These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7958#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 920 fasta sequence [CGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAATCATCATCATGTATATTTTAATTTTAATCACACTAAAAATAGTCAACTTTATTCTTTTTTTACGATTTAAACTTGAGTTAATTTATTTTGTTTGTCTATTTTCTTATTCTCTGAAGGAGTGGCTTTCATTACAATCAGTTATTTAAGCAAAATCATGGAATTCATAAGATTGTTCATGACTTACTTGATCAGAAAATGAAAAGATATTAATAACAACAACAACAACAAAAATGAAATGATAATTGCAAAATAAGAATTATTTTGAAGGAACTACATAATAAGTGAAAGATAAATGTTACAAAAAATTGAAAGATATGATTAGTTTCTATTGTTTTATTGTTATTCTCCTTTAGTTTTGATAGTATTTTATTCCGCCGAAATACCCAAACTAATACGTACACTTCGAAGTGCTAGACTATTGAAACGTGCTTTATCTTCACGCCATGTTTTTGCTGCATCCACATTAGCTGCACTCTCATCATTCGGTTCTGCAAGCATACTAACAACAGATAATAAAATTTTTTCTACTGATTGAACTGGACTCCAACGTTCAACGGAACTTTCATAACCCATTGGATCATCACCAGGAGCATGAAGTATGGAAATGCATACGCGTCCATCTGGATAGATATTTGGATGGAACACTTCAGTTAGAAACTGCATTTTTGGTGGAGACAAAGGATAATCTGATGGGAAGTTTAAACGTACAGCGAAAACACCACCTTCAAATGGAGTACCCTCTGGTCCAGCAATTAATGCTTCCCACTCAAAAAAATTCCTTTCATCCACTGGTCCAGCAACAATACCCTCTGGTGGGTTGACTGTTAATTGTTTGTACTCTGCCATGAGTCTTTTCAAAGCATTGC] [+] EMBL AI975872 [CGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAATCATCATCATGTATATTTTAATTTTAATCACACTAAAAATAGTCAACTTTATTCTTTTTTTACGATTTAAACTTGAGTTAATTTATTTTGTTTGTCTATTTTCTTATTCTCTGAAGGAGTGGCTTTCATTACAATCAGTTATTTAAGCAAAATCATGGAATTCATAAGATTGTTCATGACTTACTTGATCAGAAAATGAAAAGATATTAATAACAACAACAACAACAAAAATGAAATGATAATTGCAAAATAAGAATTATTTTGAAGGAACTACATAATAAGTGAAAGATAAATGTTACAAAAAATTGAAAGATATGATTAGTTTCTATTGTTTTATTGATATTCTCCTTTAGTTTTGATAGTATTTTATTCCGCCGAAATACCCAAACTAATACGTACACTTCGAAGTGCTAGACTATTGAAACGTGCTTTATCT ] [+] EMBL CD077123 [ CATCATCATGTATATTTTAATTTTAATCACACTAAAAATAGTCAACTTTATTCTTTTTTTACGATTTAAACTTGAGTTAATTTATTTTGTTTGCCTATTTTCTTATTCTCTGAAGGAGTGGCTTTCATTACAATCAGTTATTTAAGCAAAATCATGGAATTCATAAGATTGTTCATGACTTACTTGATCAGAAAATGAAAAGATATTAATAACAACAACAACAACAAAAATGAAATGATAATTGCAAAATAAGAATTATTTTGAAGGAACTACATAATAAGTGAAAGATAAATGTTACAAAAAATTGAAAGATATGATTAGTTTCTATTGTTTTATTGTTATTCTCCTTTAGTTTTGATAGTATTTTATTCCGCCGAAATACCCAAACTAATACGTACACTTCGAAGTGCTAGACTATTGAAACGTGCTTTATCTTCACGCCATGTTTTTGCTGCATCCACATTAGCT ] [+] EMBL CD073266 [ ACTTGAGTTAATTTATTTTGTTTGTCTATTTTCTTATTCTCTGAAGGAGTGGCTTTCATTACAATCAGTTATTTAAGCAAAATCATGGAATTCATAAGATTGTTCATGACTTACTTGATCAGAAAATGAAAAGATATTAATAACAACAACAACAACAAAAATGAAATGATAATTGCAAAATAAGAATTATTTTGAAGGAACTACATAATAAGTGAAAGATAAATGTTACAAAAAATTGAAAGATATGATTAGTTTCTATTGTTTTATTGTTATTCTCCTTTAGTTTTGATAGTATTTTATTCCGCCGAAATACCCAAACTAATACGTACACTTCGAAGTGCTAGACTATTGAAACGTGCTTTATCTTCACGCCATGTTTTTGCTGCATCCACATTAGCTGCACTCTCATCATTCGGTTCTGCAAGCATACTAACAACAGATAATAAAATTTTTTCTACTGATTGAACTGGACTCCAACGTTCAACGGAACTTTCATAACCCATTGGATCATCACCAGGAGCATGAAGTATGGAAATGCATACGCGTCCATCTGGATAGATATTTGGATGGAACACTTCAGTTAGAAACTGCATTTTTGGTGGAGAC AAGGATAATCT ] [-] EMBL CD078806 [ ATTAATANCANCANCANCAACAANAATGAAATGATAATTGCAAAATAAGAATTATTNTGAAGGAACTACATAATAAGTGAAAGATAAATGTTACAAAAAATTGAAAGATATGATTAGTTTCTATTGTTTTATTGTTATTCTCCTTTAGTTTTGATAGTATTTTATTCCGCCGAAATACCCAAACTAATACGTACACTTCGAAGTGCTAGACTATTGAAACGTGCTTTATCTTCACGCCATGTTTTTGCTGCATCCACATTAGCTGCACTCTCATCATTCGGTTCTGCAAGCATACTAACAACAGATAATAAAATTTTTTCTACTGATTGAACTGGACTCCAACGTTCAACGGAACTTTCATAACCCATTGGATCATCACCAGGAGCATGAAGTATGGAAATGCATACGCGTCCATCTGGATAGATATTTGGATGGAACACTTCAGTTAGAAACTGCATTTTTGGTGGAGACAAAGGATAATCTGATGGGAAGTTTAAACGTACAGCGAAAACACCACCTTCAAATGGAGTACCCTCTGGTCCAGCAATTAATGCTTCCCACTCAAAAAAATTCCTTTCATCCACTGGTCCAGCAAC ] [+] EMBL CD167281 [ TTGGATCATCACCAGGAGCATGAAGTATGGAAATGTGTACGCGTCCATCTGGATAGATATTTGGATGGAACACTTCAGTTAGAAACTGCATTTTTGGTGGAGACAAAGGATAATCTGATGGGAAGTTTAAACGTACAGCGAAAACACCACCTTCAAATGGAGTACCCTCTGGTCCAGCAATTAATGCTTCCCACTCAAAAAAATTCCTTTCATCCACTGGTCCAGCAACAATACCCTCTGGTGGGTTGACTGTTAATTGTTTGTACTCTGCCATGAGTCTTTTCAAAGCATTGC] [+] EMBL CD128434 [ TGGATCATCACCAGGAGCATGAAGTATGGAAATGCATACGCGTCCATCTGGATAGATATTTGGATGGAACACTTCAGTTAGAAACTGCATTTTTGGTGGAGACAAAGGATAATCTGATGGGAAGTTTAAACGTACAGCGAAAACACCACCTTCAAATGGAGTACCCTCTGGTCCAGCAATTAATGCTTCCCACTCAAAAAAATTCCTTTCATCCACTGGTCCAGCAACAATACCCTCTGGTGGGTTGACTGTTAATTGTTTGTACTCTGCCATGAGTCTTTTCAAAGCATTGC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||