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Schistosoma mansoni
cluster # 7986 cluster # 7986       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7986#0 length = 669 sequences # 6  

consensusID : consensus_7986#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 669
fasta sequence
                              [TAGAATAGCATTCCTATATTGTTTGAAACATTTATTTGTTGCACTTGGTAATTCTCTCACAAACGTTATCTTTCTACCTTCTTAATAATATTTAGATTTAACTACTGATGGGGCAGTTTATGTCGGATAACTGAGTGGTAAATTTTGTCAAGGTAATAATGTGTCTTCAAGTTTATGATCAACTTGGGACCGTTATTTATCCGATCAATTTCGGTTTAGACTGGGCGATAGCGAGTATCTAAACTAAGCACCTCAGTTACTCCTCATTTTAAGCTGATTTAGTTTGAACACCACACTTCAGACCAATACAATCACCTCAAACTATTGAATGCCTCATCCGAAACTTATCCAAA-GACCCCAAATTTGTACATACGTACCTTACAACTACCTTTTTGTAAGCTCAGGCAAAAAGAAATCCAAATCCAGGGCACAGATCTTTCGCAACAACTTCGAAACGTGTTGTTATTAAAAACACAACAAGGTCACCTGCCTACAAACTTTATTCAAATGGAAGAAAACGCCGCAGCACACTTAGATCTTGGCCGATACTGATGATACATACTGAGTGATTGCCAGTTAGATGTTATCAGTTCAGGAATAGATATCTGAATAATGTTGATTCTTTTCAGTGCATATTGCCAGCTGTCATGATGTCTCTGATGGTGGTAC]

