cluster # 7973

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Schistosoma mansoni
cluster # 7973 cluster # 7973 Sequences # 6 consensus # 2

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consensus_7973#0 length = 1163 sequences # 5

consensus_7973#1 length = 593 sequences # 1

consensusID : consensus_7973#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1163
fasta sequence

                              [GATAAACTGCAAAGTAGTCTAGTCATCTATTAATGTTGTCATCAGATCTTGCTACCACTTACGTGAAATCTTCGATAGATAAAGTAACGTTAGATGATAGGCAAGTGTCTCTGGAAGTAACTATCCTTAATTTAAGAAGCTTCGTTCTGATAAACAGTGAAGCTTCAGCGAGGTACGTGGAAGTAACCGTTCCTATTTGATTTTCAAAGGATCCAGCCTAATCTATATTCTGTCTTATTGTCGCTACTGCTTCCTTTATTTTTTGCTTCAGCCATTTCATATCTTATATATGTTTGTTAATTGTAATGCTCTACTGCTTTTATCATGACCAGCAGTCCTATTTTAGATTTTTCTAAAAGTAAACACTGATCAATATAGTTTATTTTCAAATAACTTGATTGCATGAAAATCATACTCGCTCTGTCCTTCATTAAATAATACATATCTGAAAAATTTAAATGTGATGCAGTTACTTGGGAAGCGGTTTTTCTTAAGGTTATGCTGCTATTGTATGCAAGAGTGTACATAATAAAGATTTGGTTGGGTATCAACTTTAGTTGGCAATTTACTTTTAAGCACACAGCTNTCCTCCAGGGTCTTTT-AAATCCAGATTGGAATCCGTCGCATGCTTTCTGCTGGTATTCGTATAAACTACACAAGCGCCATTATATTGAAGTAATGTTTGATTCCTACCAGTAAAGCTTGGTAGTGACAATAAAGAAAATCAAGTTGATTTGGAAGTCGTCTCATATAAAATCACTCGTTTAAATACTTCGAAGAATCTTAATATGAGCATTCATTTCAATGTCTCAGCAGCATCACGCGATAATGCAATGTATAGCTTTAAAATTCTTAACTTACAGATCTCTTGCAATAGTGTCATCAGAAGTACTTCATGTCGTTATCGTCAACTTGGTCTCAAACTATTGTTATTTCGTTTCGTATTTGGAAATATCCCACCCTCTCTTTATTAATATGTCTCATGATTTTATCCGTGAATTTGTTCTAGATATCACTTCATTTTTACCCCTATATTACCTTTATAACTATTGTAACCAAGACATTTTGATCATCCGTTGCTAAATGATTAATTTTACAATGTTTTCTATTTGGACACAATTTTTTATTTTTATTATTCATATTACATAATCTAACATTACAAT]

