These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8005#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 906 fasta sequence [ATATATGTATTTT--T-GTGGGACAATT--ATCGTCTC-GGTTTAAAGGGTT-AAGAACTGCAAAATAATTT-GGCGTAAAATTAAAACGAAAAATAAAGAAGTGAAAATCAGGATTTCAGGTTAAGCATAAGCGCAGATAAGAAAGGGATGATTATTCAAAAGCTTATTTATGTAATATGATTTATTAAATGAAACATTTACTTAAGAAGCATAAAATTATGTGTAACGAACTAAGTAGCAAGGGTAAAAACATGTGAACTTGACAATAATTAACAACTATACAGGTAAAACAAAATGACGCGGAAAGAAAACAATATTGAATAACGTAAGGCAACAGACATTGATGGCTAGTAGGAAGCATATAAGTCAATTTTTAGGAACATAAACAGTTGAGTCCCCAAATGTAAACACCGAAACACAAAAGCTACAAAAACATTTAAGATTTTCGTTTGATTCATATGAACTGAAAAAA-CAAGTAACTGTAATTACCGACTCACTAACAGATATATGTATATGAAAATATGAACGGAGTAGTACAGTGCAGGAATTAAGAAAATATGAGAAACAGGAAGTGTATGGTGACAACATTAAATATAATCAAAAATTAAGAGAATAATACTTTACATGTAATTTTAAAAATTATTTGAATTTTAGTAAGCAGGAAGTGGGAATAAATCAGAACAGCAGGAGGAAAGGGAAGTGATCTTCCAGTAATACATTACTTCCAAAATCAAATATCCTAAACAAAACATTGTGTAATTTTCTCAAGGGAAAGAGAAGCATATTAATTAGCTGAAAT-ATAATAGTATCAACGAACAAACAAATTCAGAAGATCCAATACAAAAGCATTGCTTTTCATCGTCTATTCTACTACCTTGNGAAACTTCCATGTGATGTAGGGAAGATGTGAAG] [+] EMBL CD074195 [ATATATGTATTTT T GTGGGACAATTTCATCGTCTCAGGTTTAAAGGGTTAAAGAACTGCAAAATAATTT GGCGTAAAATTAAAACGAAAAATAAAGAAGTGAAAATCAGGATTTCAGGTTAAGCATAAGCGCAGATAAGAAAGGGATGATTATTCAAAAGCTTATTTATGTAATATGATTTATTAAATGAAACATTTACTTAAGAAGCATAAAATTATGTGTAACGAACTAAGTAGCAAGGGTAAAAACATGTGAACTTGACAATAATTAACAACTATACAGGTAAAACAAAATGACGCGGAAAGAAAACAATATTGAATAACGTAAGGCAACAGACATTGATGGCTAGTAGGAAGCATATAAGTCAATTTTTAGGAACATAAACAGTTGAGTCCCCAAATGTAAACACCGAAACACAAAAGCTACAAAAACATTTAAGATTTTCGTTTGATTCATATGAACTGAAAAAA CAAGTAACTGTAATTACCGACTCACTAACAGATATATGTATATGAAAATATGAACGGAGTAGTACAGTGCAGGAATTAAGAAAATATGAGAAACAGGAAGTGTATGGTGACAACATTAAATATAATCAAAAATTAAGAGAAATATACTT ] [+] EMBL CD075024 [ taATTTTCCTAGTGGCAGAATT ATGGNCTC GGTTTAAAGGGTT