[+] EMBL CD085117             [TAGAATAGCATTCCTATATTGTTTGAAACATTTATTTGTTGCACTTGGTAATTCTCTCACAAACGTTATCTTTCTACCTTCTTAATAATATTTAGATTTAACTACTGATGGGGCAGTTTATGTCGGATAACTGAGTGGTAAATTTTGTCAAGGTAATAATGTGTCTTCAAGTTTATGATCAACTTGGGACCGTTATTTATCCGATCAATTTCGGTTTAGACTGGGCGATAGCGAGTATCTAAACTAAGCACCTCAGTTACTCCTCATTTTAAGCTGATTTAGTTTGAACACCACACTTCAGACCAATACAATCACCTCAAACTATTGAATGCCTCATCCGAAACTTATCCAAA GACCCCAAATTTGTACATACGTACCTTACAACTACCTTTTTGTAAGCTCAGGCAAAAAGAAATCCAAATCCAGGGCACAGATCTTTCGCAACAACTTCGAAACGTGTTGTTATTAAAAACACAACAAGGTCACCTGCCTACAAACTTTATTCAAATGGAAGAAAACGCCGCAGCACACTTAGATCTTGGCCGATACTGATGATACATACTGAGTGATTGCCAGTTAGATGNTATCAGTTCAGGAATAGATATCTGAATAATGGTGATTCTTTTCAGTGCATANTGCCAGCTGTCATGATGTCTCTGATGGTGGTA ]
[+] EMBL CD085349             [TAGAATAGCATTCCTATATTGTTTGAAACATTTATTTGTTGCACTTGGTAATTCTCTCACAAACGTTATCTTTCTACCTTCTTAATAATATTTAGATTTAACTACTGATGGGGCAGTTTATGTCGGATAACTGAGTGGTAAATTTTGTCAAGGTAATAATGTGTCTTCAAGTTTATGATCAACTTGGGACCGTTATTTATCCGATCAATTTCGGTTTAGACTGGGCGATAGCGAGTATCTAAACTAAGCACCTCAGTTACTCCTCATTTTAAGCTGATTTAGTTTGAACACCACACTTCAGACCAATACAATCACCTCAAACTATTGAATGCCTCATCCGAAACTTATCCAAA GACCCCAAATTTGTACATACGTACCTTACAACTACCTTTTTGTAAGCTCAGGCAAAAAGAAATCCAAATCCAGGGCACAGATCTTTCGCAACAACTTCGAAACGTGTTGTTATTAAAAACACAACAAGGTCACCTGCCTACAAACTTTATTCAAATGGAAGAAAACGCCGCAGCACACTTAGATCTTGGCCGATACTGATGATACATACTGAGTGATTGCCAGATAGATGnt                                                                                    ]
[+] EMBL CD085086             [TAGAATAGCATTCCTATATTGTTTGAAACATTTATTTGTTGCACTTGGTAATTCTCTCACAAACGTTATCTTTCTACCTTCTTAATAATATTTAGATTTAACTACTGATGGGGCAGTTTATGTCGGATAACTGAGTGGTAAATTTTGTCAAGGTAATAATGTGTCTTCAAGTTTATGATCAACTTGGGACCGTTATTTATCCGATCAATTTCGGTTTAGACTGGGCGATAGCGAGTATCTAAACTAAGCACCTCAGTTACTCCTCATTNTAAGCTGANTTAGTTTGAACACCACACTTCAGACCAATACAATCACCTCANACTATTGAATGCCTCATCCGAAACTTATCCAAANGACCC  AATTTGTACATACGTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD085098             [                                                                               TCTTTATAATATTTAGATTTAACTACTGATGGGGCAGTNTATGTCGNATAACTGAGTGGTAAATTNTGTCAAGGTAATAATGTGTCTTCAAGTTTATGATCAACTTGGGACCGTTATTTATCCGATCAATTTCGGTTTAGACTGGGCGATAGCGAGTATCTAAACTAAGCACCTCAGTTACTCCTCATTTTAAGCTGATTTAGTTTGAACACCACACTTCAGACCAATACAATCACCTCAAACTATTGAATGCCTCATCCGAAACTTATCCAAA GACCCCAAATTTGTACATACGTACCTTACAACTACCTTTTTGTAAGCTCAGGCAAAAAGAAATCCAAATCCAGGGCACAGATCTTTCGCAACAACTTCGAAACGTGTTGTTATTAAAAACACAACAAGGTCACCTGCCTACAAACTTTATTCAAATGGAAGAAAACGCCGCAGCACACTTAGATCTTGGCCGATACTGATGATACATACTGAGTGATTGCCAGTTAGATGTTATCAGTTCAGGAATAGATATCTGAATAATGTTGATTCTTTTCAGTGCATATTGCCAGCTGTCATGATGTCTCTGATGGTGGTAC]
[-] EMBL CD085169             [                                                                                                                  AGTNTATGTCGGATANCTGAGTGGT AATTTTGTCAAGGTAATAATGTGTCTTCAAGTTTATGATCAACTGGGGACCGTTATTTATCCGATCAATTTCGGTTTAGACTGGGCGATAGCGAGTATCTAAACTAAGCACCTCAGTTACTCCTCATTTTAAGCTGATTTAGTTTGAACACCACACTTCAGACCAATACAATCACCTCAAACTATTGAATGCCTCATCCGAAACTTATCCAAA GACCCCAAATTTGTACATACGTACCTTACAACTACCTTTTTGTAAGCTCAGGCAAAAAGAAATCCAAATCCAGGGCACAGATCTTTCGCAACAACTTCGAAACGTGTTGTTATTAAAAACACAACAAGGTCACCTGCCTACAAACTTTATTCAAATGGAAGAAAACGCCGCAGCACACTTAGATCTTGGCCGATACTGATGATACATACTGAGTGATTGCCAGTTAGATGTTATCAGTTCAGGAATAGATATCTGAATAATGTTGATTCTTTTCAGTGCATATTGCCAGCTGTCATGATGTCTCTGATGGTGGTAC]
[-] EMBL CD085172             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AATACAATCACCTCAAACTATTGAATGCCTCATCCGAAACTTATCCAAA GACCCCAAATTTGTACATACGTACCTTACAACTACCTTTTTGTAAGCTCAGGCAAAAAGAAATCCAAATCCAGGGCACAGATCTTTCGCAACAACTTCGAAACGTGTTGTTATTAAAAACACAACAAGGTCACCTGCCTACAAACTTTATTCAAATGGAAGAAAACGCCGCAGCACACTTAGATCTTGGCCGATACTGATGATACATACTGAGTGATTGCCAGTTAGATGTTATCAGTTCAGGAATAGATATCTGAATAATGTTGATTCTTTTCAGTGCATATTGCCAGCTGTCATGATGTCTCTGATGGTGGTAC]


>consensus_7986#0 TAGAATAGCATTCCTATATTGTTTGAAACATTTATTTGTTGCACTTGGTAATTCTCTCAC AAACGTTATCTTTCTACCTTCTTAATAATATTTAGATTTAACTACTGATGGGGCAGTTTA TGTCGGATAACTGAGTGGTAAATTTTGTCAAGGTAATAATGTGTCTTCAAGTTTATGATC AACTTGGGACCGTTATTTATCCGATCAATTTCGGTTTAGACTGGGCGATAGCGAGTATCT AAACTAAGCACCTCAGTTACTCCTCATTTTAAGCTGATTTAGTTTGAACACCACACTTCA GACCAATACAATCACCTCAAACTATTGAATGCCTCATCCGAAACTTATCCAAAGACCCCA AATTTGTACATACGTACCTTACAACTACCTTTTTGTAAGCTCAGGCAAAAAGAAATCCAA ATCCAGGGCACAGATCTTTCGCAACAACTTCGAAACGTGTTGTTATTAAAAACACAACAA GGTCACCTGCCTACAAACTTTATTCAAATGGAAGAAAACGCCGCAGCACACTTAGATCTT GGCCGATACTGATGATACATACTGAGTGATTGCCAGTTAGATGTTATCAGTTCAGGAATA GATATCTGAATAATGTTGATTCTTTTCAGTGCATATTGCCAGCTGTCATGATGTCTCTGA TGGTGGTAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)