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Schistosoma mansoni
cluster # 7927 cluster # 7927       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7927#0 length = 971 sequences # 6  

consensusID : consensus_7927#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 971
fasta sequence
                              [TTTTCATATCACAAGCAACTGTATCAAATCCGTTTGATGACTGCGACTCTGTTGAACATGTATAAGGTCTTTTTGGTGGCATTAGATGAGATTCATTTGTTGGTAGTTCAGTATGCACAAAATGACTATTGTCCAGTAGATGAGTATCACGATGACGTCGAGTCATGCAAGCACGTTTAGTATCTGTATCATCCATAGGTGTTAAAATATTTGAAGTTTCTTCTTCTTCAACTCCTCTTAGTTTACATGCTGGTCTGAAATAATGATCACTGGACATGATAGACCTAGGACTTAAAATATGTGACTTTTCTGTCTTCCCAGGACCATATGTATATTGTTCAATTGGATTTAATTGAATATCTGATAATGTATGGTGGATAGATGAATCAGAAGCAGTCCTGCGCCAATCAACCACTGAATACGGTGTTTGAGCCTGCCTAATCTGTTCAGTAATATTAGCAGAAAAAGGTGTTTTCAATTGGTGTTGTAAAGAATTTGTAGGAGGAAAACTTCGAAATCCAACTGGTGTGCCGATACCAGCACTAAAATAACCTGATTCACATGTATATTGACTTGAATTAGTTAATGATGATTGTTGCGTAAGTAAACTGGTAGTGGATGCCACTTCAATATCTGAATGAGATGTACAAAATAGATAAGGATTTGTAGAAATATGTGATTTCGGTTGTAAACTTTGATAGTACGGTTTAGTATCTGTAAATAAATTAAAATTCCTTTGAATTTGATGCCGGCTAACAACTGCAACATTGGAACACTCATTGTTCCAATTATCTAAACAACTTTTAGGAGCAGAATGTTGTGTAGGTGGAATAGTAGACCAAGAGGATGACAAGTAATTATCAGATGATGCATAATCAGTATCATGAATAAAAGTATTTCGTTCATGTAAATGATGAGATGTATCAGGTGTTGTAGTTGTAGTAGTTTTTGAACCAATTGGTTCATATGAA]

