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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7986#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 669 fasta sequence
[TAGAATAGCATTCCTATATTGTTTGAAACATTTATTTGTTGCACTTGGTAATTCTCTCACAAACGTTATCTTTCTACCTTCTTAATAATATTTAGATTTAACTACTGATGGGGCAGTTTATGTCGGATAACTGAGTGGTAAATTTTGTCAAGGTAATAATGTGTCTTCAAGTTTATGATCAACTTGGGACCGTTATTTATCCGATCAATTTCGGTTTAGACTGGGCGATAGCGAGTATCTAAACTAAGCACCTCAGTTACTCCTCATTTTAAGCTGATTTAGTTTGAACACCACACTTCAGACCAATACAATCACCTCAAACTATTGAATGCCTCATCCGAAACTTATCCAAA-GACCCCAAATTTGTACATACGTACCTTACAACTACCTTTTTGTAAGCTCAGGCAAAAAGAAATCCAAATCCAGGGCACAGATCTTTCGCAACAACTTCGAAACGTGTTGTTATTAAAAACACAACAAGGTCACCTGCCTACAAACTTTATTCAAATGGAAGAAAACGCCGCAGCACACTTAGATCTTGGCCGATACTGATGATACATACTGAGTGATTGCCAGTTAGATGTTATCAGTTCAGGAATAGATATCTGAATAATGTTGATTCTTTTCAGTGCATATTGCCAGCTGTCATGATGTCTCTGATGGTGGTAC]
[+] EMBL CD085117 [TAGAATAGCATTCCTATATTGTTTGAAACATTTATTTGTTGCACTTGGTAATTCTCTCACAAACGTTATCTTTCTACCTTCTTAATAATATTTAGATTTAACTACTGATGGGGCAGTTTATGTCGGATAACTGAGTGGTAAATTTTGTCAAGGTAATAATGTGTCTTCAAGTTTATGATCAACTTGGGACCGTTATTTATCCGATCAATTTCGGTTTAGACTGGGCGATAGCGAGTATCTAAACTAAGCACCTCAGTTACTCCTCATTTTAAGCTGATTTAGTTTGAACACCACACTTCAGACCAATACAATCACCTCAAACTATTGAATGCCTCATCCGAAACTTATCCAAA GACCCCAAATTTGTACATACGTACCTTACAACTACCTTTTTGTAAGCTCAGGCAAAAAGAAATCCAAATCCAGGGCACAGATCTTTCGCAACAACTTCGAAACGTGTTGTTATTAAAAACACAACAAGGTCACCTGCCTACAAACTTTATTCAAATGGAAGAAAACGCCGCAGCACACTTAGATCTTGGCCGATACTGATGATACATACTGAGTGATTGCCAGTTAGATGNTATCAGTTCAGGAATAGATATCTGAATAATGGTGATTCTTTTCAGTGCATANTGCCAGCTGTCATGATGTCTCTGATGGTGGTA ]
[+] EMBL CD085349 [TAGAATAGCATTCCTATATTGTTTGAAACATTTATTTGTTGCACTTGGTAATTCTCTCACAAACGTTATCTTTCTACCTTCTTAATAATATTTAGATTTAACTACTGATGGGGCAGTTTATGTCGGATAACTGAGTGGTAAATTTTGTCAAGGTAATAATGTGTCTTCAAGTTTATGATCAACTTGGGACCGTTATTTATCCGATCAATTTCGGTTTAGACTGGGCGATAGCGAGTATCTAAACTAAGCACCTCAGTTACTCCTCATTTTAAGCTGATTTAGTTTGAACACCACACTTCAGACCAATACAATCACCTCAAACTATTGAATGCCTCATCCGAAACTTATCCAAA GACCCCAAATTTGTACATACGTACCTTACAACTACCTTTTTGTAAGCTCAGGCAAAAAGAAATCCAAATCCAGGGCACAGATCTTTCGCAACAACTTCGAAACGTGTTGTTATTAAAAACACAACAAGGTCACCTGCCTACAAACTTTATTCAAATGGAAGAAAACGCCGCAGCACACTTAGATCTTGGCCGATACTGATGATACATACTGAGTGATTGCCAGATAGATGnt ]
