These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7980#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1051 fasta sequence [TGGTGCTGGATGAGTTTGGATATCAACAAAGCTCTAAGTCGTAATCGAGAAAGTTTAAGGGTACTAAGAGTAGAACCACTATTTCAACCTTCATGGGGAAATAACGCAGAGTTATGGCCACACAATAGTAATCTGAACATGTTGCCTAAAATAAAAAGGCCAGATGTTAGTGTCTTGGATTTTATTCCTTCACAAGTAATCCAGAAGCCAGGCTGTTTAGATGATTCGTCTGAAAGCAGAAAAAAGTATAAGAAAGCTCTCGGCGGGATATGGTGGATAGCACACCAGACAAACGCTGAAAACACTGATCTGGACAGTAATTACTTTGTTAGGTGGACAGAAATTCAAAACCCAGACTATGATACTAAAAATCGTAGAGGGACTATTTCAGCCTTCCCTCCTGGTGTAAATCTTCTTGAACCTGTGCCTAGCTGGTATAGACATCCTACTTATTTAACACAATCCTTAGATGATAGCCCAACAGACAATCTATGGGATGAATCTAGTGTTGATGTTCAGTTACATATATTTTTGGATCAACTTTTTCACCCTTGTTGCTTGTCTTGGTTCGCGATCGCAAATGCATTCAAATCAATTTGTGAAAGTTATTCACTCCTGGATTGTGATTCAGTGTTCACCGTCAGTAATCTTCATGAAATGCGTGTTTTTATACATCGCACTTTGATGGATAAGCTAATTCCAAATCTCGATCATGCTGGTTTCAAAACAATGTTAAATACATTTTATGCTACGGCTATTGATTATCATGAACATGGTTTACAACCTTTAGGATTGTCACGTTTAAGTACTACAGATACTACTACTAGTAGTGGTAGTAGTACGTCAGGAAAGATGTTTCCCAGTGAAGATGATACTATTATAGTTATTCGTCGATGGGGATTTTCTATTCTACGTCATTTACAAGATGTGGAAATTCTATTATGGAATAATATACCTCCTATAATTGATCGAATACAATCACCTCATCTTGATACAAAAGTAAACACACAAAACGTCGTTGATCTAACTACGGATTGTAGAAAGATTCTGC] [+] EMBL CD113503 [TGGTGCTGGATGAGTTTGGATATCAACAAAGCTCTAAGTCGTAATCGAGAAAGTTTAAGGGTACTAAGAGTAGAACCACTATTTCAACCTTCATGGGGAAATAACGCAGAGTTATGGCCACACAATAGTAATCTGAACATGTTGCCTAAAATAAAAAGACCAGATGTTAGTGTCTTGGATTTTATTCCTTCACAAGTAATCCAGAAGCCAGGCTGTTTAGATGATTCGTCTGAAAGCAGAAAAAAGTATAAGAAAGCTCTCGGCGGGATATGGTGGATAGCACACCAGACAAACGCTGAAAACACTGATCTGGACAGTAATTACTTTGTTAGGTGGACAGAAATTCAAAACCCAGACTATGATACTAAAAATCATAGAGGGACTATTTCAGCCTTCCCTCCTGGTGTAAAT ] [+] EMBL CD113542 [TGGTGCTGGATGAGTTTGGATATCAACAAAGCTCTAAGTCGTAATCGAGAAAGTTTAAGGGTACTAAGAGTAGAACCACTATTTCAACCTTCATGGGGAAATAACGCAGAGTTATGGCCACACAATAGTAATCTGAACATGTTGCCTAAAATAAAAAGGCCAGATGTTAGTGTCTTGGATTTTATTCCTTCACAAGTAATCCAGAAGCCAGGCTGTTTAGATGATTCGTCTGAAAGCAGAAAAAAGTATAAGAAAGCTCTCGGCGGGATATGGTGGATAGCACACCAGACAAACGCTGAAAACACTGATCTGGACAGTAATTACTTTGTTAGGTGGACAGAAATTCAAAACCCAGACTATGATACTAAAAATCGTAGAGGGACTATTTCAGCCTTCCCTCCTGGTGTAAAT ] [-] EMBL CD113622 [ GGTGCTGCATGAGTTTGGACATCAACAAAGCTATAAGTCGTAATCGAGAAAGTTTAAGGGTACTAAGAGTAGAACCACTATTTCAACCTTCATGGGGAAATAACGCAGAGTTATGGCCACACAATAGTAGTCTGAACATGTTGCCTGAAATAAAAAGGCCAGATGTTAGTGTCATGGATTTTATTCCTTCACAAGTAATCCAGAAGCCAGGCTGTTTAGATGATTCGTCTGAAAGCAGAAAAAAGTATAAGAAAGCTCTCGGCGGGATATGGTGGATAGCACACCAGACAAACGCTGAAAACACTGATCTGGACAGTAAGTACTTTGTTAGGTGGACAGAAATTCAAAACCCAGACTATGATAGTAAAAATCGTAGAGGGACTATTTCAGCCTTCCCTCCTGGTGTAAATC ] [+] EMBL CD096806 [ TCAAAACCCAGACTATGATACTAAAAATCGTAGAGGGACTATTTCAGCCTTCCCTCCTGGTGTAAATCTTCTTGAACCTGTGCCTAGCTGGTATAGACATCCTACTTATTTAACACAATCCTTAGATGATAGCCCAACAGACAATCTATGGGATGAATCTAGTGTTGATGTTCAGTTACATATATTTTTGGATCAACTTTTTCACCCTTGTTGCTTGTCTTGGTTCGCGATCGCAAATGCATTCAAATCAATTTGTGAAAGTTATTCACTCCTGGATTGTGATTCAGTGTTCACCGTCAGTAATCTTCATGAAATGCGTGTTTTTATACATCGCACTTTGATGGATAAGCTAATTCCAAATCTTGATCATGCTGGTTTCAAAACAATGTTAAATACATTTTATGCTACGGCTATTGATTATCATGAACATGGTTTACAACCTTTAGGATTGTTACGTTTAAGTACTACAGATACTACTACTAGTAGTGGTAGTAGTACGTCAGGAAAGATGTTTCCCAGTGAAGATGATACTATTATAGTTATTCGTCGATGGGGATTTTCTATTCTACGTC ] [-] EMBL CD096715 [ TGGGATGAATCTAGTGTTGATGTTCAGTTACATATA TTTTGGATCAACTGTTTCACCCTGGTTGCTTGTCTTGGTTCGCGATCGCAAATGCATTCAAATCAATTTGTGAAAGTTATTCACTCCTGGATTGTGATTCAGTGTTCACCGTCAGTAATCTTCATGAAATGCGTGTTTTTATACATCGCACTTTGATGGATAAGCTAATTCCAAATCTCGATCATGCTGGTTTCAAAACAATGTTAAATACATTTTATGCTACGGCTATTGATTATCATGAACATGGTTTACAACCTTTAGGATTGTCACGTTTAAGTACTACAGATACTACTACTAGTAGTGGTAGTAGTACGTCAGGAAAGATGTTTCCCAGTGAAGATGATACTATTATAGTTATTCGTCGATGGGGATTTTCTATTCTACGTCATTTACAAGATGTGGAAATTCTATTATGGAATAATATACCTCCTATAATTGATCGAATACAATCACCTCATCTTGATACAAAAGTAAACACACAAAACGTCGTTGATCTAACTACGGATTGTAGAAAGATTCTGC] [-] EMBL CD096744 [ TCACTCCTGGATTGTGATTCAGTGTTCACCGTCAGTAATCTTCATGAAATGCGTGTTTTTATACATCGCACTTTGATGGATAAGCTAATTCCAAATCTCGATCATGCTGGTTTCAAAACAATGTTAAATACATTTTATGCTGCGGCTATTGATTATCATGAACATGGTTTCCAACCTTTAGGATTGTCACGTTTAAGTACTACAGATACTACTACTAGTAGTGGTAGTAGTACGTCAGGAAAGATGTTTCCCAGTGAAGATGATACTATTATAGTTATTCGTCGATGGGGATTTTTTATTCTACGTCATTTACAAGATGTGGAAATTCTATTATGGAATAATATACCTCCTATAATTGATCGAATACAATCACCTCATCTTGATACAAAAGTAAACACACAAAACGTCGTTGATCTAACTACGGATTGTAGAAAGATTCTGC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||