[-] EMBL CD064855             [TTTTCATATCACAAGCAACTGTATCAAATCCGTTTGATGACTGCGACTCTGTTGAACATGTATAAGGTCTTTTTGGTGGCATTAGATGAGATTCATTTGTTGGTAGTTCAGTATGCACAAAATGACTATTGTCCAGTAGATGAGTATCACGATGACGTCGAGTCATGCAAGCACGTTTAGTATCTGTATCATCCATAGGTGTTAAAATATTTGAAGTTTCTTCTTCTTCAACTCCTCTTAGTTTACATGCTGGTCTGAAATAATGATCACTGGACATGATAGACCTAGGACTTAAAATATGTGACTTTTCTGTCTTCCCAGGACCATATGTATATTGTTCAATTGGATTTAATTGAATATCTAATAATGTATGGTGGATAGATGAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD147217             [    CATATCACAAGCAACTGTATCAAATCCGTTTGATGACTGCGACTCTGTTGAACATGTATAAGGTCTTTTTGGTGGCATTAGATGAGATTCATTTGTTGGTAGTTCAGTATGCACAAAATGACTATTGTCCAGTAGATGAGTATCACGATGACGTCGAGTCATGCAAGCACGTTTAGTATCTGTATCATCCATAGGTGTTAAAATATTTGAAGTTTCTTCTTCTTCAACTCCTCTTAGTTTACATGCTGGTCTGAAATAATGATCACTGGACATGATAGACCTAGGACTTAAAATATGTGACTTTTCTGTCTTCCCAGGACCATATGTATATTGTTCAATTGGATTTAATTGAATATCTGATAATGTATGGTGGATAGATGAATCAGAAGCAGTCCTGCGCCAATCAACCACTGAATACGGTGTTTGAGCCTGCCTAATCTGTTCAGTAATATTAGCAGAANAAGGTGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD147594             [                                                                                                                                                 ATCACGATGACGTCGAGTCATGCAAGCACGTTTAGTATCTGTATCATCCATAGGTGTTAAAATATTTGAAGTTTCTTCTTCTTCAACTCCTCTTAGTTTACATGCTGGTCTGAAATAATGATCACTGGACATGATAGACCTAGGACTTAAAATATGTGACTTTTCTGTCTTCCCAGGACCATATGTATATTGTTCAATTGGATTTAATTGAATATCTGATAATGTATGGTGGATAGATGAATCAGAAGCAGTCCTGCGCCGATCAACCACTGAATACGGTGTTTGAGCCTGCCTAATCTGTTCAGTAATATTAGCAGAAAAAGGTGTTTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD156737             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CCTGCCTAATCTGTTCAGTAATATTAGCAGAAAAAGGTGTTTTCAATTGGTGTTGTAAAGAATTTGTAGGAGGAAAACTTCGAAATCCAACTGGTGTGCCGATACCAGCACTAAAATAACCTGATTCACATGTATATTGACTTGAATTAGTTAATGATGATTGTTGCGTAAGTAAACTGGTAGTGGATGCCACTTCAATATCTGAATGAGGTGTACAAAATAGATAAGGATTTGTAGAAATATGTGATTTCGGTTGTAAACTTTGATAGTACGGTTTAGTATCTGTAAATAAATTAAAATTCCTTTGAATTTGATGCCGGCTAACAACTGCAACATTGGAACACTCATTGTTCCAATTATCTAAACAACTTTTAGGAGCAGAATGTTGTGTAGGTGGAATAGTAGACCAAGAGGATGACAAGTAATTATCAGATGATGCATAAT                                                                                               ]
[+] EMBL CD156649             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CCTGCCTAATCTGTTCAGTAATATTAGCAGAAAAAGGTGTTTTCAATTGGTGTTGTAAAGAATTTGTAGGAGGAAAACTTCGAAATCCAACTGGTGTGCCGATACCAGCACTAAAATAACCTGATTCACATGTATATTGACTTGAATTAGTTAATGATGATTGTTGCGTAAGTAAACTGGTAGTGGATGCCACTTCAATATCTGAATGAGATGTACAAAATAGATAAGGATTTGTAGAAATATGTGATTTCGGTTGTAAACTTTGATAGTACGGTTTAGTATCTGTAAATAAATTAAAATTCCTTTGAATTTGATGCCGGCTAACAACTGCAACATTGGAACACTCATTGTTCCAATTATCTAAACAACTTTTAGGAGCAGAATGTTGTG                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD147122             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTGTAGGAGGAAAACTTCGAAATCCAACTGGTGTGCCGATACCAGCACTAAAATAACCTGATTCACATGTATATTGACTTGAATTAGTTAATGATGATTGTTGCGTAAGTAAACTGGTAGTGGATGCCACTTCAATATCTGAATGAGATGTACAAAATAGATAAGGATTTGTAGAAATATGTGATTTCGGTTGTAAACTTTGATAGTACGGTTTAGTATCTGTAAATAAATTAAAATTCCTTTGAATTTGATGCCGGCTAACAACTGCAACATTGGAACACTCATTGTTCCAATTATCTAAACAACTTTTAGGAGCAGAATGTTGTGTAGGTGGAATAGTAGACCAAGAGGATGACAAGTAATTATCAGATGATGCATAATCAGTATCATGAATAAAAGTATTTCGTTCATGTAAATGATGAGATGTATCAGGTGTTGTAGTTGTAGTAGTTTTTGAACCAATTGGTTCATATGAA]


>consensus_7927#0 TTTTCATATCACAAGCAACTGTATCAAATCCGTTTGATGACTGCGACTCTGTTGAACATG TATAAGGTCTTTTTGGTGGCATTAGATGAGATTCATTTGTTGGTAGTTCAGTATGCACAA AATGACTATTGTCCAGTAGATGAGTATCACGATGACGTCGAGTCATGCAAGCACGTTTAG TATCTGTATCATCCATAGGTGTTAAAATATTTGAAGTTTCTTCTTCTTCAACTCCTCTTA GTTTACATGCTGGTCTGAAATAATGATCACTGGACATGATAGACCTAGGACTTAAAATAT GTGACTTTTCTGTCTTCCCAGGACCATATGTATATTGTTCAATTGGATTTAATTGAATAT CTGATAATGTATGGTGGATAGATGAATCAGAAGCAGTCCTGCGCCAATCAACCACTGAAT ACGGTGTTTGAGCCTGCCTAATCTGTTCAGTAATATTAGCAGAAAAAGGTGTTTTCAATT GGTGTTGTAAAGAATTTGTAGGAGGAAAACTTCGAAATCCAACTGGTGTGCCGATACCAG CACTAAAATAACCTGATTCACATGTATATTGACTTGAATTAGTTAATGATGATTGTTGCG TAAGTAAACTGGTAGTGGATGCCACTTCAATATCTGAATGAGATGTACAAAATAGATAAG GATTTGTAGAAATATGTGATTTCGGTTGTAAACTTTGATAGTACGGTTTAGTATCTGTAA ATAAATTAAAATTCCTTTGAATTTGATGCCGGCTAACAACTGCAACATTGGAACACTCAT TGTTCCAATTATCTAAACAACTTTTAGGAGCAGAATGTTGTGTAGGTGGAATAGTAGACC AAGAGGATGACAAGTAATTATCAGATGATGCATAATCAGTATCATGAATAAAAGTATTTC GTTCATGTAAATGATGAGATGTATCAGGTGTTGTAGTTGTAGTAGTTTTTGAACCAATTG GTTCATATGAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)