These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7869#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1017 fasta sequence [CCTCCAGCCAAGATTCGGCACGAGGCGATTTTCGGTGCTCTTGATAATACTGGCAGTTTAACAAATTTAGGTCGTCAAATGGTTGAATTTCCATTGGATCCAGCTTTGTCTAAATTATTGATTATTTCCTGTGATATGAATTGTTCTGAAGAGATTCTAACCATTGTATCGATGCTCTCTGTCCCGAGTGTATTCTACAGACCAAAAGGTCGTGAAGAAGAATCAGATAATGCAAGAGAGAAGTTTCAAGTTCCAGAATCTGATCATTTAACACTGTTGAACGTTTTCACTCAATGGCGTAAATCAGGTTATTCATCAGCATTTTGTGCAAAACACTTTTTACACTTAAAAGCCATGCGTAAAATTCGTGAAGTTCGACAACAAATGAAAGAAATCATGGAACAACACAACATGAATTTACAATCTATCGGCAGTGATTGGGATGTTGTACGTGAATGTTTATGCGCTACTTTCTTCCATCAAGCTGCTCGTATCAAGGGTTTAGGTGAATATGTGAATTTACGAACTGGTATGCCTTGTCATCTACATCCAACTAGTGCTCTCTATGGAATGGGTTATACTCCAGATTATGTTATTTATCATGAATTAATTATGACAACAAAAGAATATATGCAATGTGTTACATCTGTTGATGGTAATTGGTTAGCTAAAGTTGGTCCTATGTTTTACAGTGTTAAAGATCCTAACCTTACTCGATTGGAAAGAAAGCGACAAGCTGAAGAACAGCTCGTAGAAATGGAAAATGAAATGCGTCTGGCTGAAGAACAACTTTCTCGTCGACGTGAGGAACTTTCAGCATCTATTGGTTCAAGTCGTTTGCGACCAATAGTTACACCTGGTATGCGAACTCCTGGTACTCCTTTGGTATCTAAACGTCCTGGCAGTAGACTTGGTTTATAGTCTTATCTGTTGTACAATTATTAATTAATGTACATATATTATTTTTGTAAAATATTTTCAAATACAATATAAAAACTCATCTTTCAAATATATTCA] [+] EMBL CD080779 [CCTCCAGCCAAGATTCGGCACGAGGCGATTTTCGGTGCTCTTGATAATACTGGCAGTTTAACAAATTTAGGTCGTCAAATGGTTGAATTTCCATTGGATCCAGCTTTGTCTAAATTATTGATTATTTCCTGTGATATGAATTGTTCTGAAGAGATTCTAACCATTGTATCGATGCTCTCTGTCCCGAGTGTATTCTACAGACCAAAAGGTCGTGAAGAAGAATCAGATAATGCAAGAGAGAAGTTTCAAGTTCCAGAATCTGATCATTTAACACTGTTGAACGTTTTCACTCAATGGCGTAAATCAGGTTATTCATCAGCATTTTGTGCAAAACACTTTTTACACTTAAAATCCATGCGTAAAATTCGTGAAGTTCGACAACAAATGAAAGAAATCATGGAACAACACAACATGAATTTACAATCTATCGGCAGTGATTGGGATGTTGTACGTGAATGTTTATGCGCTACTTTCTTCCATCAAGCTGCTCGTATCAAGGGTTTAGGTGAATATGTGAATTTACGAACTGGTATGCCTTGTCATCTACATCCAACTAGTGCTCTCTATGGAATGGGTTATACTCCAGATTATGTTATTTATCATGAATTAATTATGACAACAAAAGAATATATGCAATGTGTTACATCTGTTGATGGTAATTGGTTAGCTAAAGTTGGTCCTATGTTTTACAGTGTTAAAGATCCTAACCTTACTCGATTGGAAAG AAGCGAC AGCTGAAG ACAGCTCG ] [-] EMBL CD137017 [ GTGAAGAAGAATCAGATAATGCAAGAGAGAAGTTTCAAGTTCCAGAATCTGATCATTTAACACTGTTGAACGTTTTCACTCAATGGCGTAAATCAGGTTATTCATCAGCATTTTGTGCAAAACACTTTTTACACTTAAAAGCCATGCGTAAAATTCGTGAAGTTCGACAACAAATGAAAGAAATCATGGTACAACACAACATGAATTTACAATCTATCGGCAGTGATTGGGATGTTGTACGTGAATGTTTATGCGCTACTTTCTTCCATCAAGCTGCTCGTATCAAGGGTTTAGGTGAATATGTGAATTTACGAACTGGTATGCCTTGTCATCTACATCCAACTAGTGCTCTCTATGGAATGGGTTATACTCCAGATTATGTTATTTATCATGAATTAATTATGACAACAAAAGAATATATGCAATGTGTTACATCTGTTGATGGTAATTGGTTAGCTAA ] [+] EMBL CD078511 [ CCAGAATCTGATCATTTAACACTGTTGAACGTTTTCACTCAATGGCGTAAATCAGGTTATTCATCAGCATTTTGTGCAAAACACTTTTTACACTTAAAAGCCATGCGTAAAATTCGTGAAGTTCGACAACAAATGAAAGAAATCATGGAACAACACAACATGAATTTACAATCTATCGGCAGTGATTGGGATGTTGTACGTGAATGTTTATGCGCTACTTTCTTCCATCAAGCTGCTCGTATCAAGGGTTTAGGTGAATATGTGAATTTACGAACTGGTATGCCTTGTCATCTACATCCAACTAGTGCTCTCTATGGAATGGGTTATACTCCAGATTATGTTATTTATCATGAATTAATTATGACAACAAAAGAATATATGCAATGTGTTACATCTGTTGATGGTAATTGGTTAGCTAAAGTTGGTCCTATGTTTTACAGTGTTAAAGATCCTAACCTTACTCGATTGGAAAGAAAGCGACAAGCTGAAGAACAGCTCGTAGAAATGGAAAATGAAATGCGTCTGGCTGAAGAACAACTTTCTCGTCGACGTGAGGAACTTTC ] [-] EMBL CD074702 [ ATCAAGGGTTTAGGTGAATATGTGAATTTACGAACTGGTATGCCTTGTCATCTACATCCAACTAGTGCTCTCTATGGAATGGGTTATACTCCAGATTATGTTATTTATCATGAATTAATTATGCCACCAAAAGAATATATGCAATGTGTTACATCTGTTGATGGTAATTGGTTAGCTAAAGTTGGTCCTATGTTTTACAGTGTTAAAGATCCTACCCTTACTCGATTGGAAAGAAAGCGACAAGCTGAAGAACAGCTCGTAGAAATGGAAAATGAAATGCGTCTGGCTGAAGAACAACTTTCTCGTCGACGTGAGGAACTTTCAGCATCTATTGGTTCAAGTCGTTTGCGACCAATAGTTACACCTGGTATGCGAACTCCTGGTACTCCTTTGGTATCTAAACGTCCTGGCAGTAGACTTGGTTTATAGTCTTATCTGTTGTACAATTATTAATTAATGTACATATATTATTTTTGTAAAATATTTTCAAATACAATATAAAAACTCATCTTTCAAATATATTCA] [-] EMBL CD072980 [ ATTTATCATGAATTAATTATGACAACAAAAGAATATATGCAATGTGTTACATCTGTTGATGGTAATTGGTTAGCTAAAGTTGGTCCTATGTTTTACAGTGTTAAAGATCCTAACCTTACTCGATTGGAAAGAAAGCGACAAGCTGAAGAACAGCTCGTAGAAATGGAAAATGAAATGCGTCTGGCTGAAGAACAACTTTCTCGTCGACGTGAGGAACTTTCAGTATCTATTGGTTCAAGTCGTTTGCGACCAATAGTTACACCTGGTATGCGAACTCCTGGTACTCCTTTGGTATCTAAACGTCCTGGCAGTAGACTTGGTTTATAGTCTTATCTGTTGTACAATTATTAATTAATGTACATATATTATTTTTGTAAAATATTTTCAAATACAATATAAAAACTCATCTTTCAAATATATTCA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||