[+] EMBL CD080497             [GATAAACTGCAAAGTAGTCTAGTCATCTATTAATGTTGTCATCAGATCTTGCTACCACTTACGTGAAATCTTCGATAGATAAAGTAACGTTAGATGATAGGCAAGTGTCTCTGGAAGTAACTATCCTTAATTTAAGAAGCTTCGTTCTGATAAACAGTGAAGCTTCAGCGAGGTACGTGGAAGTAACCGTTCCTATTTGATTTTCAAAGGATCCAGCCTAATCTATATTCTGTCTTATTGTCGCTACTGCTTCCTTTATTTTTTGCTTCAGCCATTTCATATCTTATATATGTTTGTTAATTGTAATGCTCTACTGCTTTTATCATGACCAGCAGTCCTATTTTAGATTTTTCTAAAAGTAAACACTGATCAATATAGTTTATTTTCAAATAACTTGATTGCATGAAAATCATACTCGCTCTGTCCTTCATTAAATAATACATATCTGAAAAATTTAAATGTGATGCAGTTACTTGGGAAGCGGTTTTTCTTAAGGTTATGCTGCTATTGTATGCAAGAGTGTACATAATAAAGATTTGGTTGGGTATCAACTTTAGTTGGCAATTTACTTTTAAGCACACAGCTNTCCTCCAGGGTCTTTT AAATCCAGATTGGAATCCGTCGCATGCTTTCTGCTGGTATTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD184168             [                                                                                                                                                                                                                         CTAATCTATATTCTGTCTTATTGTCGCTACTGCTTCCTTTATTTTTTGCTTCAGCCATTTCATATCTTATATATGTTTGTTAATTGTAATGCTCTACTGCTTTTATCATGACCAGCAGTCCTATTTTAGATTTTTCTAAAAGTAAACACTGATCAATATAGTTTATTTTCAAATAACTTGATTGCATGAAAATCATACTCGCTCTGTCCTTCATTAAATAATACATATCTGAAAAATTTAAATGTGATGCAGTTACTTGGGAAGCGGTTTTTCTTAAGGTTATGCTGCTATTGTATGCAAGAGTGTACATAATAAAGATTTGGTTGGGTATCAACTTTAGTTGGCAATTTACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD074407             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTATCAACTTTAGTTGGCAATTTACTTTTAAGCACACAGCTTTCCTCCAGGGTCTTTTAAAATCCAGATTGGAATCCGTCGCATGCTTTCTGCTGGTATTCGTATAAACTACACAAGCGCCATTATATTGAAGTAATGTTTGATTCCTACCAGTAAAGCTTGGTAGTGACAATAAAGAAAATCAAGTTGATTTGGAAGTCGTCTCATATAAAATCACTCGTTTAAATACTTCGAAGAATCTTAATATGAGCATTCATTTCAATGTCTCAGCAGCATCACGCGATAATGCAATGTATAGCTTTAAAATTCTTAACTTACAGATCTCTTGCAATAGTGTCATCAGAAGTACTTCATGTCGTTATCGTCAACTTGGTCTCAAACTATTGTTATTTCGTTTCGTATTTGGAAATATCCCACCCTCTCTTTATTAATATGTCTCATGATTTTATCCGTGAATTTGTTCTAGATATCACTTCATTTTTACCCCTATATTACCTTTATAACTATTGTAACCAAGACATTTTGATCATCCGTTGCTAAATGATTAATTTTACAATGTTTTCTATTTGGACACAATTTTTTATTTTTATTATTCATATTACATAATCTAACATTACAAT]
[-] EMBL CD073274             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         a AAATCCAGATTGGAATCCGTCGCATGCTTTCAGCTGGTATTCGTATAAACTACACAAGCGCCATTATATTGAAGTAATGTTTGATTCCTACCAGTAAAGCTTGGTAGTGACAATAAAGAAAATCAAGTTGATTTGGAAGTCGTCTCATATAAAATCACTCGTTTAAATACTTCGAAGAATCTTAATATGAGCATTCATTTCAATGTCTCAGCAGCATCACGCGATAATGCAATGTATAGCTTTAAAATTCTTAACTTACAGATTTCTTGCAATAGTGTCATCAGAAGTACTTCATGTCGTTATCGTCAACTTGGTCTCAAACTATTGTTATTTCGTTTCGTATTTGGAAATATCCCACCCTCTCTTTATTAATATGTCTCATGATTTTATCCGTGAATTTGTTCTAGATATCACTTCATTTTTACCCCTATATTACCTTTATAACTATTGTAACCAAGACATTTTGATCATCCGTTGCTAAATGATTAATTTTACAATGTTTTCTATTTGGACACAATTTTTTATTTTTATTATTCATATTACATAATCTAACATTACAAT]
[-] EMBL CD077169             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTAATATGTCTCATAATTTTATCCGTGAATTTGTTCTAGATATCACTTCATTTTTACCCCTATATTACCTTTATAACTATTGTAACCAAGACATTTTGATCATCCGTTGCTAAATGATTAATTTAACAATGTTTTATATTTGGACACAATTTTTTATTTTTATTATTCATATTACATAATCTAACATTACAA ]




