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Schistosoma mansoni
cluster # 8129 cluster # 8129       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8129#0 length = 586 sequences # 6  

consensusID : consensus_8129#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 586
fasta sequence
                              [TCCACTTCAGACAATGGATGAATGGTTGCTCAAGATCATGGATCGATTGAAGTTAGATATTAACACCGTTGAATGCCGGCCAGCTCAGTGATCTAGAGGTAAAGCGTTCGCGCGCTATCTCTACTTTTAAACGTTGCCTCAACTGAAATCAACACGTGAAGAATATCTTTGCGAAAACCTCTTCATTTAGTTACGTAAGAGTCCTTACTACATTTAATAACTAAATATCATCAAACGAATAGAGATTATTGAAACCTATAAAGATTATTTCAAACAAAAAACAGTGACCAAACATTACAATGAAAATTTATTTACTTTCTACATTGTGTATGTGTGTTGTTGTTGTGGGTGCATGTAAATTTGTATGATCGATTAGATTAAATTTCTGCGGTCATTATATTCCTATTTTGATTACATTTTTTGTCATTAAGAATTTTAAAGTTAAGCTGTTTGTAGATTATGTATTTATTGATTGTACTTATATGTATGTGTCTTAGGAAGAACATTACATGTTGATTGATATATAGCTGTAAATGGCGATGTGAATTGTTTGTTACGAACAATATAATATTAATTCACGCTCGAG]

