Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8092 cluster # 8092       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8092#0 length = 818 sequences # 6  

consensusID : consensus_8092#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 818
fasta sequence
                              [AAAATTCGGCACGAGGGCAGACCCCATCCATTCCATATGGTAGGCTTTGTGAGCTTAAAACAAGGAACAAATCAGTTTGCTTACATGGAAGAAGCTTTTGGTGTGACTGCGAAGCTATCAACTATTAAAAGTTTGAATGAGTTACCGTGGACAATCACTCCCAATCATTTTTCCCATGAATATCCTATTCATGATTTAGAACAGCCTGTTATATTGTTGTCTCCAAATGCACGTCAAACATTTGAAGCTGGTGAATATGACCATAATGCCGCTTATGTCATTGGGGCAATAGTGGATAAAGCTGTTCGGAGACCAATTTCTTCTGCAATAGCCCGACAGTTACGCATAAAATGTGTCAGTTTACCTTTGGATCGCTATATGAGATGGGGAAATGGCAAAAGCAAAACCCTATCCATAAATTGCATTCATGCAATAATGTGTGCAGCCAAGGAAACTAATGGAGACTGGAAGAGGGCTCTACTTGAAAATATTCCTTCACGATTCTATGCTCTTCCATCAAAAAAATCTGTTGTATATAAAAGTACATAAAGCCGCGTTTGTCTTAACGTATACTTTTTGATAATACATAATCATCCTTAATATGTAAGTAGTCCTATTCATACTACTTCAATGGATGTAAACATAGCTCTAATATTGCACAAACATACGTCAATTATTTGCGATATTCTTAAATTACATATATAACAATTTGTTTATTATGTACACAATACCAAGAACACTTTCATTTCATCAACTAACATCCCAATCTTTGGTT-TTTTTTGC-AATGAATG-CCAAATCGGATAGAAAACTTATATAGT]

[+] EMBL CD081223             [AAAATTCGGCACGAGGGCAGACCCCATCCATTCCATATGGTAGGCTTTGTGAGCTTAAAACAAGGAACAAATCAGTTTGCTTACATGGAAGAAGCTTTTGGTGTGACTGCGAAGCTATCAACTATTAAAAGTTTGAATGAGTTACCGTGGACAATCACTCCCAATCA  TTTCCCATGAATATCCTATTCATGATTTAGAACAGCCTGTTATATTGTTGTCTCCAAATGCACGTCAAACATTTGAAGCTGGTGAATATGACCATAATGCCGCTTATGTCATTGGGGCAATAGTGGATAAAGCTGTTCGGAGACCAATTTCTTCTGCAATAGCCCGACAGTTACGCATAAAATGTGTCAGTTTACCTTTGGATCGCTATATGAGATGGGGAAATGGCAAAAGCAAAACCCTATCCATAAATTGCATTCATGCAATAATGTGTGCAGCCAAGGAAACTAATGGAGACTGGAAGAGGGCTCTACTTGAAAATATTCCTTCACGATTCTATGCTCTTCCATCAAAAAAATCTGTTGTATATAAAAGTACATAAAGCCGCGTTTGTCTTAACGTATACTTTTTGATAATACATAATCATCCTCTATATGTAAGTAGTCCTATTCATACTACTTCAATGGATGTAAACATAGCTCTAATATTGCACAAACATACGTCAATTATTTGCGATATTCTTAAATTACATATATAACAATTTGTTTATTATGTACACATTACCAAGAACACTTTCAT                                                                           ]