>consensus_7973#0
GATAAACTGCAAAGTAGTCTAGTCATCTATTAATGTTGTCATCAGATCTTGCTACCACTT
ACGTGAAATCTTCGATAGATAAAGTAACGTTAGATGATAGGCAAGTGTCTCTGGAAGTAA
CTATCCTTAATTTAAGAAGCTTCGTTCTGATAAACAGTGAAGCTTCAGCGAGGTACGTGG
AAGTAACCGTTCCTATTTGATTTTCAAAGGATCCAGCCTAATCTATATTCTGTCTTATTG
TCGCTACTGCTTCCTTTATTTTTTGCTTCAGCCATTTCATATCTTATATATGTTTGTTAA
TTGTAATGCTCTACTGCTTTTATCATGACCAGCAGTCCTATTTTAGATTTTTCTAAAAGT
AAACACTGATCAATATAGTTTATTTTCAAATAACTTGATTGCATGAAAATCATACTCGCT
CTGTCCTTCATTAAATAATACATATCTGAAAAATTTAAATGTGATGCAGTTACTTGGGAA
GCGGTTTTTCTTAAGGTTATGCTGCTATTGTATGCAAGAGTGTACATAATAAAGATTTGG
TTGGGTATCAACTTTAGTTGGCAATTTACTTTTAAGCACACAGCTNTCCTCCAGGGTCTT
TTAAATCCAGATTGGAATCCGTCGCATGCTTTCTGCTGGTATTCGTATAAACTACACAAG
CGCCATTATATTGAAGTAATGTTTGATTCCTACCAGTAAAGCTTGGTAGTGACAATAAAG
AAAATCAAGTTGATTTGGAAGTCGTCTCATATAAAATCACTCGTTTAAATACTTCGAAGA
ATCTTAATATGAGCATTCATTTCAATGTCTCAGCAGCATCACGCGATAATGCAATGTATA
GCTTTAAAATTCTTAACTTACAGATCTCTTGCAATAGTGTCATCAGAAGTACTTCATGTC
GTTATCGTCAACTTGGTCTCAAACTATTGTTATTTCGTTTCGTATTTGGAAATATCCCAC
CCTCTCTTTATTAATATGTCTCATGATTTTATCCGTGAATTTGTTCTAGATATCACTTCA
TTTTTACCCCTATATTACCTTTATAACTATTGTAACCAAGACATTTTGATCATCCGTTGC
TAAATGATTAATTTTACAATGTTTTCTATTTGGACACAATTTTTTATTTTTATTATTCAT
ATTACATAATCTAACATTACAAT

consensusID : consensus_7973#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 593
fasta sequence

                              [GCCTCCACAACCATCTGAAAATAAATAATACTAAATTGAGGCAGTTGTCATCAGATCTTGCTACCACTTACGTGAAATCTTCGATAGATAAAGTAACGTTAGATGATAGGCAAGTGTCTCTGGAAGTAACTATCCTTAATTTAAGAAGCTTCGTTCTGATAAACAGTGAAGCTTCAGCGAGGTACGTGGAAGTAACCGTTCCTATTTGATTTTCAAAGGATCCAGCCTAATCTATATTCTGTCTTATTGTCGCTACTGCTTCCTTTATTTTTTGCTTCAGCCATTTCATATCTTATATATGTTTGTTAATTGTAATGCTCTACTGCTTTTATCATGACCAGCAGTCCTATTTTAGATTTTTCTAAAAGTAAACACTGATCAATATAGTTTATTTTCAAATAACTTGATTGCATAAAAATCATACTCGCTCTGTCCTTCATTAAATAATACATATCTGAAAAATTTAAATGTGATGCAGTTACTTGGGAAGCGGTTTTTCTTAAGGTTATGCTGCTATTGTATGCAAGAGTGTACATAATANAGATTTGGTTGGGTATCAACTTTAGTTGGCAATTTACTTTTAAGCACACAGC]

