cluster # 8122

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Schistosoma mansoni
cluster # 8122 cluster # 8122 Sequences # 6 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_8122#0 length = 487 sequences # 6

consensusID : consensus_8122#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 487
fasta sequence

                              [ATTGTTTGATATGGAGTGTCAACTAATAAAGGTTGGATGATTTTAACACTAAACCAGTGTTAAAAATGACCCATAGTTTTCTAAGTTTTCTCTGGCTATCCCTTACCGTAGATATCTGTTCCCTACTTCAACTTCATTGCCTTGTGACTTCAACAATCATATCGAAAGCGTAGAAGAAAATATACCAAAGAAATTACCTGCTTTCATTTTGGTTCTCAAGCAAAGTCATCGTGACTAAACAAATAACACATTTTTATGTTAAATTGTGTACGTTATTTATTATCCGAACTTAGTGATAAACAGCTGAGAGCCTGGCGCAATTGTAAGTCAGCTCAAGTCACTATATCACATTAATACAACAAGATAAAATTAACAAGATTGTTGGGGATGTTATATTCCCAGAACTCACTCGGTAAATGCCTTATCTTTGTAATTTTATTTCAAAACTTTGAATTTCTTGTTTTCTTCACCAAAAGCGCTCGTTTTC]

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[+] EMBL CD118546             [ATTGTTTGATATGGAGTGTCAACTAATAAAGGTTGGATGATTTTAACACTAAACCAGTGTTAAAAATGACCCATAGTTTTCTAAGTTTTCTCTGGCTATCCCTTACCGTAGATATCTGTTCCCTACTTCAACTTCATTGCCTTGTGACTTCAACAATCATATCGAAAGCGTAGAAGAAAATATACCAAAGAAATTACCTGCTTTCATTTTGGTTCTCAAGCAAAGTCATCGTGACTAAACAAATAACACATTTTTATGTTAAATTGTGTACGTTATTTATTATCCGAACTTAGTGATAAACAGCTGAGAGCCTGGCGCAATTGTAAGTCAGCTCAAGTCACTATATCACATTAATACAACAAGATAAAATTAACAAGATTGTTGGGGATGTTATATTCCCAGAACTCACTCGGTAAATGCCTTATCTTTGTAATTTTATTTCAAAACTTTGAATTTCTTGTTTTCTTCACCAAAAGCGCTCGTTTTC]
[+] EMBL CD118633             [ATTGTTTGATATGGAGTGTCAACTAATAAAGGTTGGATGATTTTAACACTAAACCAGTGTTAAAAATGACCCATAGTTTTCTAAGTTTTCTCTGGCTATCCCTTACCGTAGATATCTGTTCCCTACTTCAACTTCATTGCCTTGTGACTTCAACAATCATATCGAAAGCGTAGAAGAAAATATACCAAAGAAATTACCTGCTTTCATTTTGGTTCTCAAGCAAAGTCATCGTGACTAAACAAATAACACATTTTTATGTTAAATTGTGTACGTTATTTATTATCCGAACTTAGTGATAAACAGCTGAGAGCCTGGCGCAATTGTAAGTTAGCTCAAGTCACTATATCACATTAATACAACAAGATAAAATTAACAAGATTGTTGGGGATGTTATATTCCCAGAACTCACTCGGTAAATGCCTTATCTTTGTAATTTTATTTCAAAACTTTGAATTTCTTGTTTTCTTCACCAAAAGCGCTCGTTTTC]
[+] EMBL CD118534             [ATTGTTTGATCTGGAGTGTCAACTAATAAAGGTTGGATGATTTTAACACTAAACCCTTGTTAAAAATGACCCATAGTTTTCTAAGTTTTCTCTGGCTATCCCTTACCGTAGATATCTGTTCCCTACTTCAACTTCATTGCCTTGTGACTTCAACAATCATATCGAAAGCGTAGAAGAAAATATACCAAAGAAATTACCTGCTTTCATTTTGGTTCTCAAGCAAAGTCATCGTGACTAAACAAATAACACATTTTTATGTTAAATTGTGTACGTTATTTATTATCCGAACTTAGTGAT                                                                                                                                                                                              ]




>consensus_8122#0
ATTGTTTGATATGGAGTGTCAACTAATAAAGGTTGGATGATTTTAACACTAAACCAGTGT
TAAAAATGACCCATAGTTTTCTAAGTTTTCTCTGGCTATCCCTTACCGTAGATATCTGTT
CCCTACTTCAACTTCATTGCCTTGTGACTTCAACAATCATATCGAAAGCGTAGAAGAAAA
TATACCAAAGAAATTACCTGCTTTCATTTTGGTTCTCAAGCAAAGTCATCGTGACTAAAC
AAATAACACATTTTTATGTTAAATTGTGTACGTTATTTATTATCCGAACTTAGTGATAAA
CAGCTGAGAGCCTGGCGCAATTGTAAGTCAGCTCAAGTCACTATATCACATTAATACAAC
AAGATAAAATTAACAAGATTGTTGGGGATGTTATATTCCCAGAACTCACTCGGTAAATGC
CTTATCTTTGTAATTTTATTTCAAAACTTTGAATTTCTTGTTTTCTTCACCAAAAGCGCT
CGTTTTC

clustalw multiple alignements is not computed in this case