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Schistosoma mansoni
cluster # 8059 cluster # 8059       Sequences # 6       consensus # 4


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8059#0 length = 1056 sequences # 1  
consensus_8059#1 length = 1031 sequences # 3  
consensus_8059#2 length = 702 sequences # 1  
consensus_8059#3 length = 505 sequences # 1  

consensusID : consensus_8059#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 1056
fasta sequence
                              [GGCCAGAATTCGGCACGAGGTGATTATGTAAATATACAAAAATTAATTTTATTATTATTTCCAAAATATGAAATAAAGAATATTGTTGCCAAGGTTTTAAATAAAGGATATTCAAATCAATTAATCCGAATTGATAATGATCCCCATTCATCATTACTTATTCGTATCTATGGTGATCTAACAACATCATTAATTAATAGAACTAATGAAATGAAATATATTCAAATAGTTGGCAAATTAAAAGGCTATCAACGCATATATGGAATATTTAATAATGGTTTTGTATATTCCTATATTGATGGTAATGATATTACATTAGAAAAATTATCTGATATAAAATATGGCAGGTTAATTGCAAAGAAAATGGCTCAGTTACATTGTTTACCTATTGATGAATTCATCCAAAAAACACAAAATGATACATTAATTGAGAAGAGTAAACCAGAATCTCAACTATTTCCAACAATTTTCAAATGGATAGATAGACTTGACGAGGAATTCATCGATTCGTCAAGGAATATTAAAAAATATGAATCAATTTTTCCAAGTAAATCTTATGTTTTAAATGAAGTAATCCAATTGAAAGATCAATATCTTTTTAATCCTATATCTAAAGTAGTTTTATGCCATAATGATCTGAATGCAGCTAACATTATACTGGCTCCAGATGGAAATTCTGTTCACTTGATTGATATGGAATATTGTGACTTANACTATGCTGCATATGATATTGGTAATCACTTTTGTGAATTTACTGGACCATATGCTACAGAAATTCACATTATCCATCATTTGATATCAAAGGGATGGATAATGCATANTTACTGCNTATATAATATCTCATCAAATAGATTACCATGATATTCCAGAGATATNTATCATGCTTAGAGGTATGNNTGCTGNATTATACTTGGCGTGGCANATGCATCGACTAGTCTGATTTACTGCGTCAAGACATAATGAAGTCACTCTCCATGATTCTTTACGCNNGATGTGATTTTCAAAACCGCCCTCTCGTATGGGGTAAGAGCATACCCGAGACACCGAGAGGGGGGG]

[+] EMBL CD079913             [GGCCAGAATTCGGCACGAGGTGATTATGTAAATATACAAAAATTAATTTTATTATTATTTCCAAAATATGAAATAAAGAATATTGTTGCCAAGGTTTTAAATAAAGGATATTCAAATCAATTAATCCGAATTGATAATGATCCCCATTCATCATTACTTATTCGTATCTATGGTGATCTAACAACATCATTAATTAATAGAACTAATGAAATGAAATATATTCAAATAGTTGGCAAATTAAAAGGCTATCAACGCATATATGGAATATTTAATAATGGTTTTGTATATTCCTATATTGATGGTAATGATATTACATTAGAAAAATTATCTGATATAAAATATGGCAGGTTAATTGCAAAGAAAATGGCTCAGTTACATTGTTTACCTATTGATGAATTCATCCAAAAAACACAAAATGATACATTAATTGAGAAGAGTAAACCAGAATCTCAACTATTTCCAACAATTTTCAAATGGATAGATAGACTTGACGAGGAATTCATCGATTCGTCAAGGAATATTAAAAAATATGAATCAATTTTTCCAAGTAAATCTTATGTTTTAAATGAAGTAATCCAATTGAAAGATCAATATCTTTTTAATCCTATATCTAAAGTAGTTTTATGCCATAATGATCTGAATGCAGCTAACATTATACTGGCTCCAGATGGAAATTCTGTTCACTTGATTGATATGGAATATTGTGACTTANACTATGCTGCATATGATATTGGTAATCACTTTTGTGAATTTACTGGACCATATGCTACAGAAATTCACATTATCCATCATTTGATATCAAAGGGATGGATAATGCATANTTACTGCNTATATAATATCTCATCAAATAGATTACCATGATATTCCAGAGATATNTATCATGCTTAGAGGTATGNNTGCTGNATTATACTTGGCGTGGCANATGCATCGACTAGTCTGATTTACTGCGTCAAGACATAATGAAGTCACTCTCCATGATTCTTTACGCNNGATGTGATTTTCAAAACCGCCCTCTCGTATGGGGTAAGAGCATACCCGAGACACCGAGAGGGGGGG]


