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Schistosoma mansoni
cluster # 7955 cluster # 7955       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7955#0 length = 669 sequences # 6  

consensusID : consensus_7955#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 669
fasta sequence
                              [CAATTGCAGCAACAACAAGCAGCAGTTGTTCAACATCAACAACTTTTACAACAGCAGCAACAACAACAGCAGGCTAACTATGCAGTGGCAGCTGCTGCGGCTGCCGCTGCTGCTGGTACACATTTAGTTGCAGTCTCTAATCATGGTAATTGTAATCAATCAACTGTCAATCAAACACAGCAATTCCAATT---ACAACAACAACAACAACAGGCTGTGGCTTTAGCAGCCCATCAACAAGCAGCGCACAGTTTTCTTTTCCCTGCTGCTGGAGTTAATGCTAGCGTTAACTCGACAGGTACTGTTGCAACACCATCTGGTCCAACTACATTCTTTTGTCATCCACAAGAAGGAATGGCTGCTGGTTTGTTTCTGGCTTCTTCAACTGACCCAGCTAGTTTTGCATTAGCAGCTGCTGCTCAAGCACAAGCACAAGCAGCTGCGGCAGCTGTTGCCGTTGTCCAGCAACAACAACAACACCAGCAACAGCAGAGTAATGTTAATGCTGTTAATGCTCAGAACAATTCTTCAATTGCTGCTACACAATTACAACTAGTAACAGGTTATTCACAGGTGGCGGCTGATGCTCAACAAACTGTTGCACAACAACAACTACAACATCAACAGCTATTGTTACAACGGCAACAACATCAGCAGAGATTAGCAGCAGTG]

[+] EMBL CD096482             [CAATTGCAGCAACAACAAGCAGCAGTTGTTCAACATCAACAACTTTTACAACAGCAGCAACAACAACAGCAGGCTAACTATGCAGTGGCAGCTGCTGCGGCTGCCGCTGCTGCTGGTACACATTTAGTTGCAGTCTCTAATCATGGTAATTGTAATCAATCAACTGTCAATCAAACACAGCAATTCCAATTACAACAACAACAACAACAACAGGCTGTGGCTTTAGCAGCCCATCAACAAGCAGCGCACAGTTTTCTTTTCCCTGCTGCTGGAGTTAATGCTAGCGTTAACTCGACAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD138997             [                                                                                                                          TTTAGTTGCAGTCTCTAATCATGGTAATTGTAATCAATCAACTGTCAATCAAACACAGCAATTCCAATT   ACAACAACAACAACAACAGGCTGTGGCTTTAGCAGCCCGTCAACAAGCAGCGCACAGTTTTCTTTTCCCTGCTGCTGGAGTTAATGCTAGCGTTAACTCGACAGGTACTGTTGCAACACCATCTGGTCCAACTACATTCTTTTGTCATCCACAAGAAGGAATGGCTGCTGGTTTGTTTCTGGCTTCTTCAACTGACCCAGCTAGTTTTGCATTAGCAGCTGCTGCTCAAGCACAAGCACAAGCAGCTGCGGCAGCTGTTGCCGTTGTCCAGCAACAACAACAACACCAGCAACAGCAGAGTCATGTTAATGCTGTTAATGCTCAGAACAATTCTTCAATTGCTGCTACACAATTACAACTAGTAACAGG                                                                                                             ]
[-] EMBL CD164887             [                                                                                                                           TTAGTTGCAGTCTCTAATCATGGTAATTGTAATCAATCAACTGTCAATCAAACACAGCAATTCCAATT   ACAACAACAACAACAACAGGCTGTGGCTTTAGCAGCCCATCGACAAGCAGCGCACAGTTTTCTTTTCCCTGCTGCTGGAGTTAATGCTAGCGTTAACTCGACAGGTACTGTTGCGACACCATCTGGTCCAACTACATTCTTTTGTCATCCACAAGAAGGAATGGCTGCTGGTTTGTTTCTGGCTTCTTCAACTGACCCAGCTAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD164885             [                                                                                                                           TTAGTTGCAGTCTCTAATCATGGTAATTGTAATCAATCAACTGTCAATCAAACACAGCAATTCCAATT   ACAACAACAACAACAACAGGCTGTGGCTTTAGCAGCCCATCAACAAGCAGCGCACAGTTTTCTTTTCCCTGCTGCTGGAGTTAATGCTAGCGTTAACTCGACAGGTACTGTTGCAACACCATCTGGTCCAACTACATTCTTTTGTCATCCACAAGAAGGAATGGCTGCTGGTTTGTTTCTGGCTTCTTCAACTGACCCAGCTAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD183596             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATGGCTGCTGGTTTGTTTCTGGCTTCTTCAACTGACCCAGCTAGTTTTGCATTAGCAGCTGCTGCTCAAGCACAAGCACAAGCAGCTGCGGCAGCTGTTGCCGTTGTCCAGCAACAACAACAACACCAGCAACAGCAGAGTAATGTTAATGCTGTTAATGCTCAGAACAATTCTTCAATTGCTGCTACACAATTACAACTAGTAACAGGTTATTCACAGGTGGCGGCTGATGCTCAACAAACTGTTGCACAACAACAACTACAACATCAACAGCTATTGTTACAACGGCAACAACATCAGCAGAGATTAGCAGCAGTG]
[+] EMBL CD164827             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GCAACAACAACAACACCAGCAACAGCAGAGTAATGTTAATGCGGTTAATGCTCAGAACAATTCTTCAATTGCTGCTACACAATTACAACTAGTAACAGGTTATTCACAGGTGGCGGCTGATGCTCAACAAACTGTTGCACAACAACAACTACAACATCAACAGCTATTGTTACAACAGCAACAACATCAGCAGAG             ]


>consensus_7955#0 CAATTGCAGCAACAACAAGCAGCAGTTGTTCAACATCAACAACTTTTACAACAGCAGCAA CAACAACAGCAGGCTAACTATGCAGTGGCAGCTGCTGCGGCTGCCGCTGCTGCTGGTACA CATTTAGTTGCAGTCTCTAATCATGGTAATTGTAATCAATCAACTGTCAATCAAACACAG CAATTCCAATTACAACAACAACAACAACAGGCTGTGGCTTTAGCAGCCCATCAACAAGCA GCGCACAGTTTTCTTTTCCCTGCTGCTGGAGTTAATGCTAGCGTTAACTCGACAGGTACT GTTGCAACACCATCTGGTCCAACTACATTCTTTTGTCATCCACAAGAAGGAATGGCTGCT GGTTTGTTTCTGGCTTCTTCAACTGACCCAGCTAGTTTTGCATTAGCAGCTGCTGCTCAA GCACAAGCACAAGCAGCTGCGGCAGCTGTTGCCGTTGTCCAGCAACAACAACAACACCAG CAACAGCAGAGTAATGTTAATGCTGTTAATGCTCAGAACAATTCTTCAATTGCTGCTACA CAATTACAACTAGTAACAGGTTATTCACAGGTGGCGGCTGATGCTCAACAAACTGTTGCA CAACAACAACTACAACATCAACAGCTATTGTTACAACGGCAACAACATCAGCAGAGATTA GCAGCAGTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)