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Schistosoma mansoni
cluster # 7946 cluster # 7946       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7946#0 length = 1290 sequences # 6  

consensusID : consensus_7946#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1290
fasta sequence
                              [GGTTGGATTCCTTCATTTGTCGACGTGTCTTATTGGAATTTTAAAGCCCTATTTACAGTAACTTGTAACTTTTTATATTAGTCTTAAGTCTGACTTCTAAAAATTTATTTAATAGATTATCGCTGCAACCGATCATCATAATGAAGTGACAATTTGGGACTTGGAGTCCTCAGCCACAGCGTCATCATCTGCAGCCATTTCATCCTGTAATTATGGACTTCCCAGTTCTTTTGCACCAGTTCGCAGTACAGGATGTTTAGCTTCGACATGGGCTCAACCAGGCAATAAAACACCCCTTATTCTTGATAGTTCTCTACCACATCGATCAGTCCGATCAATTTTGTGCCTTCCTAACAACAGTGTTATGCAGTTTAATGAATATAACAAACTCCATTCTCAAGTTACTCATTTACCAGCTATAGTGGCCGGTGGTAATGATGCACGTTTACGGTATTGGAACTTCCGAAAACCAGAGGATTCGTGTGTTTTAGTTTGGGCTGGGATTGATGAAGCTACCCCTCCTCGACTTACCTACCGGTCAATATATGTAAATGATGTCTATATTTTAATTGAACAAACTGATACTTCTTCCGTTAATGATACATCAAGTAGTTTGTTAACAAAAACAATGTACACAGAAGTATCACAAAAATTACAATCATCAAGTAATATAACAGAAGTATCAAATAGTGCATTCCCTGTATCAGGACGTTTAGAATTACGTGAATCAACCAAAGGACATAAGAATATTATATCTGATTTAACTGTTCTTCAAGCAGGTCAAGCATTTTTAGTCTCTGCTTCAATGGATGGTGTGATAAAAATTTGGCGATAATATATACTAATCATAAATTTATTCATAAAGTATTTTTTTATCAATTGATTTCATTAATTTATTAATTATTATAGATTGTGATTATGATGATGATAGAACAAACTACTTGTACACTATTTTATTTTATATATTTATAACATAAATGAAACATACTTGCAAATTTTGCTTAAATATCAGTTATCTAAATTTGAAGTTGTGTACGTTTGTCAAAACCTTAATTGTTTTTATTAAAGTTGAACTTTAAACACTAGTCTAAGCGTTATTTTCGATTTTATTTCAACCGAAAAAGACAAAAAAACACCAAATTGTTACACATACAGCGCAATAGGATTGTGATTCACAAAAACGATTTGTTTGTTTTTTCGAACTGCATAACAATATAAATAAACATGTGAATACATACAAATTTGAACAAAATAAAGAAAATAAGATATCAAAAAAAGGGTAAAAAAAAA]

[-] EMBL CD188187             [GGTTGGATTCCTTCATTTGTCGACGTGTCTTATTGGAATTTTAAAGCCCTATTTACAGTAACTTGTAACTTTTTATATTAGTCTTAAGTCTGACTTCTAAAAATTTATTTAATAGATTATCGCTGCAACCGATCATCATAATGAAGTGACAATTTGGGACTTGGAGTCCTCAGCCACAGCGTCATCATCTGCAGCCATTTCATCCTGTAATTATGGACTTCCCAGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD079387             [                                                                                                               