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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7993#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 601 fasta sequence
[ACTGAAAGTTTCCAGCAGATAAACAACCCATAATATTGGTTAAATAATGGTCTAAGAATGAAAACAGGATTAAGATTTCAGTATCACTCCCTACCACCTTTTGACGGATTATTTCTTTTGAAATTTAAAACAATTTGTTTTGTTTCTACAAATCTGTTTGATTTCTGACCTGAATTCTTTCCCCTTTCAATAAAAGTGAAAAATATGAGTTATTGAGATTGCTGTGTATAAAACAGGTTAAGATTAAATATAAACATTTTGTGTAAGATTTATAACACATTTCGTTAATTGAAGTATGATTCACTGTCTCAGATGGCAAGATAAAATATTACATACCTTCTGAAATGAAGTAGTACACACTGAATTTACGATTGTATGCAAAAATATGTAAACATATGTTTGTAAATATTGCAAAACAATAAGGTTTAGGGAATTCTTAA-TCAAAATATGAGATGAGTATTAACTGTATTATCATTTATCTTATTCAATGTTGTCTCCATTTACTCAAACTACTATCCATACTTCGGTGATCGGACGAAAACTGGTGTTTTCAGTTTGATATGGTAGCCGAC-AGGAATCAGTATGATCA-CCAGACAAATCA]
[+] EMBL CD088800 [ACTGAAAGTTTCCAGCAGATAAACAACCCATAATATTGGTTAAATAATGGTCTAAGAATGAAAACAGGATTAAGATTTCAGTATCACTCCCTACCACCTTTTGACGGATTATTTCTTTTGAACTTTAAAACAATTTGTTTTGTTTCTACAAATCTGTTTGATTTCTGACCTGAATTCTTTCCCCTTTCAATAAAAGTGAAAAATATGAGTTATTGAGATTGCTGTGTATAAAACAGGTTAAGATTAAATATAAACATTTTGTGTAAGATTTATAACACATTTCGTTAATTGAAGTATGATTCACTGTCTCAGATGGCAAGATAAAATATTACATACCTTCTGAAATGAAGTAGTACACACTGAATTTACGATTGTATGCAAAAATATGTAAACATATGTTTGTAAATATTGCAAAACAATAAGGTTTAGGGAATTCTTAA TCAAAATATGAGATGAGTATTAACTGTATTATCATTTATCTTATTCAATGTTGTCTCCATTTACTCAAACTACTATCCATACTTCGGTGATCGGACG AAACTGGTGTTTTCAGTTTGATATGGTAGCCGACAAGGAATCAGTATGATCA CCAGACAAATCA]
[+] EMBL CD088836 [ACTGAAAGTTTCCAGCAGATAAACAACCCATAATATTGGTTAAATAATGGTCTAAGAATGAAAACAGGATTAAGATTTCAGTATCACTCCCTACCACCTTTTGACGGATTATTTCTTTTGAAATTTAAAACAATTTGTTTTGTTTCTACAAATCTGTTTGATTTCTGACCTGAATTCTTTCCCCTTTCAATAAAAGTGAAAAATATGAGTTATTGAGATTGCTGTGTATAAAACAGGTTAAGATTAAATATAAACATTTTGTGTAAGATTTATAACACATTTCGTTAATTGAAGTATGATTCACTGTCTCAGATGGCAAGATAAAATATTACATACCTTCTGAAATGAAGTAGTACACACTGAATTTACGATTGTATGCAAAAATATGTAAACATATGTTTGTAAATATTGCAAAACAATAAGGTTTAGGGAATTCTTAA TCAAAATATGAGATGAGTATTAACTGTATTATCATTTATCTTATTCAATGTTGTCTCCATTTACTCAAACTACTATCCATACTTCGGTGATCGGACGAAAACTGGTGTTTTCAGTTTGATATGGTAGCCGAC AGGGATCAGTATGATCACCCAGAC AATCA]
