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Schistosoma mansoni
cluster # 7869 cluster # 7869       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7869#0 length = 1017 sequences # 5  

consensusID : consensus_7869#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1017
fasta sequence
                              [CCTCCAGCCAAGATTCGGCACGAGGCGATTTTCGGTGCTCTTGATAATACTGGCAGTTTAACAAATTTAGGTCGTCAAATGGTTGAATTTCCATTGGATCCAGCTTTGTCTAAATTATTGATTATTTCCTGTGATATGAATTGTTCTGAAGAGATTCTAACCATTGTATCGATGCTCTCTGTCCCGAGTGTATTCTACAGACCAAAAGGTCGTGAAGAAGAATCAGATAATGCAAGAGAGAAGTTTCAAGTTCCAGAATCTGATCATTTAACACTGTTGAACGTTTTCACTCAATGGCGTAAATCAGGTTATTCATCAGCATTTTGTGCAAAACACTTTTTACACTTAAAAGCCATGCGTAAAATTCGTGAAGTTCGACAACAAATGAAAGAAATCATGGAACAACACAACATGAATTTACAATCTATCGGCAGTGATTGGGATGTTGTACGTGAATGTTTATGCGCTACTTTCTTCCATCAAGCTGCTCGTATCAAGGGTTTAGGTGAATATGTGAATTTACGAACTGGTATGCCTTGTCATCTACATCCAACTAGTGCTCTCTATGGAATGGGTTATACTCCAGATTATGTTATTTATCATGAATTAATTATGACAACAAAAGAATATATGCAATGTGTTACATCTGTTGATGGTAATTGGTTAGCTAAAGTTGGTCCTATGTTTTACAGTGTTAAAGATCCTAACCTTACTCGATTGGAAAGAAAGCGACAAGCTGAAGAACAGCTCGTAGAAATGGAAAATGAAATGCGTCTGGCTGAAGAACAACTTTCTCGTCGACGTGAGGAACTTTCAGCATCTATTGGTTCAAGTCGTTTGCGACCAATAGTTACACCTGGTATGCGAACTCCTGGTACTCCTTTGGTATCTAAACGTCCTGGCAGTAGACTTGGTTTATAGTCTTATCTGTTGTACAATTATTAATTAATGTACATATATTATTTTTGTAAAATATTTTCAAATACAATATAAAAACTCATCTTTCAAATATATTCA]