>consensus_8059#0 GGCCAGAATTCGGCACGAGGTGATTATGTAAATATACAAAAATTAATTTTATTATTATTT CCAAAATATGAAATAAAGAATATTGTTGCCAAGGTTTTAAATAAAGGATATTCAAATCAA TTAATCCGAATTGATAATGATCCCCATTCATCATTACTTATTCGTATCTATGGTGATCTA ACAACATCATTAATTAATAGAACTAATGAAATGAAATATATTCAAATAGTTGGCAAATTA AAAGGCTATCAACGCATATATGGAATATTTAATAATGGTTTTGTATATTCCTATATTGAT GGTAATGATATTACATTAGAAAAATTATCTGATATAAAATATGGCAGGTTAATTGCAAAG AAAATGGCTCAGTTACATTGTTTACCTATTGATGAATTCATCCAAAAAACACAAAATGAT ACATTAATTGAGAAGAGTAAACCAGAATCTCAACTATTTCCAACAATTTTCAAATGGATA GATAGACTTGACGAGGAATTCATCGATTCGTCAAGGAATATTAAAAAATATGAATCAATT TTTCCAAGTAAATCTTATGTTTTAAATGAAGTAATCCAATTGAAAGATCAATATCTTTTT AATCCTATATCTAAAGTAGTTTTATGCCATAATGATCTGAATGCAGCTAACATTATACTG GCTCCAGATGGAAATTCTGTTCACTTGATTGATATGGAATATTGTGACTTANACTATGCT GCATATGATATTGGTAATCACTTTTGTGAATTTACTGGACCATATGCTACAGAAATTCAC ATTATCCATCATTTGATATCAAAGGGATGGATAATGCATANTTACTGCNTATATAATATC TCATCAAATAGATTACCATGATATTCCAGAGATATNTATCATGCTTAGAGGTATGNNTGC TGNATTATACTTGGCGTGGCANATGCATCGACTAGTCTGATTTACTGCGTCAAGACATAA TGAAGTCACTCTCCATGATTCTTTACGCNNGATGTGATTTTCAAAACCGCCCTCTCGTAT GGGGTAAGAGCATACCCGAGACACCGAGAGGGGGGG



consensusID : consensus_8059#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1031
fasta sequence
                              [CCTGGTACGAGGACTAATGATCCCCATTCATCATTACTTATTCGTTTCTATGGTGATCTAACAACATCATTAATTAATAGAACTAATGAAATGAAATATATTCAAATAGTTGGCAAATTAAAAGGCTATCAACGCATATATGGAATATTTAATAATGGTTTTGTATATTCCTATATTGATGGTAATGATATTACATTAGAAAAATTATCTGATATAAAATATGGCAGGTTAATTGCAAAGAAAATGGCTCAGTTACATTGTTTACCTATTGATGAATTCATCCAAAAAACACAAAATGATACATTAATTGAGAAGAGTAAACCAGAATCTCAACTATTTCCAACAATTTTCAAATGGATAGATAGACTTGACGAGGAATTCATCGATTCGTCAAGGAATATTAAAAAATATGAATCAATTTTTCCAAGTAAATCTTATGTTTTAAATGAAGTAATCCAATTGAAAGATCAATATCTTTTTAATCCTATATCTAAAGTAGTTTTATGCCATAATGATCTGAATGCAGCTAACATTATACTGGCTCCAGATGGAAATTCTGTTCACTTGATTGATATGGAATATTGTGACTTAAACTATGCTGCATATGATATTGGTAATCACTTTTGTGAATTTACTGGACCATATGCTACAGAATTTCAACATTATCCATCAATTGAATATCAAAAGGAATGGATAAATGCATATTTAACTGCTTATTATAAATATTCTCAATCAAAATTAGATTTACAATTGAATATATACAAAGAAGATTATATAAATCAATGGCTTAAAGAGGTTAATTGTTTTGCATTGGTATCTCATTTACTTTGGGCTGTTTGGGCAGTAATTTGCGCATCGGAAAACTTACGTTCTATGGATTTTCTAGCTTATGCTGATTCAAGAATGAAACAATATTATAATATGAAAAAATGGTTACCATCAACTTTTCAATTACCCATTTTGTAATTTTTTTTACTTTTTATATAAACCGGTCAGTTGATGAGAATCTTTGTTTCTGAATTTACTACACT]