[+] EMBL CD085086 [TAGAATAGCATTCCTATATTGTTTGAAACATTTATTTGTTGCACTTGGTAATTCTCTCACAAACGTTATCTTTCTACCTTCTTAATAATATTTAGATTTAACTACTGATGGGGCAGTTTATGTCGGATAACTGAGTGGTAAATTTTGTCAAGGTAATAATGTGTCTTCAAGTTTATGATCAACTTGGGACCGTTATTTATCCGATCAATTTCGGTTTAGACTGGGCGATAGCGAGTATCTAAACTAAGCACCTCAGTTACTCCTCATTNTAAGCTGANTTAGTTTGAACACCACACTTCAGACCAATACAATCACCTCANACTATTGAATGCCTCATCCGAAACTTATCCAAANGACCC AATTTGTACATACGTAC ]
[-] EMBL CD085098 [ TCTTTATAATATTTAGATTTAACTACTGATGGGGCAGTNTATGTCGNATAACTGAGTGGTAAATTNTGTCAAGGTAATAATGTGTCTTCAAGTTTATGATCAACTTGGGACCGTTATTTATCCGATCAATTTCGGTTTAGACTGGGCGATAGCGAGTATCTAAACTAAGCACCTCAGTTACTCCTCATTTTAAGCTGATTTAGTTTGAACACCACACTTCAGACCAATACAATCACCTCAAACTATTGAATGCCTCATCCGAAACTTATCCAAA GACCCCAAATTTGTACATACGTACCTTACAACTACCTTTTTGTAAGCTCAGGCAAAAAGAAATCCAAATCCAGGGCACAGATCTTTCGCAACAACTTCGAAACGTGTTGTTATTAAAAACACAACAAGGTCACCTGCCTACAAACTTTATTCAAATGGAAGAAAACGCCGCAGCACACTTAGATCTTGGCCGATACTGATGATACATACTGAGTGATTGCCAGTTAGATGTTATCAGTTCAGGAATAGATATCTGAATAATGTTGATTCTTTTCAGTGCATATTGCCAGCTGTCATGATGTCTCTGATGGTGGTAC]
[-] EMBL CD085169 [ AGTNTATGTCGGATANCTGAGTGGT AATTTTGTCAAGGTAATAATGTGTCTTCAAGTTTATGATCAACTGGGGACCGTTATTTATCCGATCAATTTCGGTTTAGACTGGGCGATAGCGAGTATCTAAACTAAGCACCTCAGTTACTCCTCATTTTAAGCTGATTTAGTTTGAACACCACACTTCAGACCAATACAATCACCTCAAACTATTGAATGCCTCATCCGAAACTTATCCAAA GACCCCAAATTTGTACATACGTACCTTACAACTACCTTTTTGTAAGCTCAGGCAAAAAGAAATCCAAATCCAGGGCACAGATCTTTCGCAACAACTTCGAAACGTGTTGTTATTAAAAACACAACAAGGTCACCTGCCTACAAACTTTATTCAAATGGAAGAAAACGCCGCAGCACACTTAGATCTTGGCCGATACTGATGATACATACTGAGTGATTGCCAGTTAGATGTTATCAGTTCAGGAATAGATATCTGAATAATGTTGATTCTTTTCAGTGCATATTGCCAGCTGTCATGATGTCTCTGATGGTGGTAC]
[-] EMBL CD085172 [ AATACAATCACCTCAAACTATTGAATGCCTCATCCGAAACTTATCCAAA GACCCCAAATTTGTACATACGTACCTTACAACTACCTTTTTGTAAGCTCAGGCAAAAAGAAATCCAAATCCAGGGCACAGATCTTTCGCAACAACTTCGAAACGTGTTGTTATTAAAAACACAACAAGGTCACCTGCCTACAAACTTTATTCAAATGGAAGAAAACGCCGCAGCACACTTAGATCTTGGCCGATACTGATGATACATACTGAGTGATTGCCAGTTAGATGTTATCAGTTCAGGAATAGATATCTGAATAATGTTGATTCTTTTCAGTGCATATTGCCAGCTGTCATGATGTCTCTGATGGTGGTAC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||