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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7981#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 800 fasta sequence
[ATCACAACCAGCTGTTGGAAAATTAGCGTTTATGCGTCATCCTCGAGCTGTACTACAATCTGCTGGGTCACCTGTAAAACCGGCAACAGTTCTGGAAGCTAAATTACCAGATGAACTTACTGATTACAGGANCTGGTGGTATATTAAAAACAACTGATATTGATGATATGCCATCTTATATTCCAGAATATAATCAAAATGGTGATCAATACACCACATACAATGAATCGTTACCGCAAACATGGTCAAAACTAGTCGATCATTACGATGAGCCATTAGCTAAATCTGAGCTTGATTTACGACAAGTTGCTTATCATTTAAAATCGGATTGGAGAATATTAGCTCAATGTTTAGGCTTGTCTGATGAGGATCAGTATAATATTACTNCTCTTTGCCTAATCGTCCTGAAGAAGAATATGCATATACTAGTTTATTGTTGTGGCAAGAACGTAATGGGAATGAGTTAACTTCAGGTACACAA-CTTGCTGAAGCATTACAAGCTATCGGTCGTAAAGATATATTGGAATATTGTATGACTAACATTTC-GCCTGTAATAACAGCTGATGAACGGGTTACTGCTTTACGTTCATTGAATGCCGTTTCGCCCAATTTAAATGTTAATCGTGAAAGTCGATCCCATTCAAAAGATGGCGGTGGTGGTTTAAGTGAATCAGTTGATACAGGTTATGGCACACAGACCGGATCTACTACACTAATACCAACAACACCAGTGATTACCAAAACAATGTCGTCACAATTTATACACTACCCACTTTAAGCATGTAGATAATTCTAACCAT]
[+] EMBL CD130559 [ATCACAACCAGCTGTTGGAAAATTAGCGTTTATGCGTCATCCTCGAGCTGTACTACAATCTGCTGGGTCACCTGTAAAACCGGCAACAGTTCTGGAAGCTAAATTACCAGATGAACTTACTGATTACAGGANCTGGTGGTATATTAAAAACAACTGATATTGATGATATGCCATCTTATATTCCAGAATATAATCAAAATGGTGATCAATACACCACATACAATGAATCGTTACCGCAAACATGGTCAAAACTAGTCGATCATTACGATGAGCCATTAGCTAAATCTGAGCTTGATTTACGACAAGTTGCTTATCATTTAAAATCGGATTGGAGAATATTAGCTCAATGTTTAGGCTTGTCTGATGAGGATCAGTATAATATTACTNCTCTTTGCCT ]
[+] EMBL CD117878 [ AACCAGTCGATCATTACGATGAGCCATTAGCTAAATCTGAGCTTGATTTACGACAAGTTGCTTATCATTTAAAATCGGATTGGAGAATATTAGCTCAATGTTTAGGCTTGTCTGATGAGGATCAGTATAATATTACT TCTTTGCCTAATCGTCCTGAAGAAGAATATGCATATACTAGTTTATTGTTGTGGCAAGAACGTAATGGGAATGAGTTAACTTCAGGTACACAA CTTGCTGAAGCATTACAAGCTATCGGTCGTAAAGATATATTGGAATATTGTATGACTAACATTTC GCCTGTAATAACAGCTGATGAACGGGTTACTGCTTTACGTTCATTGAATGCCGTTTCGCCCAATTTAAATGTTAATCGTGAAAGTCGATCCCATTCAAAAGATGGCGGTGGTGGTTTAAGTGAATCAGTTGATACAGGTTATGGCACACAAACCGGATCTACTACACTAATACCAACAACACCAGTGGTTACCAAAACAATGTCGTCACAATTTATACACTACCCACTTTAAGCATGTAGATAATTCTAACCAT]
[+] EMBL CD191943 [ GGCAAGAACGTAATGGGAATGAGTTAACTTCAGGTACACAA CTTGCTGAAGCATTACAAGCTATCGGTCGTAAAGATATATTGGAATATTGTATGACTAACATTTC GCCTGTAATAACAGCTGATGAACGGGTTACTGCTTTACGTTCATTGAATGCCGTTTCGCCCAATTTAAATGTTAATCGTGAAAGTCGATCCCATTCAAAAGATGGCGGTGGTGGTTTAAGTGAATCAGTTGATACAGGTTATGGCACACAGACCGGATCTACTACACTAATACCAACAACACCAGTGA ]
[+] EMBL CD192086 [ GGCAAGAACGTAATGGGAATGAGTTAACTTCAGGTACACAA CTTGCTGAAGCATTACAAGCTATCGGTCGTAAAGATATATTGGAATATTGTATGACTAACATTTC GCCTGTAATAACAGCTGATGAACGGGTTACTGCTTTACGTTCATTGAATGCCGTTTCGCCCAATTTAAATGTTAATCGTGAAAGTCGATCCCATTCAAAAGATGGCGGTGGTGGTTTAAGTGAATCAGTTGATACAGGTTATGGCACACAGACCGGATCTACTACACTAATACCAACAACACCAGTGA ]
[+] EMBL CD192154 [ GGCAAGAACGTAATGGGAATGAGTTAACTTCAGGTACACAA CTTGCTGAAGCATTACAAGCTATCGGTCGTAAAGATATATTGGAATATTGTATGACTAACATTTC GCCTGTAATAACAGCTGATGAACGGGTTACTGCTTTACGTTCATTGAATGCCGTTTCGCCCAATTTAAATGTTAATCGTGAAAGTCGATCCCATTCAAAAGATGGCGGTGGTGGTTTAAGTGAATCAGTTGATACAGGTTATGGCACACAGACCGGATCTACTACACTAATACCAACAACACCAGTGA ]
[+] EMBL CD192143 [ GGCAAGAACGTAATGGGAATGAGTTAACTTCATGTACACAATCTTGCTGAAGCATTACAAGCTATCGGTCGTAAAGATATATCGGAATATTGTATGACTAACATTTCTACCTGTAATAACAGCTGATGAACGGGTTACTGCTTTACGTTCATTGAATGCCGTTTCTCCCAATTTAAATGTTAATCGTGAAAGTCGATCCCATTCAAAA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||