gagGATTATCGCTGCAACCGATCATCATAATGAAGTGACAATTTGGGACTTGGAGTCCTCAGCCACAGCGTCATCATCTGCAGCCATTTCATCCTGTAATTATGGACTTCCCAGTTCTTTTGCACCAGTTCGCAGTACAGGATGTTTAGCTTCGACATGGGCTCAACCAGGCAATAAAACACCCCTTATTCTTGATAGTTCTCTACCACATCGATCAGTCCGATCAATTTTGTGCCTTCCTAACAACAGTGTTATGCAGTTTAATGAATATAACAAACTCCATTCTCAAGTTACTCATTTACCAGCTATAGTGGCCGGTGGTAATGATGCACGTTTACGGTATTGGAACTTCCGAAAACCAGAGGATTCGTGTGTTTTAGTTTGGGCTGGGATTGATGAAGCTACCCCTCCTCGACTTACCTACCGGTCAATATATGTAAATGATGTCTATATTTTAATTGAACAAACTGATACTTCTTCCGTTAATGATACATCAAGTAGTTTGTTAACAAAAACAATGTACACAGAAGTATCACAAAAATTACAATCATCAAGTAATATAACAGAAGTATCAAATAGTGCATTCCCTGTATCAGGACGTTTAGAATTACGTGAATCAACCAAAGGACATAAGAATATTATATCTGATTTAACTGTTCTTCAAGCAGGTCAAGCATTTTTAGTCTCTGCTTCAATGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD112614             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTAACAACAGTGTTATGCAGTTTAATGAATATAACAAACTCCATTCTCAAGTTACTCATTTACCAGCTATAGTGGCCGGTGGTAATGATGCACGTTTACGGTATTGGAACTTCCGAAAACCAGAGGATTCGTGTGTTTTAGTTTGGGCTGGGATTGATGAAGCTACCCCTCCTCGACTTACCTACCGGTCAATATATGTAAATGATGTCTATATTTTAATTGAACAAACTGATACTTCTTCCGTTAATGATACATCAAGTAGTTTGTTAACAAAAACAATGTACACAGAAGTATCACAAAAATTACAATCATCAAGTAATATAACAGAAGTATCAAATAGTGCATTCCCTGTATCAGGACGTTTAGAATTACGTGAATCAACCAAAGGACATAAGAATATTATATCTGATTTAACTGTTCTTCAAGCAGGTCAAGCATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD112719             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGTGTTATGCAGTNTAATGAATATAACAAACTCCATTCTCAAGTTACTCATTTACCAGCTATAGTGGCCGGTGGTAATGATGCACGTTTACGGTATTGGAACTTCCGAAAACCAGAGGATTCGTGTGTTTTAGTTTGGGCTGGGATTGATGAAGCTACCCCTCCTCGACTTACCTACCGGTCAATATATGTAAATGATGTCTATATTTTAATTGAACAAACTGATACTTCTTCCGTTAATGATACATCAAGTAGTTTGTTAACAAAAACAATGTACACAGAAGTATCACAAAAATTACAATCATCAAGTAATATAACAGAAGTATCAAATAGTGCATTCCCTGTATCAGGACGTTTAGAATTACGTGAATCAACCAAAGGACATAAGAATATTGTATCTGATTTAACTGTTCTTCAAGCAGGTCAAGCATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD112608             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TATAACAGACTCCATTCTCAAGTTACTCATTTACAAGCTATAGTGGCCGGTGGTAATGATGCACGTTTACGGTATTGGAACTTCCGAAAACCAGAGGATTCGTGTGTTTTAGTTTGGGCTGGGATTGATGAAGCTACCCCTCCTCGACTTACCTACCGGTCAATATATGTAAATGATGTCTATATTTTAATTGAACAAACTGATACTTCTTCCGTTAATGATACATCAAGTAGTTTGTTAACAAAAACAATGTACACAGAAGTATCACAAAAATTACAATCATCAAGTAATATAACAGAAGTATCAAATAGTGCATTCCCTGTATCAGGACGTTTAGAATTACGTGAATCAACCAAAGGACATAAGAATA