These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7999#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 925 fasta sequence [CCAGGCACGTTTTGCATTGGATACATTTAGTTTAGTATGTAGAAGAGCAGCACAATTACTTCAAGAGACTCCTCCTATGGATTCTAATCCAGGTTGGATATCACCAGATGCACGAATTCTTCTTTCTGCATTATGCCTATGGACTGAATGGATGATTTTACATCCTGAACATTGGTTACCACCACCAAATCATCGTGATCCTACACTTCGACCACATCTAGATGATTGGTTACTTGTTGCTAAATTATGCACTGAAGCAGCTAGTTGGCTTACACGTTTATCTGTTAAACCAAACTATG-AAGAAATTACACCGACAACATCTCTTGTACTTCGATTAAAAGGTGAACTTAACTGTGATGAAAAGTTGGATGATGATTCAGATAAATCTTCTACTTTATATCATATCTTTGAAGATGGTAACTTGTATAAAGCTACTTTTCTTTCTGAAGAAGCATTCGTTGCCGGA-TTCAAACCTATGCTTGATTTAACACCTAAAATATATTATTACACAGGTGATTGGGATCCAGAAACTGTGGCAGATTTTGTTCGAATAGAGAAATTAGTTTTATTTGGTGATTATTTATGTGGAATTGAAACCCCTGTATTAAACTATAATATTGATCAAGCAGTTTATGAATCTGTTATACAACGTGAATCCTCTGAACGTCTCC-AAGATAAACGTGTAGATGTTAATGCAAATATCT-AACAGAATAGTTCAGATATCAATTTGGAAAATGAAGAGAAACGTCAGTTGGAGTTAATGTCTGTATTGAATGATAACAAAAATCTTTCATCAGATGATGGTACAATAGAATCTAATTCTGTCCTAACAGATATTGCAGCTTTACAACGGCAAAGAGCTTTCCTTCAAAAGCAACTAGATGAAGAAGCCCGTCTAGATGCATGGCGTCGTAATGCTATAAGA] [+] EMBL CD115912 [CCAGGCACGTTTTGCATTGGATACATTTAGTTTAGTATGTAGAAGAGCAGCACAATTACTTCAAGAGACTCCTCCTATGGATTCTAATCCAGGTTGGATATCACCAGATGCACGAATTCTTCTTTCTGCATTATGCCTATGGACTGAATGGATGATTTTACATCCTGAACATTGGTTACCACCACCAAATCATCGTGATCCTACACTTCGACCACATCTAGATGATTGGTTACTTGTTGCTAAATTATGCACTGAAGCAGCTAGTTGGCTTACACGTTTATCTGTTAAACCAAACTATG AAGAAATTACACCAACAACATCTCTTGTACTTCGATTAAAAGGTGAACTTAACTGTGATGAAAAGTTGGATGATGATTCAGATAAATCTTCTACTTTATATCGTATCTTTGAAGATGGTAACTTGTATAAAGCTACTCTTCTTTCTGAAGAAGCATTCGTTGCCGGA TTCAAACCTATGCTTGATTTAACACCTAAAATATATTATTACACAGGTGATTGGGATCCAGATACTGTGGCAGATTTTGTTCGAATAGAGAAATTAGTTCTATTTGGTGATTATTTATGTGGAATTGANACCCCTGTATTAAACTATTATATTGATCAAGCAGTTTATGAATCTGTTATACAACGTGAATCCTCTGAACGTCTCC AAGATAAACGTGTAGATGCTAATGGCAATATCT AACAGGATAGTTCAGATATCAATTTGGga ] [+] EMBL CD187879 [ TAGATGATTGGTTACTTGTTGCTAAATTATGCACTGAAGCAGCTAGTTGGCTTACACGTTTATCTGTTAAACCAAACTATGTAAGAAATTACACCGACAACATCTCTTGTACTTCGATTAAAAGGTGAACTTAACTGTGATGAAAAGTTGGATGATGATTCAGATAAATCTTCTACTTTATATCATATCTTTGAAGATGGTAACTTGTATAAAGCTACTTTTCTTTCTGAAGAAGCATTCGTTGCCGGA