Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8031 cluster # 8031       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8031#0 length = 561 sequences # 6  

consensusID : consensus_8031#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 561
fasta sequence
                              [ACTTTGAACGTCGTATTAATGAAGCAGTCTTTCCAGGTTTACAGGGTGGTCCTCACAATAACACTATTGCAGCTATAGCTGTTTGTTTAAAAGAAGCTGCGTCACCTGAATACAAGGTTTACCA-AGAGCAAGTGCTCAAAAATATGAAACAACTTTGCAAATCATTAAAAGCTTACGGTTATGAGCTTGTGACTGGAGGTAGTGATACACACTTATGCTTGCTGGATCTTCGCCCATTGAAAATAGATGGTGCCCGAGCTGAGAAAGTTCTAGAATTAGTTCGTATCGCTGCGAACAAGAACACTTGTCCTGGTGATGTTAGTGCTTTAAGACCTGGTGGCTTACGCTTTGGAAGTGCCGCATTAACATCACGAAATTTTCATGAAGAAGATTTCGTGAAAGTTTCAGAATTCATACATGTTGCAATTCAAATAGCTGTTAAAGCTAATGAACTAGCTAGCAGCAAACTATTAAAGGATTATGAAGTTGTTGTTGAAACANATGTTGAAGTACGTTCAATGATTGAAAAATTGAGCTTGAAATTGAGGAGTTTGCTTCTAA]