[+] EMBL CD078814             [GCCTCCACAACCATCTGAAAATAAATAATACTAAATTGAGGCAGTTGTCATCAGATCTTGCTACCACTTACGTGAAATCTTCGATAGATAAAGTAACGTTAGATGATAGGCAAGTGTCTCTGGAAGTAACTATCCTTAATTTAAGAAGCTTCGTTCTGATAAACAGTGAAGCTTCAGCGAGGTACGTGGAAGTAACCGTTCCTATTTGATTTTCAAAGGATCCAGCCTAATCTATATTCTGTCTTATTGTCGCTACTGCTTCCTTTATTTTTTGCTTCAGCCATTTCATATCTTATATATGTTTGTTAATTGTAATGCTCTACTGCTTTTATCATGACCAGCAGTCCTATTTTAGATTTTTCTAAAAGTAAACACTGATCAATATAGTTTATTTTCAAATAACTTGATTGCATAAAAATCATACTCGCTCTGTCCTTCATTAAATAATACATATCTGAAAAATTTAAATGTGATGCAGTTACTTGGGAAGCGGTTTTTCTTAAGGTTATGCTGCTATTGTATGCAAGAGTGTACATAATANAGATTTGGTTGGGTATCAACTTTAGTTGGCAATTTACTTTTAAGCACACAGC]




>consensus_7973#1
GCCTCCACAACCATCTGAAAATAAATAATACTAAATTGAGGCAGTTGTCATCAGATCTTG
CTACCACTTACGTGAAATCTTCGATAGATAAAGTAACGTTAGATGATAGGCAAGTGTCTC
TGGAAGTAACTATCCTTAATTTAAGAAGCTTCGTTCTGATAAACAGTGAAGCTTCAGCGA
GGTACGTGGAAGTAACCGTTCCTATTTGATTTTCAAAGGATCCAGCCTAATCTATATTCT
GTCTTATTGTCGCTACTGCTTCCTTTATTTTTTGCTTCAGCCATTTCATATCTTATATAT
GTTTGTTAATTGTAATGCTCTACTGCTTTTATCATGACCAGCAGTCCTATTTTAGATTTT
TCTAAAAGTAAACACTGATCAATATAGTTTATTTTCAAATAACTTGATTGCATAAAAATC
ATACTCGCTCTGTCCTTCATTAAATAATACATATCTGAAAAATTTAAATGTGATGCAGTT
ACTTGGGAAGCGGTTTTTCTTAAGGTTATGCTGCTATTGTATGCAAGAGTGTACATAATA
NAGATTTGGTTGGGTATCAACTTTAGTTGGCAATTTACTTTTAAGCACACAGC

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_7973#0      --------GATAAACTGCAAAGTAGTC-TAGTCATCTATTAATGTTGTCATCAGATCTTG 51
consensus_7973#1      GCCTCCACAACCATCTGAAAATAAATAATACTAAATTGAGGCAGTTGTCATCAGATCTTG 60
                               *  * *** ***  * *  ** * *  *      *****************

consensus_7973#0      CTACCACTTACGTGAAATCTTCGATAGATAAAGTAACGTTAGATGATAGGCAAGTGTCTC 111
consensus_7973#1      CTACCACTTACGTGAAATCTTCGATAGATAAAGTAACGTTAGATGATAGGCAAGTGTCTC 120
                      ************************************************************

consensus_7973#0      TGGAAGTAACTATCCTTAATTTAAGAAGCTTCGTTCTGATAAACAGTGAAGCTTCAGCGA 171
consensus_7973#1      TGGAAGTAACTATCCTTAATTTAAGAAGCTTCGTTCTGATAAACAGTGAAGCTTCAGCGA 180
                      ************************************************************

