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Schistosoma mansoni
cluster # 7980 cluster # 7980       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7980#0 length = 1051 sequences # 6  
consensusID : consensus_7980#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1051
fasta sequence 
                              [TGGTGCTGGATGAGTTTGGATATCAACAAAGCTCTAAGTCGTAATCGAGAAAGTTTAAGGGTACTAAGAGTAGAACCACTATTTCAACCTTCATGGGGAAATAACGCAGAGTTATGGCCACACAATAGTAATCTGAACATGTTGCCTAAAATAAAAAGGCCAGATGTTAGTGTCTTGGATTTTATTCCTTCACAAGTAATCCAGAAGCCAGGCTGTTTAGATGATTCGTCTGAAAGCAGAAAAAAGTATAAGAAAGCTCTCGGCGGGATATGGTGGATAGCACACCAGACAAACGCTGAAAACACTGATCTGGACAGTAATTACTTTGTTAGGTGGACAGAAATTCAAAACCCAGACTATGATACTAAAAATCGTAGAGGGACTATTTCAGCCTTCCCTCCTGGTGTAAATCTTCTTGAACCTGTGCCTAGCTGGTATAGACATCCTACTTATTTAACACAATCCTTAGATGATAGCCCAACAGACAATCTATGGGATGAATCTAGTGTTGATGTTCAGTTACATATATTTTTGGATCAACTTTTTCACCCTTGTTGCTTGTCTTGGTTCGCGATCGCAAATGCATTCAAATCAATTTGTGAAAGTTATTCACTCCTGGATTGTGATTCAGTGTTCACCGTCAGTAATCTTCATGAAATGCGTGTTTTTATACATCGCACTTTGATGGATAAGCTAATTCCAAATCTCGATCATGCTGGTTTCAAAACAATGTTAAATACATTTTATGCTACGGCTATTGATTATCATGAACATGGTTTACAACCTTTAGGATTGTCACGTTTAAGTACTACAGATACTACTACTAGTAGTGGTAGTAGTACGTCAGGAAAGATGTTTCCCAGTGAAGATGATACTATTATAGTTATTCGTCGATGGGGATTTTCTATTCTACGTCATTTACAAGATGTGGAAATTCTATTATGGAATAATATACCTCCTATAATTGATCGAATACAATCACCTCATCTTGATACAAAAGTAAACACACAAAACGTCGTTGATCTAACTACGGATTGTAGAAAGATTCTGC]

[+] EMBL CD113503             [TGGTGCTGGATGAGTTTGGATATCAACAAAGCTCTAAGTCGTAATCGAGAAAGTTTAAGGGTACTAAGAGTAGAACCACTATTTCAACCTTCATGGGGAAATAACGCAGAGTTATGGCCACACAATAGTAATCTGAACATGTTGCCTAAAATAAAAAGACCAGATGTTAGTGTCTTGGATTTTATTCCTTCACAAGTAATCCAGAAGCCAGGCTGTTTAGATGATTCGTCTGAAAGCAGAAAAAAGTATAAGAAAGCTCTCGGCGGGATATGGTGGATAGCACACCAGACAAACGCTGAAAACACTGATCTGGACAGTAATTACTTTGTTAGGTGGACAGAAATTCAAAACCCAGACTATGATACTAAAAATCATAGAGGGACTATTTCAGCCTTCCCTCCTGGTGTAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD113542             [TGGTGCTGGATGAGTTTGGATATCAACAAAGCTCTAAGTCGTAATCGAGAAAGTTTAAGGGTACTAAGAGTAGAACCACTATTTCAACCTTCATGGGGAAATAACGCAGAGTTATGGCCACACAATAGTAATCTGAACATGTTGCCTAAAATAAAAAGGCCAGATGTTAGTGTCTTGGATTTTATTCCTTCACAAGTAATCCAGAAGCCAGGCTGTTTAGATGATTCGTCTGAAAGCAGAAAAAAGTATAAGAAAGCTCTCGGCGGGATATGGTGGATAGCACACCAGACAAACGCTGAAAACACTGATCTGGACAGTAATTACTTTGTTAGGTGGACAGAAATTCAAAACCCAGACTATGATACTAAAAATCGTAGAGGGACTATTTCAGCCTTCCCTCCTGGTGTAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD113622             [ GGTGCTGCATGAGTTTGGACATCAACAAAGCTATAAGTCGTAATCGAGAAAGTTTAAGGGTACTAAGAGTAGAACCACTATTTCAACCTTCATGGGGAAATAACGCAGAGTTATGGCCACACAATAGTAGTCTGAACATGTTGCCTGAAATAAAAAGGCCAGATGTTAGTGTCATGGATTTTATTCCTTCACAAGTAATCCAGAAGCCAGGCTGTTTAGATGATTCGTCTGAAAGCAGAAAAAAGTATAAGAAAGCTCTCGGCGGGATATGGTGGATAGCACACCAGACAAACGCTGAAAACACTGATCTGGACAGTAAGTACTTTGTTAGGTGGACAGAAATTCAAAACCCAGACTATGATAGTAAAAATCGTAGAGGGACTATTTCAGCCTTCCCTCCTGGTGTAAATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD096806             