cluster # 7902

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7902 cluster # 7902 Sequences # 5 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7902#0 length = 719 sequences # 5
consensusID : consensus_7902#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 719
fasta sequence
                              [TAAGATAGCAGATCTTGAATTTTAGCGCGAAATTCATCTACTCATTTGATTAAATACTATTTTGACATTATAACTCATATCAGTTAGTGATGAAAATGTTAAATCTAATTCCTAAACCTAAAAATTAACTGTAAATTATAATTCTTTATA-CTAGTT--TATAA-CTTTCATTTA-GTTCTAG-TTTGTAGGTGGACATTCTGAAGGTCAATTTAGCGTCACTCAAAGGTCATTCATAAATTATAGTCTCACTGTTTCAACTATTGATTTTTATTTTTAACCCTTTTTTATCGGTCGTATGTTGTCAATTAAAGCACCATGTTTTGTTTACAGGTTACACGTAATATCGTTGATGTAGGTTGTAATATTGTATAAGTTGGTTAAAACGTAACTTTTATCCGATGATGGATCATTTTCATGGTAATTCTATGTAGATAATTAAATTGTTTTGAAGTTGTTTTGCTCAATGAACTGGTTGGTTTAGTTGTGAAACTTCCATTGCCTTTCTAACAAGCACCAACACTATATATTCCACAAATTGGTTATGCAATGAACGTTAGCCTGATACTTAAGTGAATTAGTTTATGGGGAGGTTTATTACTTAATTACGCCCATCAGGATACTTTGACCAACTATGTCCTGAACTCCTTTCCAGTTTATTCTAAGTACTATTCAGCCTTCAGAGGCCATGTGTTTTTTGTCCTACCTTGAAGATATCAAGTTGG]

