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Schistosoma mansoni
cluster # 7886 cluster # 7886       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7886#0 length = 1235 sequences # 5  
consensusID : consensus_7886#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1235
fasta sequence 
                              [TTTGAACAGACAATTTCTGTTCCGATCTCACGATGTCGGTAAACCGAAAGCCAATGTTGCTGCTGATTTTATCATGCGCCGCATTCCAACATGCAAGGTCGTCCCACATTACAATAAAATTCAAGATTTCGGTGCGCCATTTTATAAACAATTTAATGCTGTGGTTTGTGGTCTTGATTCAGTCACAGCTCGACGGTGGTAACTCTATGCTGGCAAGTCTAGTTCGTTATAATCCAGATGGTCAACCAGATCCAAACACTGTCATACCACTTGTTGATGGTGGGACAGAGGGATTCAAAGGACATGTCCTCGTTGTTCTGTATGGCCTAACTGGATGCCTAGAATGTACACTTGACCTATACCCTCCACCAACCAATTTTCCCTTATGTACTATAGCGCATACTCCTCGCCTTCCAGAACATTGCATAGAATATGTAAGAATACTGTTGTGGTCAAAAGACAATCCATTTGGAGATAATGTTGCAATCGACGGTGATTCACCTGAACACATACAATGGATATATGAAAAGTCATGTGAAAGGGCTAAACAATTCGGAATTTCAGGTGTTACACTACGTCTTGTACAAGGTGTTGTAAAGCGAATAATCCCTGCTGTCGCTTCTACAAATGCTGTTATCGCAGCTGCATGTGCAACTGAGGTCTTCAAACTAATCACATTCTGTTACAATTATTTGGATAATTACATGAATTTCAGTGATATTGATGGAGTTTATACCTATGGTTTTTCTGTTGAACGCAAAGCTGATTGTCTTGCCTGTAACAATGTGCCTCGAACTCTTCGTTTGCAGACTGGTTGTACACTAAGAGATCTTATAAATGTTTTGAAGACAGATCCTGAATTTCAAATGCAGTCACCCAGTATAACAACAATTATTGATGATCAACATCGTTCATTGTATATCAATTTTCCAGAATTGGTTGATACATTGAAACCGAATTTGTTTAAAACCCTTCAAGAACTTGGTCTTATTAATGGTCAAATCATTCATGTTAGTGATATTACAACACCTAGAACATTATCTATAAAGCTTCAATTGGATGATAAGTAATAATGCAAATAATTTGGTCGCTCTGAATTAATCTCATTGAAGCCAACTATTTATTGATGATAACATAATTATTATATTATAAAATGTATTATTATTATTATCATTATTATTTCTTGTATCTTTGTGATATGGTTATTTTAGTTGTCATAGTAAATATAACGTTGT]

[+] EMBL CD080499             [TTTGAACAGACAATTTCTGTTCCGATCTCACGATGTCGGTAAACCGAAAGCCAATGTTGCTGCTGATTTTATCATGCGCCGCATTCCAACATGCAAGGTCGTCCCACATTACAATAAAATTCAAGATTTCGGTGCGCCATTTTATAAACAATTTAATGCTGTGGTTTGTGGTCTTGATTCAGTCACAGCTCGACGGTGGTAACTCTATGCTGGCAAGTCTAGTTCGTTATAATCCAGATGGTCAACCAGATCCAAACACTGTCATACCACTTGTTGATGGTGGGACAGAGGGATTCAAAGGACATGTCCTCGTTGTTCTGTATGGCCTAACTGGATGCCTAGAATGTACACTTGACCTATACCCTCCACCAACCAATTTTCCCTTATGTACTATAGCGCATACTCCTCGCCTTCCAGAACATTGCATAGAATATGTAAGAATACTGTTGTGGTCAAAAGACAATCCATTTGGAGATAATGTTGCAATCGACGGTGATTCACCTGAACACATACAATGGATATATGAAAAGTCATGTGAAAGGGCTAAACAATTCGGAATTTCAGGTGTTACACTACGTCTTGTACAAGGTGTTGTAAAGCGAATAATCCCTGCTGTCGCTTCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD078552             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGACATGTCCTCGTTGTTCTGTATGGCCTAACTGGATGCCTAGAATGTACACTTGACCTATACCCTCCACCAACCAATTTTCCCTTATGTACTATAGCGCATACTCCTCGCCTTCCAGAACATTGCATAGAATATGTAAGAATACTGTTGTGGTCAAAAGACAATCCATTTGGAGATAATGTTGCAATCGACGGTGATTCACCTGAACACATACAATGGATATATGAAAAGTCATGTGAAAGGGCTAAACAATTCGGAATTTCAGGTGTTACACTACGTCTTGTACAAGGTGTTGTAAAGCGAATAATCCCTGCTGTCGCTTCTACAAATGCTGTTATCGCAGCTGCATGTGCAACTGAGGTCTTCAAACTAATCACATTCTGTTACAATTATTTGGATAATTACATGAATTTCAGTGATATTGATGGAGTTTATACCTATGGTTTTTCTGTTGAACGCAAAGCTGATTGTCTTGCCTGTAACAATGTGCCTCGAACTCTTCGTTTGCAGACTGGTTGTACACTAAGAGATCTTATAAATGTTNTGAAGACAGATCCTGAATTTCAAATGCAGTCAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD074409             