These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7993#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 601 fasta sequence [ACTGAAAGTTTCCAGCAGATAAACAACCCATAATATTGGTTAAATAATGGTCTAAGAATGAAAACAGGATTAAGATTTCAGTATCACTCCCTACCACCTTTTGACGGATTATTTCTTTTGAAATTTAAAACAATTTGTTTTGTTTCTACAAATCTGTTTGATTTCTGACCTGAATTCTTTCCCCTTTCAATAAAAGTGAAAAATATGAGTTATTGAGATTGCTGTGTATAAAACAGGTTAAGATTAAATATAAACATTTTGTGTAAGATTTATAACACATTTCGTTAATTGAAGTATGATTCACTGTCTCAGATGGCAAGATAAAATATTACATACCTTCTGAAATGAAGTAGTACACACTGAATTTACGATTGTATGCAAAAATATGTAAACATATGTTTGTAAATATTGCAAAACAATAAGGTTTAGGGAATTCTTAA-TCAAAATATGAGATGAGTATTAACTGTATTATCATTTATCTTATTCAATGTTGTCTCCATTTACTCAAACTACTATCCATACTTCGGTGATCGGACGAAAACTGGTGTTTTCAGTTTGATATGGTAGCCGAC-AGGAATCAGTATGATCA-CCAGACAAATCA] [+] EMBL CD088800 [ACTGAAAGTTTCCAGCAGATAAACAACCCATAATATTGGTTAAATAATGGTCTAAGAATGAAAACAGGATTAAGATTTCAGTATCACTCCCTACCACCTTTTGACGGATTATTTCTTTTGAACTTTAAAACAATTTGTTTTGTTTCTACAAATCTGTTTGATTTCTGACCTGAATTCTTTCCCCTTTCAATAAAAGTGAAAAATATGAGTTATTGAGATTGCTGTGTATAAAACAGGTTAAGATTAAATATAAACATTTTGTGTAAGATTTATAACACATTTCGTTAATTGAAGTATGATTCACTGTCTCAGATGGCAAGATAAAATATTACATACCTTCTGAAATGAAGTAGTACACACTGAATTTACGATTGTATGCAAAAATATGTAAACATATGTTTGTAAATATTGCAAAACAATAAGGTTTAGGGAATTCTTAA TCAAAATATGAGATGAGTATTAACTGTATTATCATTTATCTTATTCAATGTTGTCTCCATTTACTCAAACTACTATCCATACTTCGGTGATCGGACG AAACTGGTGTTTTCAGTTTGATATGGTAGCCGACAAGGAATCAGTATGATCA CCAGACAAATCA] [+] EMBL CD088836 [ACTGAAAGTTTCCAGCAGATAAACAACCCATAATATTGGTTAAATAATGGTCTAAGAATGAAAACAGGATTAAGATTTCAGTATCACTCCCTACCACCTTTTGACGGATTATTTCTTTTGAAATTTAAAACAATTTGTTTTGTTTCTACAAATCTGTTTGATTTCTGACCTGAATTCTTTCCCCTTTCAATAAAAGTGAAAAATATGAGTTATTGAGATTGCTGTGTATAAAACAGGTTAAGATTAAATATAAACATTTTGTGTAAGATTTATAACACATTTCGTTAATTGAAGTATGATTCACTGTCTCAGATGGCAAGATAAAATATTACATACCTTCTGAAATGAAGTAGTACACACTGAATTTACGATTGTATGCAAAAATATGTAAACATATGTTTGTAAATATTGCAAAACAATAAGGTTTAGGGAATTCTTAA TCAAAATATGAGATGAGTATTAACTGTATTATCATTTATCTTATTCAATGTTGTCTCCATTTACTCAAACTACTATCCATACTTCGGTGATCGGACGAAAACTGGTGTTTTCAGTTTGATATGGTAGCCGAC AGGGATCAGTATGATCACCCAGAC AATCA] [+] EMBL CD088821 [ACTGAAAGTTTCCAGCAGATAAACAACACATAATATTGGTTAAATAATGGTCTAAGAATGAAAACAGGATTAAGATTTCAGTATCACTCCCTACCACCTTTTGACGGATTATTTCTTTTGAAATTTAAAACAATTTGTTTTGTTTCTACAAATCTGTTTGATTTCTGACCTGAATTCTTTCCCCTTTCAATAAAAGTGAAAAATATGAGTTATTGAGATTGCTGTGTATAAAACAGGTTAAGATTAAATATAAACATTTTGTGTAAGATTTATAACACATTTCGTTAATTGAAGTATGATTCACTGTCTCAGATGGCAAGATAAAATATTACATACCTTCTGAAATGAAGTAGTACACACTGAATTTACGATTGTATGCAAAAATATGTAAACATATGTTTGTAAATATTGCAAAACAATAAGGTTTAGGGAATTCTTAA TCAAAATATGAGATGAGTATTAACTGTATTATCATTTATCTTATTCAATGTTGTCTCCATTTACTCANACTACTATCCATACTTCGGTGATCGGACGAANACTGGTGTTTTCAGTTTGATATGGTAGCCGAC AGGAATCAGTATGATCA CCAGACAAAT ] [+] EMBL CD088784 [ACTGAAAGTTTCCAGCAGATAAACAACCCATAATATTGGTTAAATAATGGTCTAAGAATGAAAACAGGATTAAGATTTCAGTATCACTCCCTACCACCTTTTGACGGATTATTTCTTTTGAAATTTAAAACAATTTGTTTTGTTTCTACAAATCTGTTTGATTTCTGACCTGAATTCTTTCCCCTTTCAATAAAAGTGAAAAATATGAGTTATTGAGATTGCTGTGTATAAAACAGGTTAAGATTAAATATAAACATTTTGTGTAAGATTTATAACACATTTCGTTAATTGAAGTATGATTCACTGTCTCAGATGGCAAGATAAAATATTACATACCTTCTGAAATGAAGTAGTACACACTGAATTTACGATTGTATGCAAAAATATGTAAACATATGTTTGTAAATATTGCAAAACAATAAGGTTTAGGGAATTCTTAA TCAAAATATGAGATGAGTATTAACTGTATTATCATTCATCTTATTCAATGTTGTCTCCATTTACTCAAACTACTATCCATACTTCGGTGATCGGACGAAAACTGGTGTTTTCAGTTTGATATGGTAGCCGAC AGGAATCAGTATGATCA CCAGACAA ] [+] EMBL CD088775 [ACTGAAAGTTTCCAGCAGATAAACAACCCATAATATTGGTTAAATAATGGTCTAAGAATGAATACAGGATTAAGATTTCAGTATCACTCCCTACCACCTTTTGACGGATTATTTCTTTTGAAATTTAAAACAATTTGTTTTGTTTCTACAAATCTGTTTGATTTCTGACCTGAATTCTTTCCCCTTTCAATAAAAGTGAAAAATATGAGTTATTGAGATTGCTGTGTATAAAACAGGTTAAGATTAAATATAAACATTTTGTGTAAGATTTATAACACATTTCGTTAATTGAAGTATGATTCACTGTCTCAGATGGCAAGATAAAATATTACATACCTTCTGAAATGAAGTAGTACACACTGAATTTACGATTGTATGCAAAAATATGTAAACTTATGTTTGTAAATATTGCAAAACAATAAGGTTTAGGGAATTCTTAA TCAAGATATGAGATGAGTATTAACTGTATTATCATTTATCTTATTCAATGTTGTCTCCATTTACTCANACTACTATCCATACTTCGGTGATCGGACGAAAACTGGTGNTTTCAGTTTGATATGGTAGCCGAC AGGAA ] [+] EMBL CD088782 [ACTGAAAGTTTCCAGCAGATAAACAACCCATAATATTGGTTAAATAATGGTCTAAGAATGAAAACAGGATTAAGATTTCAGTATCACTCCCTACCACCTTTTGACGGATTATTTCTTTTGAAATTTAAAACAATTTGTTTTGTTTCTACAAATCTGTTTGATTTCTGACCTGAATTCTTTCCCCTTTCAATAAAAGTGAGAAATATGAGTTATTGAGATTGCTGTGTATAAAACAGGTTAAGATTAAATATAAACATTTTGTGTAAGATTTATAACACATTTCGTTAATTGAAGTATGATTCACTGTCTCAGATGGCAAGATAAAATATTACATACCTTCTGAAATGAAGTAGTACACACTGAATTTACGATTGTATGCAAAAATATGTAAACATATGTTTGTAAATATTGCAAAACAATAAGGTTTAGGGAATTCTTAANTC AAATATGAGATGAGTAT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||