[+] EMBL CD080779             [CCTCCAGCCAAGATTCGGCACGAGGCGATTTTCGGTGCTCTTGATAATACTGGCAGTTTAACAAATTTAGGTCGTCAAATGGTTGAATTTCCATTGGATCCAGCTTTGTCTAAATTATTGATTATTTCCTGTGATATGAATTGTTCTGAAGAGATTCTAACCATTGTATCGATGCTCTCTGTCCCGAGTGTATTCTACAGACCAAAAGGTCGTGAAGAAGAATCAGATAATGCAAGAGAGAAGTTTCAAGTTCCAGAATCTGATCATTTAACACTGTTGAACGTTTTCACTCAATGGCGTAAATCAGGTTATTCATCAGCATTTTGTGCAAAACACTTTTTACACTTAAAATCCATGCGTAAAATTCGTGAAGTTCGACAACAAATGAAAGAAATCATGGAACAACACAACATGAATTTACAATCTATCGGCAGTGATTGGGATGTTGTACGTGAATGTTTATGCGCTACTTTCTTCCATCAAGCTGCTCGTATCAAGGGTTTAGGTGAATATGTGAATTTACGAACTGGTATGCCTTGTCATCTACATCCAACTAGTGCTCTCTATGGAATGGGTTATACTCCAGATTATGTTATTTATCATGAATTAATTATGACAACAAAAGAATATATGCAATGTGTTACATCTGTTGATGGTAATTGGTTAGCTAAAGTTGGTCCTATGTTTTACAGTGTTAAAGATCCTAACCTTACTCGATTGGAAAG AAGCGAC AGCTGAAG ACAGCTCG                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD137017             [                                                                                                                                                                                                                   GTGAAGAAGAATCAGATAATGCAAGAGAGAAGTTTCAAGTTCCAGAATCTGATCATTTAACACTGTTGAACGTTTTCACTCAATGGCGTAAATCAGGTTATTCATCAGCATTTTGTGCAAAACACTTTTTACACTTAAAAGCCATGCGTAAAATTCGTGAAGTTCGACAACAAATGAAAGAAATCATGGTACAACACAACATGAATTTACAATCTATCGGCAGTGATTGGGATGTTGTACGTGAATGTTTATGCGCTACTTTCTTCCATCAAGCTGCTCGTATCAAGGGTTTAGGTGAATATGTGAATTTACGAACTGGTATGCCTTGTCATCTACATCCAACTAGTGCTCTCTATGGAATGGGTTATACTCCAGATTATGTTATTTATCATGAATTAATTATGACAACAAAAGAATATATGCAATGTGTTACATCTGTTGATGGTAATTGGTTAGCTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD078511             [                                                                                                                                                                                                                                                            CCAGAATCTGATCATTTAACACTGTTGAACGTTTTCACTCAATGGCGTAAATCAGGTTATTCATCAGCATTTTGTGCAAAACACTTTTTACACTTAAAAGCCATGCGTAAAATTCGTGAAGTTCGACAACAAATGAAAGAAATCATGGAACAACACAACATGAATTTACAATCTATCGGCAGTGATTGGGATGTTGTACGTGAATGTTTATGCGCTACTTTCTTCCATCAAGCTGCTCGTATCAAGGGTTTAGGTGAATATGTGAATTTACGAACTGGTATGCCTTGTCATCTACATCCAACTAGTGCTCTCTATGGAATGGGTTATACTCCAGATTATGTTATTTATCATGAATTAATTATGACAACAAAAGAATATATGCAATGTGTTACATCTGTTGATGGTAATTGGTTAGCTAAAGTTGGTCCTATGTTTTACAGTGTTAAAGATCCTAACCTTACTCGATTGGAAAGAAAGCGACAAGCTGAAGAACAGCTCGTAGAAATGGAAAATGAAATGCGTCTGGCTGAAGAACAACTTTCTCGTCGACGTGAGGAACTTTC                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD074702             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCAAGGGTTTAGGTGAATATGTGAATTTACGAACTGGTATGCCTTGTCATCTACATCCAACTAGTGCTCTCTATGGAATGGGTTATACTCCAGATTATGTTATTTATCATGAATTAATTATGCCACCAAAAGAATATATGCAATGTGTTACATCTGTTGATGGTAATTGGTTAGCTAAAGTTGGTCCTATGTTTTACAGTGTTAAAGATCCTACCCTTACTCGATTGGAAAGAAAGCGACAAGCTGAAGAACAGCTCGTAGAAATGGAAAATGAAATGCGTCTGGCTGAAGAACAACTTTCTCGTCGACGTGAGGAACTTTCAGCATCTATTGGTTCAAGTCGTTTGCGACCAATAGTTACACCTGGTATGCGAACTCCTGGTACTCCTTTGGTATCTAAACGTCCTGGCAGTAGACTTGGTTTATAGTCTTATCTGTTGTACAATTATTAATTAATGTACATATATTATTTTTGTAAAATATTTTCAAATACAATATAAAAACTCATCTTTCAAATATATTCA]
[-] EMBL CD072980             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTTATCATGAATTAATTATGACAACAAAAGAATATATGCAATGTGTTACATCTGTTGATGGTAATTGGTTAGCTAAAGTTGGTCCTATGTTTTACAGTGTTAAAGATCCTAACCTTACTCGATTGGAAAGAAAGCGACAAGCTGAAGAACAGCTCGTAGAAATGGAAAATGAAATGCGTCTGGCTGAAGAACAACTTTCTCGTCGACGTGAGGAACTTTCAGTATCTATTGGTTCAAGTCGTTTGCGACCAATAGTTACACCTGGTATGCGAACTCCTGGTACTCCTTTGGTATCTAAACGTCCTGGCAGTAGACTTGGTTTATAGTCTTATCTGTTGTACAATTATTAATTAATGTACATATATTATTTTTGTAAAATATTTTCAAATACAATATAAAAACTCATCTTTCAAATATATTCA]


>consensus_7869#0 CCTCCAGCCAAGATTCGGCACGAGGCGATTTTCGGTGCTCTTGATAATACTGGCAGTTTA ACAAATTTAGGTCGTCAAATGGTTGAATTTCCATTGGATCCAGCTTTGTCTAAATTATTG ATTATTTCCTGTGATATGAATTGTTCTGAAGAGATTCTAACCATTGTATCGATGCTCTCT GTCCCGAGTGTATTCTACAGACCAAAAGGTCGTGAAGAAGAATCAGATAATGCAAGAGAG AAGTTTCAAGTTCCAGAATCTGATCATTTAACACTGTTGAACGTTTTCACTCAATGGCGT AAATCAGGTTATTCATCAGCATTTTGTGCAAAACACTTTTTACACTTAAAAGCCATGCGT AAAATTCGTGAAGTTCGACAACAAATGAAAGAAATCATGGAACAACACAACATGAATTTA CAATCTATCGGCAGTGATTGGGATGTTGTACGTGAATGTTTATGCGCTACTTTCTTCCAT CAAGCTGCTCGTATCAAGGGTTTAGGTGAATATGTGAATTTACGAACTGGTATGCCTTGT CATCTACATCCAACTAGTGCTCTCTATGGAATGGGTTATACTCCAGATTATGTTATTTAT CATGAATTAATTATGACAACAAAAGAATATATGCAATGTGTTACATCTGTTGATGGTAAT TGGTTAGCTAAAGTTGGTCCTATGTTTTACAGTGTTAAAGATCCTAACCTTACTCGATTG GAAAGAAAGCGACAAGCTGAAGAACAGCTCGTAGAAATGGAAAATGAAATGCGTCTGGCT GAAGAACAACTTTCTCGTCGACGTGAGGAACTTTCAGCATCTATTGGTTCAAGTCGTTTG CGACCAATAGTTACACCTGGTATGCGAACTCCTGGTACTCCTTTGGTATCTAAACGTCCT GGCAGTAGACTTGGTTTATAGTCTTATCTGTTGTACAATTATTAATTAATGTACATATAT TATTTTTGTAAAATATTTTCAAATACAATATAAAAACTCATCTTTCAAATATATTCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)