These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7880#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 976 fasta sequence [GTGGTCTAGCCAAAAT-GATTGGAATCGAACAGAATTCTACAAAAGCTTTTCAACAGATAATTCAACAAAAGGTTAATTCATTATTACAGACGAAATTTAT-AGAGAATACACAAAATTCACAAGAATTAATTATTGCATTCAATCGTCTTTGTGAAATCCTCGGTATTGTTATGGAGAGTAAACTTTTACTGGCTAATAATTTGTTTGATCGTCAACGATGGTTACAAAATTTCCAATCAGAATTAAATCGTCTCGATGCAATTATTCAACGTTGTCTTCGTCGTATGTGTCGTGTCACTACAACTGGTACATTAATATCTCAATTAAATGAAGCTGGTCCCACCTATGCTCGCTGTTTAGCTGAAATTGTTAGACGTACAGAATTTGACGATATGCTTACTCAACGATCTGTATGTTATCTTAAAGAGGAAACTAATTTGAGAACTGAAGAATGTCGCCGACGGCGTATATTTTCTAAACATTTAAAAAATAACGTTCTACATTCACTCTTCTCTCCATGGACTAATCCAAAAGCGGAATCTCTTGGGCTTAGCAACATACCAGGAACAATTTCTATGTCACAAGATGTAGCTGAACAGCAGTTGTGTGAAACATCTACCTCCTTCCCCACTACTACTACTACTACTACTATTACGACTACATCTAATCAGAAAGTCGATTCACTTTCACATAGTCCTCATATAAATACTACGGAATTCACAGTGAATCGACGATTCGCCTTATCTTCTTTATCTGAACCACGTTTAAATGAATTAGCCAAAGCTTGTGCATTGAATCGTGTACAACATTCTCGTGTTCGTTCAACTCGATTAAATTCACTTAGTTCTCCAGATCCTCAGTTGACTAAGGTTAAAGAAGATGAAATGATTGAATCGGATCAAAATAAAAAACGTTCAAATTATAATTGTCCTATACAACACCAACCAGTTTTGTTACGTCCACAACATACTAAACT] [+] EMBL CD127406 [GTGGTCTAGCCGGAATAGATTGGAATCGAACAGAATTCTCCAAAAGCTTTTCAACAGATAATTCAACAAAAGGTTAATTCATTATTACAGACGAAATTTAT AGAGAATACACAAAATTCACAAGAATTAATTATTGCATTCAATCGTCTTTGTGAAATCCTCGGTATTGTTATGGAGAGTAAACTTTTACTGGCTAATAATTTGTTTGATCGTCAACGATGGTTACAAAATTTCCAATCAGAATTAAATCGTCTCGATGCAATTATTCAACGTTGTCTTCGTCGTATGTGTCGTGTCACTACAACTGGTACATTAATATCTCAATTAAATGAAGCTGGTCCCACCTATGCTCGCTGTTTAGCTGAAATTGTTAGACGTACAGAATTTGACGATATGCTTACTCAACGATCTGTATGTTATCTTAAAGAGGAAACTAATTTGAGAACTGAAGAATGTCGCCGACGGCGTATATTTTCTAAACATTTAAAAAATAACGTTCTACATTCACTCTTCTCTCCATGGACTAATCCAAAAGCGGAATCTCTTGGGCTTAGCAACATACCAGGAACAATTTCTATGTCACAAGATGTAGCTGAACAGCAGTTG ] [+] EMBL CD127447 [ AAAAT GATTGGAATCGAACAGAATTCTACAAAAGCTTTTCAACAGATAATTCAACAAAAGGTTAATTCATTATTACAGACGAAATTTAT