAATTATAAGCAGTAAATAATTAGACAAATAGCAGA
GATAAATAATTCTGTTTTCATGAATAATTGACTTGAGTTTCACTTTGTTGTTATATGGTT
TCAGAGGATTTGTATATGAACATAAAACGCTTGAACAATAAAGTATCAGTAGTAATTAAA
TAGGTAAGAATGATAGAAGGTTATTGGTTTTTTGTTTAATTTGAATTGAATAAAACTAAG
GTAGAGTTACTATGTTAAAGAAGTATGCAATAACATAAATATGTGGTTATTTTTGTATGA
ACATTTCATTAAACAAATATCCGGAGTAAAAAAGAGAAAATAAGAATAAAAGAAAGAGAA
ATCGATGAAGCAGAAATTACATTTTTTTGTTGTAGTTTGGAAACAATTGATTTAAAGATA
CAACATTTATAATTAGTAAATAATACGTTAGTTATAAATAAGACAATTCTATTGGGCAAT
TTCTTTTATAAATCACCAAAAATTCCAGCAAATGTTTTGCGTAGGTTTTTCATAGTATCA
TCTGTATCTTCACTACTTGGTCCCGTACGTAATGAAGTTTGTCTTGGTGGGACATCTGGA
CGATCAAGTCCACTGG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)