TATATCTGATTTAACTGTTCTTCAAGCAGGTCAAGCATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD073662             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTAATGATACATCAAGTAGTTTGTTAACAAAAACAATGTACACAGAAGTATCACAAAAATTACAATCATCAAGTAATATAACAGAAGTATCAAATAGTGCATTCCCTGTATCAGGACGTTTAGAATTACGTGAATCAACCAAAGGACATAAGAATATTATATCTGATTTAACTGTTCTTCAAGCAGGTCAAGCATTTTTAGTCTCTGCTTCAATGGATGGTGTGATAAAAATTTGGCGATAATATATACTAATCATAAATTTATTCATAAAGTATTTTTTTATCAATTGATTTCATTAATTTATTAATTATTATAGATTGTGATTATGATGATGATAGAACAAACTACTTGTACACTATTTTATTTTATATATTTATAACATAAATGAAACATACTTGCAAATTTTGCTTAAATATCAGTTATCTAAATTTGAAGTTGTGTACGTTTGTCAAAACCTTAATTGTTTTTATTAAAGTTGAACTTTAAACACTAGTCTAAGCGTTATTTTCGATTTTATTTCAACCGAAAAAGACAAAAAAACACCAAATTGTTACACATACAGCGCAATAGGATTGTGATTCACAAAAACGATTTGTTTGTTTTTTCGAACTGCATAACAATATAAATAAACATGTGAATACATACAAATTTGAACAAAATAAAGAAAATAAGATATCAAAAAAAGGGTAAAAAAAAA]


>consensus_7946#0 GGTTGGATTCCTTCATTTGTCGACGTGTCTTATTGGAATTTTAAAGCCCTATTTACAGTA ACTTGTAACTTTTTATATTAGTCTTAAGTCTGACTTCTAAAAATTTATTTAATAGATTAT CGCTGCAACCGATCATCATAATGAAGTGACAATTTGGGACTTGGAGTCCTCAGCCACAGC GTCATCATCTGCAGCCATTTCATCCTGTAATTATGGACTTCCCAGTTCTTTTGCACCAGT TCGCAGTACAGGATGTTTAGCTTCGACATGGGCTCAACCAGGCAATAAAACACCCCTTAT TCTTGATAGTTCTCTACCACATCGATCAGTCCGATCAATTTTGTGCCTTCCTAACAACAG TGTTATGCAGTTTAATGAATATAACAAACTCCATTCTCAAGTTACTCATTTACCAGCTAT AGTGGCCGGTGGTAATGATGCACGTTTACGGTATTGGAACTTCCGAAAACCAGAGGATTC GTGTGTTTTAGTTTGGGCTGGGATTGATGAAGCTACCCCTCCTCGACTTACCTACCGGTC AATATATGTAAATGATGTCTATATTTTAATTGAACAAACTGATACTTCTTCCGTTAATGA TACATCAAGTAGTTTGTTAACAAAAACAATGTACACAGAAGTATCACAAAAATTACAATC ATCAAGTAATATAACAGAAGTATCAAATAGTGCATTCCCTGTATCAGGACGTTTAGAATT ACGTGAATCAACCAAAGGACATAAGAATATTATATCTGATTTAACTGTTCTTCAAGCAGG TCAAGCATTTTTAGTCTCTGCTTCAATGGATGGTGTGATAAAAATTTGGCGATAATATAT ACTAATCATAAATTTATTCATAAAGTATTTTTTTATCAATTGATTTCATTAATTTATTAA TTATTATAGATTGTGATTATGATGATGATAGAACAAACTACTTGTACACTATTTTATTTT ATATATTTATAACATAAATGAAACATACTTGCAAATTTTGCTTAAATATCAGTTATCTAA ATTTGAAGTTGTGTACGTTTGTCAAAACCTTAATTGTTTTTATTAAAGTTGAACTTTAAA CACTAGTCTAAGCGTTATTTTCGATTTTATTTCAACCGAAAAAGACAAAAAAACACCAAA TTGTTACACATACAGCGCAATAGGATTGTGATTCACAAAAACGATTTGTTTGTTTTTTCG AACTGCATAACAATATAAATAAACATGTGAATACATACAAATTTGAACAAAATAAAGAAA ATAAGATATCAAAAAAAGGGTAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)