[+] EMBL CD082266             [CCTGGTACGAGGACTAATGATCCCCATTCATCATTACTTATTCGTTTCTATGGTGATCTAACAACATCATTAATTAATAGAACTAATGAAATGAAATATATTCAAATAGTTGGCAAATTAAAAGGCTATCAACGCATATATGGAATATTTAATAATGGTTTTGTATATTCCTATATTGATGGTAATGATATTACATTAGAAAAATTATCTGATATAAAATATGGCAGGTTAATTGCAAAGAAAATGGCTCAGTTACATTGTTTACCTATTGATGAATTCATCCAAAAAACACAAAATGATACATTAATTGAGAAGAGTAAACCAGAATCTCAACTATTTCCAACAATTTTCAAATGGATAGATAGACTTGACGAGGAATTCATCGATTCGTCAAGGAATATTAAAAAATATGAATCAATTTTTCCAAGTAAATCTTATGTTTTAAATGAAGTAATCCAATTGAAAGATCAATATCTTTTTAATCCTATATCTAAAGTAGTTTTATGCCATAATGATCTGAATGCAGCTAACATTATACTGGCTCCAGATGGAAATTCTGTTCACTTGATTGATATGGAATATTGTGACTTAAACTATGCTGCATATGATATTGGTAATCACTTTTGTGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD074110             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATGGATAGATAGACTTGACGAGGAATTCATCGATTCGTCAAGGAATATTAAAAAATATGAATCAATTTTTCCAAGTAAATCTTATGTTTTAAATGAAGTAATCCAATTGAAAGATCAATATCTTTTTAATCCTATATCTAAAGTAGTTTTATGCCATAATGATCTGAATGCAGCTAACATTATACTGGCTCCAGATGGAAATTCTGTTCACTTGATTGATATGGAATATTGTGACTTAAACTATGCTGCATATGATATTGGTAATCACTTTTGTGAATTTACTGGACCATATGCTACAGAATTTCAACATTATCCATCAATTGAATATCAAAAGGAATGGATAAATGCATATTTAACTGCTTATTATAAATATTCTCAATCAAAATTAGATTTACAATTGAATATATACAAAGAAGATTATATAAATCAATGGCTTAAAGAGGTTAATTGTTTTGCATTGGTATCTCATTTACTTTGGGCTGTTTGGGCAGTAATTTGCGCATCGGAAAACTTACGTTCTATGGATTTTCTAGCTTATGCTGATTCAAGAATGAAACAATATTATAATATGAAAAAATGGTTACCATCAACTTTTCAATTACCCATTTTGTAATTTTTTTTACTTTTTATATAAACCGGTCAGTTGATGAGAATCTTTGTTTCTGAATTTACTACACT]
[+] EMBL CD179871             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GAATATTAAAAAATATGAATCAATTTTTCCAAGTAAATCTTATGTTTTAAATGAAGTAATCCAATTGAAAGATCAATATCTTTTTAATCCTATATCTAAAGTAGTTTTATGCCATAATGATCTGAATGCAGCTAACATTATACTGGCTCCAGATGGAAATTCTGTTCACTTGATTGATATGGAATATTGTGACTTAAACTATGCTGCATATGATATTGGTAATCACTTTTGTGAATTTACTGGACCATATGCTACAGAATTTCAACATTATCCATCAATTGAATATCAAAAGGAATGGATAAATGCATATTTAACTGCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]