[+] EMBL CD088821 [ACTGAAAGTTTCCAGCAGATAAACAACACATAATATTGGTTAAATAATGGTCTAAGAATGAAAACAGGATTAAGATTTCAGTATCACTCCCTACCACCTTTTGACGGATTATTTCTTTTGAAATTTAAAACAATTTGTTTTGTTTCTACAAATCTGTTTGATTTCTGACCTGAATTCTTTCCCCTTTCAATAAAAGTGAAAAATATGAGTTATTGAGATTGCTGTGTATAAAACAGGTTAAGATTAAATATAAACATTTTGTGTAAGATTTATAACACATTTCGTTAATTGAAGTATGATTCACTGTCTCAGATGGCAAGATAAAATATTACATACCTTCTGAAATGAAGTAGTACACACTGAATTTACGATTGTATGCAAAAATATGTAAACATATGTTTGTAAATATTGCAAAACAATAAGGTTTAGGGAATTCTTAA TCAAAATATGAGATGAGTATTAACTGTATTATCATTTATCTTATTCAATGTTGTCTCCATTTACTCANACTACTATCCATACTTCGGTGATCGGACGAANACTGGTGTTTTCAGTTTGATATGGTAGCCGAC AGGAATCAGTATGATCA CCAGACAAAT ]
[+] EMBL CD088784 [ACTGAAAGTTTCCAGCAGATAAACAACCCATAATATTGGTTAAATAATGGTCTAAGAATGAAAACAGGATTAAGATTTCAGTATCACTCCCTACCACCTTTTGACGGATTATTTCTTTTGAAATTTAAAACAATTTGTTTTGTTTCTACAAATCTGTTTGATTTCTGACCTGAATTCTTTCCCCTTTCAATAAAAGTGAAAAATATGAGTTATTGAGATTGCTGTGTATAAAACAGGTTAAGATTAAATATAAACATTTTGTGTAAGATTTATAACACATTTCGTTAATTGAAGTATGATTCACTGTCTCAGATGGCAAGATAAAATATTACATACCTTCTGAAATGAAGTAGTACACACTGAATTTACGATTGTATGCAAAAATATGTAAACATATGTTTGTAAATATTGCAAAACAATAAGGTTTAGGGAATTCTTAA TCAAAATATGAGATGAGTATTAACTGTATTATCATTCATCTTATTCAATGTTGTCTCCATTTACTCAAACTACTATCCATACTTCGGTGATCGGACGAAAACTGGTGTTTTCAGTTTGATATGGTAGCCGAC AGGAATCAGTATGATCA CCAGACAA ]
[+] EMBL CD088775 [ACTGAAAGTTTCCAGCAGATAAACAACCCATAATATTGGTTAAATAATGGTCTAAGAATGAATACAGGATTAAGATTTCAGTATCACTCCCTACCACCTTTTGACGGATTATTTCTTTTGAAATTTAAAACAATTTGTTTTGTTTCTACAAATCTGTTTGATTTCTGACCTGAATTCTTTCCCCTTTCAATAAAAGTGAAAAATATGAGTTATTGAGATTGCTGTGTATAAAACAGGTTAAGATTAAATATAAACATTTTGTGTAAGATTTATAACACATTTCGTTAATTGAAGTATGATTCACTGTCTCAGATGGCAAGATAAAATATTACATACCTTCTGAAATGAAGTAGTACACACTGAATTTACGATTGTATGCAAAAATATGTAAACTTATGTTTGTAAATATTGCAAAACAATAAGGTTTAGGGAATTCTTAA TCAAGATATGAGATGAGTATTAACTGTATTATCATTTATCTTATTCAATGTTGTCTCCATTTACTCANACTACTATCCATACTTCGGTGATCGGACGAAAACTGGTGNTTTCAGTTTGATATGGTAGCCGAC AGGAA ]
[+] EMBL CD088782 [ACTGAAAGTTTCCAGCAGATAAACAACCCATAATATTGGTTAAATAATGGTCTAAGAATGAAAACAGGATTAAGATTTCAGTATCACTCCCTACCACCTTTTGACGGATTATTTCTTTTGAAATTTAAAACAATTTGTTTTGTTTCTACAAATCTGTTTGATTTCTGACCTGAATTCTTTCCCCTTTCAATAAAAGTGAGAAATATGAGTTATTGAGATTGCTGTGTATAAAACAGGTTAAGATTAAATATAAACATTTTGTGTAAGATTTATAACACATTTCGTTAATTGAAGTATGATTCACTGTCTCAGATGGCAAGATAAAATATTACATACCTTCTGAAATGAAGTAGTACACACTGAATTTACGATTGTATGCAAAAATATGTAAACATATGTTTGTAAATATTGCAAAACAATAAGGTTTAGGGAATTCTTAANTC AAATATGAGATGAGTAT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||