[+] EMBL CD088902             [TAAGATAGCAGATCTTGAATTTTAGCGCGAAATTCATCTACTCATTTGATTAAATACTATTTTGACATTATAACTCATATCAGTTAGTGATGAAAATGTTAAATCTAATTCCTAAACCTAAAAATTAACTGTAAATTATAATTCTTTATA CTAGTT  TATAA CTTTCATTTA GTTCTAG TTTGTAGGTGGACATTCTGAAGGTCAATTTAGCGTCACTCAAAGGTCATTCATAAATTATAGTCTCACTGTTTCAACTATTGATTTTTATTTTTAACCCTTTTTTATCGGTCGTATGTTGTCAATTAAAGCACCATGTTTTGTTTACAGGTTACACGTAATATCGTTGATGTAGGTTGTAATATTGTATAAGTTGGTTAAAACGTAACTTTTATCCGATGATGGATCATTTTCATGGTAATTCTATGTAGATAATTAAATTGTTTTGAAGTTGTTTTGCTCAATGAACTGGTTGGTTTAGTTGTGAAACTTCCATTGCCTTTCTAACAAGCACCAACACTATATATTCCACAAATTGGTTATGCAATGAACGTTAGCCTGATACTTAAGTGAATTAGTTTATGGGGAGGTTTATTATTTAATTACGCCCATCAGGAT                                                                                                        ]
[-] EMBL CD177796             [                                                                                                                                         tgAAATGTTNAAATCTAATTCCTAAAACCTAAAAATTACTTTCTAGTTTTGTAGGTGGACATTCTGAAGGTCAATTTAGCGTCACTCAAAGGTCATTCATAAATTATAGTCTCACTGTTTCAACTATTGATTTTTATTTTTAACCCTTTTTTATCGGTCGTATGTTGTCAATTAAAGCGCCATGTTTTGTTTACAGGTTACACGTAATATCGTTGATGTAGGTTGTAATATTGTATAAGTTGGTTAAAACGTAACTTTTATCCGATGATGGATCATTTTCATGGTAATTCTATGTAGATAATTAAATTGTTTTGAAGTTGTTTTGCTCAATGAACTGGTTGGTTTAGTTGTGAAACTTCCATTGCCTTTCTAACAAGCACCAACACTATATATTCCACAAATTGGTTATGCAATGAACGTTAGCCTGATACTTAAGTGAATTAGTTTATGGGGAGGTTTATTACTTAATTACGCCCATCAGGATACTTTGACCAACTATGTCCTGAACTCCTTTCCAGTTTATTCTAA                                                            ]
[+] EMBL CD067491             [                                                                                                                                                                                                                      gGCGTCACTCAAAGGTCATTCATAAACCATAGTCTCACTGTTTCAACTATTGATTTTTATTTTTAACCCTTTTTTATCGGTCGTATGATGTCAATTAAAGCACCATGTTTTGTTTACAGGTTACACGTAATATCCTTGATGTAGGTTGTAATAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD084803             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TAAAACGTAACTTTTATCCGATGATGGATCATTTTCATGGTAATTCTATGTAGATAATTAAATTGTTTTGAAGTTGTTTTGCTCAATGAACTGGTTGGTTTAGTTGTGAAACTTCCATTGCCTTTCTAACAAGCACCAACACTATATATTCCACAAATTGGTTATGCAATGAACGCTAGCCTGATACTTAAGTGAATTAGTTTATGGGGAGGTTTATTACTTAATTACGCCCATCAGGATACTTTGACCAACTATGTCCTGAACTCCTTTCCAGTTTATTCTAAGTACTATTCAGCCTTCAGAGGCCATGTGTTTTTTGTCCTACCTTGAAGATATCAAGTTGG]
[+] EMBL CD084691             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAACGTAACTTTTATCCGATGATGGATCATTTTCATGGTAATTCTATGTAGAT ATTAAATTGTTTTGAAGTTGTTTTGCTCAATGAACTGGTTGGTTTAGTTGTGAAACTTCCATTGCCTTTCTAACAAGCACCAACACTATATATTCCACAAATTGGTTATGCAATGAACGCTAGCCTGATACTTAAGTGAATTAGTTTATGGGGAGGTTTATTACTTAATTACGCCCATCAGGATACTTTGACCAACTATGTCCTGAACTCCTTTCCAGTTTATTCTAAGTACTATTCAGCCTTCAGAGGCCATGTGTTTTTTGTCCTACCTTGAAGATATCAAGTTGG]




>consensus_7902#0
TAAGATAGCAGATCTTGAATTTTAGCGCGAAATTCATCTACTCATTTGATTAAATACTAT
TTTGACATTATAACTCATATCAGTTAGTGATGAAAATGTTAAATCTAATTCCTAAACCTA
AAAATTAACTGTAAATTATAATTCTTTATACTAGTTTATAACTTTCATTTAGTTCTAGTT
TGTAGGTGGACATTCTGAAGGTCAATTTAGCGTCACTCAAAGGTCATTCATAAATTATAG
TCTCACTGTTTCAACTATTGATTTTTATTTTTAACCCTTTTTTATCGGTCGTATGTTGTC
AATTAAAGCACCATGTTTTGTTTACAGGTTACACGTAATATCGTTGATGTAGGTTGTAAT
ATTGTATAAGTTGGTTAAAACGTAACTTTTATCCGATGATGGATCATTTTCATGGTAATT
CTATGTAGATAATTAAATTGTTTTGAAGTTGTTTTGCTCAATGAACTGGTTGGTTTAGTT
GTGAAACTTCCATTGCCTTTCTAACAAGCACCAACACTATATATTCCACAAATTGGTTAT
GCAATGAACGTTAGCCTGATACTTAAGTGAATTAGTTTATGGGGAGGTTTATTACTTAAT
TACGCCCATCAGGATACTTTGACCAACTATGTCCTGAACTCCTTTCCAGTTTATTCTAAG
TACTATTCAGCCTTCAGAGGCCATGTGTTTTTTGTCCTACCTTGAAGATATCAAGTTGG
clustalw multiple alignements is not computed in this case