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Schistosoma mansoni
cluster # 7942 cluster # 7942       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7942#0 length = 1383 sequences # 6  

consensusID : consensus_7942#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1383
fasta sequence
                              [GAAAAAAAGCCCGTTNAGATAATTATACTACAGTAAATGGAACGAAATCATTTCCAGTCACTTCCAAATCCATTTCTGAGTCTCTCCAGTCACCGTGCAACATGGTTACGGCGTTGCGCAAGGCAGCAAATCACCAGGCCCTTTTTTTCTGGTCTCGCATACACAGACTCAAACCTTCGGGATATTGCAGAATCTTTGCACTTAGATCCAAGTCACTCTAATGCTGATCCCAATCTTATCTATGAAGACCTACTTGCAATGAGTGATCATCAGATACATAAACTTTGCCAGTTTTACGAGACTTTATCATCATATACTCTCTCCCCTGAATCTATCATTTCTGGATCTGGAAAAATCCAATGGTTAAATGACAATTTGCCTAAATTAGTCTCCG-AGGACATCGTATTTTGATTTTTAGTCAGTTTGTCATCATGTTAGATATATTAGAGGAATTTTTAAGGATAACTAACAGGCGTTATATACGAATGGATGGATCAACTCCAGTCTCGGAACGACAAACATTAATAGATCGTTTCAACAGTCCTGTTCACGTCATACGACTAATCTCTGAAGGTACTTTAGAAGAGGGTATGCTGCGTATTGCATCTGAGAAATTACAAATGGAACAGAATGTAACAGGTTGTGTATCTGGATACAACACAGAACAGACCGAGGAATCTGAAAAAACTGCTCGTGTTAGTTCCCGGAGGAGAAGGTCAAAGTCAGCCAATATTTTACCATG-TTCCAGTCTAGATGGTATGACAGAGAATGGAAATGTTTTCAAAGTCCTCGGTAATTTGAACCCAACTGCCTCGGATCTCAGTTTATCCATTGTCAATCCTATATCATCGAGTCGAATTAGTGAACGAGATGTTCGCTCCCTTCTTTCAGATGCTTTAAAATTGTAGTGATAAACATTTTTCTACTTCTAAATATTCCACAATCCCTCTAAGACAAATGCCGATTTATACACTTG-TTATAATCACTGTTTTCACTGCACCGTTCCTTTG-TATTGATTCAGTGAATTCAGTGGTTTGAGTATTTGTGCGTTGATAAGAACTTTAACATAAACACACATGGAAATATTTTAATTTATTTTTGTGAATATATATAGGATGCTAATGATGACGATTTCACGAAAACAGTGAAATTTATCTTCATTCTTTACCCATGTAAATTGACTTTTTGGTAAAAAAAAAATTCTAAATTTTACCCATGTATCATTNTTTTGTTTTTCCAAAANNCATTTTTGCTTAATTTGGTATTTTTTACTTTTGTGCTCCGGNGTTTTGGGTTTTCGTCTATCTTGGTGAACATCGTACGCACATGCATATGCATATTACTAATTACTATGTNGAATTAGAATTTCCACAGGTTCGATTC]

[-] EMBL CD165232             [GAAAAAAAGCCCGTTNAGATAATTATACTACAGTAAATGGAACGAAATCATTTCCAGTCACTTCCAAATCCATTTCTGAGTCTCTCCAGTCACCGTGCAACATGGTTACGGCGTTGCGCAAGGCAGCAAATCACCAGGCCCTTTTTTTCTGGTCTCGCATACACAGACTCAAACCTTCGGGATATTGCAGAATCTTTGCACTTAGATCCAAGTCACTCTAATGCTGATCCCAATCTTATCTATGAAGGCCTACTTGCAATGAGTGATCATCAGATACATAAACTTTGCCAGTTTTACGAGACTTTATCATCATATACTCTCTCCCCTGAATCTATCATTTCCGGATCTGGAAAAATCCAATGGTTAAATGACAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD153258             [                                                                                                                                              