These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8092#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 818 fasta sequence [AAAATTCGGCACGAGGGCAGACCCCATCCATTCCATATGGTAGGCTTTGTGAGCTTAAAACAAGGAACAAATCAGTTTGCTTACATGGAAGAAGCTTTTGGTGTGACTGCGAAGCTATCAACTATTAAAAGTTTGAATGAGTTACCGTGGACAATCACTCCCAATCATTTTTCCCATGAATATCCTATTCATGATTTAGAACAGCCTGTTATATTGTTGTCTCCAAATGCACGTCAAACATTTGAAGCTGGTGAATATGACCATAATGCCGCTTATGTCATTGGGGCAATAGTGGATAAAGCTGTTCGGAGACCAATTTCTTCTGCAATAGCCCGACAGTTACGCATAAAATGTGTCAGTTTACCTTTGGATCGCTATATGAGATGGGGAAATGGCAAAAGCAAAACCCTATCCATAAATTGCATTCATGCAATAATGTGTGCAGCCAAGGAAACTAATGGAGACTGGAAGAGGGCTCTACTTGAAAATATTCCTTCACGATTCTATGCTCTTCCATCAAAAAAATCTGTTGTATATAAAAGTACATAAAGCCGCGTTTGTCTTAACGTATACTTTTTGATAATACATAATCATCCTTAATATGTAAGTAGTCCTATTCATACTACTTCAATGGATGTAAACATAGCTCTAATATTGCACAAACATACGTCAATTATTTGCGATATTCTTAAATTACATATATAACAATTTGTTTATTATGTACACAATACCAAGAACACTTTCATTTCATCAACTAACATCCCAATCTTTGGTT-TTTTTTGC-AATGAATG-CCAAATCGGATAGAAAACTTATATAGT] [+] EMBL CD081223 [AAAATTCGGCACGAGGGCAGACCCCATCCATTCCATATGGTAGGCTTTGTGAGCTTAAAACAAGGAACAAATCAGTTTGCTTACATGGAAGAAGCTTTTGGTGTGACTGCGAAGCTATCAACTATTAAAAGTTTGAATGAGTTACCGTGGACAATCACTCCCAATCA TTTCCCATGAATATCCTATTCATGATTTAGAACAGCCTGTTATATTGTTGTCTCCAAATGCACGTCAAACATTTGAAGCTGGTGAATATGACCATAATGCCGCTTATGTCATTGGGGCAATAGTGGATAAAGCTGTTCGGAGACCAATTTCTTCTGCAATAGCCCGACAGTTACGCATAAAATGTGTCAGTTTACCTTTGGATCGCTATATGAGATGGGGAAATGGCAAAAGCAAAACCCTATCCATAAATTGCATTCATGCAATAATGTGTGCAGCCAAGGAAACTAATGGAGACTGGAAGAGGGCTCTACTTGAAAATATTCCTTCACGATTCTATGCTCTTCCATCAAAAAAATCTGTTGTATATAAAAGTACATAAAGCCGCGTTTGTCTTAACGTATACTTTTTGATAATACATAATCATCCTCTATATGTAAGTAGTCCTATTCATACTACTTCAATGGATGTAAACATAGCTCTAATATTGCACAAACATACGTCAATTATTTGCGATATTCTTAAATTACATATATAACAATTTGTTTATTATGTACACATTACCAAGAACACTTTCAT ] [+] EMBL CD078295 [ TTTGCTTACATGGAAGAAGCTTTTGGTGTGACTGCGAAGCTATCAACTATTAAAAGTTTGAATGAGTTACCGTGGACAATCACTCCCAATCATTTTTCCCATGAATATCCTATTCATGATTTAGAACAGCCTGTTATATTGTTGTCTCCAAATGCACGTCAAACATTTGAAGCTGGTGAATATGACCATAATGCCGCTTATGTCATTGGGGCAATAGTGGATAAAGCTGTTCGGAGACCAATTTCTTCTGCAATAGCCCGACAGTTACGCATAAAATGTGTCAGTTTACCTTTGGATCGCTATATGAGATGGGGAAATGGCAAAAGCAAAACCCTATCCATAAATTGCATTCATGCAATAATGTGTGCAGCCAAGGAAACTAATGGAGACTGGAAGAGGGCTCTACTTGAAAATATTCCTTCACGATTCTATGCTCTTCCATCAAAAAAATCTGTTGTATATAAAAGTACATAAAGCCGCGTTTGTCTTAACGTATACTTTTTGATAATACATAATCATCCTTAATATGTAAGTAGTCCTATTCATACTACTTCAATGGATGTAAACATAGCTCTAATATTGCACANACATACGTCAATTATTTGCGATATTCTTAAATTACATATATAAACATTTGNTTATTATGTACACAATACCCAGAACACTTTCATTTCATCAACTAACATNCCAATCTTTNGTTNTTTTTTGC