>consensus_8059#1 CCTGGTACGAGGACTAATGATCCCCATTCATCATTACTTATTCGTTTCTATGGTGATCTA ACAACATCATTAATTAATAGAACTAATGAAATGAAATATATTCAAATAGTTGGCAAATTA AAAGGCTATCAACGCATATATGGAATATTTAATAATGGTTTTGTATATTCCTATATTGAT GGTAATGATATTACATTAGAAAAATTATCTGATATAAAATATGGCAGGTTAATTGCAAAG AAAATGGCTCAGTTACATTGTTTACCTATTGATGAATTCATCCAAAAAACACAAAATGAT ACATTAATTGAGAAGAGTAAACCAGAATCTCAACTATTTCCAACAATTTTCAAATGGATA GATAGACTTGACGAGGAATTCATCGATTCGTCAAGGAATATTAAAAAATATGAATCAATT TTTCCAAGTAAATCTTATGTTTTAAATGAAGTAATCCAATTGAAAGATCAATATCTTTTT AATCCTATATCTAAAGTAGTTTTATGCCATAATGATCTGAATGCAGCTAACATTATACTG GCTCCAGATGGAAATTCTGTTCACTTGATTGATATGGAATATTGTGACTTAAACTATGCT GCATATGATATTGGTAATCACTTTTGTGAATTTACTGGACCATATGCTACAGAATTTCAA CATTATCCATCAATTGAATATCAAAAGGAATGGATAAATGCATATTTAACTGCTTATTAT AAATATTCTCAATCAAAATTAGATTTACAATTGAATATATACAAAGAAGATTATATAAAT CAATGGCTTAAAGAGGTTAATTGTTTTGCATTGGTATCTCATTTACTTTGGGCTGTTTGG GCAGTAATTTGCGCATCGGAAAACTTACGTTCTATGGATTTTCTAGCTTATGCTGATTCA AGAATGAAACAATATTATAATATGAAAAAATGGTTACCATCAACTTTTCAATTACCCATT TTGTAATTTTTTTTACTTTTTATATAAACCGGTCAGTTGATGAGAATCTTTGTTTCTGAA TTTACTACACT



consensusID : consensus_8059#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 702
fasta sequence
                              [TCCAGGCCAGAATTCTGCACGAGGCGATTCGTCAAGGAATATTAAAAAATATGAATTAATTATTTCCAAGTAAATCTTATGTTTTAAATGAAGTAATCCAATTGAAAGATCAATATCTTTTTAATCCTATATCTAAAGTAGTTTTATGCCATAATGATCTGAATGCAGCTAACATTATACTGGCTCCAGATGGAAATTCTGTTCACTTGATTGATATGGAATATTGTGACTTAAACTATGCTGCATATGATATTGGTAATCACTTTTGTGAATTTACTGGACCATATGCTACAGAATTTCAACATTATCCATCAATTGAATATCAAAAGGAATGGATAAATGCATATTTAACTGCTTATTATAAATATTCTCAATCAAAATTAGATTTACAATTGAATATATACAAAGAAGATTATATAAATCAATGGCTTAAAGAGGTTAATTGTTTTGCATTGGTATCTCATTTACTTTGGGCTGTTTGGGCAGTAATTTGCGCATCGGAAAACTTACGTTCTATGGATTTTCTAGCTTATGCTGATTCAAGAATGAAACAATATTATAATATGAAAAAATGGTTACCATCAACTTTTCAATTACCCATTTTGTAATTTTTTTTACTTTTTATATAAACCGGTCAGTTGATGAGAATCTTTGTTTCTGAATTTACTACACTNTTATTTGCATCAGTTNTATTTATAAAAT]