cTTTTTCTGGTCTCGCATACACAGACTCAAACCTTCGGGATATTGCAGAATCTTTGCACTTAGATCCAAGTCACTCTAATGCTGATCCCAATCTTATCTATGAAGACCTACTTGCAATGAGTGATCATCAGATACATAAACTTTGCCAGTTTTACGAGACTTTATCATCATATACTCTCTCCCCTGAATCTATCATTTCTGGATCTGGAAAAATCCAATGGTTAAATGACAATTTGCCTAAATTAGTCTCCG AGGACATCGTATTTTGATTTTTAGTCAGTTTGTCATCATGTTAGATATATTAGAGGAATTTTTAAGGATAACTAACAGGCGTTATATACGAATGGATGGATCAACTCCAGTCTCGGAACGACAAACATTAATAGATCGTTTCAACAGTCCTGTTCACGTCATACGACTAATCTCTGAAGGTACTTTAGAAGAGGGTATGCTGCGTATTGCATCTGAGAAATTACAAATGGAACAGAATGTAACAGGTTGTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD167130             [                                                                                                                                                                                                                                       AATCTTATCTATGAAGACCTACTTGCAATGAGTGATCATCAGATACATAAACTTTGCCAGGTTTACGAGACTTTATCATCATATACTCTCTCCCCTGAATCTATCATTTCTGGATCTGGAAAAATCCAATGGTTAAATGACAATTTGCCTAAATTAGTCTCCGAAGGACATCGTATTTTGATTTTTAGTCAGTTTGACATCATGTTAGATATATTAGAGGAATTTTTAAGGATAACTAACAGGCGTTATATACGAATGGATGGATCAACTCCTGTCTCGGAACGACAAACATTAATAGATCGGTTCAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD079349             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CGTATTGCATCTGAGAAATTACAAATGGAACAGAATGTAACAGGTTGTGTATCTGGATACAACACAGAACAGACCGAGGAATCTGAAAAAACTGCTCGTGTTAGTTCCCGGAGGAGAAGGTCAAAGTCAGCCAATATTTTACCATG TTCCAGTCTAGATGGTATGACAGAGAATGGAAATGTTTTCAAAGTCCTCGGTAATTTGAACCCAACTGCCTCGGATCTCAGTTTATCCATTGTCAATCCTATATCATCGAGTCGAATTAGTGAACGAGATGTTCGCTCCCTTCTTTCAGATGCTTTAAAATTGTAGTGATAAACATTTTTCTACTTCTAAATATTCCACAATCCCTCTAAGACAAATGCCGATTTATACACTTG TTATAATCACTGTTTTCACTGCACCGTTCCTTTG TATTGATTCAGTGAATTCAGTGGTTTGAGTATTTGTGCGTTGATAAGAACTTTAACATAAACACACATGGAAATATTTTAATTTATTTTTGTGAATATATATAGGATGCTAATGATGACGATTTCACGAAAACAGTGAAATTTATCTTCATTCTTTACCCATGTAAATTGACTTTTTGGTAAAAAAAAAATTCTAAATTTTACCCATGTATCATTNTTTTGTTTTTCCAAAANNCATTTTTGCTTAATTTGGTATTTTTTACTTTTGTGCTCCGGNGTTTTGGGTTTTCGTCTATCTTGGTGAACATCGTACGCACATGCATATGCATATTACTAATTACTATGTNGAATTAGAATTTCCACAG         ]
