These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8130#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 506 fasta sequence [AGTAACAGGATAAAATAAACCCATATGAATAAACACTGTACTGGCTGAGCAAGTTGGTGGCGCCTTGACTACTCTGTAAAGGATAACTTGCCAATGTTTGAAAAGATTTGGACTAGGTTTGAGTATAAGTGTGAATACCAATATTGAGATGAAGCTGTATTAAGCTGAGAAATGCTAAACAGGACAGAATGTACATCGTTGATTTAAGAGCTAGCTAGTATCCAAACATACTAGTAACGTTTCAGTTAACTATACGTTATCTTTTTGTAATAATATTCTGGCTATTGACGAAATAAGAAATCGTTTCTTCATTTCATGTGTATTTCTACCTTAATAAGATATCTAAAAAAAAACGTAGTACTTTGAAAACAGTTTACCGTCAGAAATGTTATCATTAGAAAATGCTTAATTTCTTCGATGAGTAATTCATTCGCANAATTACTCAACGATATAAATTTGTCTGGATGTACATTTGACCATAGNAACATCTGACTTAATAAATACTA] [+] EMBL AI067696 [AGTAACAGGATAAAATAAACCCATATGAATAAACACTGTACTGGCTGAGCAAGTTGGTGGCGCCTTGACTACTCTGTAAAGGATAACTTGCCAATGTTTGAAAAGATTTGGACTAGGTTTGAGTATAAGTGTGAATACCAATATTGAGATGAAGCTGTATTAAGCTGAGAAATGCTAAACAGGACAGAATGTACATCGTTGATTTAAGAGCTAGCTAGTATCCAAACATACTAGTAACGTTTCAGTTAACTATACGTTATCTTTTTGTAATAATATTCTGGCTATTGACGAAATAAGAAATCGTTTCTTCATTTCATGTGTATTTCTACCTTAATAAGATATCTAAAAAAAAACGTAGTACTTTGAAAACAGTTTACCGTCAGAAATGTTATCATTAGAAAATGCTTAATTTCTTCGATGAGTAATTCATTCGCANAATTACTCAACGATATAAATTTGTCTGGATGTACATTTGACCATAGNAACATCTGACTTAATAAATACTA] [+] EMBL AI068291 [AGTAACAGGATAAAATAAACCCATATGAATAAACACTGTACTGGCTGAGCAAGTTGGTGGCGCCTTGACTACTCTGTAAAGGATAACTTGCCAATGTTTGAAAAGATTTGGACTAGGTTTGAGTATAAGTGTGAATACCAATATTGAGATGAAGCTGTATTAAGCTGAGAAATGCTAAACAGGACAGAATGTACATCGTTGATTTAAGAGCTAGCTAGTATCCAAACATACTAGTAACGTTTCAGTTAACTATACGTTATCTTTTTGTAATAATATTCTGGCTATTGACGAAATAAGAAATCGTTTCTTCATTTCATGTGTATTTCTACCTTAATAAGATATCTAAAAAAAAACGTAGTACTTTGAAAACAGTTTACCGTCAGAAATGTTATCATTAGAAAATGCTTAATTTCTTCGATGAGTAATTCATTCGCANAATTACTCAACGATATAAATTTG ] [+] EMBL AI067330 [ CCATATGAATAAACACTGTACTGGCTGAGCAAGTTGGTGGCGCCTTGACTACTCTGTAAAGGATAACTTGCCAATGTTTGAAAAGATTTGGACTAGGTTTGAGTATAAGTGTGAATACCAATATTGAGATGAAGCTGTATTAAGCTGAGAAATGCTAAACAGGACAGAATGTACATCGTTGATTTAAGAGCTAGCTAGTATCCAAACATACTAGTAACGTTTCAGTTAACTATACGTTATCTTTTTGTAATAATATTCTGGCTATTGACGAAATAAGAAATCGTTTCTTCATTTCATGTGTATTTCTACCTTAATAAGATATCTAAAAAAAAACGTAGTACTTTGAAAACAGTTTACCGTCAGAAATGTTATCATTAGAAAATGCCTAATTTC ] [+] EMBL AI067320 [ CCATATGAATAAACACTGTACTGGCTGAGCAAGTTGGTGGCGCCTTGACTACTCTGTAAAGGATAACTTGCCAATGTTTGAAAAGATTTGGACTAGGTTTGAGTATAAGTGTGAATACCAATATTGAGATGAAGCTGTATTAAGCTGAGAAATGCTAAACAGGACAGAATGTACATCGTTGATTTAAGAGCTAGCTAGTATCCAAACATACTAGTAACGTTTCAGTTAACTATACGTTATCTTTTTGTAATAATATTCTGGCTATTGACGAAATAAGAAATCGTTTCTTCATTTCATGTGTATTTCTACCTTAATAAGATATCTAAAAAAAAACGTAGTACTTTGAAAACA ] [+] EMBL AI067455 [ CTGAGCAAGTTGGTGGCGCCTTGACTACTCTGTAAAGGATAACTTGCCAATGTTTGAAAAGATTTGGACTAGGTTTGAGTATAAGTGTGAATACCAATATTGAGATGAAGCTGTATTAAGCTGAGAAATGCTAAACAGGACAGAATGTACATCGTTGATTTAAGAGCTAGCTAGTATCCAAACATACTAGTAACGTTTCAGTTAACTATACGTTATCTTTTTGTAATAATATTCTGGCTATTGACGAAATAAGAAATCGTTTCTTCATTTCATGTGTATTTCTACCTTAATAA ] [+] EMBL AI067037 [ CTGAGCAAGTTGGTGGCGCCTTGACTACTCTGTAAAGGATAACTTGCCAATGTTTGAAAAGATTTGGACTAGGTTTGAGTATAAGTGTGAATACCAATATTGAGATGAAGCTGTATTAAGCTGAGAAATGCTAAACAGGACAGA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||