These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7859#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1158 fasta sequence [CTCCGAGCCAATATTCGGCACGAGGCGGCACGAGGGCAAAATATGTGTATGAACTAAAAACTGATAGTGGTACCGGCGGTGGTTTATCCTCTGATAATGAAAATATGAATCCTCCTTTATCAAATATTGCCTGCCGCCGACTCACTGATGCAGATCTGTTTGTTAAACCATTGGATCCTGTTCATGTTCATCGTCATAGAAGTAAAAAAGTTGATACCTATTCTACTCCACGTACTAATGGTATTTCATCAACCAGTTCTGTACAAAGTATTGATGATCTTAGCGGTGCATCAAGTATTCGAAGTAGTAAGAGTTCAATCGCTTTCGAAATTAAGAATGATCAAAAAGTAACTGTACGACGTTTACCAGCTCCAACTTCACAACTATCCTCTCAATATCATAATAACAATAGTGATAACAACAAATCACGAAAATTAGGACAATCAACTAAGAAATTAAATAATTTTAATTGTAAATCTGCATTTTCTTCATCTAAATTAACTAGAACAACCACTAATACTTCAACTCCATTAATCCCTCAATGATTTCTGATGGTCAACAATGTACATTTTATTTGATATACTTTTGTGATCTGAATTGTTCACCTTGAACCGCGAAAAATAAGCTGGACAAGTATCCTTATCAACATCATCATCTTCATCTAAGAAGCTATTCATTTTCTTCTTCAATTTCCTCATTGGAATGCATTCCAGTGAACACACTTACCTTCTTTG-TTTTACATAACTCANACATACATGCACACTATTTCATTGTTCCTGTACTTCATAAACCTTAATGGTACTTCCTATTCCACAATCTCCTTTAATTAATTTCTTCAGATTTTTTTGTACATTCGATTTCGTTTCTGTACTTACCTTTTTTCATCTTTATTCTA-TGGTGTT--GAATACTG-TTG-AATCTTTCATTTTGCCTT-CGTTATCATCAACATGTTT-GTCTAATGCCTTTATTAGTTTATTTTTTTACAGAATTTTTAGTGTGTACACGAAGGGAGAAAACCAAAACAAGAAACCGTATTAGCTGATCCCGGTTCTTTATATTTTTTTCCTTTTTTTAAAAAAAAACTATTTTATTCTACAAATAAAAGTTAGATATTGTATAGTTGCTGAGTGAAAACAAACATAATTTCAAGANATATATAGT] [+] EMBL CD082726 [CTCCGAGCCAATATTCGGCACGAGGCGGCACGAGGGCAAAATATGTGTATGAACTAAAAACTGATAGTGGTACCGGCGGTGGTTTATCCTCTGATAATGAAAATATGAATCCTCCTTTATCAAATATTGCCTGCCGCCGACTCACTGATGCAGATCTGTTTGTTAAACCATTGGATCCTGTTCATGTTCATCGTCATAGAAGTAAAAAAGTTGATACCTATTCTACTCCACGTACTAATGGTATTTCATCAACCAGTTCTGTACAAAGTATTGATGATCTTAGCGGTGCATCAAGTATTCGAAGTAGTAAGAGTTCAATCGCTTTCGAAATTAAGAATGATCAAAAAGTAACTGTACGACGTTTACCAGCTCCAACTTCACAACTATCCTCTCAATATCATAATAACAATAGTGATAACAACAAATCACGAAAATTAGGACAATCAACTAAGAAATTAAATAATTTTAATTGTAAATCTGCATTTTCTTCATCTAAATTAACTAGAACAACCACTAATACTTCAACTCCATTAATCCCTCAATGATTTCTGATGGTCAACAATGTACATTTTATTTGATATACTTTTGTGATCTGAATTGTTCACCTTGAACCGCGAAAAAT