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Schistosoma mansoni
cluster # 8062 cluster # 8062       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8062#0 length = 999 sequences # 6  
consensusID : consensus_8062#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 999
fasta sequence 
                              [AGACTGCAAGTCTGTTCGTAATAAATAAAATAATTCAGTGTGTTATGATTGTCGGTATGGGAGTTGTTTGCAATTCTTCAGCGATTCAATAACTTGAAGTGATCACTGTGAACACACTCACATATTGAGGTACAAACAGTGTTCGTCGATCGACTCCTCATTATTCATAGTGAGTGTTGTTTCATAAAGCACAACCACTCATTTCACTGTTCCACATCAGCATTTCGATGCATGTCATTTTGTTACTCTGTCACTGTAGCAATTGAGTATAGCTTGAATGCATCTGCACCCTACTTTCTGTTTCGAATAAAAATGTCAATCATGCAATGGCATTTTAATTTTTCTATTTATTTTTACTTGTTTGCAGAAATGCTCACCATGTTTCGTTCTTCTGTTAATACATAGGTTATGTAGGTAATCGTCGAATAAAACAAATGTGGTGTAAGTTCTAACCCTTGACCTTTTCATTTTTGTTTGTACGCGTTTCTTCGTATTTCTGAAGTGCACGTGTCAGTGTTTCACGTTGGAATTTTCTTGTGTGTTATTCCAGGGTCTCCTTTATGTAGTTTTTATCAAGCGCTCGAATTGCAATTTACCTTTTCTGATTATATTTTGCCTGTTTTTGTTTGTCTGTAACATGTTATGCTTTACTTCAGGCTTTTCTCTCGATCACTTTTATGTTTTACTGAATATCTATTCGCAGCATAGGTTCCGCCTATACTCACTTTCCCCCAATGTTCATCCATGATTTTCTTCATTTATTGACTTACTTACATATGAGAGAAATGTAATGTAATTACATATGAGAAATGTAAAACTACCTGATGATCAATGTGTTAATCCGTTATTATGTATCCAGAAATCATTCTCCAACTTATCCAATCCATTACTGTTGATCATTGTATCACTAATGATATATCATTATTTCTTGTTTCAGAGGTCAAAGGTGTTGGTGCTGTCTGAATGCGTGACAAACACTCAGAATCGTCGTTCCTTTCT]

[-] EMBL CD159485             [AGACTGCAAGTCTGTTCGTAATAAATAAAATAATTCAGTGTGTTATGATTGTCGGTATGGGAGTTGTTTGCAATTCTTCAGCGATTCAATAACTTGAAGTGATCACTGTGAACACACTCACATATTGAGGTACAAACAGTGTTCGTCGATCGACTCCTCATTATTCATAGTGAGTGTTGTTTCATAAAGCACAACCACTCATTTCACTGTTCCACATCAGCATTTCGATGCATGTCATTTTGTTACTCTGTCACTGTAGCAATTGAGTATAGCTTGAATGCATCTGCACCCTACTTTCTGTTTCGAATAAAAATGTCAATCATGCAATGGCATTTTAATTTTTCTATTTATTTTTACTTGTTTGCAGAAATGCTCACCATGTTTCGTTCTTCTGTTAATACATAGGTTATGTAGGTAATCGTCGAATAAAACAAATGTGGTGTAAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD116953             [                                                                                                                                                                                                                      CATCAGCATTTCGATGCATGTCATTTTGTTACTCTGTCACTGTAGCAATTGAGTATAGCTTGAATGCATCTGCACCCTACTTTCTGTTTCGAATAAAAATGTCAATCATGCAATGGCATTTTAATTTTTCTATTTATTTTTACTTGTTTGCAGAAATGCTCACCATGTTTCGTTCTTCTGTTAATACATAGGTTATGTAGGTAATCGTCGAATAAAACAAATGTGGTGTAAGTTCTAACCCTTGACCTTTTCATTTTTGTTTGTACGCGTTTCTTCGTATTTCTGAAGTGCACGTGTCAGTGTTTCACGTTGGAATTTTCTTGTGTGTTATTCCAGGGTCTCCTTTATGTAGTTTTTATCAAGCGCTCGAATTGCAATTTACCTTTTCTGATTATATTTTGCCTGTTTTTGTTTGTCTGTAACATGTTATGCTTTACTTCAGGCTTTTCTCTCGATCACTTTTATGTTTTACTGAATATCTATTCGCAGCATAGGTTCCGCCTATACTCACTTTCCCCCAATGTTCATCCATGATTNTCTTCATTTATTGACTTACTTACATATGAGAGAAATGNTATGTAATTACATATGAGAAATGTA                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD116718             [                                                                                                                                                                                                                      