[+] EMBL CD080113             [TCCAGGCCAGAATTCTGCACGAGGCGATTCGTCAAGGAATATTAAAAAATATGAATTAATTATTTCCAAGTAAATCTTATGTTTTAAATGAAGTAATCCAATTGAAAGATCAATATCTTTTTAATCCTATATCTAAAGTAGTTTTATGCCATAATGATCTGAATGCAGCTAACATTATACTGGCTCCAGATGGAAATTCTGTTCACTTGATTGATATGGAATATTGTGACTTAAACTATGCTGCATATGATATTGGTAATCACTTTTGTGAATTTACTGGACCATATGCTACAGAATTTCAACATTATCCATCAATTGAATATCAAAAGGAATGGATAAATGCATATTTAACTGCTTATTATAAATATTCTCAATCAAAATTAGATTTACAATTGAATATATACAAAGAAGATTATATAAATCAATGGCTTAAAGAGGTTAATTGTTTTGCATTGGTATCTCATTTACTTTGGGCTGTTTGGGCAGTAATTTGCGCATCGGAAAACTTACGTTCTATGGATTTTCTAGCTTATGCTGATTCAAGAATGAAACAATATTATAATATGAAAAAATGGTTACCATCAACTTTTCAATTACCCATTTTGTAATTTTTTTTACTTTTTATATAAACCGGTCAGTTGATGAGAATCTTTGTTTCTGAATTTACTACACTNTTATTTGCATCAGTTNTATTTATAAAAT]


>consensus_8059#2 TCCAGGCCAGAATTCTGCACGAGGCGATTCGTCAAGGAATATTAAAAAATATGAATTAAT TATTTCCAAGTAAATCTTATGTTTTAAATGAAGTAATCCAATTGAAAGATCAATATCTTT TTAATCCTATATCTAAAGTAGTTTTATGCCATAATGATCTGAATGCAGCTAACATTATAC TGGCTCCAGATGGAAATTCTGTTCACTTGATTGATATGGAATATTGTGACTTAAACTATG CTGCATATGATATTGGTAATCACTTTTGTGAATTTACTGGACCATATGCTACAGAATTTC AACATTATCCATCAATTGAATATCAAAAGGAATGGATAAATGCATATTTAACTGCTTATT ATAAATATTCTCAATCAAAATTAGATTTACAATTGAATATATACAAAGAAGATTATATAA ATCAATGGCTTAAAGAGGTTAATTGTTTTGCATTGGTATCTCATTTACTTTGGGCTGTTT GGGCAGTAATTTGCGCATCGGAAAACTTACGTTCTATGGATTTTCTAGCTTATGCTGATT CAAGAATGAAACAATATTATAATATGAAAAAATGGTTACCATCAACTTTTCAATTACCCA TTTTGTAATTTTTTTTACTTTTTATATAAACCGGTCAGTTGATGAGAATCTTTGTTTCTG AATTTACTACACTNTTATTTGCATCAGTTNTATTTATAAAAT



consensusID : consensus_8059#3
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 505
fasta sequence
                              [TCCAAATTTTATAAATAAAACTGATGCAAATAAAAGTGTATTAAATTCAAAAACAAAAATTTTCATCAACTGACCGGTTTATTTAAAAAGTAAAAAAAATTACAAAATGGGTAATTGAAAAGTTGATGGTAACCATTTTTTCATATTATAATATTGTTTCATTCTTGAATCACCATAAGCTAAAAAATCCATAAAACGTAAGTTTTCCGATGCCCAAATTACTGCCCAAACAGCCCAAAGTAAATGAAATCCCCATTATTTCTAGGGGTTAAGTATTCGTCCAAGTCCTGGTCCATCTCGTCGTCTATGTCAACTACTCAAAAGTTCATTGAATTATAATATGATTCATATTAGTTAAAGTAATTTGACTTACCAATGCAAAACAATTAACCTTTTTAAGCCATGGATTTATATAATCTTCTTTGAATATATCCAATTGTAAATCTAATTTTGATTGAAAATATTTATAATAAGCAGTTAAATATGCATTTATCCATTCCTTTTG]

