These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7946#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1290 fasta sequence [GGTTGGATTCCTTCATTTGTCGACGTGTCTTATTGGAATTTTAAAGCCCTATTTACAGTAACTTGTAACTTTTTATATTAGTCTTAAGTCTGACTTCTAAAAATTTATTTAATAGATTATCGCTGCAACCGATCATCATAATGAAGTGACAATTTGGGACTTGGAGTCCTCAGCCACAGCGTCATCATCTGCAGCCATTTCATCCTGTAATTATGGACTTCCCAGTTCTTTTGCACCAGTTCGCAGTACAGGATGTTTAGCTTCGACATGGGCTCAACCAGGCAATAAAACACCCCTTATTCTTGATAGTTCTCTACCACATCGATCAGTCCGATCAATTTTGTGCCTTCCTAACAACAGTGTTATGCAGTTTAATGAATATAACAAACTCCATTCTCAAGTTACTCATTTACCAGCTATAGTGGCCGGTGGTAATGATGCACGTTTACGGTATTGGAACTTCCGAAAACCAGAGGATTCGTGTGTTTTAGTTTGGGCTGGGATTGATGAAGCTACCCCTCCTCGACTTACCTACCGGTCAATATATGTAAATGATGTCTATATTTTAATTGAACAAACTGATACTTCTTCCGTTAATGATACATCAAGTAGTTTGTTAACAAAAACAATGTACACAGAAGTATCACAAAAATTACAATCATCAAGTAATATAACAGAAGTATCAAATAGTGCATTCCCTGTATCAGGACGTTTAGAATTACGTGAATCAACCAAAGGACATAAGAATATTATATCTGATTTAACTGTTCTTCAAGCAGGTCAAGCATTTTTAGTCTCTGCTTCAATGGATGGTGTGATAAAAATTTGGCGATAATATATACTAATCATAAATTTATTCATAAAGTATTTTTTTATCAATTGATTTCATTAATTTATTAATTATTATAGATTGTGATTATGATGATGATAGAACAAACTACTTGTACACTATTTTATTTTATATATTTATAACATAAATGAAACATACTTGCAAATTTTGCTTAAATATCAGTTATCTAAATTTGAAGTTGTGTACGTTTGTCAAAACCTTAATTGTTTTTATTAAAGTTGAACTTTAAACACTAGTCTAAGCGTTATTTTCGATTTTATTTCAACCGAAAAAGACAAAAAAACACCAAATTGTTACACATACAGCGCAATAGGATTGTGATTCACAAAAACGATTTGTTTGTTTTTTCGAACTGCATAACAATATAAATAAACATGTGAATACATACAAATTTGAACAAAATAAAGAAAATAAGATATCAAAAAAAGGGTAAAAAAAAA] [-] EMBL CD188187 [GGTTGGATTCCTTCATTTGTCGACGTGTCTTATTGGAATTTTAAAGCCCTATTTACAGTAACTTGTAACTTTTTATATTAGTCTTAAGTCTGACTTCTAAAAATTTATTTAATAGATTATCGCTGCAACCGATCATCATAATGAAGTGACAATTTGGGACTTGGAGTCCTCAGCCACAGCGTCATCATCTGCAGCCATTTCATCCTGTAATTATGGACTTCCCAGTT ] [+] EMBL CD079387 [ gagGATTATCGCTGCAACCGATCATCATAATGAAGTGACAATTTGGGACTTGGAGTCCTCAGCCACAGCGTCATCATCTGCAGCCATTTCATCCTGTAATTATGGACTTCCCAGTTCTTTTGCACCAGTTCGCAGTACAGGATGTTTAGCTTCGACATGGGCTCAACCAGGCAATAAAACACCCCTTATTCTTGATAGTTCTCTACCACATCGATCAGTCCGATCAATTTTGTGCCTTCCTAACAACAGTGTTATGCAGTTTAATGAATATAACAAACTCCATTCTCAAGTTACTCATTTACCAGCTATAGTGGCCGGTGGTAATGATGCACGTTTACGGTATTGGAACTTCCGAAAACCAGAGGATTCGTGTGTTTTAGTTTGGGCTGGGATTGATGAAGCTACCCCTCCTCGACTTACCTACCGGTCAATATATGTAAATGATGTCTATATTTTAATTGAACAAACTGATACTTCTTCCGTTAATGATACATCAAGTAGTTTGTTAACAAAAACAATGTACACAGAAGTATCACAAAAATTACAATCATCAAGTAATATAACAGAAGTATCAAATAGTGCATTCCCTGTATCAGGACGTTTAGAATTACGTGAATCAACCAAAGGACATAAGAATATTATATCTGATTTAACTGTTCTTCAAGCAGGTCAAGCATTTTTAGTCTCTGCTTCAATGG ] [-] EMBL CD112614 [ CTAACAACAGTGTTATGCAGTTTAATGAATATAACAAACTCCATTCTCAAGTTACTCATTTACCAGCTATAGTGGCCGGTGGTAATGATGCACGTTTACGGTATTGGAACTTCCGAAAACCAGAGGATTCGTGTGTTTTAGTTTGGGCTGGGATTGATGAAGCTACCCCTCCTCGACTTACCTACCGGTCAATATATGTAAATGATGTCTATATTTTAATTGAACAAACTGATACTTCTTCCGTTAATGATACATCAAGTAGTTTGTTAACAAAAACAATGTACACAGAAGTATCACAAAAATTACAATCATCAAGTAATATAACAGAAGTATCAAATAGTGCATTCCCTGTATCAGGACGTTTAGAATTACGTGAATCAACCAAAGGACATAAGAATATTATATCTGATTTAACTGTTCTTCAAGCAGGTCAAGCATTT ] [-] EMBL CD112719 [ AGTGTTATGCAGTNTAATGAATATAACAAACTCCATTCTCAAGTTACTCATTTACCAGCTATAGTGGCCGGTGGTAATGATGCACGTTTACGGTATTGGAACTTCCGAAAACCAGAGGATTCGTGTGTTTTAGTTTGGGCTGGGATTGATGAAGCTACCCCTCCTCGACTTACCTACCGGTCAATATATGTAAATGATGTCTATATTTTAATTGAACAAACTGATACTTCTTCCGTTAATGATACATCAAGTAGTTTGTTAACAAAAACAATGTACACAGAAGTATCACAAAAATTACAATCATCAAGTAATATAACAGAAGTATCAAATAGTGCATTCCCTGTATCAGGACGTTTAGAATTACGTGAATCAACCAAAGGACATAAGAATATTGTATCTGATTTAACTGTTCTTCAAGCAGGTCAAGCATTT ] [-] EMBL CD112608 [ TATAACAGACTCCATTCTCAAGTTACTCATTTACAAGCTATAGTGGCCGGTGGTAATGATGCACGTTTACGGTATTGGAACTTCCGAAAACCAGAGGATTCGTGTGTTTTAGTTTGGGCTGGGATTGATGAAGCTACCCCTCCTCGACTTACCTACCGGTCAATATATGTAAATGATGTCTATATTTTAATTGAACAAACTGATACTTCTTCCGTTAATGATACATCAAGTAGTTTGTTAACAAAAACAATGTACACAGAAGTATCACAAAAATTACAATCATCAAGTAATATAACAGAAGTATCAAATAGTGCATTCCCTGTATCAGGACGTTTAGAATTACGTGAATCAACCAAAGGACATAAGAATA TATATCTGATTTAACTGTTCTTCAAGCAGGTCAAGCATTT ] [-] EMBL CD073662 [ TTAATGATACATCAAGTAGTTTGTTAACAAAAACAATGTACACAGAAGTATCACAAAAATTACAATCATCAAGTAATATAACAGAAGTATCAAATAGTGCATTCCCTGTATCAGGACGTTTAGAATTACGTGAATCAACCAAAGGACATAAGAATATTATATCTGATTTAACTGTTCTTCAAGCAGGTCAAGCATTTTTAGTCTCTGCTTCAATGGATGGTGTGATAAAAATTTGGCGATAATATATACTAATCATAAATTTATTCATAAAGTATTTTTTTATCAATTGATTTCATTAATTTATTAATTATTATAGATTGTGATTATGATGATGATAGAACAAACTACTTGTACACTATTTTATTTTATATATTTATAACATAAATGAAACATACTTGCAAATTTTGCTTAAATATCAGTTATCTAAATTTGAAGTTGTGTACGTTTGTCAAAACCTTAATTGTTTTTATTAAAGTTGAACTTTAAACACTAGTCTAAGCGTTATTTTCGATTTTATTTCAACCGAAAAAGACAAAAAAACACCAAATTGTTACACATACAGCGCAATAGGATTGTGATTCACAAAAACGATTTGTTTGTTTTTTCGAACTGCATAACAATATAAATAAACATGTGAATACATACAAATTTGAACAAAATAAAGAAAATAAGATATCAAAAAAAGGGTAAAAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||