consensus_7973#0      GGTACGTGGAAGTAACCGTTCCTATTTGATTTTCAAAGGATCCAGCCTAATCTATATTCT 231
consensus_7973#1      GGTACGTGGAAGTAACCGTTCCTATTTGATTTTCAAAGGATCCAGCCTAATCTATATTCT 240
                      ************************************************************

consensus_7973#0      GTCTTATTGTCGCTACTGCTTCCTTTATTTTTTGCTTCAGCCATTTCATATCTTATATAT 291
consensus_7973#1      GTCTTATTGTCGCTACTGCTTCCTTTATTTTTTGCTTCAGCCATTTCATATCTTATATAT 300
                      ************************************************************

consensus_7973#0      GTTTGTTAATTGTAATGCTCTACTGCTTTTATCATGACCAGCAGTCCTATTTTAGATTTT 351
consensus_7973#1      GTTTGTTAATTGTAATGCTCTACTGCTTTTATCATGACCAGCAGTCCTATTTTAGATTTT 360
                      ************************************************************

consensus_7973#0      TCTAAAAGTAAACACTGATCAATATAGTTTATTTTCAAATAACTTGATTGCATGAAAATC 411
consensus_7973#1      TCTAAAAGTAAACACTGATCAATATAGTTTATTTTCAAATAACTTGATTGCATAAAAATC 420
                      ***************************************************** ******

consensus_7973#0      ATACTCGCTCTGTCCTTCATTAAATAATACATATCTGAAAAATTTAAATGTGATGCAGTT 471
consensus_7973#1      ATACTCGCTCTGTCCTTCATTAAATAATACATATCTGAAAAATTTAAATGTGATGCAGTT 480
                      ************************************************************

consensus_7973#0      ACTTGGGAAGCGGTTTTTCTTAAGGTTATGCTGCTATTGTATGCAAGAGTGTACATAATA 531
consensus_7973#1      ACTTGGGAAGCGGTTTTTCTTAAGGTTATGCTGCTATTGTATGCAAGAGTGTACATAATA 540
                      ************************************************************

consensus_7973#0      AAGATTTGGTTGGGTATCAACTTTAGTTGGCAATTTACTTTTAAGCACACAGCTNTCCTC 591
consensus_7973#1      NAGATTTGGTTGGGTATCAACTTTAGTTGGCAATTTACTTTTAAGCACACAGC------- 593
                       ****************************************************       

consensus_7973#0      CAGGGTCTTTTAAATCCAGATTGGAATCCGTCGCATGCTTTCTGCTGGTATTCGTATAAA 651
consensus_7973#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7973#0      CTACACAAGCGCCATTATATTGAAGTAATGTTTGATTCCTACCAGTAAAGCTTGGTAGTG 711
consensus_7973#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7973#0      ACAATAAAGAAAATCAAGTTGATTTGGAAGTCGTCTCATATAAAATCACTCGTTTAAATA 771
consensus_7973#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7973#0      CTTCGAAGAATCTTAATATGAGCATTCATTTCAATGTCTCAGCAGCATCACGCGATAATG 831
consensus_7973#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7973#0      CAATGTATAGCTTTAAAATTCTTAACTTACAGATCTCTTGCAATAGTGTCATCAGAAGTA 891
consensus_7973#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7973#0      CTTCATGTCGTTATCGTCAACTTGGTCTCAAACTATTGTTATTTCGTTTCGTATTTGGAA 951
consensus_7973#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7973#0      ATATCCCACCCTCTCTTTATTAATATGTCTCATGATTTTATCCGTGAATTTGTTCTAGAT 1011
consensus_7973#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7973#0      ATCACTTCATTTTTACCCCTATATTACCTTTATAACTATTGTAACCAAGACATTTTGATC 1071
consensus_7973#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7973#0      ATCCGTTGCTAAATGATTAATTTTACAATGTTTTCTATTTGGACACAATTTTTTATTTTT 1131
consensus_7973#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7973#0      ATTATTCATATTACATAATCTAACATTACAAT 1163
consensus_7973#1      --------------------------------