cluster # 7970

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Schistosoma mansoni
cluster # 7970 cluster # 7970 Sequences # 6 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7970#0 length = 578 sequences # 6

consensusID : consensus_7970#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 578
fasta sequence

                              [AAGAACCTGGTACGTATGTAAATTGGCTCAAGTTGTCAATTCCAATTAACACAGGGAGATGAAATTGTCAGGCTAAATCCCAGAACTTTAGAGGTAGTAACAATATCACTAATAACAGGGAAGATTAGGTAGGCATCGAAAATAAGATTCGA--GGAGAAAATATAGAGTGGCGAAATAAAACAAAAGCTGGGGAATTCAGAATTTAAGGGAAAGTAAAGAATTGATGCACTTGAGTCATTGCAGACGATTTTGAGACTTGTCACACAAAGTCTCTAACCATTGGTTATGATAATTAACCGGGTCATAACAAAGTAGTCTACACCTGTTAACATGGTTCAGTCCAACTGTCATTGACTTTATGGACTGTTACCACGTTTTGATTTGGCCACCCCTAGCTGTCTTCCAGCCTACTCCTACACCAGAAAGCATCGGTTGTCGAGTAAGACTGTGGTTGGGTATACGTAGCACATGTGTCCAAACCACCTCAGTTGATGAAGATTTATCATAACTTAATGAATCCATCTTGATAAGGTCATAAATATCCAAAATAAAGCAAATATCACTTAAATATTTGTGGT]

