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Schistosoma mansoni
cluster # 7880 cluster # 7880       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7880#0 length = 976 sequences # 5  
consensusID : consensus_7880#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 976
fasta sequence 
                              [GTGGTCTAGCCAAAAT-GATTGGAATCGAACAGAATTCTACAAAAGCTTTTCAACAGATAATTCAACAAAAGGTTAATTCATTATTACAGACGAAATTTAT-AGAGAATACACAAAATTCACAAGAATTAATTATTGCATTCAATCGTCTTTGTGAAATCCTCGGTATTGTTATGGAGAGTAAACTTTTACTGGCTAATAATTTGTTTGATCGTCAACGATGGTTACAAAATTTCCAATCAGAATTAAATCGTCTCGATGCAATTATTCAACGTTGTCTTCGTCGTATGTGTCGTGTCACTACAACTGGTACATTAATATCTCAATTAAATGAAGCTGGTCCCACCTATGCTCGCTGTTTAGCTGAAATTGTTAGACGTACAGAATTTGACGATATGCTTACTCAACGATCTGTATGTTATCTTAAAGAGGAAACTAATTTGAGAACTGAAGAATGTCGCCGACGGCGTATATTTTCTAAACATTTAAAAAATAACGTTCTACATTCACTCTTCTCTCCATGGACTAATCCAAAAGCGGAATCTCTTGGGCTTAGCAACATACCAGGAACAATTTCTATGTCACAAGATGTAGCTGAACAGCAGTTGTGTGAAACATCTACCTCCTTCCCCACTACTACTACTACTACTACTATTACGACTACATCTAATCAGAAAGTCGATTCACTTTCACATAGTCCTCATATAAATACTACGGAATTCACAGTGAATCGACGATTCGCCTTATCTTCTTTATCTGAACCACGTTTAAATGAATTAGCCAAAGCTTGTGCATTGAATCGTGTACAACATTCTCGTGTTCGTTCAACTCGATTAAATTCACTTAGTTCTCCAGATCCTCAGTTGACTAAGGTTAAAGAAGATGAAATGATTGAATCGGATCAAAATAAAAAACGTTCAAATTATAATTGTCCTATACAACACCAACCAGTTTTGTTACGTCCACAACATACTAAACT]

[+] EMBL CD127406             [GTGGTCTAGCCGGAATAGATTGGAATCGAACAGAATTCTCCAAAAGCTTTTCAACAGATAATTCAACAAAAGGTTAATTCATTATTACAGACGAAATTTAT AGAGAATACACAAAATTCACAAGAATTAATTATTGCATTCAATCGTCTTTGTGAAATCCTCGGTATTGTTATGGAGAGTAAACTTTTACTGGCTAATAATTTGTTTGATCGTCAACGATGGTTACAAAATTTCCAATCAGAATTAAATCGTCTCGATGCAATTATTCAACGTTGTCTTCGTCGTATGTGTCGTGTCACTACAACTGGTACATTAATATCTCAATTAAATGAAGCTGGTCCCACCTATGCTCGCTGTTTAGCTGAAATTGTTAGACGTACAGAATTTGACGATATGCTTACTCAACGATCTGTATGTTATCTTAAAGAGGAAACTAATTTGAGAACTGAAGAATGTCGCCGACGGCGTATATTTTCTAAACATTTAAAAAATAACGTTCTACATTCACTCTTCTCTCCATGGACTAATCCAAAAGCGGAATCTCTTGGGCTTAGCAACATACCAGGAACAATTTCTATGTCACAAGATGTAGCTGAACAGCAGTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD127447             [           AAAAT GATTGGAATCGAACAGAATTCTACAAAAGCTTTTCAACAGATAATTCAACAAAAGGTTAATTCATTATTACAGACGAAATTTAT AGAGAATACACAAAATTCACAAGAATTAATTATTGCATTCAATCGTCTTTGTGAAATCCTCGGTATTGTTATGGAGAGTAAACTTTTACTGGCTAATAATTTGTTTGATCGTCAACGATGGTTACAAAATTTCCAATCAGAATTAAATCGTCTCGATGCAATTATTCAACGTTGTCTTCGTCGTATGTGTCGTGTCACTACAACTGGTACATTAATATCTCAATTAAATGAAGCTGGTCCCACCTATGCTCGCTGTTTAGCTGAAATTGTTAGACGTACAGAATTTGACGATATGCTTACTCAACGATCTGTATGTTATCTTAAAGAGGAAACTAATTTGAGAACTGAAGAATGTCGCCGACGGCGTATATTTTCTAAACATTTAAAAAATAACGTTCTACATTCACTCTTCTCTCCATGGACTAATCCAAAAGCGGAATCTCTTGGGCTTAGCAACATACCAGGAACAATTTCTATGTCACAAGATGTAGCTGAACAGCAGTTGTGTGAAACATCTACCTCCTTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD127369             [            AAAA GATTGGAATCGAACAGAATTCTACAAAAGCTTTTCAACAGATAATTCAACAAAAGGTTAATTCATTATTACAGACGAAATTTAT