AGAGAATACACAAAATTCACAAGAATTAATTATTGCATTCAATCGTCTTTGTGAAATCCTCGGTATTGTTATGGAGAGTAAACTTTTACTGGCTAATAATTTGTTTGATCGTCAACGATGGTTACAAAATTTCCAATCAGAATTAAATCGTCTCGATGCAATTATTCAACGTTGTCTTCGTCGTATGTGTCGTGTCACTACAACTGGTACATTAATATCTCAATTAAATGAAGCTGGTCCCACCTATGCTCGCTGTTTAGCTGAAATTGTTAGACGTACAGAATTTGACGATATGCTTACTCAACGATCTGTATGTTATCTTAAAGAGGAAACTAATTTGAGAACTGAAGAATGTCGCCGACGGCGTATATTTTCTAAACATTTAAAAAATAACGTTCTACATTCACTCTTCTCTCCATGGACTAATCCAAAAGCGGAATCTCTTGGGCTTAGCAACATACCAGGAACAATTTCTATGTCACAAGATGTAGCTGAACAGCAGTTGTGTGAAACATCTACCTCCTTCC ] [+] EMBL CD127369 [ AAAA GATTGGAATCGAACAGAATTCTACAAAAGCTTTTCAACAGATAATTCAACAAAAGGTTAATTCATTATTACAGACGAAATTTAT AGAGAATACACAAAATTCACAAGAATTAATTATTGCATTCAATCGTCTTTGTGAAATCCTCGGTATTGTTATGGAGAGTAAACTTTTACTGGCTAATAATTTGTTTGATCGTCAACGATGGTTACAAAATTTCCAATCAGAATTAAATCGTCTCGATGCAATTATTCAACGTTGTCTTCGTCGTATGTGTCGTGTCACTACAACTGGTACATTAATATCTCAATTAAATGAAGCTGGTCCCACCTATGCTCGCTGTTTAGCTGAAATTGTTAGACGTACAGAATTTGACGATATGCTTACTCAACGATCTGTATGTTATCTTAAAGAGGAAACTAATTTGAGAACTGAAGAATGTCGCCGACGGCGTATATTTTCTAAACATTTAAAAAATAACGTTCTACATTCACTCTTCTCTCCATGGACTAATCCAAAAGCGGAATCTCTTGGGCTTAGCAACATACCAGGAACAATTTCTATGTCACAAGATGTAGCTGAACAGCAGTTGTGTGAAA ] [+] EMBL CD127897 [ ggaatttT GATTGAGATCGAACAGAATACTACCCCAGCTGTTCAACAGATAATTCAACAAAAGGTTAATTCATTATTACAGACGAACTTTATAAGAGAATACACAAAATTCACAAGAATTAATTATTGCATTCAATCGTCTTTGTGAAATCCTCGGTATTGTTATGGAGAGTAAACTTTTACTGGCTAATAATTTGTTGGATCGTCAACGATGGTTACAAAATTTCCAATCAGAATTAAATCGTCTCGATGCAATTATTCAACGTTGGCTTCGGCGCATGTGTCGTGTCACTACAACTGGTACATTAATATCTCAATTAAATGAATCTGGTCCCACCTATGCTCGCTGTTTAACTGAAATGGTTAGACGTACAGAATCTGACGATATGCTTACTCAACGATCTGCGTGTTATCTTAAAGAGGAAACTAATTTGAGAACTGAAGAATGTCGCCGACGGCGTATATTTTCTAAACATTTAAAAAATAACGTTCTACATTCACTCTTCTCTCCATGGACTAATCCAAAAGCGGAATCTCTTGGGCTTAGCAACATACCAGGAACAATTTCTATGTCACAAGATGTAGCTGAACAGCAGTTGTGTGAAACATC ] [+] EMBL CD195575 [ TTTCTATGTCACAAGATGTAGCTGAACAGCAGTTGTGTGAAACATCTACCACCACCACCACTACTACTACTACTACTACTATTACGACTACATCTAATCAGAAAGTCGATTCACTTTCACATAGTCCTCATATAAATACTACGGAATTCACAGTGAATCGACGATTCGCCTTATCTTCTTTATCTGAACCACGTTTAAATGAATTAGCCAAAGCTTGTGCATTGAATCGTGTACAACATTCTCGTGTTCGTTCAACTCGATTAAATTCACTTAGTTCTCCAGATCCTCAGTTGACTAAGGTTAAAGAAGATGAAATGATTGAATCGGATCAAAATAAAAAACGTTCAAATTATAATTGTCCTATACAACACCAACCAGTTTTGTTACGTCCACAACATACTAAACT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||