These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8129#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 586 fasta sequence [TCCACTTCAGACAATGGATGAATGGTTGCTCAAGATCATGGATCGATTGAAGTTAGATATTAACACCGTTGAATGCCGGCCAGCTCAGTGATCTAGAGGTAAAGCGTTCGCGCGCTATCTCTACTTTTAAACGTTGCCTCAACTGAAATCAACACGTGAAGAATATCTTTGCGAAAACCTCTTCATTTAGTTACGTAAGAGTCCTTACTACATTTAATAACTAAATATCATCAAACGAATAGAGATTATTGAAACCTATAAAGATTATTTCAAACAAAAAACAGTGACCAAACATTACAATGAAAATTTATTTACTTTCTACATTGTGTATGTGTGTTGTTGTTGTGGGTGCATGTAAATTTGTATGATCGATTAGATTAAATTTCTGCGGTCATTATATTCCTATTTTGATTACATTTTTTGTCATTAAGAATTTTAAAGTTAAGCTGTTTGTAGATTATGTATTTATTGATTGTACTTATATGTATGTGTCTTAGGAAGAACATTACATGTTGATTGATATATAGCTGTAAATGGCGATGTGAATTGTTTGTTACGAACAATATAATATTAATTCACGCTCGAG] [+] EMBL CD089286 [TCCACTTCAGACAATGGATGAATGGTTGCTCAAGATCATGGATCGATTGAAGTTAGATATTAACACCGTTGAATGCCGGCCAGCTCAGTGATCTAGAGGTAAAGCGTTCGCGCGCTATCTCTACTTTTAAACGTTGCCTCAACTGAAATCAACACGTGAAGAATATCTTTGCGAAAACCTCTTCATTTAGTTACGTAAGAGTCCTTACTACATTTAATAACTAAATATCATCAAACGAATAGAGATTATTGAAACCTATAAAGATTATTTCAAACAAAAAACAGTGACCAAACATTACAATGAAAATTTATTTACTTTCTACATTGTGTATGTGTGTTGTTGTTGTGGGTGCATGTAAATTTGTATGATCGATTAGATTAAATTTCTGCGGTCATTATATTCCTATTTTGATTACATTTTTTGTCATTAAGAATTTTAAAGTTAAGCTGTTTGTAGATTATGTATTTATTGATTGTACTTATATGTATGCGTCTTAGAAAGAACATTACATGTTGATTGATATATAGCTGTAAATGGCGATGTGAATTGTTTGTTACGAACAATATAATATTAATTCACGCTCGA ] [+] EMBL CD089291 [TCCACTTCAGACAATGGATAAATGGTTGCTCAAGATCATGGATCGATTGAAGTTAGATATTAACACCGTTGAATGCCGGCCAGCTCAGTGATCTAGAGGTAAAGCGTTCGCGCGCTATCTCTACTTTTAAACGTTGCCTCAACTGAAATCAACACGTGAAGAATATCTTTGCGAAAACCTCTTCATTTAGTTACGTAAGAGTCCTTACTACACTTAATAACTAAATATCATCAAACGAATAGAGATTATTGAAACCTATAAAGATTATTTCAAACAAAAAACAGTGACCAAACATTACAATGAAAATTTATTTACTTTCTACATTGTGTATGTGTGTTGTTGTTGTGGGTGCATGTAAATTTGTATGATCGATTAGATTAAATTTCTGCGGTCATTATATTCCTATTTTGATTACATTTTTTGTCATTAAGAATTTTAAAGTTAAGCTGTTTGTAGATTATGTATTTATTGATTGTACTTATATGTATGTGTCTTAGGAAGAACATTACATGTTGATTGATATATAGCTGTAAATGGCGATGTGAATTGTTTGTTACGAACAATATAATATTAATTCACGCTCGA ] [+] EMBL CD089305 [TCCACTTCAGACAATGGATGAATGGTTGCTCAAGATCATGGATCGATTGAAGTTAGATATTAACACCGTTGAATGCCGGCCAGCTCAGTGATCTAGAGGTAAAGCGTTCGCGCGCTATCTCTACTTTTAAACGTTGCCTCAACTGAAATCAACACGTGAAGAATATCTTTGCGAAAACCTCTTCATTTAGTTACGTAAGAGTCCTTACTACATTTAATAACTAAATATCATCAAACGAATAGAGATTATTGAAACCTATAAAGATTATTTCAAACAAAAAACAGTGACCAAACATTACAATGAAAATTTATTTACTTTCTACATTGTGTATGTGTGTTGTTGTTGTGGGTGCATGTAAATTTGTATGATCGATTAGATTAAATTTCTGCGGTCATTATATTCCTATTTTGATTACATTTTTTGTCATTAAGAATTTTAAAGTTAAGCTGTTTGTAGATTATGTATTTATTGATTGTACTTATATGTATGTGTCTTAGGAAGAACATTACATGTTGATTGATATATAGCTGTANATGGCGATGTGAATTGTTTGTTACGAACAATATAATATTAATTCACGCTCGA ] [-] EMBL CD089284 [ CCACTTCAGACAATGGATGAATGGTTGCTCAAGATCATGGATCGATTGAAGTTAGATATTAACACCGTTGAATGCCGGCCAGCTCAGTGATCTAGAGGTAAAGCGTTCGCGCGCTATCTCTACTTTTAAACGTTGCCTCAACTGAAATCAACACGTGAAGAATATCTTTGCGAAAACCTCTTCATTTAGTTACGTAAGAGTCCTTACTACATTTAATAACTAAATATCATCAAACGAATAGAGATTATTGAAACCTATAAAGATTATTTCAAACAAAAAACAGTGACCAAACATTACAATGAAAATTTATTTACTTTCTACATTGTGTATGTGTGTTGTTGTTGTGGGTGCATGTAAATTTGTATGATCGATTAGATTAAATTTCTGCGGTCATTATATTCCTATTTTGATTACATTTTTTGTCATTAAGAATTTTAAAGTTAAGCTGTTTGTAGATTATGTATTTATTGATTGTACTTATATGTATGTGTCTTAGGAAGAACATTACATGTTGATTGATATATAGCTGTAAATGGCGATGTGAATTGTTTGTTACGAACAATATAATATTAATTCACGCTCGAG] [-] EMBL CD089277 [ CCACTTCAGACAATGGATGAATGGTTGCTCAAGGTCATGGATCGATTGAAGTTAGATATTAACACCGTTGAATGCCGGCCAGCTCAGTGATCTAGAGGTAAAGCGTTCGCGCGCTATCTCTACTTCTAAACGTTGCCTCAACTGAGATCAACACGTGAAGAATATCTTTGCGAAAACCTCTTCATTTAGTTACGTAAGAGTCCTTACTACATTTAATAACTAAATATCATCAAACGAATAGAGATTATTGAAACCTATAAAGATTATTTCAAACAAAAAACAGTGACCAAACATTACAATGAAAATTTATTTACTTTCTACATTGTGTATGTGTGTTGTTGTTGTGGGTGCATGTAAATTTGTATGATCGATTAGATTAAATTTCTGCGGTCATTATATTCCTATTTTGATTACATTTTTTGTCATTAAGAATTTTAAAGTTAAGCTGTTTGTAGATTATGTATTTATTGATTGTACTTATATGTATGTGTCTTAGGAAGAACATTACATGTTGATTGATATATAGCTGTAAATGGCGATGTGAATTGTTTGTTACGAACAATATAATATTAATTCACGCTCGAG] [-] EMBL CD089303 [ CTAGAGGTAAAGCGTTCGCGCGCTATCTCTACTTTTAAACGTTGCCTCAACTGAGATCAACACGTGAAGAATATCTTTGCGAAAACCTCTTCATTTAGTTACGTAAGAGTCCTTACTACATTTAATAACTAAATATCATCAAACGAATAGAGATTATTGAAACCTATAAAGATTATTTCAAACAAAAAACAGTGACCAAACATTACAATGAAAATTTATTTACTTTCTACATTGTGTATGTGTGTTGTTGTTGTGGGTGCATGTAAATTTGTATGATCGATTAGATTAAATTTCTGCGGTCATTATATTCCTATTTTGATTACATTTTTTGTCATTAAGAATTTTAGAGTTAAGCTGTTTGTAGATTATGTATTTATTGATTGTACTTATATGTATGTGTCTTAGGAAGAACATTACATGTTGATTGATATATAGCTGTAAATGGCGATGTGAATTGTTTGTTACGAACAATATAATATTAATTCACGCTCGAG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||