[+] EMBL CD075873             [TCCAAATTTTATAAATAAAACTGATGCAAATAAAAGTGTATTAAATTCAAAAACAAAAATTTTCATCAACTGACCGGTTTATTTAAAAAGTAAAAAAAATTACAAAATGGGTAATTGAAAAGTTGATGGTAACCATTTTTTCATATTATAATATTGTTTCATTCTTGAATCACCATAAGCTAAAAAATCCATAAAACGTAAGTTTTCCGATGCCCAAATTACTGCCCAAACAGCCCAAAGTAAATGAAATCCCCATTATTTCTAGGGGTTAAGTATTCGTCCAAGTCCTGGTCCATCTCGTCGTCTATGTCAACTACTCAAAAGTTCATTGAATTATAATATGATTCATATTAGTTAAAGTAATTTGACTTACCAATGCAAAACAATTAACCTTTTTAAGCCATGGATTTATATAATCTTCTTTGAATATATCCAATTGTAAATCTAATTTTGATTGAAAATATTTATAATAAGCAGTTAAATATGCATTTATCCATTCCTTTTG]


>consensus_8059#3 TCCAAATTTTATAAATAAAACTGATGCAAATAAAAGTGTATTAAATTCAAAAACAAAAAT TTTCATCAACTGACCGGTTTATTTAAAAAGTAAAAAAAATTACAAAATGGGTAATTGAAA AGTTGATGGTAACCATTTTTTCATATTATAATATTGTTTCATTCTTGAATCACCATAAGC TAAAAAATCCATAAAACGTAAGTTTTCCGATGCCCAAATTACTGCCCAAACAGCCCAAAG TAAATGAAATCCCCATTATTTCTAGGGGTTAAGTATTCGTCCAAGTCCTGGTCCATCTCG TCGTCTATGTCAACTACTCAAAAGTTCATTGAATTATAATATGATTCATATTAGTTAAAG TAATTTGACTTACCAATGCAAAACAATTAACCTTTTTAAGCCATGGATTTATATAATCTT CTTTGAATATATCCAATTGTAAATCTAATTTTGATTGAAAATATTTATAATAAGCAGTTA AATATGCATTTATCCATTCCTTTTG



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_8059#1      ------------------------------------------------------------
consensus_8059#2      ------------------------------------------------------------
consensus_8059#0      GGCCAGAATTCGGCACGAGGTGATTATGTAAATATACAAAAATTAATTTTATTATTATTT 60
consensus_8059#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8059#1      ------------------------------------------------------------
consensus_8059#2      ------------------------------------------------------------
consensus_8059#0      CCAAAATATGAAATAAAGAATATTGTTGCCAAGGTTTTAAATAAAGGATATTCAAATCAA 120
consensus_8059#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8059#1      CCTGGTACGAGGACTAATGATCCCCATTCATCATTACTTATTCGTTTCTATGGTGATCTA 60
consensus_8059#2      ------------------------------------------------------------
consensus_8059#0      TTAATCCGAATTGATAATGATCCCCATTCATCATTACTTATTCGTATCTATGGTGATCTA 180
consensus_8059#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8059#1      ACAACATCATTAATTAATAGAACTAATGAAATGAAATATATTCAAATAGTTGGCAAATTA 120
consensus_8059#2      ------------------------------------------------------------
consensus_8059#0      ACAACATCATTAATTAATAGAACTAATGAAATGAAATATATTCAAATAGTTGGCAAATTA 240
consensus_8059#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8059#1      AAAGGCTATCAACGCATATATGGAATATTTAATAATGGTTTTGTATATTCCTATATTGAT 180
consensus_8059#2      ------------------------------------------------------------
consensus_8059#0      AAAGGCTATCAACGCATATATGGAATATTTAATAATGGTTTTGTATATTCCTATATTGAT 300
consensus_8059#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8059#1      GGTAATGATATTACATTAGAAAAATTATCTGATATAAAATATGGCAGGTTAATTGCAAAG 240
consensus_8059#2      ------------------------------------------------------------
consensus_8059#0      GGTAATGATATTACATTAGAAAAATTATCTGATATAAAATATGGCAGGTTAATTGCAAAG 360
consensus_8059#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8059#1      AAAATGGCTCAGTTACATTGTTTACCTATTGATGAATTCATCCAAAAAACACAAAATGAT 300
consensus_8059#2      ------------------------------------------------------------
consensus_8059#0      AAAATGGCTCAGTTACATTGTTTACCTATTGATGAATTCATCCAAAAAACACAAAATGAT 420
consensus_8059#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8059#1      ACATTAATTGAGAAGAGTAAACCAGAATCTCAACTATTTCCAACAATTTTCAAATGGATA 360
consensus_8059#2      ------------------------------------------------TCCA---GGCCA 9
consensus_8059#0      ACATTAATTGAGAAGAGTAAACCAGAATCTCAACTATTTCCAACAATTTTCAAATGGATA 480
consensus_8059#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8059#1      GATAGACTTGACGAGGAATTCATCGATTCGTCAAGGAATATTAAAAAATATGAATCAATT 420
consensus_8059#2      GA-ATTCTGCACGAGG-------CGATTCGTCAAGGAATATTAAAAAATATGAATTAATT 61
consensus_8059#0      GATAGACTTGACGAGGAATTCATCGATTCGTCAAGGAATATTAAAAAATATGAATCAATT 540
consensus_8059#3      -----------------------------TCCAAATTTTATAAATAAAACTGATGCAAAT 31
                                                     ***    *** ** ***  ***   ** *