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AATCACATTCTGTTACAATTATTTGGATAATTACATGAATTTCAGTGATATTGATGGAGTTTATACCTATGGTTTTTCTGTTGAACGCAAAGCTGATTGTCTTGCCTGTAACAATGTGCCTCGAACTTTTTGTTTGCAGACTGGTTGTACACTAAGAGATTTTATAAATGTTTTGAAGACAGATCCTGAATTTCAAATGCAGTCACCCAGTATAACAACAATTATTGATGATCAACATCGTTCATTGTATATCAATTTTCCAGAATTGGTTGATACATTGAAACCGAATTTGTTTAAAACCCTTCAAGAACTTGGTTTTATTAATGGTCAAATCATTCATGTTAGTGATATTACAACACCTAGAACATTATTTATAAAGCTTCAATTGGATGATAAGTAATAATGCAAATAATTTGGTCGCTTTGAATTAATTTCATTGAAGCCAACTATTTATTGATGATAACATAATTATTATATTATAAAATGTATTATTATTATTATCATTATTATTTTTTGTATCTTTGTGATATGGTTATTTTAGTTGTCATAGTAAATATAACGTT  ]
[-] EMBL CD073019             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTTTATACCTATGGTTTTTCTGTTGAACGCAAAGCTGATTGTCTTGCCTGTAACAATGTGCCTCGAACTCTTCGTTTGCAGACTGGTTGTACACTAAGAGATCTTATAAATGTTTTGAAGACAGATCCTGAATTTCAAATGCAGTCACCCAGTATAACAACAATTATTGATGATCAACATCGTTCATTGTATATCAATCTTCCAGAATTGGTTGATACATTGAAACCGAATTTGTTTAAAACCCTTCAAGAACTTGGTCTTATTAATGGTCAAATCATTCATGTTAGTGATATTACAACACCTAGAACATTATCTATAAAGCTTCAATTGGATGATAAGTAATAATGCAAATAATTTGGTCGCTCTGAATTAATCTCATTGAAGCCAACTATTTATTGATGATAACATAATTATTATATTATAAAATGTATTATTATTATTATCATTATTATTTCTTGTATCTTTGTGATATGGTTATTTTAGTTGTCATAGTAAATATAACGTTGT]
[-] EMBL AI764901             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CATTGAAACCGGAATTGTCTAAAACCCTTCAAGAACTTGGTCTTATTAATGGTCAAATCATTCATGTTAGTGATATTACAACACCTAGAACATTATCTATAAAACTTCAATTGGATGATAAGTAATAATGCAAATAATTTGGTCGCTCTGAATTAATCTCATTGAAGCCAACTATTTATTGATGATAACATGATTATTATATTATAAAATGTATTATTATTATTATCATTATTATTTCTTGTATCTTTGTGATATGGTTATTTTAGTTGTCATAGTAAATATAACGTT  ]




>consensus_7886#0
TTTGAACAGACAATTTCTGTTCCGATCTCACGATGTCGGTAAACCGAAAGCCAATGTTGC
TGCTGATTTTATCATGCGCCGCATTCCAACATGCAAGGTCGTCCCACATTACAATAAAAT
TCAAGATTTCGGTGCGCCATTTTATAAACAATTTAATGCTGTGGTTTGTGGTCTTGATTC
AGTCACAGCTCGACGGTGGTAACTCTATGCTGGCAAGTCTAGTTCGTTATAATCCAGATG
GTCAACCAGATCCAAACACTGTCATACCACTTGTTGATGGTGGGACAGAGGGATTCAAAG
GACATGTCCTCGTTGTTCTGTATGGCCTAACTGGATGCCTAGAATGTACACTTGACCTAT
ACCCTCCACCAACCAATTTTCCCTTATGTACTATAGCGCATACTCCTCGCCTTCCAGAAC
ATTGCATAGAATATGTAAGAATACTGTTGTGGTCAAAAGACAATCCATTTGGAGATAATG
TTGCAATCGACGGTGATTCACCTGAACACATACAATGGATATATGAAAAGTCATGTGAAA
GGGCTAAACAATTCGGAATTTCAGGTGTTACACTACGTCTTGTACAAGGTGTTGTAAAGC
GAATAATCCCTGCTGTCGCTTCTACAAATGCTGTTATCGCAGCTGCATGTGCAACTGAGG
TCTTCAAACTAATCACATTCTGTTACAATTATTTGGATAATTACATGAATTTCAGTGATA
TTGATGGAGTTTATACCTATGGTTTTTCTGTTGAACGCAAAGCTGATTGTCTTGCCTGTA
ACAATGTGCCTCGAACTCTTCGTTTGCAGACTGGTTGTACACTAAGAGATCTTATAAATG
TTTTGAAGACAGATCCTGAATTTCAAATGCAGTCACCCAGTATAACAACAATTATTGATG
ATCAACATCGTTCATTGTATATCAATTTTCCAGAATTGGTTGATACATTGAAACCGAATT
TGTTTAAAACCCTTCAAGAACTTGGTCTTATTAATGGTCAAATCATTCATGTTAGTGATA
TTACAACACCTAGAACATTATCTATAAAGCTTCAATTGGATGATAAGTAATAATGCAAAT
AATTTGGTCGCTCTGAATTAATCTCATTGAAGCCAACTATTTATTGATGATAACATAATT
ATTATATTATAAAATGTATTATTATTATTATCATTATTATTTCTTGTATCTTTGTGATAT
GGTTATTTTAGTTGTCATAGTAAATATAACGTTGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)