[+] EMBL CD078295             [                                                                           TTTGCTTACATGGAAGAAGCTTTTGGTGTGACTGCGAAGCTATCAACTATTAAAAGTTTGAATGAGTTACCGTGGACAATCACTCCCAATCATTTTTCCCATGAATATCCTATTCATGATTTAGAACAGCCTGTTATATTGTTGTCTCCAAATGCACGTCAAACATTTGAAGCTGGTGAATATGACCATAATGCCGCTTATGTCATTGGGGCAATAGTGGATAAAGCTGTTCGGAGACCAATTTCTTCTGCAATAGCCCGACAGTTACGCATAAAATGTGTCAGTTTACCTTTGGATCGCTATATGAGATGGGGAAATGGCAAAAGCAAAACCCTATCCATAAATTGCATTCATGCAATAATGTGTGCAGCCAAGGAAACTAATGGAGACTGGAAGAGGGCTCTACTTGAAAATATTCCTTCACGATTCTATGCTCTTCCATCAAAAAAATCTGTTGTATATAAAAGTACATAAAGCCGCGTTTGTCTTAACGTATACTTTTTGATAATACATAATCATCCTTAATATGTAAGTAGTCCTATTCATACTACTTCAATGGATGTAAACATAGCTCTAATATTGCACANACATACGTCAATTATTTGCGATATTCTTAAATTACATATATAAACATTTGNTTATTATGTACACAATACCCAGAACACTTTCATTTCATCAACTAACATNCCAATCTTTNGTTNTTTTTTGC AATGAATGCCCCAATC GATAG AAACTTA ATAG ]
[+] EMBL CD078382             [                                                                           TTTGCTTACATGGAAGAAGCTTTTGGTGTGACTGCGAAGCTATCAACTATTAAAAGTTTGAATGAGTTACCGTGGACAATCACTCCCAATCATTTTTCCCATGAATATCCTATTCATGATTTAGAACAGCCTGTTATATTGTTGTCTCCAAATGCACGTCAAACATTTGAAGCTGGTGAATATGACCATAATGCCGCTTATGTCATTGGGGCAATAGTGGATAAAGCTGTTCGGAGACCAATTTCTTCTGCAATAGCCCGACAGTTACGCATAAAATGTGTCAGTTTACCTTTGGATCGCTATATGAGATGGGGAAATGGCAAAAGCAAAACCCTATCCATAAATTGCATTCATGCAATAATGTGTGCAGCCAAGGAAACTAATGGAGACTGGAAGAGGGCTCTACTTGAAAATATTCCTTCACGATTCTATGCTCTTCCATCAAAAAAATCTGTTGTATATAAAAGTACATAAAGCCGCGTTTGTCTTAANG ACACTTTTTGATAATACATAATCATCCTTAATATGTAAGTAGTCCTATTCATACTACTTCAATGGATGTAAACATAGCTCTAATATTGCACAAACATACGTCAATTATTTGCGATATTCTT AATTAC TATATAAC ATTTGTTTATTATG ACAC ATACCAAGAACACTTT ATTT ATCAACT ACATCCC ATC TTGG T TTTTTTGC AATG ATG CCAA  CGGATA AAAACTatta    ]
[-] EMBL CD075055             [                                                                                                                                                                                                                 TATA TGTTGTCTCCAAATGCACGTCAAACATTTGAAGCTGGTGAATATGACCATAATGCCGCTTATGTCATTGGGGCAATAGTGGATAAAGCTGTTCGGAGACCAATTTCTTCTGCAATAGCCCGACAGTTACGCATAAAATGTGTCAGTTTACCTTTGGATCGCTATATGAGATGGGGAAATGGCAAAAGCAAAACCCTATCCATAAATTGCATTCATGCAATAATGTGTGCAGCCAAGGAAACTAATGGAGACTGGAAGAGGGCTCTACTTGAAAATATTCCTTCACGATTCTATGCTCTTCCATCAAAAAAATCTGTTGTATATAAAAGTACATAAAGCCGCGTTTGTCTTAACGTATACTTTTTGATAATACATAATCATCCTTAATATGTAAGTAGTCCTATTCATACTACTTCAATGGATGTAAACATAGCTCTAATATTGCACAAACATACGTCAATTATTTGCGATATTCTTAAATTACATATATATCAATTTGTTGATTATGTACACAATACAAAAAACACTTTCATTTCATCACTTAAa                                                              ]