consensus_8059#1      -TTTCCAAGTAAATCTTATGTTTTAAATGAAGTAATCCAATTGAAAGATCAATATCTTTT 479
consensus_8059#2      ATTTCCAAGTAAATCTTATGTTTTAAATGAAGTAATCCAATTGAAAGATCAATATCTTTT 121
consensus_8059#0      -TTTCCAAGTAAATCTTATGTTTTAAATGAAGTAATCCAATTGAAAGATCAATATCTTTT 599
consensus_8059#3      ------AAAAGTGTATTAAATTCAAAAACAAAAATTTTCATCAACTGACCGGTTTATTTA 85
                            **     * ***  **  ***  **  * *   **  *  ** *  * * *** 

consensus_8059#1      TAATCCTATATCTAAAGTAGTTTTATGCCATAATGATCTGAATGCAGCTAACATTATACT 539
consensus_8059#2      TAATCCTATATCTAAAGTAGTTTTATGCCATAATGATCTGAATGCAGCTAACATTATACT 181
consensus_8059#0      TAATCCTATATCTAAAGTAGTTTTATGCCATAATGATCTGAATGCAGCTAACATTATACT 659
consensus_8059#3      AAA------AGTAAAAAAAATTACAAAATG-GGTAATTGAAAAGTTGATGGTA--ACCAT 136
                       **      *   ***  * **  *        * **   ** *  * *   *  *   *

consensus_8059#1      GGCTCCAGATGGAAATTCTGTTCACTTGATTGATATGGAATATTGTGACTTAAACTATGC 599
consensus_8059#2      GGCTCCAGATGGAAATTCTGTTCACTTGATTGATATGGAATATTGTGACTTAAACTATGC 241
consensus_8059#0      GGCTCCAGATGGAAATTCTGTTCACTTGATTGATATGGAATATTGTGACTTANACTATGC 719
consensus_8059#3      TTTTTCATATTATAATATTGTTT-CATTCTTGAATCACCATAA-GCTAAAAAATCCATAA 194
                         * ** **   ***  ****  * *  ****      ***  *  *   *  * **  

consensus_8059#1      TGCATATGATATTGGTAATCACTTTTGTGAATTTACTGGACCATATGCTACAGAATTTCA 659
consensus_8059#2      TGCATATGATATTGGTAATCACTTTTGTGAATTTACTGGACCATATGCTACAGAATTTCA 301
consensus_8059#0      TGCATATGATATTGGTAATCACTTTTGTGAATTTACTGGACCATATGCTACAGAAATTCA 779
consensus_8059#3      AACGTAAGTTTTCCGATGCCCAAATTACTGCCCAAACAGCCCAAAGTAAATGAAATCCCC 254
                        * ** * * *  *    *    **        *   * *** *    *   **   * 