AATGAATGCCCCAATC GATAG AAACTTA ATAG ] [+] EMBL CD078382 [ TTTGCTTACATGGAAGAAGCTTTTGGTGTGACTGCGAAGCTATCAACTATTAAAAGTTTGAATGAGTTACCGTGGACAATCACTCCCAATCATTTTTCCCATGAATATCCTATTCATGATTTAGAACAGCCTGTTATATTGTTGTCTCCAAATGCACGTCAAACATTTGAAGCTGGTGAATATGACCATAATGCCGCTTATGTCATTGGGGCAATAGTGGATAAAGCTGTTCGGAGACCAATTTCTTCTGCAATAGCCCGACAGTTACGCATAAAATGTGTCAGTTTACCTTTGGATCGCTATATGAGATGGGGAAATGGCAAAAGCAAAACCCTATCCATAAATTGCATTCATGCAATAATGTGTGCAGCCAAGGAAACTAATGGAGACTGGAAGAGGGCTCTACTTGAAAATATTCCTTCACGATTCTATGCTCTTCCATCAAAAAAATCTGTTGTATATAAAAGTACATAAAGCCGCGTTTGTCTTAANG ACACTTTTTGATAATACATAATCATCCTTAATATGTAAGTAGTCCTATTCATACTACTTCAATGGATGTAAACATAGCTCTAATATTGCACAAACATACGTCAATTATTTGCGATATTCTT AATTAC TATATAAC ATTTGTTTATTATG ACAC ATACCAAGAACACTTT ATTT ATCAACT ACATCCC ATC TTGG T TTTTTTGC AATG ATG CCAA CGGATA AAAACTatta ] [-] EMBL CD075055 [ TATA TGTTGTCTCCAAATGCACGTCAAACATTTGAAGCTGGTGAATATGACCATAATGCCGCTTATGTCATTGGGGCAATAGTGGATAAAGCTGTTCGGAGACCAATTTCTTCTGCAATAGCCCGACAGTTACGCATAAAATGTGTCAGTTTACCTTTGGATCGCTATATGAGATGGGGAAATGGCAAAAGCAAAACCCTATCCATAAATTGCATTCATGCAATAATGTGTGCAGCCAAGGAAACTAATGGAGACTGGAAGAGGGCTCTACTTGAAAATATTCCTTCACGATTCTATGCTCTTCCATCAAAAAAATCTGTTGTATATAAAAGTACATAAAGCCGCGTTTGTCTTAACGTATACTTTTTGATAATACATAATCATCCTTAATATGTAAGTAGTCCTATTCATACTACTTCAATGGATGTAAACATAGCTCTAATATTGCACAAACATACGTCAATTATTTGCGATATTCTTAAATTACATATATATCAATTTGTTGATTATGTACACAATACAAAAAACACTTTCATTTCATCACTTAAa ] [-] EMBL CD194688 [ CCATAATGCCGCTTATGTCATTGGGGCAATAGTGGATAAAGCTGTTCGGAGACCAATTTCTTCTGCAATAGCCCGACAGTTACGCATAAAATGTGTCAGTTTACCTTTGGATCGCTATATGAGATGGGGAAATGGCAAAAGCAAAACCCTATCCATAAATTGCATTCATGCAATAATGTGTGCAGCCAAGGAAACTAATGGAGACTGGAAGAGGGCTCTACTTGAAAATATTCCTTCACGATTCTATGCTCTTCCATCAAAAAAATCTGTTGTATATAAAAGTACATAAAGCCGCGTTTGTCTTAACGTATACTTTTTGATAATACATAATCATCCTTAATATGTAAGTAGTCCTATTCATACTACTTCAATGG ] [-] EMBL CD072943 [ TTCGGAGACCAATTTCTTCTGCAATAGCCCGACAGTTACGCATAAAATGTGTCAGTTTACCTTTGGATCGCTATATGAGATGGGGAAATGGCAAAAGCAAAACCCTATCCATAAATTGCATTCATGCAATAATGTGTGCAGCCAAGGAAACTAATGGAGACTGGAAGAGGGCTCTACTTGAAAATATTCCTTCACGATTCTATGCTCTTCCATCAAAAAAATCTGTTGTATATAAAAGTACATAAAGCCGCGTTTGTCTTAACGTATACTTTTTGATAATACATAATCATCCTTAATATGTAAGTAGTCCTATTCATACTACTTCAATGGATGTAAACATAGCTCTAATATTGCACAAACATACGTCAATTATTTGCGATATTCTTAAATTACATATATAACAATTTGTTTATTATGTACACAATACCAAGAACACTTTCATTTCATCAACTAACATCCCAATCTTTGGTT TTTTTTGCAAATGAATG CCAAATCGGATAGAAAACTTATATAGT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||