CATCAGCATTTCGATGCATGTCATTTTGTTACTCTGTCACTGTAGCAATTGAGTATAGCTTGAATGCATCTGCACCCTACTTTCTGTTTCGAATAAAAATGTCAATCATGCAATGGCATTTTAATTTTTCTATTTATTTTTACTTGTTTGCAGAAATGCTCACCATGTTTCGTTCTTCTGTTAATACATAGGTTATGTAGGTAATCGTCGAATAAAACAAATGTGGTGTAAGTTCTAACCCTTGACCTTTTCATTTTTGTTTGTACGCGTTTCTTCGTATTTCTGAAGTGCACGTGTCAGTGTTTCACGTTGGAATTTTCTTGTGTGTTATTCCAGGGTCTCCTTTATGTAGTTTTTATCAAGCGCTCGAATTGCAATTTACCTTTTCTGATTATATTTTGCCTGTTTTTGTTTGTCTGTAACATGTTATGCTTTACTTCAGGCTTTTCTCTCGATCACTTTTATGTTTTACTGAATATCTATTCGCAGCATAGGTTCCGCCTATACTCACTTTCCCCCAATGTTCATCCATGATTTTCTTCATTTATTGACTTACTTACATATGAGAGAAATGTAATGTAATTACATATGAGAA                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD117365             [                                                                                                                                                                                                                      CATCAGCATTTCGATGCATGTCATTTTGTTACTCTGTCACTGTAGCAATTGAGTATAGCTTGAATGCATCTGCACCCTACTTTCTGTTTCGAATAAAAATGTCAATCATGCAATGGCATTTTAATTTTTCTATTTATTTTTACTTGTTTGCAGAAATGCTCACCATGTTTCGTTCTTCTGTTAATACATAGGTTATGTAGGTAATCGTCGAATAAAACAAATGTGGTGTAAGTTCTAACCCTTGACCTTTTCATTTTTGTTTGTACGCGTTTCTTCGTATTTCTGAAGTGCACGTGTCAGTGTTTCACGTTGGAATTTTCTTGTGTGTTATTCCAGGGTCTCTTTTATGTAGTTTTTATCAAGCGCTCGAATTGCAATTTACCTTTTCTGATTATATTTTGCCTGTTTTTGTTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD152912             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTATGTAGTTTTTATCAAGCGCTCGAATTGCAATTTACCTTTTCTGATTATATTTTGCCTGTTTTTGTTTGTCTGTAACATGTTATGCTTTACTTCAGGCTTTTCTCTCGATCACTTTTATGTTTTACTGAATATCTATTCGCAGTATAGGTTCCGCCTATACTCACTTTCCCCCAATGTTCATCCATGATTTTCTTCATTTATTGACTTACTTACATATGAGAGAAATGTAATGTAATTACATATGAGAGATGTAAAACTACCTGATGATCAATGTGTTAATCCGTTATTATGTATCCAGAAATCATTCTCCAACTTATCCAATCCATTACTGTTGATCATTGTATCACTAATGATATATCATTATTTCTTGTTTCAGAGGTCAAAGGTGTTGGTGCTGTCTGAATGCGTGACAAACACTCAGAATCGTCGTTCCTTTCT]
[+] EMBL CD152777             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTATGTAGTTTTTATCAAGCGCTCGAATTGCAATTTACCTTTTCTGATTATATTTTGCCTGTTTTTGTTTGTCTGTAATATGTTATGCTTTACTTCAGGCTTTTCTCTCGATCACTTTTATGTTTTACTGAATATCTATTCGCAGTATAGGTTCCGCCTATACTCACTTTCCCCCAATGTTCATCCATGATTTTCTTCATTTATTGACTTACTTACATATGAGAGAAATGTAATGT                                                                                                                                                                                                             ]




>consensus_8062#0
AGACTGCAAGTCTGTTCGTAATAAATAAAATAATTCAGTGTGTTATGATTGTCGGTATGG
GAGTTGTTTGCAATTCTTCAGCGATTCAATAACTTGAAGTGATCACTGTGAACACACTCA
CATATTGAGGTACAAACAGTGTTCGTCGATCGACTCCTCATTATTCATAGTGAGTGTTGT
TTCATAAAGCACAACCACTCATTTCACTGTTCCACATCAGCATTTCGATGCATGTCATTT
TGTTACTCTGTCACTGTAGCAATTGAGTATAGCTTGAATGCATCTGCACCCTACTTTCTG
TTTCGAATAAAAATGTCAATCATGCAATGGCATTTTAATTTTTCTATTTATTTTTACTTG
TTTGCAGAAATGCTCACCATGTTTCGTTCTTCTGTTAATACATAGGTTATGTAGGTAATC
GTCGAATAAAACAAATGTGGTGTAAGTTCTAACCCTTGACCTTTTCATTTTTGTTTGTAC
GCGTTTCTTCGTATTTCTGAAGTGCACGTGTCAGTGTTTCACGTTGGAATTTTCTTGTGT
GTTATTCCAGGGTCTCCTTTATGTAGTTTTTATCAAGCGCTCGAATTGCAATTTACCTTT
TCTGATTATATTTTGCCTGTTTTTGTTTGTCTGTAACATGTTATGCTTTACTTCAGGCTT
TTCTCTCGATCACTTTTATGTTTTACTGAATATCTATTCGCAGCATAGGTTCCGCCTATA
CTCACTTTCCCCCAATGTTCATCCATGATTTTCTTCATTTATTGACTTACTTACATATGA
GAGAAATGTAATGTAATTACATATGAGAAATGTAAAACTACCTGATGATCAATGTGTTAA
TCCGTTATTATGTATCCAGAAATCATTCTCCAACTTATCCAATCCATTACTGTTGATCAT
TGTATCACTAATGATATATCATTATTTCTTGTTTCAGAGGTCAAAGGTGTTGGTGCTGTC
TGAATGCGTGACAAACACTCAGAATCGTCGTTCCTTTCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)