consensus_8059#1      ACATTATCCATCAATTGAATATCAAAAGGAATGGATAAATGCATATTTAACTGCTTATTA 719
consensus_8059#2      ACATTATCCATCAATTGAATATCAAAAGGAATGGATAAATGCATATTTAACTGCTTATTA 361
consensus_8059#0      -CATTATCCATCATTTGA-TATCAAAGGGA-TGGATAA-TGCATANTTA-CTGCNTAT-A 833
consensus_8059#3      ATTATTTCTAGGGGTTAAGTATTC----GTCCAAGTCCTGGTCCATCTCGTCGTCTATGT 310
                          * ** *    ** * ***      *      *    *   *  *    *  ***  

consensus_8059#1      TAAATATTCTCAATCAAAATTAGATTTACAATTGAATATATAC-AAAGAAGATTATATAA 778
consensus_8059#2      TAAATATTCTCAATCAAAATTAGATTTACAATTGAATATATAC-AAAGAAGATTATATAA 420
consensus_8059#0      TAA-TATCTC--ATCAAA--TAGATT-ACCAT--GATAT-TCC-AGAGA------TATNT 877
consensus_8059#3      CAACTACTCAAAAGTTCA--TTGAATTATAATATGATTCATATTAGTTAAAGTAATTTGA 368
                       ** **      *    *  * ** * *  **   **   *   *   *      * *  

consensus_8059#1      ATCAATGGCTTAAAGAGGTTAAT--TGTTTTGCA-TTGGT--ATCTCATTTACTTTGGGC 833
consensus_8059#2      ATCAATGGCTTAAAGAGGTTAAT--TGTTTTGCA-TTGGT--ATCTCATTTACTTTGGGC 475
consensus_8059#0      ATCAT--GCTTAGAGGTATGNNTGCTGNATTATACTTGGC--GTGGCANATGCATCGACT 933
consensus_8059#3      CTTACCAATGCAAAACAATTAACCTTTTTAAGCCATGGATTTATATAATCTTCTTTGAAT 428
                       * *       * *    *      *         * *     *   *  * * * *   

consensus_8059#1      TGTTTGGGC-AGTAATTTGCGCATCGGAAAACTTACGTTCTATGGATTTTCTAGCTTATG 892
consensus_8059#2      TGTTTGGGC-AGTAATTTGCGCATCGGAAAACTTACGTTCTATGGATTTTCTAGCTTATG 534
consensus_8059#0      AGTCTGATTTACTGCGTCAAGACATAATGAAGTCACTCTCCATGATTCTTTACGCNNGAT 993
consensus_8059#3      ATATCCAATTGTAAATCTAATTTTGATTGAAAATATTTATAATAAGCAGTTAAATATGCA 488
                                                   **   *      **      *          

consensus_8059#1      CTGATTCAAGAATGAAACAATATTATAATATGAAAAAATGGT-TACCATCAACTTTTCAA 951
consensus_8059#2      CTGATTCAAGAATGAAACAATATTATAATATGAAAAAATGGT-TACCATCAACTTTTCAA 593
consensus_8059#0      GTGATTTT----CAAAACCGCCCTCTCGTATGGGGTAAGAGCATACCCGAGACACCGAGA 1049
consensus_8059#3      TTTATCCATTCCTTTTG------------------------------------------- 505
                       * **                                                       

consensus_8059#1      TTACCCATTTTGTAATTTTTTTTACTTTTTATATAAACCGGTCAGTTGATGAGAATCTTT 1011
consensus_8059#2      TTACCCATTTTGTAATTTTTTTTACTTTTTATATAAACCGGTCAGTTGATGAGAATCTTT 653
consensus_8059#0      GGGGGGG----------------------------------------------------- 1056
consensus_8059#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8059#1      GTTTCTGAATTTACTACACT----------------------------- 1031
consensus_8059#2      GTTTCTGAATTTACTACACTNTTATTTGCATCAGTTNTATTTATAAAAT 702
consensus_8059#0      -------------------------------------------------
consensus_8059#3      -------------------------------------------------
                                                                       




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)