TTCAAACCTATGCTTGATTTAACACCTAAAATATATTATTACACAGGTGATTGGGATCCAGAAACTGTGGCAGATTTTGTTCGAATAGAGAAATTAGTTTTATTTGGTGATTATTTATGTGGAATTGAAACCCCTGTATTAAACTATAATATTGATCAAGCAGTTTATGAATCTGTTATACAACGTGAATCCTCTGAACGTCTCC AAGATAAACGTGTAGATGTTAATGCAAATATTA AACAGAATAGTTCAGATATCAATTTGGA ] [+] EMBL CD187878 [ TAGATGATTGGTTACTTGTTGCTAAATTATGCACTGAAGCAGCTAGTTGGCTTACACGTTTATCTGTTAAACCAAACTATG AAGAAATTACACCGACAACATCTCTTGTACTTCGATTAAAAGGTGAACTTAACTGTGATGAAAAGTTGGATGATGATTCAGATAAATCTTCTACTTTATATCATATCTTTGAAGATGGTAACTTGTATAAAGCTACTTTTCTTTCTGAAGAAGCATTCGTTGCCGGA TTCAAACCTATGCTTGATTTAACACCTAAAATATATTATTACACAGGTGATTGGGATCCAGAAACTGTGGCAGATTTTGTTCGAATAGAGAAATTAGTTNTATTTGGTGATTATTTATGTGGAATTGAAACCCCTGTATTAAACTATAATATTGATCAAGCAGTTTATGAATCTGTTATACAACGTGAATCCTCTGAACGTCTCC AAGATAAACGTGTAGATGTTAATGCA ] [+] EMBL CD187868 [ TAGATGATTGGTTACTTGTTGCTAAATTATGCACTGAAGCAGCTAGTTGGCTTACACGTTTATCTGTTAAACCAAACTATG AAGAAATTACACCGACAACATCTCTTGTACTTCGATTAAAAGGTGAACTTAACTGTGATGAAAAGTTGGATGATGATTCAGATAAATCTTCTACTTTATATCATATCTTTGAAGATGGTAACTTGTATAAAGCTACTTTTCTTTCTGAAGAAGCATTCGTTGCCGGA TTCAAACCTATGCTTGATTTAACACCTAAAATATATTATTACACAGGTGATTGGGATCCAGAAACTGTGGCAGATTTTGTTCGAATAGAGAAATTAGTTNTATTTGGTGATTATTTATGTGGAATTGAAACCCCTGTATTAAACTATAATATTGATCAAGCAGTTTATGAATCTGTTATACAACGTGAATCCTCTGAACGTCTCCAAAGAT AACGTGTAGAT ] [-] EMBL CD196044 [ AAGAAGCATTCGTTG CGGATTTCAAACCTATGCTTGATTTAACACCTAAAATATATTATTACACAGGTGATTGGGATCCAGAAACTGTGGCAGATTTTGTTCGAATAGAGAAATTAGTTTTATTTGGTGATTATTTATGTGGAATTGAAACCCCTGTATTAAACTATAATATTGATCAAGCAGTTTATGAATCTGTTATACAACGTGAATCCTCTGAACGTCTCC AAGATAAACGTGTAGATGTTAATGCAAATA CTAAACAGAATAGTTCA ] [+] EMBL CD163070 [ TTATGTGGAATTGAAACCCCTGTATTAAACTATAATATTGATCAAGCGGTTTATGAATCTGTTATACAACGTGAATCCTCTGAACGTCTCC AAGATAAACGTGTAGACGTTAATGCAAATATTA AACAGAATATTTCAGATATCAATTTGGAAAATGAAGAGAAACGTCAGTTGGAGTTAATGTCTGTATTGAATGATAACAAAAATCTTTCATCAGATGATGGTACAATAGAATCTAATTCTGTCCTAACAGATATTGCAGCTTTACAACGGCAAAGAGCTTTCCTTCAAAAGCAACTAGATGAAGAAGCCCGTCTAGATGCATGGCGTCGTAATGCTATAAGA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||