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCAAAACCCAGACTATGATACTAAAAATCGTAGAGGGACTATTTCAGCCTTCCCTCCTGGTGTAAATCTTCTTGAACCTGTGCCTAGCTGGTATAGACATCCTACTTATTTAACACAATCCTTAGATGATAGCCCAACAGACAATCTATGGGATGAATCTAGTGTTGATGTTCAGTTACATATATTTTTGGATCAACTTTTTCACCCTTGTTGCTTGTCTTGGTTCGCGATCGCAAATGCATTCAAATCAATTTGTGAAAGTTATTCACTCCTGGATTGTGATTCAGTGTTCACCGTCAGTAATCTTCATGAAATGCGTGTTTTTATACATCGCACTTTGATGGATAAGCTAATTCCAAATCTTGATCATGCTGGTTTCAAAACAATGTTAAATACATTTTATGCTACGGCTATTGATTATCATGAACATGGTTTACAACCTTTAGGATTGTTACGTTTAAGTACTACAGATACTACTACTAGTAGTGGTAGTAGTACGTCAGGAAAGATGTTTCCCAGTGAAGATGATACTATTATAGTTATTCGTCGATGGGGATTTTCTATTCTACGTC                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD096715             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGGGATGAATCTAGTGTTGATGTTCAGTTACATATA TTTTGGATCAACTGTTTCACCCTGGTTGCTTGTCTTGGTTCGCGATCGCAAATGCATTCAAATCAATTTGTGAAAGTTATTCACTCCTGGATTGTGATTCAGTGTTCACCGTCAGTAATCTTCATGAAATGCGTGTTTTTATACATCGCACTTTGATGGATAAGCTAATTCCAAATCTCGATCATGCTGGTTTCAAAACAATGTTAAATACATTTTATGCTACGGCTATTGATTATCATGAACATGGTTTACAACCTTTAGGATTGTCACGTTTAAGTACTACAGATACTACTACTAGTAGTGGTAGTAGTACGTCAGGAAAGATGTTTCCCAGTGAAGATGATACTATTATAGTTATTCGTCGATGGGGATTTTCTATTCTACGTCATTTACAAGATGTGGAAATTCTATTATGGAATAATATACCTCCTATAATTGATCGAATACAATCACCTCATCTTGATACAAAAGTAAACACACAAAACGTCGTTGATCTAACTACGGATTGTAGAAAGATTCTGC]
[-] EMBL CD096744             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TCACTCCTGGATTGTGATTCAGTGTTCACCGTCAGTAATCTTCATGAAATGCGTGTTTTTATACATCGCACTTTGATGGATAAGCTAATTCCAAATCTCGATCATGCTGGTTTCAAAACAATGTTAAATACATTTTATGCTGCGGCTATTGATTATCATGAACATGGTTTCCAACCTTTAGGATTGTCACGTTTAAGTACTACAGATACTACTACTAGTAGTGGTAGTAGTACGTCAGGAAAGATGTTTCCCAGTGAAGATGATACTATTATAGTTATTCGTCGATGGGGATTTTTTATTCTACGTCATTTACAAGATGTGGAAATTCTATTATGGAATAATATACCTCCTATAATTGATCGAATACAATCACCTCATCTTGATACAAAAGTAAACACACAAAACGTCGTTGATCTAACTACGGATTGTAGAAAGATTCTGC]




>consensus_7980#0
TGGTGCTGGATGAGTTTGGATATCAACAAAGCTCTAAGTCGTAATCGAGAAAGTTTAAGG
GTACTAAGAGTAGAACCACTATTTCAACCTTCATGGGGAAATAACGCAGAGTTATGGCCA
CACAATAGTAATCTGAACATGTTGCCTAAAATAAAAAGGCCAGATGTTAGTGTCTTGGAT
TTTATTCCTTCACAAGTAATCCAGAAGCCAGGCTGTTTAGATGATTCGTCTGAAAGCAGA
AAAAAGTATAAGAAAGCTCTCGGCGGGATATGGTGGATAGCACACCAGACAAACGCTGAA
AACACTGATCTGGACAGTAATTACTTTGTTAGGTGGACAGAAATTCAAAACCCAGACTAT
GATACTAAAAATCGTAGAGGGACTATTTCAGCCTTCCCTCCTGGTGTAAATCTTCTTGAA
CCTGTGCCTAGCTGGTATAGACATCCTACTTATTTAACACAATCCTTAGATGATAGCCCA
ACAGACAATCTATGGGATGAATCTAGTGTTGATGTTCAGTTACATATATTTTTGGATCAA
CTTTTTCACCCTTGTTGCTTGTCTTGGTTCGCGATCGCAAATGCATTCAAATCAATTTGT
GAAAGTTATTCACTCCTGGATTGTGATTCAGTGTTCACCGTCAGTAATCTTCATGAAATG
CGTGTTTTTATACATCGCACTTTGATGGATAAGCTAATTCCAAATCTCGATCATGCTGGT
TTCAAAACAATGTTAAATACATTTTATGCTACGGCTATTGATTATCATGAACATGGTTTA
CAACCTTTAGGATTGTCACGTTTAAGTACTACAGATACTACTACTAGTAGTGGTAGTAGT
ACGTCAGGAAAGATGTTTCCCAGTGAAGATGATACTATTATAGTTATTCGTCGATGGGGA
TTTTCTATTCTACGTCATTTACAAGATGTGGAAATTCTATTATGGAATAATATACCTCCT
ATAATTGATCGAATACAATCACCTCATCTTGATACAAAAGTAAACACACAAAACGTCGTT
GATCTAACTACGGATTGTAGAAAGATTCTGC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)