[-] EMBL CD194688             [                                                                                                                                                                                                                                                                    CCATAATGCCGCTTATGTCATTGGGGCAATAGTGGATAAAGCTGTTCGGAGACCAATTTCTTCTGCAATAGCCCGACAGTTACGCATAAAATGTGTCAGTTTACCTTTGGATCGCTATATGAGATGGGGAAATGGCAAAAGCAAAACCCTATCCATAAATTGCATTCATGCAATAATGTGTGCAGCCAAGGAAACTAATGGAGACTGGAAGAGGGCTCTACTTGAAAATATTCCTTCACGATTCTATGCTCTTCCATCAAAAAAATCTGTTGTATATAAAAGTACATAAAGCCGCGTTTGTCTTAACGTATACTTTTTGATAATACATAATCATCCTTAATATGTAAGTAGTCCTATTCATACTACTTCAATGG                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD072943             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTCGGAGACCAATTTCTTCTGCAATAGCCCGACAGTTACGCATAAAATGTGTCAGTTTACCTTTGGATCGCTATATGAGATGGGGAAATGGCAAAAGCAAAACCCTATCCATAAATTGCATTCATGCAATAATGTGTGCAGCCAAGGAAACTAATGGAGACTGGAAGAGGGCTCTACTTGAAAATATTCCTTCACGATTCTATGCTCTTCCATCAAAAAAATCTGTTGTATATAAAAGTACATAAAGCCGCGTTTGTCTTAACGTATACTTTTTGATAATACATAATCATCCTTAATATGTAAGTAGTCCTATTCATACTACTTCAATGGATGTAAACATAGCTCTAATATTGCACAAACATACGTCAATTATTTGCGATATTCTTAAATTACATATATAACAATTTGTTTATTATGTACACAATACCAAGAACACTTTCATTTCATCAACTAACATCCCAATCTTTGGTT TTTTTTGCAAATGAATG CCAAATCGGATAGAAAACTTATATAGT]


>consensus_8092#0 AAAATTCGGCACGAGGGCAGACCCCATCCATTCCATATGGTAGGCTTTGTGAGCTTAAAA CAAGGAACAAATCAGTTTGCTTACATGGAAGAAGCTTTTGGTGTGACTGCGAAGCTATCA ACTATTAAAAGTTTGAATGAGTTACCGTGGACAATCACTCCCAATCATTTTTCCCATGAA TATCCTATTCATGATTTAGAACAGCCTGTTATATTGTTGTCTCCAAATGCACGTCAAACA TTTGAAGCTGGTGAATATGACCATAATGCCGCTTATGTCATTGGGGCAATAGTGGATAAA GCTGTTCGGAGACCAATTTCTTCTGCAATAGCCCGACAGTTACGCATAAAATGTGTCAGT TTACCTTTGGATCGCTATATGAGATGGGGAAATGGCAAAAGCAAAACCCTATCCATAAAT TGCATTCATGCAATAATGTGTGCAGCCAAGGAAACTAATGGAGACTGGAAGAGGGCTCTA CTTGAAAATATTCCTTCACGATTCTATGCTCTTCCATCAAAAAAATCTGTTGTATATAAA AGTACATAAAGCCGCGTTTGTCTTAACGTATACTTTTTGATAATACATAATCATCCTTAA TATGTAAGTAGTCCTATTCATACTACTTCAATGGATGTAAACATAGCTCTAATATTGCAC AAACATACGTCAATTATTTGCGATATTCTTAAATTACATATATAACAATTTGTTTATTAT GTACACAATACCAAGAACACTTTCATTTCATCAACTAACATCCCAATCTTTGGTTTTTTT TGCAATGAATGCCAAATCGGATAGAAAACTTATATAGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)