[+] EMBL CD123770             [AAGAACCTGGTACGTATGTAAATTGGCTCAAGTCGTCAATTCCAATTAACACAGGGAGATGAAATTGTCAGGCTAAATCCCAGAACTTTAGAGGTAGTAACAATATCACTAATAACAGGGAAGATTAGGTAGGCATCGAAAATAAGATTCGAGGGGAGAAAATATAGAGTGGCGAAATAAAACAAAAGCTGGGGAATTCAGAATTTAAGGGAAAGTAAAGAATTGATGCACTTGAGTCATTGCAGACGATTTTGAGACTTGTCACACAAAGTCTCTAACCATTGGTTATGATAATTAACCGGGTCATAACAAAGTAGTCTACACCTGTTAACATGGTTCAGTCCAACTGTCATTGACTTTATGGACTGTTACCACGTTTTGATTTGGCCACCCCTAGCTGTCTTCCAGCCTACTCCTACACCAGAAAGCATCGGTTGTCGAGTAAGACTGTGGTTGGGTATACGTAGCACATGTGTCCAAACCACCTCAGTTGATGAAGATTTATCATAACTTAATGAATCCATCTTGATAAGGTCATAAATATCCAAAATAAAGCAAATATCACTTAAATATTTGTGG ]
[+] EMBL CD123777             [AAGAACCTGGTACGTATGTAAATTGGCTCAAGTTGTCAATTCCAATTAACACAGGGAGATGAAATTGTCAGGCTAAATCCCAGAACTTTAGAGGTAGTAACAATATCACTAATAACAGGGAAGATTAGGTAGGTATCGAAAATAAGATTCGA  GGAGAAAATATAGAGTGGCGAAATAAAACAAAAGCTGGGGAATTCAGAATTTAAGGGAAAGTAAAGAATTGATGCACTTGAGTCATTGCAGACGATTTTGAGACTTGTCACACAAAGTCTCTAACCATTGGTTGTGATAATTAACCGGGTCATAACAAAGTAGTCTACACCTGTTAACATGGTTCAGTCCAACTGTCATTGACTTTATGGACTGTTACCACGTTTTGATTTGGCCACCCCTAGCTGTCTTCCAGCCTACTCCTACACCAGAAAGCATCGGTTGTCGAGTAAGACTGTGGTTGGGTATACGTAGCACATGTGTCCAAACCACCTCAGTTGATGAAGATTTATCATAACTTAATGAATCCATCTTGATAAGGTCATAAATATCCAAAATAAAGCAAATATCACTTAAATATTTGTGG ]
[+] EMBL CD123793             [AAGAACCTGGTACGTATGTAAATTGGCTCAAGTTGTCAATTCCAATTAACACAGGGAGATGAAATTGTCAGGCTAAATCCCAGAACTTTAGAGGTAGTAACAATATCACTAATAACAGGGAAGATTAGGTAGGCATCGAAAATAAGATTCGA  GGAGAAAATATAGAGTGGCGAAATAAAACAAAAGCTGGGGAATTCAGAATTTAAGGGAAAGTAAAGAATTGATGCACTTGAGTCATTGCAGACGATTTTGAGACTTGTCACACAAAGTCTCTAACCATTGGTTACGATAATTAACCGGGTCATAACAAAGTAGTCTACACCTGTTAACATGGTTCAGTCCAACTGTCATTGACTTTATGGACTGTTACCACGTTTTGATTTGGCCACCCCTAGCTGTCTTCCAGCCTACTCCTACACCAGAAAGCATCGGTTGTCGAGTAAGACTGTGGTTGGGTATACGTAGCACATGTGTCCAAACCACCTCAGTTGATGAAGATTTATCATAACTTAATGAATCCATCTTGATAAGGTCATAAATATCCAAAATAAAGCAAATATCACTTAAATATTTGTGG ]
[+] EMBL CD123838             [AAGAACCTGGTACGTATGTAAATTGGCTCAAGTTGTCAATTCCAATTAACACAGGGAGATGAAATTGTCAGGCTAAATCCCAGAACTTTAGAGGTAGTAACAATATCACTAATAACAGGGAAGATTAGGTAGGCATCGAAAATAAGATTCGA  GGAGAAAATATAGAGTGGCGAAATAAAACAAAAGCTGGGGAATTCAGAATTTAAGGGAAAGTAAAGAATTGATGCACTTGAGTCATTGCAGACGATTTTGAGACTTGTCACACAAAGTCTCTAACCATTGGTTATGATTATTAACCGGGTCATAACAAAGTAGTCTACACCTGTTAACATGGTTCAGTCCAACTGTCATTGACTTTATGGACTGTTACCACGTTTTGATTTGGCCACCCCTAGCTGTCTTCCAGCCTACTCCTACACCAGAAAGC                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD123762             [ AGAACCTGGTACGTATGTAAATTGGCTCAAGTTGTCAATTCCAATTAACACAGGGAGATGAAATTGTCAGGCTAAATCCCAGAACTTTAGAGGTAGTAACAATATCACTAATAACAGGGAAGATTAGGTAGGCATCGAAAATAAGATTCGA  GGAGAAAATATAGAGTGGCGAAATAAAACAAAAGCTGGGGAATTCAGAATTTAAGGGAAAGTAAAGAATTGATGCACTTGAGTCATTGCAGACGATTTTGAGACTTGTCACACAAAGTCTCTAACCATTGGTTATGATAATTAACCGGGTCATAACAAAGTAGTCTACACCTGTTAACATGGTTCAGTCCAACTGTCATTGACTTTATGGACTGTTACCACGTTTTGATTTGGCCACCCCTAGCTGTCTTCCAGCCTACTCCTACACCAGAAAGCATCGGTTGTCGAGTAAGACTGTGGTTGGGTATACGTAGCACATGTGTCCAAACCACCTCAGTTGATGAAGATTTATCATAACTTAATGAATCCATCTTGATAAGGTCATAAATATCCAAAATAAAGCAAATATCACTTAAATATTTGTGGT]
[+] EMBL CD123861             [    ACCTGGTACGTATGTAAATTGGCTCAAGTTGTCAATCCCAATTAACACAGGGAGATGAAATTGTCAGGCTAAATCCCAGAACTTTAGAGGTAGTAACAATATCACTAATAACAGGGAAGATTAGGTAGGCATCGAAAATAAGATTCGA  GGAGAAAATATAGAGTGGCGAAATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]




>consensus_7970#0
AAGAACCTGGTACGTATGTAAATTGGCTCAAGTTGTCAATTCCAATTAACACAGGGAGAT
GAAATTGTCAGGCTAAATCCCAGAACTTTAGAGGTAGTAACAATATCACTAATAACAGGG
AAGATTAGGTAGGCATCGAAAATAAGATTCGAGGAGAAAATATAGAGTGGCGAAATAAAA
CAAAAGCTGGGGAATTCAGAATTTAAGGGAAAGTAAAGAATTGATGCACTTGAGTCATTG
CAGACGATTTTGAGACTTGTCACACAAAGTCTCTAACCATTGGTTATGATAATTAACCGG
GTCATAACAAAGTAGTCTACACCTGTTAACATGGTTCAGTCCAACTGTCATTGACTTTAT
GGACTGTTACCACGTTTTGATTTGGCCACCCCTAGCTGTCTTCCAGCCTACTCCTACACC
AGAAAGCATCGGTTGTCGAGTAAGACTGTGGTTGGGTATACGTAGCACATGTGTCCAAAC
CACCTCAGTTGATGAAGATTTATCATAACTTAATGAATCCATCTTGATAAGGTCATAAAT
ATCCAAAATAAAGCAAATATCACTTAAATATTTGTGGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case