[+] EMBL CD089286             [TCCACTTCAGACAATGGATGAATGGTTGCTCAAGATCATGGATCGATTGAAGTTAGATATTAACACCGTTGAATGCCGGCCAGCTCAGTGATCTAGAGGTAAAGCGTTCGCGCGCTATCTCTACTTTTAAACGTTGCCTCAACTGAAATCAACACGTGAAGAATATCTTTGCGAAAACCTCTTCATTTAGTTACGTAAGAGTCCTTACTACATTTAATAACTAAATATCATCAAACGAATAGAGATTATTGAAACCTATAAAGATTATTTCAAACAAAAAACAGTGACCAAACATTACAATGAAAATTTATTTACTTTCTACATTGTGTATGTGTGTTGTTGTTGTGGGTGCATGTAAATTTGTATGATCGATTAGATTAAATTTCTGCGGTCATTATATTCCTATTTTGATTACATTTTTTGTCATTAAGAATTTTAAAGTTAAGCTGTTTGTAGATTATGTATTTATTGATTGTACTTATATGTATGCGTCTTAGAAAGAACATTACATGTTGATTGATATATAGCTGTAAATGGCGATGTGAATTGTTTGTTACGAACAATATAATATTAATTCACGCTCGA ]
[+] EMBL CD089291             [TCCACTTCAGACAATGGATAAATGGTTGCTCAAGATCATGGATCGATTGAAGTTAGATATTAACACCGTTGAATGCCGGCCAGCTCAGTGATCTAGAGGTAAAGCGTTCGCGCGCTATCTCTACTTTTAAACGTTGCCTCAACTGAAATCAACACGTGAAGAATATCTTTGCGAAAACCTCTTCATTTAGTTACGTAAGAGTCCTTACTACACTTAATAACTAAATATCATCAAACGAATAGAGATTATTGAAACCTATAAAGATTATTTCAAACAAAAAACAGTGACCAAACATTACAATGAAAATTTATTTACTTTCTACATTGTGTATGTGTGTTGTTGTTGTGGGTGCATGTAAATTTGTATGATCGATTAGATTAAATTTCTGCGGTCATTATATTCCTATTTTGATTACATTTTTTGTCATTAAGAATTTTAAAGTTAAGCTGTTTGTAGATTATGTATTTATTGATTGTACTTATATGTATGTGTCTTAGGAAGAACATTACATGTTGATTGATATATAGCTGTAAATGGCGATGTGAATTGTTTGTTACGAACAATATAATATTAATTCACGCTCGA ]
[+] EMBL CD089305             [TCCACTTCAGACAATGGATGAATGGTTGCTCAAGATCATGGATCGATTGAAGTTAGATATTAACACCGTTGAATGCCGGCCAGCTCAGTGATCTAGAGGTAAAGCGTTCGCGCGCTATCTCTACTTTTAAACGTTGCCTCAACTGAAATCAACACGTGAAGAATATCTTTGCGAAAACCTCTTCATTTAGTTACGTAAGAGTCCTTACTACATTTAATAACTAAATATCATCAAACGAATAGAGATTATTGAAACCTATAAAGATTATTTCAAACAAAAAACAGTGACCAAACATTACAATGAAAATTTATTTACTTTCTACATTGTGTATGTGTGTTGTTGTTGTGGGTGCATGTAAATTTGTATGATCGATTAGATTAAATTTCTGCGGTCATTATATTCCTATTTTGATTACATTTTTTGTCATTAAGAATTTTAAAGTTAAGCTGTTTGTAGATTATGTATTTATTGATTGTACTTATATGTATGTGTCTTAGGAAGAACATTACATGTTGATTGATATATAGCTGTANATGGCGATGTGAATTGTTTGTTACGAACAATATAATATTAATTCACGCTCGA ]
[-] EMBL CD089284             [ CCACTTCAGACAATGGATGAATGGTTGCTCAAGATCATGGATCGATTGAAGTTAGATATTAACACCGTTGAATGCCGGCCAGCTCAGTGATCTAGAGGTAAAGCGTTCGCGCGCTATCTCTACTTTTAAACGTTGCCTCAACTGAAATCAACACGTGAAGAATATCTTTGCGAAAACCTCTTCATTTAGTTACGTAAGAGTCCTTACTACATTTAATAACTAAATATCATCAAACGAATAGAGATTATTGAAACCTATAAAGATTATTTCAAACAAAAAACAGTGACCAAACATTACAATGAAAATTTATTTACTTTCTACATTGTGTATGTGTGTTGTTGTTGTGGGTGCATGTAAATTTGTATGATCGATTAGATTAAATTTCTGCGGTCATTATATTCCTATTTTGATTACATTTTTTGTCATTAAGAATTTTAAAGTTAAGCTGTTTGTAGATTATGTATTTATTGATTGTACTTATATGTATGTGTCTTAGGAAGAACATTACATGTTGATTGATATATAGCTGTAAATGGCGATGTGAATTGTTTGTTACGAACAATATAATATTAATTCACGCTCGAG]
[-] EMBL CD089277             [ CCACTTCAGACAATGGATGAATGGTTGCTCAAGGTCATGGATCGATTGAAGTTAGATATTAACACCGTTGAATGCCGGCCAGCTCAGTGATCTAGAGGTAAAGCGTTCGCGCGCTATCTCTACTTCTAAACGTTGCCTCAACTGAGATCAACACGTGAAGAATATCTTTGCGAAAACCTCTTCATTTAGTTACGTAAGAGTCCTTACTACATTTAATAACTAAATATCATCAAACGAATAGAGATTATTGAAACCTATAAAGATTATTTCAAACAAAAAACAGTGACCAAACATTACAATGAAAATTTATTTACTTTCTACATTGTGTATGTGTGTTGTTGTTGTGGGTGCATGTAAATTTGTATGATCGATTAGATTAAATTTCTGCGGTCATTATATTCCTATTTTGATTACATTTTTTGTCATTAAGAATTTTAAAGTTAAGCTGTTTGTAGATTATGTATTTATTGATTGTACTTATATGTATGTGTCTTAGGAAGAACATTACATGTTGATTGATATATAGCTGTAAATGGCGATGTGAATTGTTTGTTACGAACAATATAATATTAATTCACGCTCGAG]
[-] EMBL CD089303             [                                                                                            CTAGAGGTAAAGCGTTCGCGCGCTATCTCTACTTTTAAACGTTGCCTCAACTGAGATCAACACGTGAAGAATATCTTTGCGAAAACCTCTTCATTTAGTTACGTAAGAGTCCTTACTACATTTAATAACTAAATATCATCAAACGAATAGAGATTATTGAAACCTATAAAGATTATTTCAAACAAAAAACAGTGACCAAACATTACAATGAAAATTTATTTACTTTCTACATTGTGTATGTGTGTTGTTGTTGTGGGTGCATGTAAATTTGTATGATCGATTAGATTAAATTTCTGCGGTCATTATATTCCTATTTTGATTACATTTTTTGTCATTAAGAATTTTAGAGTTAAGCTGTTTGTAGATTATGTATTTATTGATTGTACTTATATGTATGTGTCTTAGGAAGAACATTACATGTTGATTGATATATAGCTGTAAATGGCGATGTGAATTGTTTGTTACGAACAATATAATATTAATTCACGCTCGAG]


>consensus_8129#0 TCCACTTCAGACAATGGATGAATGGTTGCTCAAGATCATGGATCGATTGAAGTTAGATAT TAACACCGTTGAATGCCGGCCAGCTCAGTGATCTAGAGGTAAAGCGTTCGCGCGCTATCT CTACTTTTAAACGTTGCCTCAACTGAAATCAACACGTGAAGAATATCTTTGCGAAAACCT CTTCATTTAGTTACGTAAGAGTCCTTACTACATTTAATAACTAAATATCATCAAACGAAT AGAGATTATTGAAACCTATAAAGATTATTTCAAACAAAAAACAGTGACCAAACATTACAA TGAAAATTTATTTACTTTCTACATTGTGTATGTGTGTTGTTGTTGTGGGTGCATGTAAAT TTGTATGATCGATTAGATTAAATTTCTGCGGTCATTATATTCCTATTTTGATTACATTTT TTGTCATTAAGAATTTTAAAGTTAAGCTGTTTGTAGATTATGTATTTATTGATTGTACTT ATATGTATGTGTCTTAGGAAGAACATTACATGTTGATTGATATATAGCTGTAAATGGCGA TGTGAATTGTTTGTTACGAACAATATAATATTAATTCACGCTCGAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)