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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8132#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1545 fasta sequence
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[+] EMBL AI975442 [TTTACTCTTGTGATTTGTTGCATGGGCAGTTTTTTGTCACGTGTTTTAAGTAAATAACATGAAGTTCTGTGAATTCCTCAAATAAAATAGCCGATTTACATTTTGTGAAAAAAATGATATTCTACCAGAAAATTGGCGGTGAAAGTTATTTCATTGATAGTGTTACACACAACAGCTTTATGTTATTCATCATCTTACGTGAATATATTTGTTCACTAACAATGCCAGATAACTCTGAGGACCAAATACCGTGTATTAATTCAAAAGATACAATCACTTTGTATATGCTAATGTATGAAATGTTAAAGGAAAACATTGGTAATCCATTTGACATATTAAAACGCGATTCGCAAGATGTACGTATTCCTGCGTATTTAAAACCATTGATTCGAGGCCGAATTGAAAGACTACGCAATTACTATGAGGCTGTTGCGTACACAAATTTGTCGACATTTAAAAATCTAGTCTTTGCAAAATCATCGAATGTTGGCAATGAAATCGATGACGATGACGATGAAAATAGTGGTGATGGAA ]
[+] EMBL CD136938 [ TTTGTCACGTGTCTTAAGTAAATAACATGAAGTTCTGTGAATTCCTCAAATAAAATAGCCGATTTACATTTTGTGAAAAAAATGATATTCTACCAGAAAATTGGCGGTGAAAGTTATTTCATTGATAGTGTTACACACAACAGCTTTATGTTATTCATCATCTTACGTGAATATATTTGTTCACTAACAATGCCAGATAACTCTGAGGACCAAATACCGTGTATTAATTCAAAAGATACAGTCACTTTGTATATGCTAATGTATGAAATGTTAAAGGAAAACATTGGTAATCCATTTGACATATTAAAACGCGATTCGCAAGATGTACGTATTCCTGCGTATTTAAAACCATTGATTCGAGGCCGAATTGAAAGACT ]
[+] EMBL CD088921 [ ATATTAAAACGCGATTCGCAAGATGTACGTATTCCTGCGTATTTAAAACCATTGATTCGAGGCCGAATTGAAAGACTACGCAATTACTATGAGGCTGTTGCGTACACAAATTTGTCGACATTTAAAAATCTAGTCTTTGCAAAATCATCGAATGTTGGCAATGAAATCGATGACGATGACGATGAAAATAGTGGTGATGGAGGGGGTGATGCTAATCAAAATAGTAATAGAAGATTCTTTTTGACTAAAGACAGCGTTTTCGGTTTATTTTTAAGAAAATTTTCACTTGGAATTTATTCAAAGTTTTGAAAAACTCATACAATTTTTTGACTCATTTTTTGATGCTTATGATAATGAATTATGTTCCAGGTCAAATTCGAATATTGAAGATTTAATTGTACAAAATTTTGCTCATTCATTTATTAGAGATCAGTATTTAATATCAACTCGTAATCAGGCTTTAGATGTCTGTTCCGAAATTATTGATTCTATTGGAAAAATTGGTGGACGTCCTAATCTTAATCTACAAAAATATAATGAACTTTTATTGTTAGCTAAAAAAATGTATCCTGAAGTATCATATACGCATTATGCTTCACATGCATATGCCTTGCAAAAACGG ATCTTACCATGGCTGANAACGAATTACATGCATACTTTGAAACATGTATGGCATCGGTGCAAAATCCAGAAA ]
[+] EMBL CD167085 [ GAGATCAGTATTTAATATCAACTCGTAATCAGGCTTTACATGTCTGTTCCGAAGTTATTGATTCTATTGGAAAAATTGGTGGACGTCCTAATCTTAATCTACAAAAATATAATGAACTTTTATTGTTAGCTAAAAAAATGTATCCTGAAGTATCATATACGCATTATGCTTCACATGCATATGCCTTGCAAAAACGGAATCTTACCATGGCTGAGAACGAATTACATGCATACTTTGAAACATGTATGGCATCGGTGCCAAATCCAGAAATCTCATTAACAACGTCAACATTTTCTGGAGCTGGCACAGGATCGACGACTACAACAACAACAACAGCAGGACCAGGAACAAGCGCATCGTCAG ]
[-] EMBL CD164370 [ AATCTTAATCTACCAAAATATAATGAACTTTTATTGTTAGCTAAAAAAATGTATCCTGAAGTATCATATACGCATTATGCTTCACATGCATATGCCTTGCAAAAACGGAATCTTACCATGGCTGAGAACGAATTACATGCATACTTTGAAACATGTATGGCATCGGTGCAAAATCCAGAAATCTCATTAACGACGTCAACATTTTCTGGAGCTGGCGCAGCATCGACGACT ACAACAACAACAGCAGGACCAGGAGCAAGCGCATCGTCAGTACTAACTCCACCTATCAATTCTAGTAATACCTGTGCTCATATGGCAGTGACTGGTGCTGCAATGCATTTAAATTTTGGTCATTGGTATAAAAGAAAATGTTTGATTAAGGAAGCGCTTCAAAAATCGCTAGAAAGTGAATCGAAAGATTCACTTGGTCATGTTAAAGTTACGCATACTTTAT ]
[+] EMBL CD069200 [ CAGCATGTACAAGAACAAGCGCATCGTCAGTACTAACTCCACCTATCAATTCTAGTAATACCTGTGCTCATATGGCAGTGACTGGTGCTGCAATGCATTTAAATTTTGGTCATTGGTATAAAGGAAAATGTTTGATTAAGGAAGCGCTTCAAAAATCGCTAGAAAGTGAATCGAAAGATTCACTTGGTCATGTTAAAGTTACGCATACTTTATTGAATTCAAGTGCTGATCCATTTCGTTATGATAATGAAGCACCTATGAAACAATCATTCAAATCAAATGATGTTACATTAACTGAATTTCGTACAACATTTTGCACGTGCATTAGATACAGGATCAGAACCATATTAACTTTTAACTGTTTATTTCAATTCTGTTAATATTATATCACAAGCATATTTTACTGTATGTCAATTGGATTTAGCTACAATGTGGCAATTTTATGGTTATCCAAATATG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||