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Schistosoma mansoni
cluster # 8076 cluster # 8076       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8076#0 length = 1041 sequences # 6  
consensusID : consensus_8076#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1041
fasta sequence 
                              [AGGCCAAAAATTCGGCACGAGGTGCATGTTGATTTACATCTGCATAATAACGCATCTTGGGAAAGAATGCCTCTGATTAACTATCGAACCGCTCTTACAGCTTACCAAAGGTTCCAGTCAGTCACCTGCGTGTCCCTAAATCGTCACTATGGAAGCTCACTACCACCATTGGAATATTTTACAAAACTTCAAGAGGTAGCTGATCGTTGGCCTTCTGATGCTTGCGGTAGAAAAGTGACTCTAAAAGATGAGATCAAACGTCGTGGAACTGAATTGATTTCTAAACCAATACAAGAAATAGATACTAAATTTTGGGAAGAAGAATATCAAAGTTTGTCTCGTATTCTTAATAACCATTATCGAGATATTTATCGACCTCCTTCGGTTCTTGGTGATAGTTGCACTGTACCAGGAGGTTCAGTTATAGCTGCAACTGGAGCTGATCTGATAGAATGTAGAAGAATTCTTTATGATCGTGAATAAGAAAACGAAAAAGGTGTTTCTTTGTATCAACGCCTTGTTGATAAATTATTTAACTAGTTTATTTTTCTATACTTCAAATTGATAGTTTCGTTGAAAATGTATGCATTAGTTTTGTTATTTAATATATTTTCAAAAAAGTTGTTGAGCTTCTGTTTTCATAACATTTTGTTATTAACTAGTCCTCGAGATGTGCAGTGTACTTAAGAAGTTTTACATCGGAAAATTTTCATACGATGCTAGGTATGTCAAATTGGTTGATAAACCTGTACTTTTCGTCGACTAAAGTGGCTAACCACCTCCTACCACAAACTACAATTCTGGCCGGCTCAAGATAGGGTTTGAATAATACGCGGATAGTCAAAGCAAAGAGTAACATCAGTCGTTCAATTTTAACCGTCATATTGAAATATTTAGTTGGACCGTGTCTGTCTGGTTAAGTTCTATACGAGAATCGTGATTAACAATGAAAGACCTGTGATATGACTCAATATCGGTCATAGTAGCGTGACTGCATTCATTCTTCTGTTTTTCCTATACCTCGAGTTTCAATATAATTTC]

[+] EMBL CD079800             [AGGCCAAAAATTCGGCACGAGGTGCATGTTGATTTACATCTGCATAATAACGCATCTTGGGAAAGAATGCCTCTGATTAACTATCGAACCGCTCTTACAGCTTACCAAAGGTTCCAGTCAGTCACCTGCGTGTCCCTAAATCGTCACTATGGAAGCTCACTACCACCATTGGAATATTTTACAAAACTTCAAGAGGTAGCTGATCGTTGGCCTTCTGATGCTTGCGGTAGAAAAGTGACTCTAAAAGATGAGATCAAACGTCGTGGAACTGAATTGATTTCTAAACCAATACAAGAAATAGATACTAAATTTTGGGAAGAAGAATATCAAAGTTTGTCTCGTATTCTTAATAACCATTATCGAGATATTTATCGACCTCCTTCGGTTCTTGGTGATAGTTGCACTGTACCAGGAGGTTCAGTTATAGCTGCAACTGGAGCTGATCTGATAGAATGTAGAAGAATTCTTTATGATCGTGAATAAGAAAACGAAAAAGGTGTTTCTTTGTATCAACGCCTTGTTGATAAATTATTTAACTAGTTTATTTTTCTATACTTCAAATTGATAGTTTCGTTGAAAATGTATGCATTAGTTTTGTTATTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD078116             [              tgatttgtTGCATGTTGATTTACATCTGCATAATAACGCATCTTGGGAAAGAATGCCTCTGATTAACTATCGAACCGCTCTTACAGCTTACCAAAGGTTCCAGTCAGTCACCTGCGTGTCCCTAAATCGTCACTATGGAAGCTCACTACCACCATTGGAATATTTTACAAAACTTCAAGAGGTAGCTGATCGTTGGCCTTCTGATGCTTGCGGTAGAAAAGTGACTCTAAAAGATGAGATCAAACGTCGTGGAACTGAATTGATTTCTAAACCAATACAAGAAATAGATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD074058             [                       GCATGTTGATTTACATCTGCATAATAACGCATCTTGGGAAAGAATGCCTCTGATTAACTATCGAACCGCTCTTACAGCTTACCAAAGGTTCCAGTCAGTCACCTGCGTGTCCCTAAATCGTCACTATGGAAGCTCACTACCACCATTGGAATATTTTACAAAACTTCAAGAGGTAGCTGATCGTTGGCCTTCTGATGCTTGCGGTAGAAAAGTGACTCTAAAAGATGAGATCAAACGTCGTGGAACTGAATTGATTTCTAAACCAATACAAGAAATAGATACTAAATTTTGGGAAGAAGAATATCAAAGTTTGTCTCGTATTCTTAATAACCATTATCGAGATATTTATCGACCTCCTTCGGTTCTTGGTGATAGTTGCACTGTACCAGGAGGTTCAGTTATAGCTGCAACTGGAGCTGATCTGATAGAATGTAGAAGAATTCTTTATGATCGTGAATAAGAAAACGAAAAAGGTGTTTCTTTGTATCAACGCCTTGTTGATAAATTATTTAACTAGTTTATTTTTCTATACTTCAAATTGATAGTTTCGTTGAAAATGTATGCATTAGTTTTGTTATTTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD080379             