[+] EMBL AA559624             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GCCAATATTTTACCATGTTTCCAGTCTAGATGGTATGACAGAGAATGGAAATGTTTTCAAAGTCCTCGGTAATTTGAACCCAACTGCCTCGGATCTCAGTTTATCCATTGTCAATCCTATATCATCGAGTCGAATTAGTGAACGAGATGTTCGCTCCCTTCTTTCAGATGCTTTAAAATTGTAGTGATAAACATTTTTCTACTTCTAAATATTCCACAATCCCTCTAAGACAAATGCCGATTTATACACTTGTTTATAATCACTGTTTTCACTGCACCGTNCCTTTGTTATTGATTCAGTGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD073626             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CAATATTTTACCATG TTCCAGTCTAGATGGTATGACAGAGAATGGAAATGTTTTCAAAGTCCTCGGTAATTTGAACCCAACTGCCTCGGATCTCAGTTTATCCATTGTCAATCCTATATCATCGAGTCGAATTAGTGAACGAGATGTTCGCTCCCTTCTTTCAGATGCTTTAAAATTGTAGTGATAAACATTTTTCTACTTCTAAATATTCCACAATCCCTCTAAGACAAATGCCGATTTATACACTTG TTATAATCACTGTTTTCACTGCACCGTTCCTTTG TATTGATTCAGTGAATTCAGTGGTTTGAGTATTTGTGCGTTGATAAGAACTTTAACATAAACACACATGGAAATATTTTAATTTATTTTTGTGAATATATATAGGATGCTAATGATGACGATTTCACGAAAACAGTGAAATTTATCTTCATTCTTTACCCATGTAAATTGACTTTTTGGTAAAAAAAAAATTCTAAATTTTACCCATGTATCATTTTTTTGTTTTTCCAAAATCTATTTTTGCTTAATTTGTTATTTTTTACTTTTGTGCTTCGGTGTTTTGTGTTTTCGTCTATCTTGTTGAACATCGTACGCACATGCATATGCATATTACTAATTACTATGT AATTTAGAATTTCCACAGGTTCGATTC]


>consensus_7942#0 GAAAAAAAGCCCGTTNAGATAATTATACTACAGTAAATGGAACGAAATCATTTCCAGTCA CTTCCAAATCCATTTCTGAGTCTCTCCAGTCACCGTGCAACATGGTTACGGCGTTGCGCA AGGCAGCAAATCACCAGGCCCTTTTTTTCTGGTCTCGCATACACAGACTCAAACCTTCGG GATATTGCAGAATCTTTGCACTTAGATCCAAGTCACTCTAATGCTGATCCCAATCTTATC TATGAAGACCTACTTGCAATGAGTGATCATCAGATACATAAACTTTGCCAGTTTTACGAG ACTTTATCATCATATACTCTCTCCCCTGAATCTATCATTTCTGGATCTGGAAAAATCCAA TGGTTAAATGACAATTTGCCTAAATTAGTCTCCGAGGACATCGTATTTTGATTTTTAGTC AGTTTGTCATCATGTTAGATATATTAGAGGAATTTTTAAGGATAACTAACAGGCGTTATA TACGAATGGATGGATCAACTCCAGTCTCGGAACGACAAACATTAATAGATCGTTTCAACA GTCCTGTTCACGTCATACGACTAATCTCTGAAGGTACTTTAGAAGAGGGTATGCTGCGTA TTGCATCTGAGAAATTACAAATGGAACAGAATGTAACAGGTTGTGTATCTGGATACAACA CAGAACAGACCGAGGAATCTGAAAAAACTGCTCGTGTTAGTTCCCGGAGGAGAAGGTCAA AGTCAGCCAATATTTTACCATGTTCCAGTCTAGATGGTATGACAGAGAATGGAAATGTTT TCAAAGTCCTCGGTAATTTGAACCCAACTGCCTCGGATCTCAGTTTATCCATTGTCAATC CTATATCATCGAGTCGAATTAGTGAACGAGATGTTCGCTCCCTTCTTTCAGATGCTTTAA AATTGTAGTGATAAACATTTTTCTACTTCTAAATATTCCACAATCCCTCTAAGACAAATG CCGATTTATACACTTGTTATAATCACTGTTTTCACTGCACCGTTCCTTTGTATTGATTCA GTGAATTCAGTGGTTTGAGTATTTGTGCGTTGATAAGAACTTTAACATAAACACACATGG AAATATTTTAATTTATTTTTGTGAATATATATAGGATGCTAATGATGACGATTTCACGAA AACAGTGAAATTTATCTTCATTCTTTACCCATGTAAATTGACTTTTTGGTAAAAAAAAAA TTCTAAATTTTACCCATGTATCATTNTTTTGTTTTTCCAAAANNCATTTTTGCTTAATTT GGTATTTTTTACTTTTGTGCTCCGGNGTTTTGGGTTTTCGTCTATCTTGGTGAACATCGT ACGCACATGCATATGCATATTACTAATTACTATGTNGAATTAGAATTTCCACAGGTTCGA TTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)