[+] EMBL CD132847             [ACTTTGAACGTCGTATTAATGAAGCAGTCTTTCCAGGTTTACAGGGTGGTCCTCACAATAACACTATTGCAGCTATAGCTGTTTGTTTAAAAGAAGCTGCGTCACCTGAATACAAGGTTTACCA AGAGCAAGTGCTCAAAAATATGAAACAACTTTGCAAATCATTAAAAGCTTACGGTTATGAGCTTGTGACTGGAGGTAGTGATACACACTTATGCTTGCTGGATCTTCGCCCATTGAAAATAGATGGTGCCCGAGCTGAGAAAGTTCTAGAATTAGTTCGTATCGCTGCGAACAAGAACACTTGTCCTGGTGATGTTAGTGCTTTAAGACCTGGTGGCTTACGCTTTGGAAGTGCCGCATTAACATCACGAAATTTTCATGAAGAAGATTTCGTGAAAGTTTCAGAATTCATACATGTTGCAATTCAAATAGCTGTTAAAGCTAATGAACTAGCTAGCAGCANACTATTAAAGGATTATGAAGTTGTTGTTGAAACANATGTTGAAGTACGTTCAATGATTGAAAAATTGAGCTTGAAATTGAGGAGTTTGCTTCTAA]
[+] EMBL CD065600             [              ATT ATGAAGCAGTCTTTCCAGGTTTACAGGGTGGTCCTCACAATAACACTATTGCAGCTATAGCTGTTTGTTTAAAAGAAGCTGCGTCACCTGAATACAAGGTTTACCA AGAGCAAGTGCTCAAAAATATGAAACAACTTTGCAAATCATTAGAAGCTTACGGCTATGAGCTTGTGACTGGAGGTAGTGATACACACTTATGCTTGCTGGATCTTCGCCCATTGAAGATAGATGGTGCCCGAGCTGAGAAAGTTCTAGAATTAGTTCGTATCGCTGCGAACAAGAACACTTGCCCTGGTGATGTTAGTGCTTTAAGACCTGGTGGCTTACGCTTTGGAAGTGCCGCATTAACATCACGAAATTTTCATGAAGAAGATTTCGTGAAAGTTTCAGAATTCATACATGTTGCAATTCAAATAGCTGTTAAAGCTAATGAACTAGCTAGCAGCAAACTATT                                                                                         ]
[+] EMBL CD128300             [              ATTAATGAAGCAGTCTTTCCAGGTTTACAGGGTGGTCCTCACAATAACACTATTGCAGCTATAGCTG TTGTTTAAAAGAAGCTGCGTCACCTGAATACAAGGTTTACCANAGAGCAAGTGCTCAAAAATATGAAACAACTTTGCAAATCATTAAAAGCTTACGGTTATGAGCTTGTGACTGGAGGTAGTGATACACACTTATGCTTGCTGGATCTTCGCCCATTGAAAATAGATGGTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD128241             [               TTAATGAAGCAGTCTTTCCAGGTTTACAGGGTGGTCCTCACAATAACACTATTGCAGCTATAGCTGTTTGTTTAAAAGAAGCTGCGTCACCTGAATACAAGGTTTACCA AGAGCAAGTGCTCAAAAATATGAAACAACTTTGCAAATCATTAAAAGCTTACGGTTATGAGCTTGTGACTGGAGGTAGTGATACACACTTATGCTTGCTGGATCTTCGCCCATTGAAAATAGAT GTGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD128210             [                atATGAAGCAGTCTTTCCAGGTTTACAGGGTGGTCCTCACAATAACACTA TGCAGCTATAGCTG TTGTTTAAAAGAAGCTGCGTCACCTGAATACAAGGTTTACCA AGAGCTAGTGCTCAAAAATATGAAACAACTTTGCAAATCATTAAAAGCTTACGGTTATGAGCTTGTGACTGGAGGTAGTGATACACACTTATGCTTGCTGGATCTTCGCCCATTGAAAATAGATGGTGCCCGAGCTGAGAAAGTTCTAGAATTAGTTCGTATCGCTGCGAACAAGAACACTTGTCCTGGTGATGTTAGTGCTTTAAGACCTGGTGGCTTACGCTTTGGAAGTGCCGCATTAACATCACGAAATTTTCATGAAGAAGATTTCGTGAAAGTTTCAGAATTCATACATGTTGCAATTCAAATAGCTGTTAAAGCTAATGAACTAGCTAGCAGCAA                                                                                               ]
[-] EMBL CD065777             [                    GAAGCAGTCTTTCCAGGTTTACAGGGTGGTCCTCACAATAACACTATTGCAGCTATAGCTGTTTGTTTAAAAGAAGCTGCGTCACCTGAATACAAGGTTTACCA AGAGCAAGTGCTCAAAAATATGAAACAACTTTGCAAATCATTAAAAGCTTACGGTTATGAGCTTGTGACTGGAGGTAGTGATACACACTTATGCTTGCTGGATCTTCGCCCATTGAAAATAGATGGTGCCCGAGCTGAGAAAGTTCTAGAATTAGTTCGTATCGCTGCGAACAAGAACACTTGTCCTGGTGATGTTAGTGCTTTAAGACCTGGTGGCTTACGCTTTGGAAGTGCCGCATTAACATCACGAAATTTTCATGAAGAAGATTTCGTGAAAGTTTCAGAATTCATACATGTCGCTATTCAAATAGCTGTTAAAGCTAATGAACTAGCTAGCAGCAAACTATTA                                                                                        ]


>consensus_8031#0 ACTTTGAACGTCGTATTAATGAAGCAGTCTTTCCAGGTTTACAGGGTGGTCCTCACAATA ACACTATTGCAGCTATAGCTGTTTGTTTAAAAGAAGCTGCGTCACCTGAATACAAGGTTT ACCAAGAGCAAGTGCTCAAAAATATGAAACAACTTTGCAAATCATTAAAAGCTTACGGTT ATGAGCTTGTGACTGGAGGTAGTGATACACACTTATGCTTGCTGGATCTTCGCCCATTGA AAATAGATGGTGCCCGAGCTGAGAAAGTTCTAGAATTAGTTCGTATCGCTGCGAACAAGA ACACTTGTCCTGGTGATGTTAGTGCTTTAAGACCTGGTGGCTTACGCTTTGGAAGTGCCG CATTAACATCACGAAATTTTCATGAAGAAGATTTCGTGAAAGTTTCAGAATTCATACATG TTGCAATTCAAATAGCTGTTAAAGCTAATGAACTAGCTAGCAGCAAACTATTAAAGGATT ATGAAGTTGTTGTTGAAACANATGTTGAAGTACGTTCAATGATTGAAAAATTGAGCTTGA AATTGAGGAGTTTGCTTCTAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)