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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7927#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 971 fasta sequence
[TTTTCATATCACAAGCAACTGTATCAAATCCGTTTGATGACTGCGACTCTGTTGAACATGTATAAGGTCTTTTTGGTGGCATTAGATGAGATTCATTTGTTGGTAGTTCAGTATGCACAAAATGACTATTGTCCAGTAGATGAGTATCACGATGACGTCGAGTCATGCAAGCACGTTTAGTATCTGTATCATCCATAGGTGTTAAAATATTTGAAGTTTCTTCTTCTTCAACTCCTCTTAGTTTACATGCTGGTCTGAAATAATGATCACTGGACATGATAGACCTAGGACTTAAAATATGTGACTTTTCTGTCTTCCCAGGACCATATGTATATTGTTCAATTGGATTTAATTGAATATCTGATAATGTATGGTGGATAGATGAATCAGAAGCAGTCCTGCGCCAATCAACCACTGAATACGGTGTTTGAGCCTGCCTAATCTGTTCAGTAATATTAGCAGAAAAAGGTGTTTTCAATTGGTGTTGTAAAGAATTTGTAGGAGGAAAACTTCGAAATCCAACTGGTGTGCCGATACCAGCACTAAAATAACCTGATTCACATGTATATTGACTTGAATTAGTTAATGATGATTGTTGCGTAAGTAAACTGGTAGTGGATGCCACTTCAATATCTGAATGAGATGTACAAAATAGATAAGGATTTGTAGAAATATGTGATTTCGGTTGTAAACTTTGATAGTACGGTTTAGTATCTGTAAATAAATTAAAATTCCTTTGAATTTGATGCCGGCTAACAACTGCAACATTGGAACACTCATTGTTCCAATTATCTAAACAACTTTTAGGAGCAGAATGTTGTGTAGGTGGAATAGTAGACCAAGAGGATGACAAGTAATTATCAGATGATGCATAATCAGTATCATGAATAAAAGTATTTCGTTCATGTAAATGATGAGATGTATCAGGTGTTGTAGTTGTAGTAGTTTTTGAACCAATTGGTTCATATGAA]
[-] EMBL CD064855 [TTTTCATATCACAAGCAACTGTATCAAATCCGTTTGATGACTGCGACTCTGTTGAACATGTATAAGGTCTTTTTGGTGGCATTAGATGAGATTCATTTGTTGGTAGTTCAGTATGCACAAAATGACTATTGTCCAGTAGATGAGTATCACGATGACGTCGAGTCATGCAAGCACGTTTAGTATCTGTATCATCCATAGGTGTTAAAATATTTGAAGTTTCTTCTTCTTCAACTCCTCTTAGTTTACATGCTGGTCTGAAATAATGATCACTGGACATGATAGACCTAGGACTTAAAATATGTGACTTTTCTGTCTTCCCAGGACCATATGTATATTGTTCAATTGGATTTAATTGAATATCTAATAATGTATGGTGGATAGATGAAT ]
[+] EMBL CD147217 [ CATATCACAAGCAACTGTATCAAATCCGTTTGATGACTGCGACTCTGTTGAACATGTATAAGGTCTTTTTGGTGGCATTAGATGAGATTCATTTGTTGGTAGTTCAGTATGCACAAAATGACTATTGTCCAGTAGATGAGTATCACGATGACGTCGAGTCATGCAAGCACGTTTAGTATCTGTATCATCCATAGGTGTTAAAATATTTGAAGTTTCTTCTTCTTCAACTCCTCTTAGTTTACATGCTGGTCTGAAATAATGATCACTGGACATGATAGACCTAGGACTTAAAATATGTGACTTTTCTGTCTTCCCAGGACCATATGTATATTGTTCAATTGGATTTAATTGAATATCTGATAATGTATGGTGGATAGATGAATCAGAAGCAGTCCTGCGCCAATCAACCACTGAATACGGTGTTTGAGCCTGCCTAATCTGTTCAGTAATATTAGCAGAANAAGGTGTT ]
[-] EMBL CD147594 [ ATCACGATGACGTCGAGTCATGCAAGCACGTTTAGTATCTGTATCATCCATAGGTGTTAAAATATTTGAAGTTTCTTCTTCTTCAACTCCTCTTAGTTTACATGCTGGTCTGAAATAATGATCACTGGACATGATAGACCTAGGACTTAAAATATGTGACTTTTCTGTCTTCCCAGGACCATATGTATATTGTTCAATTGGATTTAATTGAATATCTGATAATGTATGGTGGATAGATGAATCAGAAGCAGTCCTGCGCCGATCAACCACTGAATACGGTGTTTGAGCCTGCCTAATCTGTTCAGTAATATTAGCAGAAAAAGGTGTTTTC ]
[+] EMBL CD156737 [ CCTGCCTAATCTGTTCAGTAATATTAGCAGAAAAAGGTGTTTTCAATTGGTGTTGTAAAGAATTTGTAGGAGGAAAACTTCGAAATCCAACTGGTGTGCCGATACCAGCACTAAAATAACCTGATTCACATGTATATTGACTTGAATTAGTTAATGATGATTGTTGCGTAAGTAAACTGGTAGTGGATGCCACTTCAATATCTGAATGAGGTGTACAAAATAGATAAGGATTTGTAGAAATATGTGATTTCGGTTGTAAACTTTGATAGTACGGTTTAGTATCTGTAAATAAATTAAAATTCCTTTGAATTTGATGCCGGCTAACAACTGCAACATTGGAACACTCATTGTTCCAATTATCTAAACAACTTTTAGGAGCAGAATGTTGTGTAGGTGGAATAGTAGACCAAGAGGATGACAAGTAATTATCAGATGATGCATAAT ]
[+] EMBL CD156649 [ CCTGCCTAATCTGTTCAGTAATATTAGCAGAAAAAGGTGTTTTCAATTGGTGTTGTAAAGAATTTGTAGGAGGAAAACTTCGAAATCCAACTGGTGTGCCGATACCAGCACTAAAATAACCTGATTCACATGTATATTGACTTGAATTAGTTAATGATGATTGTTGCGTAAGTAAACTGGTAGTGGATGCCACTTCAATATCTGAATGAGATGTACAAAATAGATAAGGATTTGTAGAAATATGTGATTTCGGTTGTAAACTTTGATAGTACGGTTTAGTATCTGTAAATAAATTAAAATTCCTTTGAATTTGATGCCGGCTAACAACTGCAACATTGGAACACTCATTGTTCCAATTATCTAAACAACTTTTAGGAGCAGAATGTTGTG ]
[+] EMBL CD147122 [ TTTGTAGGAGGAAAACTTCGAAATCCAACTGGTGTGCCGATACCAGCACTAAAATAACCTGATTCACATGTATATTGACTTGAATTAGTTAATGATGATTGTTGCGTAAGTAAACTGGTAGTGGATGCCACTTCAATATCTGAATGAGATGTACAAAATAGATAAGGATTTGTAGAAATATGTGATTTCGGTTGTAAACTTTGATAGTACGGTTTAGTATCTGTAAATAAATTAAAATTCCTTTGAATTTGATGCCGGCTAACAACTGCAACATTGGAACACTCATTGTTCCAATTATCTAAACAACTTTTAGGAGCAGAATGTTGTGTAGGTGGAATAGTAGACCAAGAGGATGACAAGTAATTATCAGATGATGCATAATCAGTATCATGAATAAAAGTATTTCGTTCATGTAAATGATGAGATGTATCAGGTGTTGTAGTTGTAGTAGTTTTTGAACCAATTGGTTCATATGAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||