These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7955#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 669 fasta sequence [CAATTGCAGCAACAACAAGCAGCAGTTGTTCAACATCAACAACTTTTACAACAGCAGCAACAACAACAGCAGGCTAACTATGCAGTGGCAGCTGCTGCGGCTGCCGCTGCTGCTGGTACACATTTAGTTGCAGTCTCTAATCATGGTAATTGTAATCAATCAACTGTCAATCAAACACAGCAATTCCAATT---ACAACAACAACAACAACAGGCTGTGGCTTTAGCAGCCCATCAACAAGCAGCGCACAGTTTTCTTTTCCCTGCTGCTGGAGTTAATGCTAGCGTTAACTCGACAGGTACTGTTGCAACACCATCTGGTCCAACTACATTCTTTTGTCATCCACAAGAAGGAATGGCTGCTGGTTTGTTTCTGGCTTCTTCAACTGACCCAGCTAGTTTTGCATTAGCAGCTGCTGCTCAAGCACAAGCACAAGCAGCTGCGGCAGCTGTTGCCGTTGTCCAGCAACAACAACAACACCAGCAACAGCAGAGTAATGTTAATGCTGTTAATGCTCAGAACAATTCTTCAATTGCTGCTACACAATTACAACTAGTAACAGGTTATTCACAGGTGGCGGCTGATGCTCAACAAACTGTTGCACAACAACAACTACAACATCAACAGCTATTGTTACAACGGCAACAACATCAGCAGAGATTAGCAGCAGTG] [+] EMBL CD096482 [CAATTGCAGCAACAACAAGCAGCAGTTGTTCAACATCAACAACTTTTACAACAGCAGCAACAACAACAGCAGGCTAACTATGCAGTGGCAGCTGCTGCGGCTGCCGCTGCTGCTGGTACACATTTAGTTGCAGTCTCTAATCATGGTAATTGTAATCAATCAACTGTCAATCAAACACAGCAATTCCAATTACAACAACAACAACAACAACAGGCTGTGGCTTTAGCAGCCCATCAACAAGCAGCGCACAGTTTTCTTTTCCCTGCTGCTGGAGTTAATGCTAGCGTTAACTCGACAGG ] [+] EMBL CD138997 [ TTTAGTTGCAGTCTCTAATCATGGTAATTGTAATCAATCAACTGTCAATCAAACACAGCAATTCCAATT ACAACAACAACAACAACAGGCTGTGGCTTTAGCAGCCCGTCAACAAGCAGCGCACAGTTTTCTTTTCCCTGCTGCTGGAGTTAATGCTAGCGTTAACTCGACAGGTACTGTTGCAACACCATCTGGTCCAACTACATTCTTTTGTCATCCACAAGAAGGAATGGCTGCTGGTTTGTTTCTGGCTTCTTCAACTGACCCAGCTAGTTTTGCATTAGCAGCTGCTGCTCAAGCACAAGCACAAGCAGCTGCGGCAGCTGTTGCCGTTGTCCAGCAACAACAACAACACCAGCAACAGCAGAGTCATGTTAATGCTGTTAATGCTCAGAACAATTCTTCAATTGCTGCTACACAATTACAACTAGTAACAGG ] [-] EMBL CD164887 [ TTAGTTGCAGTCTCTAATCATGGTAATTGTAATCAATCAACTGTCAATCAAACACAGCAATTCCAATT ACAACAACAACAACAACAGGCTGTGGCTTTAGCAGCCCATCGACAAGCAGCGCACAGTTTTCTTTTCCCTGCTGCTGGAGTTAATGCTAGCGTTAACTCGACAGGTACTGTTGCGACACCATCTGGTCCAACTACATTCTTTTGTCATCCACAAGAAGGAATGGCTGCTGGTTTGTTTCTGGCTTCTTCAACTGACCCAGCTAGT ] [-] EMBL CD164885 [ TTAGTTGCAGTCTCTAATCATGGTAATTGTAATCAATCAACTGTCAATCAAACACAGCAATTCCAATT ACAACAACAACAACAACAGGCTGTGGCTTTAGCAGCCCATCAACAAGCAGCGCACAGTTTTCTTTTCCCTGCTGCTGGAGTTAATGCTAGCGTTAACTCGACAGGTACTGTTGCAACACCATCTGGTCCAACTACATTCTTTTGTCATCCACAAGAAGGAATGGCTGCTGGTTTGTTTCTGGCTTCTTCAACTGACCCAGCTAGT ] [+] EMBL CD183596 [ ATGGCTGCTGGTTTGTTTCTGGCTTCTTCAACTGACCCAGCTAGTTTTGCATTAGCAGCTGCTGCTCAAGCACAAGCACAAGCAGCTGCGGCAGCTGTTGCCGTTGTCCAGCAACAACAACAACACCAGCAACAGCAGAGTAATGTTAATGCTGTTAATGCTCAGAACAATTCTTCAATTGCTGCTACACAATTACAACTAGTAACAGGTTATTCACAGGTGGCGGCTGATGCTCAACAAACTGTTGCACAACAACAACTACAACATCAACAGCTATTGTTACAACGGCAACAACATCAGCAGAGATTAGCAGCAGTG] [+] EMBL CD164827 [ GCAACAACAACAACACCAGCAACAGCAGAGTAATGTTAATGCGGTTAATGCTCAGAACAATTCTTCAATTGCTGCTACACAATTACAACTAGTAACAGGTTATTCACAGGTGGCGGCTGATGCTCAACAAACTGTTGCACAACAACAACTACAACATCAACAGCTATTGTTACAACAGCAACAACATCAGCAGAG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||