These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7942#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1383 fasta sequence [GAAAAAAAGCCCGTTNAGATAATTATACTACAGTAAATGGAACGAAATCATTTCCAGTCACTTCCAAATCCATTTCTGAGTCTCTCCAGTCACCGTGCAACATGGTTACGGCGTTGCGCAAGGCAGCAAATCACCAGGCCCTTTTTTTCTGGTCTCGCATACACAGACTCAAACCTTCGGGATATTGCAGAATCTTTGCACTTAGATCCAAGTCACTCTAATGCTGATCCCAATCTTATCTATGAAGACCTACTTGCAATGAGTGATCATCAGATACATAAACTTTGCCAGTTTTACGAGACTTTATCATCATATACTCTCTCCCCTGAATCTATCATTTCTGGATCTGGAAAAATCCAATGGTTAAATGACAATTTGCCTAAATTAGTCTCCG-AGGACATCGTATTTTGATTTTTAGTCAGTTTGTCATCATGTTAGATATATTAGAGGAATTTTTAAGGATAACTAACAGGCGTTATATACGAATGGATGGATCAACTCCAGTCTCGGAACGACAAACATTAATAGATCGTTTCAACAGTCCTGTTCACGTCATACGACTAATCTCTGAAGGTACTTTAGAAGAGGGTATGCTGCGTATTGCATCTGAGAAATTACAAATGGAACAGAATGTAACAGGTTGTGTATCTGGATACAACACAGAACAGACCGAGGAATCTGAAAAAACTGCTCGTGTTAGTTCCCGGAGGAGAAGGTCAAAGTCAGCCAATATTTTACCATG-TTCCAGTCTAGATGGTATGACAGAGAATGGAAATGTTTTCAAAGTCCTCGGTAATTTGAACCCAACTGCCTCGGATCTCAGTTTATCCATTGTCAATCCTATATCATCGAGTCGAATTAGTGAACGAGATGTTCGCTCCCTTCTTTCAGATGCTTTAAAATTGTAGTGATAAACATTTTTCTACTTCTAAATATTCCACAATCCCTCTAAGACAAATGCCGATTTATACACTTG-TTATAATCACTGTTTTCACTGCACCGTTCCTTTG-TATTGATTCAGTGAATTCAGTGGTTTGAGTATTTGTGCGTTGATAAGAACTTTAACATAAACACACATGGAAATATTTTAATTTATTTTTGTGAATATATATAGGATGCTAATGATGACGATTTCACGAAAACAGTGAAATTTATCTTCATTCTTTACCCATGTAAATTGACTTTTTGGTAAAAAAAAAATTCTAAATTTTACCCATGTATCATTNTTTTGTTTTTCCAAAANNCATTTTTGCTTAATTTGGTATTTTTTACTTTTGTGCTCCGGNGTTTTGGGTTTTCGTCTATCTTGGTGAACATCGTACGCACATGCATATGCATATTACTAATTACTATGTNGAATTAGAATTTCCACAGGTTCGATTC] [-] EMBL CD165232 [GAAAAAAAGCCCGTTNAGATAATTATACTACAGTAAATGGAACGAAATCATTTCCAGTCACTTCCAAATCCATTTCTGAGTCTCTCCAGTCACCGTGCAACATGGTTACGGCGTTGCGCAAGGCAGCAAATCACCAGGCCCTTTTTTTCTGGTCTCGCATACACAGACTCAAACCTTCGGGATATTGCAGAATCTTTGCACTTAGATCCAAGTCACTCTAATGCTGATCCCAATCTTATCTATGAAGGCCTACTTGCAATGAGTGATCATCAGATACATAAACTTTGCCAGTTTTACGAGACTTTATCATCATATACTCTCTCCCCTGAATCTATCATTTCCGGATCTGGAAAAATCCAATGGTTAAATGACAAT ] [-] EMBL CD153258 [ cTTTTTCTGGTCTCGCATACACAGACTCAAACCTTCGGGATATTGCAGAATCTTTGCACTTAGATCCAAGTCACTCTAATGCTGATCCCAATCTTATCTATGAAGACCTACTTGCAATGAGTGATCATCAGATACATAAACTTTGCCAGTTTTACGAGACTTTATCATCATATACTCTCTCCCCTGAATCTATCATTTCTGGATCTGGAAAAATCCAATGGTTAAATGACAATTTGCCTAAATTAGTCTCCG AGGACATCGTATTTTGATTTTTAGTCAGTTTGTCATCATGTTAGATATATTAGAGGAATTTTTAAGGATAACTAACAGGCGTTATATACGAATGGATGGATCAACTCCAGTCTCGGAACGACAAACATTAATAGATCGTTTCAACAGTCCTGTTCACGTCATACGACTAATCTCTGAAGGTACTTTAGAAGAGGGTATGCTGCGTATTGCATCTGAGAAATTACAAATGGAACAGAATGTAACAGGTTGTGT ] [+] EMBL CD167130 [ AATCTTATCTATGAAGACCTACTTGCAATGAGTGATCATCAGATACATAAACTTTGCCAGGTTTACGAGACTTTATCATCATATACTCTCTCCCCTGAATCTATCATTTCTGGATCTGGAAAAATCCAATGGTTAAATGACAATTTGCCTAAATTAGTCTCCGAAGGACATCGTATTTTGATTTTTAGTCAGTTTGACATCATGTTAGATATATTAGAGGAATTTTTAAGGATAACTAACAGGCGTTATATACGAATGGATGGATCAACTCCTGTCTCGGAACGACAAACATTAATAGATCGGTTCAAC ] [+] EMBL CD079349 [ CGTATTGCATCTGAGAAATTACAAATGGAACAGAATGTAACAGGTTGTGTATCTGGATACAACACAGAACAGACCGAGGAATCTGAAAAAACTGCTCGTGTTAGTTCCCGGAGGAGAAGGTCAAAGTCAGCCAATATTTTACCATG TTCCAGTCTAGATGGTATGACAGAGAATGGAAATGTTTTCAAAGTCCTCGGTAATTTGAACCCAACTGCCTCGGATCTCAGTTTATCCATTGTCAATCCTATATCATCGAGTCGAATTAGTGAACGAGATGTTCGCTCCCTTCTTTCAGATGCTTTAAAATTGTAGTGATAAACATTTTTCTACTTCTAAATATTCCACAATCCCTCTAAGACAAATGCCGATTTATACACTTG TTATAATCACTGTTTTCACTGCACCGTTCCTTTG TATTGATTCAGTGAATTCAGTGGTTTGAGTATTTGTGCGTTGATAAGAACTTTAACATAAACACACATGGAAATATTTTAATTTATTTTTGTGAATATATATAGGATGCTAATGATGACGATTTCACGAAAACAGTGAAATTTATCTTCATTCTTTACCCATGTAAATTGACTTTTTGGTAAAAAAAAAATTCTAAATTTTACCCATGTATCATTNTTTTGTTTTTCCAAAANNCATTTTTGCTTAATTTGGTATTTTTTACTTTTGTGCTCCGGNGTTTTGGGTTTTCGTCTATCTTGGTGAACATCGTACGCACATGCATATGCATATTACTAATTACTATGTNGAATTAGAATTTCCACAG ] [+] EMBL AA559624 [ GCCAATATTTTACCATGTTTCCAGTCTAGATGGTATGACAGAGAATGGAAATGTTTTCAAAGTCCTCGGTAATTTGAACCCAACTGCCTCGGATCTCAGTTTATCCATTGTCAATCCTATATCATCGAGTCGAATTAGTGAACGAGATGTTCGCTCCCTTCTTTCAGATGCTTTAAAATTGTAGTGATAAACATTTTTCTACTTCTAAATATTCCACAATCCCTCTAAGACAAATGCCGATTTATACACTTGTTTATAATCACTGTTTTCACTGCACCGTNCCTTTGTTATTGATTCAGTGAA ] [-] EMBL CD073626 [ CAATATTTTACCATG TTCCAGTCTAGATGGTATGACAGAGAATGGAAATGTTTTCAAAGTCCTCGGTAATTTGAACCCAACTGCCTCGGATCTCAGTTTATCCATTGTCAATCCTATATCATCGAGTCGAATTAGTGAACGAGATGTTCGCTCCCTTCTTTCAGATGCTTTAAAATTGTAGTGATAAACATTTTTCTACTTCTAAATATTCCACAATCCCTCTAAGACAAATGCCGATTTATACACTTG TTATAATCACTGTTTTCACTGCACCGTTCCTTTG TATTGATTCAGTGAATTCAGTGGTTTGAGTATTTGTGCGTTGATAAGAACTTTAACATAAACACACATGGAAATATTTTAATTTATTTTTGTGAATATATATAGGATGCTAATGATGACGATTTCACGAAAACAGTGAAATTTATCTTCATTCTTTACCCATGTAAATTGACTTTTTGGTAAAAAAAAAATTCTAAATTTTACCCATGTATCATTTTTTTGTTTTTCCAAAATCTATTTTTGCTTAATTTGTTATTTTTTACTTTTGTGCTTCGGTGTTTTGTGTTTTCGTCTATCTTGTTGAACATCGTACGCACATGCATATGCATATTACTAATTACTATGT AATTTAGAATTTCCACAGGTTCGATTC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||