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTAATAACCATTATCGAGATATTTATCGACCTCCTTCGGTTCTTGGTGATAGTTGCACTGTACCAGGAGGTTCAGTTATAGCTGCAACTGGAGCTGATCTGATAGAATGTAGAAGAATTCTTTATGATCGTGAAGAAGAAAACGAAAAAGGTGTTTCTTTGTATCAACGCCTTGTTGATAAATTATTTAACTAGTTTATTTTTCTATACTTCAAATTGATAGTTTCGTTGAAAATGTATGCATTAGTTTTGTTATTTAATATATTTTCAAAAAAGTTGTTGAGCTTCTGTTTTCATAACATTTTGTTATTAACTAGTCCTCGAGATGTGCAGTGTACTTAAGAAGTTTTACATCGGAAAATTTTCATACGATGCTAGGTATGTCAAATTGGTTGATAAACCTGTACTTTTCGTCGACTAAAGTGGCTAACCACCTCCTACCACAAACTACAATTCTGGCCGGCTCAAGATAGGGTTTGAATAATACGCGGATAGTCAAAGCAAAGAGTAACATCAGTCGTTCAATTTTAACCGTCATATTGAAATATTTAGTTGGACCGTGTCTGTCTGGTTAAGTTCTATACGAGAATCGTGATTAACAATGAAAGACCTGTGATATGACTCAATATCGGTCATAGTAGCGTGACTGCATTCATTCTTCTGTTNTTCCTATACCTCGAGTTTCAATATAATTT ]
[-] EMBL CD074295             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTTCTTGGTGATAGTGNCACTGTACCAGGAGGTTCAGTTATAGCTGCAACTGGAGCTGATCTGATAGAATGTAGAAGAATTCTTTATGATCGTGAAGAAGAAAACGAAAAAGGTGTTTCTTTGTATCAACGCCTTGTTGATAAATTATTTAACTAGTTTATTTTTCTATACTTCAAATTGATAGTTTCGTTGAAAATGTATGCATTAGTTTTGTTATTTAATATATTTTCAAAAAAGTTGTTGAGCTTCTGTTTTCATAACATTTTGTTATTAACTAGTCCTCGAGATGTGCAGTGTACTTAAGAAGTTTTACATCGGAAAATTTTCATACGATGCTAGGTATGTCAAATTGGTTGATAAACCTGTACTTTTCGTCGACTAAAGTGGCTAACCACCTCCTACCACAAACTACAATTCTGGCCGGCTCAAGATAGGGTTTGAATAATACGCGGATAGTCAAAGCAAAGAGTAACATCAGTCGTTCAATTTTAACCGTCATATTGAAATATTTAGTTGGACCGTGTCTGTCTGGTTAAGTTCTATACGAGAATCGTGATTAACAATGAAAGACCTGTGATATGACTCAATATCGGTCATAGTAGCGTGACTGCATTCATTCTTCTGTTTTTCCTATACCTCGAGTTTCAATATAATTTC]
[-] EMBL CD074475             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    nagacngCACTCGTTCAATTTTAGCCGTCATATTGAAATATTTAGTTGGACCGTGTCTGTCTGGTTAAGTTCTATACGAGAATCGTGATTAACAATGAAAGACCTGTGATATGACTCAATATCGGTCATAGTAGCGTGACTGCATTCATTCTTCTGTTTTTCCTATACCTCGAGTTTCAATATAATTTC]




>consensus_8076#0
AGGCCAAAAATTCGGCACGAGGTGCATGTTGATTTACATCTGCATAATAACGCATCTTGG
GAAAGAATGCCTCTGATTAACTATCGAACCGCTCTTACAGCTTACCAAAGGTTCCAGTCA
GTCACCTGCGTGTCCCTAAATCGTCACTATGGAAGCTCACTACCACCATTGGAATATTTT
ACAAAACTTCAAGAGGTAGCTGATCGTTGGCCTTCTGATGCTTGCGGTAGAAAAGTGACT
CTAAAAGATGAGATCAAACGTCGTGGAACTGAATTGATTTCTAAACCAATACAAGAAATA
GATACTAAATTTTGGGAAGAAGAATATCAAAGTTTGTCTCGTATTCTTAATAACCATTAT
CGAGATATTTATCGACCTCCTTCGGTTCTTGGTGATAGTTGCACTGTACCAGGAGGTTCA
GTTATAGCTGCAACTGGAGCTGATCTGATAGAATGTAGAAGAATTCTTTATGATCGTGAA
TAAGAAAACGAAAAAGGTGTTTCTTTGTATCAACGCCTTGTTGATAAATTATTTAACTAG
TTTATTTTTCTATACTTCAAATTGATAGTTTCGTTGAAAATGTATGCATTAGTTTTGTTA
TTTAATATATTTTCAAAAAAGTTGTTGAGCTTCTGTTTTCATAACATTTTGTTATTAACT
AGTCCTCGAGATGTGCAGTGTACTTAAGAAGTTTTACATCGGAAAATTTTCATACGATGC
TAGGTATGTCAAATTGGTTGATAAACCTGTACTTTTCGTCGACTAAAGTGGCTAACCACC
TCCTACCACAAACTACAATTCTGGCCGGCTCAAGATAGGGTTTGAATAATACGCGGATAG
TCAAAGCAAAGAGTAACATCAGTCGTTCAATTTTAACCGTCATATTGAAATATTTAGTTG
GACCGTGTCTGTCTGGTTAAGTTCTATACGAGAATCGTGATTAACAATGAAAGACCTGTG
ATATGACTCAATATCGGTCATAGTAGCGTGACTGCATTCATTCTTCTGTTTTTCCTATAC
CTCGAGTTTCAATATAATTTC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)