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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8021#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1013 fasta sequence
[TGATATTAGTAACAGAGGTGGAGTTCAGAATCGAACACCACAAAAACAGAGATACAGAAGGTTGTATCATCCTTGTAAAAAAAAAGACGACCAGTGAGTAAATAAAATAAGTTCTGAATAAGTTATCTTAAGGTAATACAATAAGAAAGGATGGGATTGATAAAAATTCATAACAGATAAATTTCGAGGTTCATTCAAGCTGCCTTCAAATTTCGTTGGAAAAAAAATATATATGTATGTAACATTAAGTAACAATTATTCCATATGAATTCTAAGCAATCAAATAGATGAGATGTTCTTCTTAGAAATATGCCTGAACAAATTAAAATTAATTCATTAACTCGTATGCGCATCAAAAACTAGAAGTTATTGGGTTAGTACTATTTGACGTTGTAGCGGTGCTTCCTACAATTCGATCAGCTAGTTCTAGACTCAATTCTAATTCCAGTGGTTCACAATCATCATCGTAAGATGAATAAGGTTCAACATATTGTCGTAGATCTCTGTATGTACGATCAGTAGATCGAGTCTGTGTTGGATTTGAAGTAAAAGCTGACGATGGTGACGATGATTGTTGTGTTGCATAA-TTTGTTACAGAAGAACGGTCAACTCGTCCTAAATTACACAACTGTTCAGATATAAAATTTTCACTTTGGCTAACTTGTTTCGTTTGAGTTTGTTGTTGCAGGAACGATGATTCAATATTATGATCAGACATACCGAATAGTGTCGTTTGAGGAAAATACATAAGATCAGGTGGTGTTACTGGACCTAAGCATCTGTTCGCATTCTCATGACCACTATTTCCTGAACAAGAAGATGTGGATAAGGATGTAATTGGATCTCCTCGTTGTAAGCTATGTGAATCACTTAACAAACGCATATCTAAACCAAGAGAATGACGCCAAGAACCGGAAGATGAACCGACAGAATTATTTATAGATGGTGATAGAGATGTAGTTGAATTACCGGAACAATTTAAAAATGGAAGTTTCCCATCATTTGTTGAATGC]
[-] EMBL CD118666 [TGATATTAGTAACAGAGGTGGAGTTCAGAATCGAACACCACAAAAACAGAGATACAGAAGGTTGTATCATCCTTGTAAAAAAAAAGACGACCAGTGAGTAAATAAAATAAGTTCTGAATAAGTTATCTTAAGGTAATACAATAAGAAAGGATGGGATTGATAAAAATTCATAACAGATAAATTTCGAGGTTCATTCAAGCTGCCTTCAAATTTCGTTGGAAAAAAAATATATATGTATGTAACATTAAGTAACAATTATTCCATATGAATTCTAAGCAATCAAATAGATGAGATGTTCTTCTTAGAA ]
[-] EMBL CD194679 [ TCGTTGGAAAAAAAATATATATGTATGTAACATTAAGTAACAATTATTCCATATGAATTCTAAGCAATCAAATAGATGAGATGTTCTTCTTAGAAATATGCCTGAACAAATTAAAATTAATTCATTAACTCGTATGCGCATCAAAAACTAGAAGTTATTGGGTTAGTACTATTTGACGTTGTAGCGGTGCTTCCTACAATTCGATCAGCTAGTTCTAGACTCAA ]
[-] EMBL CD185843 [ GGTTAGTACTATTTGACGTGNTAGCGGTGCTTCCTACAATTCGATCAGCTAGTTCTAGACTCAATTCTAATTCCAGTGGTTCACAATCATCATCGTAAGATGAATAAGGTTC ]
[+] EMBL CD117171 [ TTGACGTTGTAGCGGTGCTTCCTACAATTCGATCAGCTAGTTCTAGACTCAATTCTAATTCCAGTGGTTCACAATCATCATCGTAAGATGAATAAGGTTCAACATATTGTCGTAGATCTCTGTATGTACGATCAGTAGATCGAGTCTGTGTTGGATTTGAAGTAAAAGCTGACGATGGTGACGATGATTGTTGTGTTGCATAA TTTGTTACAGAAGAACGGTCAACTCGTCCTAAATTACACAACTGTTCAGATATAAAATTTTCACTTTGGCTAACTTGTTTCGTTTGAGTTTGTTGTTGCAGGAACGATGATTCAATATTATGATCAGACATACCGAATAGTGTCGTTTGAGGAAAATACATAAGATCAGGTGGTGTTACTGGACCTAAGCATCTGTTCGCATTCTCATGACCACTATTTCCTGAACAAGAAGATGTGGATAAGGATGTAATTGGATCTCCTCGTTGTAAGCTATGTGAATCACTTAACAAACGCATATCT ]
[+] EMBL CD069119 [ tgTAACTCTGTGAGAGAAGAACGGTCAACTCGTCCTAAATTGCACAACTGTTCAGATATAAAATTTTCACTTTGGCTAACTTGTTTCGTTTGAGTTTGTTGTTGCAGGAACGATGATTCAATATTATGATCAGACATACCGAATAGTGTCGTTTGAGGAAAATACATAAGATCAGGTGGTGTTACTGGACCTAAGCATCTGTTCGCATTCTCATGACCACTATTTCCTGAACAAGAAGATGTGGATAAGGATGTAATTGGATCTCCTCGTTGTAAGCTATGTGAATCACTTAACAAACGCATATCTAAACCAAGAGAATGACGCCAAGAACCGGAAGATGAACCGACAGAATTATTTATAGATGGTGATAGAGATGTAGTTGAATTACCGGAACAATTTAAA ]
[-] EMBL CD090268 [ CCGACAGAATTATTTATAGATGGTGATAGAGATGTAGTTGAATTACCGGAACGATTTAAAAATGGAAGTTTCCCATCATTTGTTGAATGC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||