AGCTGGACAAGTATCCTCATCAACATCATCAT ] [-] EMBL CD165408 [ TAACTGTACGACGTTTACCAGCTCCAACTTCACAACTATCCTCTCAATATCATAATAACAATAGTGATAACAACAAATCACGAAAATTAGGACAATCAACTAAGAAATTAAATAATTTTAATTGTAAATCTGCATTTTCTTCATCTAAATTAACTAGAACAACCACTAATACTTCAACTCCATTAATCCCTCAATGATTTCTGATGGTCAACAATGTACATTTTATTTGATATACCTTTGTGATCTGAATTGTTCACCTTGAACCGCGAAAAATAAGCTGGACAAGTATCCTTATCAACATCATCA ] [+] EMBL AI111168 [ CATTAATCCCTCAATGATTTCTGATGGTCAACAATGTACATTTTATTTGATATACTTTNGTGATCTGAATTGTTCACCTTGAACCGCGAAAAATAAGCTGGACAAGTATCCTTATCAACATCATCATCTTCATCTAAGAAGCTATTCATTTTCTTCTTCAATTTCCTCATTGGAATGCATTCCAGTGAACACACTTACCTTCTTTG TTTTACATAACTCAAACNTACNTGCNCNCTATTTCATTGTTCCTGTACTTCATAAACCTTAATGGTACTTCCTATTCCACAATCTCCTTTAATTAATTTCTTCAGATTTTTTTGTACATTCGATTTCGTTTCTGTACTTACCTTTTTTCATCTTTATTCTA TGGTGTTTGGAATACTGTTTGAAATCTTTCATTTTGCCTTCCGTTATCATCAACATGTTTGGTCTAATGCCTTTATTAGTTTATTTTTTTACAGAATTT ] [+] EMBL AI110906 [ CATTAATCCCTCAATGATTTCTGATGGTCAACAATGTACATTTTATTTGATATACTTTNGTGATCTGAATTGTTCACCTTGAACCGCGAAAAATAAGCTGGACAAGTATCCTTATCAACATCATCATCTTCATCTAANAAGCTATTCATTTTCTTCTTCAATTTCC CATTGGAATGCATTCCAGTGAACACACTTACCTTCTTTG TTTTACATAACTCANACATACATGCACACTATTTCATTGTTCCTGTACTTCATAAACCTTAATGGTACTTCCTATTCCACAATCTCCTTTAATTAATTTCTTCANATTTTTTTGTACATTCGATTTCGTTTCTGTACTTACCTTTTTTCATCTTTATTCTATTGGTGTT GAATACTG TTG AATCTTTCATTTTGCCTT CGTTATCATCAACATGTTT GTCTAATGCCTTTATTAGTTTATTTTTTTACAGAATT ] [-] EMBL CD076317 [ CGAAAAATAAGCTGGACAAGTATCCTCATCAACATCATCATCTTCATTTAAGAAGCTATTCATTTTCTTCTTCAATTTCCTCATTGGAATGCATTCCAGTGAACACACTTACCTTCTTTGTTTTTACATAACTCAGACATACATGCACACTATTTCATTGTTCCTGTACTTCATAAACCTTAATGGTACTTCCTATTCCACAATCTCCTTTAATTAATTTCTTCAGATTTTTTTGTACATTCGATTTCGTTTCTGTACTTACCTTTTTTCATCTTTATTCTATTGGTGTT GAATACTG TTG AATCTTTCATTTTGCCTT CGTTATCATCAACATGTTT GTCTAATGCCTTTATTAGTTTATTTTTTTACAGAATTTTTAGTGTGTACACGAAGGGAGAAAACCAAAACAAGAAACCGTATTAGCTGATCCCGGTTCTTTATATTTTTTTCCTTTTTTTAAAAAAAAACTATTTTATTCTACAAATAAAAGTTAGATATTGTATAGTTGCTGAGTGAAAACAAACATAATTTCAAGANATATATAGT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||