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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7909#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 834 fasta sequence
[AAGCTGGAAAGGGGAGAACTGGTGTTATGGTCTGTGCATGTCTTCTTCGACTACACGATGTTATGAATGCAGAAGAATCACTGAAATTCTATGGTGAACAACGA-ACTGATAATGGTAAAGGTGTAACAATACCGAGTCAACGGCGTTATGTACATTATTATGATTTATTCTTAAAAAATAATCTACAATATCATAGAATTCCTCTTTTCTTAACAGCTGTACGTGTTTGTGGATTACAGTATTTACCAGGTAGTGTAACTTTTTTCTCTCCACCAATTATTTCAGTCACTTCAACTTTTTTACCATGGCTTAAACTCGTAACATTTCCCTATCTATGCACTACATCATACCCGTATGCTTACCTCTCTTATGTAATGGATATTGCAGTTCTAGTGACTACTGATCGAAAACACACATATATTTTATTATTCATACAGTAAACTGTAGCCTTTCATCCTGCTTTCTGACGTGTTGTATGAGTATATAATACATAACATCGACGATTACTTATCAGTTTTGATTGTAATTCGATTATGAATTACATATCTATACACTCGACTTTGAGCCACAACCCATTTGCATGAATGTTAGTAATAATACCTGGGTACTCAAACTGAAGTAGGTGCAGGGGAGCGTTTCGAACCAGAGCGCTTTGTGATTAAAATGTAGTTGATCAAATCACTAGTCCATGGTGCCACATTTTGTTCTTAGATTAGAAAACTGAGAATACGAAGCAATGTAGTTTGCAGTGCAGTTTTCCTTATGTTTTTACCATAGTCACTAAACCATTTAACCACCAATAAATTCGAATGTTTTTTTCTTATGTAACTTTCT]
[+] EMBL CD152408 [AAGCTGGAAAGGGGAGAACTGGTGTTATGGTCTGTGCATGTCTTCTTCGACTACACGATGTTATGAATGCAGAAGAATCACTGAAATTCTATGGTGAACAACGA ACTGATAATGGTAAAGGTGTAACAATACCGAGTCAACGGCGTTATGTACATTATTATGATTTATTCTTAAAAAATAATCTACAATATCATAGAATTCCTCTTTTCTTAACAGCTGTACGTGTTTGTGGATTACAGTATTTACCAGGTAGTGTAACTTTTTTCTCTCCACCAATTATTTCAGTCACTTCAACTTTTTTACCATGGCTTAAACTCGTAACATTTCCCTATCTATGCACTACATCATACCCGTATGCTTACCTCTCTTATGTAATGGATATTGCAGTTCTAGTGACTACTGATCGAAAACACACATATATTTTATTATTCATACAGTAAACTGTAGCCTTTCATCCTGCTTTCTGACGTGTTGTATGAGTATATAATACATAACATCGACGATTACTTATCAGTTTTGATTGTAATTCGATTATGAATTACATATCTATACACTCGACTNTGAGCCACAACCCATTTGC ]
[+] EMBL CD152382 [AAGCTGGAAAGGGGAGAACTGGTGTTATGGTCTGTGCATGTCTTCTTCGACTACACGATGTTATGAATGCAGAAGAATCACTGAAATTCTATGGTGAACAACGA ACTGATAATGGTAAAGGTGTAACAATACCGAGTCAACGGCGTTATGTACATTATTATGATTTATTCTTAAAAAATAATCTACAATATCATAGAATTCCTCTTTTCTTAACAGCTGTACGTGTTTGTGGATTACAGTATTTACCAGGTAGTGTAATTTTTTTCTCTCCACCAATTATTTCAGTCACTTCAACTTTTTTACCATGGCTTAAACTCGTAACATTTCCCTATCTATGCACTACATCATACCCGTATGCTTACCTCTCTTATGTAATGGATATTGCAGTTCTAGTGACTACTGATCGAAAACACACATATATTTTATTATTCATACAGTAAACTGTAGCCTTTCATCCTGCTTT ]
[+] EMBL CD152403 [AAGCTGGAAAGGGGAGAACTGGTGCTATGGTCTGTGCATGTCTTCTTCGACTACACGATGTTATGAATGCAGAAGAATCACTGCAATTCTATGGTGAACAACCACACTGATAATGGCTAGGGTGTGACACTACCGAGTCACCGGCGTTGTGGACATTATTATGATTTATTCTTAAAAAATAATCTACAATATCATAGAATTCCTCTTTTCTTAACAGCTGTACGTGTTTGTGGATTACAGTATTTA ]
[-] EMBL CD152450 [ TTTTCTCTCCACCAATTATTTCAGTCACTTCAACTTTTTTACCATGGCTTAAACTCGTAACATTTCCCTATCTATGCACTACATCATACCCGTATGCTTACCTCTCTTATGTAATGGATATTGCTGTTCTAGTGACTACTGATCGAAAACACACATATATTTTATTATTCATACAGTAAACTGTAGCCTTTCATCCTGCTTTCTGACGTGTTGTATGAGTATATAATACATAACATCGACGATTACTTATCAGTTTTGATTGTAATTCGATTATGAATTACATATCTATACACTCGACTTTGAGCCACAACCCATTTGCATGAATGTTAGTAATAATACCTGGGTACTCAAACTGAAGTAGGTGCAGGGGAGCGTTTCGAACCAGAGCGCTTTGTGATTAAAATGTAGTTGATCAAATCACTAGTCCATGGTGCCACATTTTGTTCTTAGATTAGAAAACTGAGAATACGAAGCAATGTAGTTTGCAGTGCAGTTTTCCTTATGTTTTTACCATAGTCACTAAACCATTTAACCACCAATAAATTCGAATGTTTTTTTCTTATGTAACTTTCT]
[-] EMBL CD152407 [ TTCTCTCCACCAATTATTTCAGTCACTTCAACTTTTTTACCATGGCTTAAACTCGTAACATTTCCCTATCTATGCACTACATCATACCCGTATGCTTACCTCTCTTATGTAATGGTTATTGCAGTTCTAGTGACTACTGATCGAAAACACACATATATTTTATTATTCATACAGTAAACTGTAGCCTTTCATCCTGCTTTCTGACGTGTTGTATGAGTATATAATACATAACATCGACGATTACTTATCAGTTTTGATTGTAATTCGATTATGAATTACATATCTATACACTCGACTTTGAGCCACAACCCATTTGCATGAATGTTAGTAATAATACCTGGGTACTCAAACTGAAGTAGGTGCAGGGGAGCGTTTCGAACCAGAGCGCTTTGTGATTAAAATGTAGTTGATCAAATCACTAGTCCATGGTGCCACATTTTGTTCTTAGATCAGAAAACTGAGAATACGAAGCAATGTAGTTTGCAGTGCAGTTTTCCTTATGTTTTTACCATAGTCACTAAACCATTTAACCACCAATAAATTCGAATGTTTTTTTCTTATGTAACTTTCT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||