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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7935#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 655 fasta sequence
[GCCGTTGTTCAAGATGCTAGCATACAGCTACCAATGCAGACTACGTTCCATACAACTGCTTGCTAGGAGTGTTGTACCAATTTGTCGCCCTATCACGCAGGACCATGCTTTGAAATCTAATAAACTTGGAACGGCACCAGCTGTTCAGAGAACCGGACTGTTACCATCATATCACTGGACATTTGAACGTATTCTAGCTGCAAGCATGTTGCCATTATATCCGATTGCACTCTATATGGATACCCCTATG-ATGAATCTTATAGTAGTG-ACTGCTG-TTTCCATGCATTCGTACTGGGGATTTGACGGTGTCATCAAAGACTATGCATTTGAACGTCGTTATGGTCCTGCACTGATGCCTATATTACGTACATTGTGGAAAGTAATGGCTGGTTTCGGTTTTGCTGGCCTTTTATATTTCAATTTTAATGATATAGGATTTATTTCAGCCGTGAAGAAACTATGGGCCTTGTGAAAATATTTTTGGTTCTTTTACTTTGACTTCTCTTTCTGATATTTTTAAGACTATTTAGATTATTTGGGTAATAACATAAAATCACCGACTACTTTTATGTATTAGCATGTTATACTTTAATACCCAAATCTAACATGGGGCTAATTTCTAATAAATGTGTCTAATTGTATGAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL CD083630 [GCCGTTGTTCAAGATGCTAGCATACAGCTACCAATGCAGACTACGTTCCATACAACTGCTTGCTAGGAGTGTTGTACCAATTTGTCGCCCTATCACGCAGGACCATGCTTTGAAATCTAATAAACTTGGAACGGCACCAGCTGTTCAGAGAACCGGACTGTTACCATCATATCACTGGACATTTGAACGTATTCTAGCTGCAAGCATGTTGCCATTATATCCGATTGCACTCTATATGGATACCCCTATG ATGAATCTTATAGTAGTG ACTGCTG TTTCCATGCATTCGTACTGGGGATTTGACGGTGTCATCAAAGACTATGCATTTGAACGTCGTTATGGTCCTGCACTGATGCCTATATTACGTACATTGTGGAAAGTAATGGCTGGTTTCGGTTTTGCTGGCCTTTTATATTTCAATTTTAATGATATAGGATTTATTTCAGCCGTGAAGAAACTATGGGCCTTGTGAAAATATTTTTGGTTCTTTTACTTTGACTTCTCTTTCTGATATTTTTAAGACTATTTAGATTAT ]
[-] EMBL AI395163 [ CCAGCTGTTCAGAGAACCGGACTGTTACCATCATATCACTGGACATCTGAACGTATTGTAGCTGCAAGCATGTTGCCATTATATCCGATTCCACTATATATGGATACCCCTATG ATGAATCTTATAGTAGTG ACTGCTG TTTCCATGCATTCGTACTGGGGATTTGACGGTGTCATCAAAGACTATGCATTTGAACGTCGTTATGGTCCTGCACTGATGCCTATATTACGTACATTGTGGAAAGTAATGGCTGGTTTCGGTTTTGCTGGCCTTTTATATTTCAATTTTAATGATATAGGATTTATTTCAGCCGTGAAGAAACTATGGGCCTTGTGAAAATATTTTTGGTTCTTTTACTTTGACTTCTCTTTCTGATATTTTTAAGACTATTTAGATTATTTGGGTAATAACATAAAATCACCGAATACTTTTATGTATTAGCATGTTATACTTTAATACCCAAATCTAACATGGGGCTAATTTCTAATAAATGTGTCTAATTGTATGAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL AA559380 [ CTGTTNCCANCATATCNCTGGACATTTGAACGTATTCTANCTGCAAGCATGTTGCCATTATATCCGATTGCACTCTATATGGATACCCCTATGAATGAATCTTATAGTAGTGAACTGCNGTTTTCCATGCATNCGTACTGGGGAa ]
[-] EMBL CD146023 [ CTGGACATTTGAACGTATTCTAGCTGCAAGCATGTTGCCATTATATCCGATTGCACTCTATATGGATACCCCTATG ATGAATCTTATAGTAGTG ACTGCTG TTTC ]
[+] EMBL CD137073 [ ATTTGAACGTATTCTAGCTGCAAGCATGTTGCCATTATATCCGATTGCACTCTATATGGATACCCCTATG ATGAATCTTATAGTAGTG ACTGCTG ATTCCATGCATTCGTACTGGGGATTTGACGGTGTCATCAAAGACTATGCATTTGAACGTCGTTATGGTCCTGCACTGATGCCTATATTACGTACATTGTGGAAAGTAATGGCTGGTTTCGGTTTTGCTGGCCTTTTATATTTCAATTTTAATGATATAGGATTTATTTCAGCCGTGAAGAAACTATGGGCCTTGTGAAAATATTTTTGGTTCTTTTACTTTGACTTCTCTTTCTGATATTTTTAAGACTATTTAGATTATTTGGGTAATAACATAAAATCACCGACTACTTTTATGTATTAGCATGTTATACTTTAATACCCAAATCTAACATGGGGCTAATTTCTAATAAATG ]
[+] EMBL CD134552 [ ATGCATTCGTACTGGGGATTTGACGGTGTCATCAAAGACTATGCATTTGAACGTCGTTATGGTCCTGCACTGATGCCTATATTACGTACATTGTGGAAAGTAATGGCTGGTTTCGGTTTTGCTGGCCTTTTATATTTCAATTTTAATGATATAGGATTTATTTCAGCCGTGAAGAAACTATGGGCCTTGTGAAAATATTTTTGGTTCTTTTACTTTGACTTCTCTTTCTGATATTTTTAAGACTATTTAGATTATTTGGGTAATAACATAAAATCACCGACTACTTTTATGTATTAGCATGTTATACTTTAATACCCAAATCTAACATGGGGCTA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||