AGAGAATACACAAAATTCACAAGAATTAATTATTGCATTCAATCGTCTTTGTGAAATCCTCGGTATTGTTATGGAGAGTAAACTTTTACTGGCTAATAATTTGTTTGATCGTCAACGATGGTTACAAAATTTCCAATCAGAATTAAATCGTCTCGATGCAATTATTCAACGTTGTCTTCGTCGTATGTGTCGTGTCACTACAACTGGTACATTAATATCTCAATTAAATGAAGCTGGTCCCACCTATGCTCGCTGTTTAGCTGAAATTGTTAGACGTACAGAATTTGACGATATGCTTACTCAACGATCTGTATGTTATCTTAAAGAGGAAACTAATTTGAGAACTGAAGAATGTCGCCGACGGCGTATATTTTCTAAACATTTAAAAAATAACGTTCTACATTCACTCTTCTCTCCATGGACTAATCCAAAAGCGGAATCTCTTGGGCTTAGCAACATACCAGGAACAATTTCTATGTCACAAGATGTAGCTGAACAGCAGTTGTGTGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD127897             [        ggaatttT GATTGAGATCGAACAGAATACTACCCCAGCTGTTCAACAGATAATTCAACAAAAGGTTAATTCATTATTACAGACGAACTTTATAAGAGAATACACAAAATTCACAAGAATTAATTATTGCATTCAATCGTCTTTGTGAAATCCTCGGTATTGTTATGGAGAGTAAACTTTTACTGGCTAATAATTTGTTGGATCGTCAACGATGGTTACAAAATTTCCAATCAGAATTAAATCGTCTCGATGCAATTATTCAACGTTGGCTTCGGCGCATGTGTCGTGTCACTACAACTGGTACATTAATATCTCAATTAAATGAATCTGGTCCCACCTATGCTCGCTGTTTAACTGAAATGGTTAGACGTACAGAATCTGACGATATGCTTACTCAACGATCTGCGTGTTATCTTAAAGAGGAAACTAATTTGAGAACTGAAGAATGTCGCCGACGGCGTATATTTTCTAAACATTTAAAAAATAACGTTCTACATTCACTCTTCTCTCCATGGACTAATCCAAAAGCGGAATCTCTTGGGCTTAGCAACATACCAGGAACAATTTCTATGTCACAAGATGTAGCTGAACAGCAGTTGTGTGAAACATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD195575             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTCTATGTCACAAGATGTAGCTGAACAGCAGTTGTGTGAAACATCTACCACCACCACCACTACTACTACTACTACTACTATTACGACTACATCTAATCAGAAAGTCGATTCACTTTCACATAGTCCTCATATAAATACTACGGAATTCACAGTGAATCGACGATTCGCCTTATCTTCTTTATCTGAACCACGTTTAAATGAATTAGCCAAAGCTTGTGCATTGAATCGTGTACAACATTCTCGTGTTCGTTCAACTCGATTAAATTCACTTAGTTCTCCAGATCCTCAGTTGACTAAGGTTAAAGAAGATGAAATGATTGAATCGGATCAAAATAAAAAACGTTCAAATTATAATTGTCCTATACAACACCAACCAGTTTTGTTACGTCCACAACATACTAAACT]




>consensus_7880#0
GTGGTCTAGCCAAAATGATTGGAATCGAACAGAATTCTACAAAAGCTTTTCAACAGATAA
TTCAACAAAAGGTTAATTCATTATTACAGACGAAATTTATAGAGAATACACAAAATTCAC
AAGAATTAATTATTGCATTCAATCGTCTTTGTGAAATCCTCGGTATTGTTATGGAGAGTA
AACTTTTACTGGCTAATAATTTGTTTGATCGTCAACGATGGTTACAAAATTTCCAATCAG
AATTAAATCGTCTCGATGCAATTATTCAACGTTGTCTTCGTCGTATGTGTCGTGTCACTA
CAACTGGTACATTAATATCTCAATTAAATGAAGCTGGTCCCACCTATGCTCGCTGTTTAG
CTGAAATTGTTAGACGTACAGAATTTGACGATATGCTTACTCAACGATCTGTATGTTATC
TTAAAGAGGAAACTAATTTGAGAACTGAAGAATGTCGCCGACGGCGTATATTTTCTAAAC
ATTTAAAAAATAACGTTCTACATTCACTCTTCTCTCCATGGACTAATCCAAAAGCGGAAT
CTCTTGGGCTTAGCAACATACCAGGAACAATTTCTATGTCACAAGATGTAGCTGAACAGC
AGTTGTGTGAAACATCTACCTCCTTCCCCACTACTACTACTACTACTACTATTACGACTA
CATCTAATCAGAAAGTCGATTCACTTTCACATAGTCCTCATATAAATACTACGGAATTCA
CAGTGAATCGACGATTCGCCTTATCTTCTTTATCTGAACCACGTTTAAATGAATTAGCCA
AAGCTTGTGCATTGAATCGTGTACAACATTCTCGTGTTCGTTCAACTCGATTAAATTCAC
TTAGTTCTCCAGATCCTCAGTTGACTAAGGTTAAAGAAGATGAAATGATTGAATCGGATC
AAAATAAAAAACGTTCAAATTATAATTGTCCTATACAACACCAACCAGTTTTGTTACGTC
CACAACATACTAAACT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)