These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7935#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 655 fasta sequence [GCCGTTGTTCAAGATGCTAGCATACAGCTACCAATGCAGACTACGTTCCATACAACTGCTTGCTAGGAGTGTTGTACCAATTTGTCGCCCTATCACGCAGGACCATGCTTTGAAATCTAATAAACTTGGAACGGCACCAGCTGTTCAGAGAACCGGACTGTTACCATCATATCACTGGACATTTGAACGTATTCTAGCTGCAAGCATGTTGCCATTATATCCGATTGCACTCTATATGGATACCCCTATG-ATGAATCTTATAGTAGTG-ACTGCTG-TTTCCATGCATTCGTACTGGGGATTTGACGGTGTCATCAAAGACTATGCATTTGAACGTCGTTATGGTCCTGCACTGATGCCTATATTACGTACATTGTGGAAAGTAATGGCTGGTTTCGGTTTTGCTGGCCTTTTATATTTCAATTTTAATGATATAGGATTTATTTCAGCCGTGAAGAAACTATGGGCCTTGTGAAAATATTTTTGGTTCTTTTACTTTGACTTCTCTTTCTGATATTTTTAAGACTATTTAGATTATTTGGGTAATAACATAAAATCACCGACTACTTTTATGTATTAGCATGTTATACTTTAATACCCAAATCTAACATGGGGCTAATTTCTAATAAATGTGTCTAATTGTATGAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL CD083630 [GCCGTTGTTCAAGATGCTAGCATACAGCTACCAATGCAGACTACGTTCCATACAACTGCTTGCTAGGAGTGTTGTACCAATTTGTCGCCCTATCACGCAGGACCATGCTTTGAAATCTAATAAACTTGGAACGGCACCAGCTGTTCAGAGAACCGGACTGTTACCATCATATCACTGGACATTTGAACGTATTCTAGCTGCAAGCATGTTGCCATTATATCCGATTGCACTCTATATGGATACCCCTATG ATGAATCTTATAGTAGTG ACTGCTG TTTCCATGCATTCGTACTGGGGATTTGACGGTGTCATCAAAGACTATGCATTTGAACGTCGTTATGGTCCTGCACTGATGCCTATATTACGTACATTGTGGAAAGTAATGGCTGGTTTCGGTTTTGCTGGCCTTTTATATTTCAATTTTAATGATATAGGATTTATTTCAGCCGTGAAGAAACTATGGGCCTTGTGAAAATATTTTTGGTTCTTTTACTTTGACTTCTCTTTCTGATATTTTTAAGACTATTTAGATTAT ] [-] EMBL AI395163 [ CCAGCTGTTCAGAGAACCGGACTGTTACCATCATATCACTGGACATCTGAACGTATTGTAGCTGCAAGCATGTTGCCATTATATCCGATTCCACTATATATGGATACCCCTATG ATGAATCTTATAGTAGTG ACTGCTG TTTCCATGCATTCGTACTGGGGATTTGACGGTGTCATCAAAGACTATGCATTTGAACGTCGTTATGGTCCTGCACTGATGCCTATATTACGTACATTGTGGAAAGTAATGGCTGGTTTCGGTTTTGCTGGCCTTTTATATTTCAATTTTAATGATATAGGATTTATTTCAGCCGTGAAGAAACTATGGGCCTTGTGAAAATATTTTTGGTTCTTTTACTTTGACTTCTCTTTCTGATATTTTTAAGACTATTTAGATTATTTGGGTAATAACATAAAATCACCGAATACTTTTATGTATTAGCATGTTATACTTTAATACCCAAATCTAACATGGGGCTAATTTCTAATAAATGTGTCTAATTGTATGAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL AA559380 [ CTGTTNCCANCATATCNCTGGACATTTGAACGTATTCTANCTGCAAGCATGTTGCCATTATATCCGATTGCACTCTATATGGATACCCCTATGAATGAATCTTATAGTAGTGAACTGCNGTTTTCCATGCATNCGTACTGGGGAa ] [-] EMBL CD146023 [ CTGGACATTTGAACGTATTCTAGCTGCAAGCATGTTGCCATTATATCCGATTGCACTCTATATGGATACCCCTATG ATGAATCTTATAGTAGTG ACTGCTG TTTC ] [+] EMBL CD137073 [ ATTTGAACGTATTCTAGCTGCAAGCATGTTGCCATTATATCCGATTGCACTCTATATGGATACCCCTATG ATGAATCTTATAGTAGTG ACTGCTG ATTCCATGCATTCGTACTGGGGATTTGACGGTGTCATCAAAGACTATGCATTTGAACGTCGTTATGGTCCTGCACTGATGCCTATATTACGTACATTGTGGAAAGTAATGGCTGGTTTCGGTTTTGCTGGCCTTTTATATTTCAATTTTAATGATATAGGATTTATTTCAGCCGTGAAGAAACTATGGGCCTTGTGAAAATATTTTTGGTTCTTTTACTTTGACTTCTCTTTCTGATATTTTTAAGACTATTTAGATTATTTGGGTAATAACATAAAATCACCGACTACTTTTATGTATTAGCATGTTATACTTTAATACCCAAATCTAACATGGGGCTAATTTCTAATAAATG ] [+] EMBL CD134552 [ ATGCATTCGTACTGGGGATTTGACGGTGTCATCAAAGACTATGCATTTGAACGTCGTTATGGTCCTGCACTGATGCCTATATTACGTACATTGTGGAAAGTAATGGCTGGTTTCGGTTTTGCTGGCCTTTTATATTTCAATTTTAATGATATAGGATTTATTTCAGCCGTGAAGAAACTATGGGCCTTGTGAAAATATTTTTGGTTCTTTTACTTTGACTTCTCTTTCTGATATTTTTAAGACTATTTAGATTATTTGGGTAATAACATAAAATCACCGACTACTTTTATGTATTAGCATGTTATACTTTAATACCCAAATCTAACATGGGGCTA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||