cluster # 8047

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8047 cluster # 8047 Sequences # 6 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_8047#0 length = 373 sequences # 6

consensusID : consensus_8047#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 373
fasta sequence

                              [TAAAATATGAATTAAATTT-AATACTCTCCATAAATTTGGAAATATAGTTCTATTCTCTACACGTATCTTCCATTCACGACATCGATACCATTTAAGAAATCTTGGAAAACGTAACATTGGTTGAATACCAACTTTAAATTGTAATAAATCCAATGGAAGTAATGATGTAATATCTAAAAGGAATTTATAGGATTTCATATAACGTTTAGCTAATTTCTGATGATTACGTACTTTTAATCCACGTTTTAAATAACTTGTATTACATTGTACAAATATATCAATTAAATAAGTTAAATCAGTGAATATATCTAAACTAAACCATAACATTTGATAAGTTATTTGTAATTCAGTAAATGCTTGACGTGCCATTGGG]

[+] EMBL CD113112             [TAAAATATGAATTAAATTT AATACTCTCCATAAATTTGGAAATATAGTTCTATTCTCTACACGTATCTTCCATTCACGACATCGATACCATTTAAGAAATCTTGGAAAACGTAACATTGGTTGAATACCAACTTTAAATTGTAATAAATCCAATGGAAGTAATGATGTAATATCTAAAAGGAATTTATAGGATTTCATATAACGTTTAGCTAATTTCTGATGATTACGTACTTTTAATCCACGTTTTAAATAACTTGTATTACATTGTACAAATATATCAATTAAATAAGTTAAATCAATGAATATATCTAAACTAAACCATAACATTTGATAAGTTATTTGTAATTCANTANATGCTTGACGTGCCATTGGG]
[+] EMBL CD113049             [TAAAATATGAATTAAATTT AATACTCTCCATAAATTTGGAAATATAGTTCTATTCTCTACACGTATCTTCCATTCACGACATCGATACCATTTAAGAAATCTTGGAAAACGTAACATTGGTTGAATACCAACTTTAAATTGTAATAAATCCAATGGAAGTAATGATGTAATATCTAAAAGGAATTTATAGGATTTCATATAACGTTTAGCTAATTTCTGATGATTACGTACTTTTAATCCACGTTTTAAATAACTTGTATTACATTGTACAAATATATCAATTAAATAAGTTAAATCAGTGAATATATCTAAACTAAACCATAACATTTGATAAGTTATTTGTAATTCAGTAA                    ]
[+] EMBL CD113101             [TAAAATATGAATTAAATTT AATACTCTCCATAAATTTGGAAATATAGTTCTATTCTCTACACGTATCTTCCATTCACGACATCGATACCATTTAAGAAATCTTGGAAAACGTAACATTGGTTGAATACCAACTTTAAATTGTAATAAATCCAATGGAAGTAATGATGTAATATCTAAAAGGAATTTATAGGATTTCATATAACGTTTAGCTAATTTCTGATGATTACGTACTTTTAATCCACGTTTTAAATAACTTGTATTACATTGTACAAATATATCAATTAAATAAGTTAAATCAGTGAATATATCTAAACTAAACCATAACATTTGATAAGTTATTTGTAATTCAGTAA                    ]
[+] EMBL CD201112             [TAAAATATGAATTAAATTT AATACTCTCCATAAATTTGGAAATATAGTTCTATTCTCTACACGTATCTTCCATTCACGACATCGATACCATTTAAGAAATCTTGGAAAACGTAACATTGGTTGAATACCAACTTTAAATTGTAATAAATCCAATGGAAGTAATGATGTAATATCTAAAAGGAATTTATAGGATTTCATATAACGTTTAGCTAATTTCTGATGATTACGTACTTTTAATCCACGTTTTAAATAACTTGTATTACATTGTACAAATATATCAATTAAATAAGTTAAATCAGTGAATATATCTAAACTAAACCATAACATTTGATAAGTTATTTGTAATTCAGTAA                    ]
[+] EMBL CD113039             [TAAAATATGAATTAAATTT AATACTCTCCATAAATTTGGAAATATAGTTCTATTCTCTACACGTATCTTCCATTCACGACATCGATACCATTAAAGAAATCTTGGAAAACGTAACATTGGTTGAATACCAACTTTAAATTGTAATAAATCCAATGGAAGTAATGATGTAATATCTAAAAGGAATTTATAGGATTTCATATAACGTTTAGCTAATTTCTGATGATTACGTACTTTTAATCCACGTTTTAAATAACTTGTATTACATTGTACAAATATATCAATTAAATAAGTTATATCAGTGAATATATCTAAACTAAACCATAACATTTGATAAGTTATTTGTAATTCAGTAA                    ]
[-] EMBL CD113084             [ AAAATATGAATTAAATTTNNNTTATCTTCATAA  TTGGAAATATAGTTCTATTCTCTACACGTATCTTCCATTCACGACATCGATACCATTTAAGAAATCTTGGAAAACGTAACATTGGTTGAATACCAACTTTAAATTGTAATAAATCCAATGGAAGTAATGATGTAATATCTAAAAGGAATTTATAGGATTTCATATAACGTTTAGCTAATTTCTGATGATTACGTACTTTTAATCCACGTTTTAAATAACTTGTATTACATTGTACAAATATATCAATTAAATAAGTTAAATCAGTGAATATATCTAAACTAAACCATAACATTTGATAAGTTATTTGTAATTCAGTAAA                   ]




>consensus_8047#0
TAAAATATGAATTAAATTTAATACTCTCCATAAATTTGGAAATATAGTTCTATTCTCTAC
ACGTATCTTCCATTCACGACATCGATACCATTTAAGAAATCTTGGAAAACGTAACATTGG
TTGAATACCAACTTTAAATTGTAATAAATCCAATGGAAGTAATGATGTAATATCTAAAAG
GAATTTATAGGATTTCATATAACGTTTAGCTAATTTCTGATGATTACGTACTTTTAATCC
ACGTTTTAAATAACTTGTATTACATTGTACAAATATATCAATTAAATAAGTTAAATCAGT
GAATATATCTAAACTAAACCATAACATTTGATAAGTTATTTGTAATTCAGTAAATGCTTG
ACGTGCCATTGGG

clustalw multiple alignements is not computed in this case