ATCAACTGCAAAATAATTTAGGCGTAAAATTAAAACGAAAAATAAAGAAGTGAAAATCAGGATTTCAGGTTAAGCATAAGCGCAGATTTGAACGGGATGATTATTCAAAAGCTTATTTATGTAATATGATTTATTAAATGAAACATTTACTTAAGAAGCATAAAATTATGTGTAACGAACTAAGTAGCAAGGGTAAAAACATGTGAACTTGACAATAATTAACAACTATACAGGTAAAACAAAATGACGCGGAAAGAAAACAATATTGAATAACGTAAGGCAACAGACATTGATGGCTAGTAGGAAGCATATAAGTCAATTTTTAGGAACATAAACAGTTGAGTCCCCAAATGTAAACACCGAAACACAAAAGCTACAAAAACATTTAAGATTTTCGTTTGATTCATATGAACTGAAAAAAGTAAGTAACTGTAATTACCGACTCACTAACAGATATATGTATATGAAAATATGAACGGAGTAGTACAGTGCAGGAATTAAGAAAATATGAGAAACAGGAAGTGTATGGTGACAACATTAAATATAATCAAAAATTAAGAGAATAATACTTTACATGTAATTTTAAAAATTATTTGAATTTTAGTAAGCAGGAAGTGGGAATAAATCAGAACAGCAGGAGGAAAGGGAAGTGATCTTCCAGTAATACATTACTTCCAAAATCAAATATCCTAAACAAAACATTGTGTAATTTTCTCAAGGGAAAGAGAAGCATATTAATTAGCTGAAAT ATAATAGTATCA ] [+] EMBL CD064659 [ TAATTAACAACTATACAGGTAAAACAAAATGACGCGGAAAGAAAACAATATTGAATAACGTAAGGCAACAGACATTGATGGCTAGTAGGAAGCATATAAGTCAATTTTTAGGAACATAAACAGTTGAGTCCCCAAATGTAAACACCGAAACACAAAAGCTACAAAAACATTTAAGATTTTCGTTTGATTCATATGAACTGAAAAAA CAAGTAACTGTAATTACCGACTCACTAACAGATATATGTATATGAAAATATGAACGGAGTAATACAGTGCAGGAATTAAGAAAATATGAGAAACAGGAAGTGTATGGTGACAACATTAAATATAATCAAAAATTAAGAGAATAATACTTTACATGTAATTTTAAAAATTATTTGAATTTTAGTAAGCAGGAAGTGGGAATAAATCAGAACAGCAGGAGGAAAGGGAAGTGATCTTCCAGTAATACATTACTTCCAAAATCAAATATCCTAAACAAAACATTGTGTAATTTTCTCAAGGGAAAGAGGAGCATATTAATTAGCTGAAATAATAATAGTATCGACGAACAAACAAATTCAGAAGATCCAATACAAAAGCATTGCTTTTCATCGTCTATTCTACTACCTTGNGAAACTTCCATGTGATGTAGGGAAGATGTGAAG] [-] EMBL CD069167 [ CAATATTGAATAACGTAAGGCAACAGACATTGATGGCTAGTAGGAAGCATATAAGTCAATTTTTAGGAACATAAACAGTTGAGTCCCCAAATGTAAACACCGAAACACAAAAGCTACAAAAACATTTAAGATTTTCGTTTGATTCATATGAACTGAAAAAA CAAGTAACTGTAATTACCGACTCACTAACAGATATATGTATATGAAAATATGAACGGAGTAGTACAGTGCAGGAATTAAGAAAATATGAGAAACAGGAAGTGTATGGTGACAACATTAAATATAATCAAAAATTAAGAGAATAATAC ] [-] EMBL CD069129 [ CAATATTGAATAACGTAAGGCAACAGACATTGATGGCTAGTAGGAAGCATATAAGTCAATTTTTAGGAACATAAACAGTTGAGTCCCCAAATGTAAACACCGAAACACAAAAGCTACAAAAACATTTAAGATTTTCGTTTGATTCATATGAACTGAAAAAA CAAGTAACTGTAATTACCGACTCACTAACAGATATATGTATATGAAAATATGAACGGAGTAGTACAGTGCAGGAATTAAGAAAATATGAGAAACAGGAAGTGTATGGTGACAACATTAAATATAATCAAAAATTAAGAGAATAATAC ] [-] EMBL SM016 [ CATAAACAGTTGAGTCCCCAAATGTAAACACCGAAACACAAAAGCTACTTTTTCATTTAAGATTTTCGTTTGATTCATATGAACTGAAAAAA CAAGTAACTGTAATTACCGACTCACTAACAGATATATGTATATGAAAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||